Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 165,947 (bp)   Positions: 503
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.008
.001
.001
.002
.004
.002
.059
.003
.03
.0
.002
.002
.001
.0
.334
.0
.0
.002
.001
.0
.001
.0
.0
.009
.005
.001
.0
.004
.0
.013
.007
.0
.001
.001
.018
.003
.0
.105
.041
.004
.001
.0
.021
.002
.314
.003
.182
.001
.068
.497
.149
.086
.01
.023
.006
.003
.004
.011
.009
.003
.006
.0
.012
.001
.022
.136
.063
.005
.022
.001
.001
.276
.002
.193
.088
.037
.122
.005
.003
.001
.374
.071
.012
.002
.001
.182
.005
.346
.06
.026
.109
.014
.001
.035
.021
.003
.001
.003
.728
.758
.014
.132
.041
.003
.039
.023
.006
.004
.047
.108
.156
.012
.083
.007
.002
.135
.003
.025
.003
.0
.0
.003
.007
.009
.0
.063
.003
.014
.002
.001
.002
.004
.093
.004
.235
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.47
.069
.131
.003
.033
.005
.014
.001
.986
.003
.195
.0
.001
.046
--
--
--
--
--
--
--
--
.395
.018
.0
.134
.082
.0
1.0
.758
.997
.102
.001
.027
.02
.169
.174
.007
.003
.129
.153
--
--
.421
.477
.006
.001
.002
--
.001
.003
.006
.0
.019
.266
.247
.012
.005
.007
.001
.042
.003
.001
.0
.0
.0
.001
.042
.001
.0
.0
.0
.007
.046
.047
.002
.009
.0
.0
.001
.0
.0
.001
.032
.093
.0
.001
.0
.0
.368
.0
.026
.01
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.001
.976
.042
.002
.0
.01
.01
.001
.001
.001
.002
.0
.0
.0
.013
.003
.001
.0
.003
.005
.087
.003
.009
.04
.044
.005
.004
.0
.002
.006
.003
.001
.001
.001
.012
.003
.011
.007
.021
.019
.104
.134
.067
.003
.04
.001
.002
.107
.269
.31
.239
.005
.039
.008
.005
.001
.027
.012
.005
.0
.001
.0
.001
.0
.001
.005
.02
.001
.001
.032
.003
.002
.0
.002
.014
.043
.047
.924
.072
.515
.552
.594
.805
.292
.056
.82
.112
.007
.012
.099
.001
.002
.001
.002
.002
.009
.048
.33
.158
.012
.014
.265
.041
.005
.001
.001
.012
.017
.015
.069
.011
.07
.205
.042
.002
.118
.028
.003
.032
.011
.1
.32
.018
--
--
.021
.012
.0
.005
.0
.001
.391
.308
.026
.032
.096
.018
.006
.014
.071
.005
.008
.004
.001
.001
.005
.008
.161
.017
.098
.252
.025
.0
.0
.001
.219
.082
.003
.658
.298
.157
.053
.014
.104
.102
.0
.062
.001
.048
.078
.006
.146
.0
.111
.035
.072
.048
.339
.356
.002
.002
.0
.002
.046
--
--
--
.003
.001
.045
.007
.001
.002
.011
.001
.041
.003
.025
.0
.006
.003
.004
.001
.023
.018
.001
.031
.083
.004
.419
.002
.041
.015
.026
.737
.001
.0
.028
.031
.083
.071
.058
.043
.041
.054
.093
.11
.223
.072
.043
.142
.123
.065
.092
.001
.009
.001
.002
.005
--
--
.115
.602
.011
.048
.043
.022
.003
.001
.01
.001
.006
.0
1.0
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
G
C
T
C
A
16
G
T
T
A
A
A
A
A
C
G
C
C
G
A
A
A
C
C
T
G
T
T
T
A
A
A
5
G
G
A
T
G
A
T
C
A
C
T
C
C
C
A
T
C
C
C
G
3
G
G
C
T
A
2
G
C
A
T
C
T
G
A
T
A
C
4
T
T
C
A
T
T
C
T
A
T
A
A
4
G
T
A
T
A
T
C
T
G
G
T
G
T
A
G
4
G
10
A
T
3
4
A
T
T
T
G
4
G
G
C
T
A
C
G
C
T
T
T
C
A
A
T
A
T
C
C
T
C
T
T
C
C
C
C
T
A
C
T
G
T
T
A
A
C
12
G
G
C
C
A
C
G
T
T
A
T
T
T
G
T
G
9
A
G
C
T
G
G
G
2
G
T
T
C
T
T
C
A
A
2
C
C
T
T
A
G
A
A
G
G
A
2
C
C
A
G
G
A
C
T
C
G
A
A
C
C
T
T
C
T
G
G
T
C
4
C
G
A
C
T
G
C
A
T
A
G
A
A
A
T
G
G
C
T
G
C
A
G
G
C
T
C
G
C
A
G
G
G
A
T
T
C
C
C
A
C
G
G
A
8
G
A
T
G
C
C
C
T
G
A
C
A
T
2
C
G
G
T
A
C
T
G
C
T
T
G
G
C
T
T
C
G
G
G
T
G
C
A
C
C
T
G
T
G
A
T
A
G
A
C
G
G
G
T
A
C
C
A
A
2
G
A
A
G
C
C
A
T
C
16
A
C
A
10
4
T
3
A
A
A
C
G
A
C
T
T
G
T
G
T
A
G
A
A
C
A
A
G
G
A
C
A
A
T
G
G
C
A
A
A
T
T
A
C
A
G
5
C
G
T
G
A
A
G
A
T
G
A
C
C
3
C
C
G
C
A
T
7
G
G
C
G
T
2
2
T
T
C
T
G
T
T
T
G
C
C
T
C
T
C
C
G
G
C
C
2
A
G
T
T
T
A
10
8
T
T
C
T
C
G
G
G
G
G
T
G
G
G
A
C
G
C
G
C
C
C
T
G
A
2
T
G
G
A
G
G
G
A
C
G
C
C
T
C
G
T
C
C
C
G
A
T
G
T
A
G
T
A
T
T
T
C
A
T
C
  151,405,972
  151,406,120
  151,406,510
  151,406,561
  151,406,590
  151,406,657
  151,407,089
  151,407,265
  151,407,297
  151,407,578
  151,407,744
  151,408,023
  151,408,138
  151,408,185
  151,408,195
  151,408,454
  151,408,705
  151,410,222
  151,410,225
  151,410,328
  151,410,334
  151,410,789
  151,411,299
  151,411,495
  151,412,321
  151,412,401
  151,412,423
  151,412,569
  151,412,662
  151,412,674
  151,412,934
  151,412,948
  151,413,040
  151,413,141
  151,413,338
  151,413,355
  151,413,373
  151,413,463
  151,413,530
  151,413,710
  151,413,720
  151,413,855
  151,413,896
  151,414,052
  151,414,524
  151,414,540
  151,414,809
  151,414,950
  151,415,237
  151,415,519
  151,415,703
  151,415,748
  151,415,828
  151,415,955
  151,416,163
  151,416,277
  151,416,291
  151,416,395
  151,416,465
  151,416,540
  151,416,559
  151,416,648
  151,416,665
  151,416,786
  151,416,834
  151,417,041
  151,417,150
  151,417,489
  151,417,639
  151,417,770
  151,417,915
  151,418,160
  151,418,343
  151,418,538
  151,418,596
  151,418,696
  151,418,727
  151,419,186
  151,419,829
  151,420,103
  151,420,129
  151,420,527
  151,420,613
  151,420,623
  151,420,844
  151,421,333
  151,421,471
  151,421,586
  151,421,602
  151,421,707
  151,422,248
  151,422,699
  151,422,744
  151,422,850
  151,423,363
  151,423,509
  151,423,630
  151,423,719
  151,423,936
  151,424,012
  151,424,250
  151,424,499
  151,424,504
  151,424,531
  151,424,582
  151,424,641
  151,424,922
  151,425,119
  151,425,472
  151,425,576
  151,425,609
  151,425,937
  151,426,102
  151,426,526
  151,426,570
  151,426,611
  151,426,849
  151,427,015
  151,427,632
  151,427,646
  151,428,165
  151,428,212
  151,428,306
  151,429,936
  151,429,975
  151,430,151
  151,430,280
  151,430,286
  151,431,289
  151,431,319
  151,431,676
  151,433,141
  151,434,072
  151,434,520
  151,435,010
  151,435,061
  151,435,073
  151,435,089
  151,435,105
  151,435,217
  151,435,221
  151,435,261
  151,435,331
  151,435,724
  151,436,434
  151,436,851
  151,437,312
  151,438,004
  151,438,865
  151,440,214
  151,441,000
  151,441,022
  151,441,708
  151,443,430
  151,443,701
  151,444,013
  151,445,424
  151,446,825
  151,447,279
  151,448,271
  151,450,006
  151,450,623
  151,450,631
  151,450,647
  151,451,392
  151,451,930
  151,452,418
  151,452,653
  151,454,294
  151,456,172
  151,456,184
  151,456,906
  151,456,983
  151,457,947
  151,458,682
  151,459,104
  151,459,223
  151,459,313
  151,459,659
  151,459,821
  151,460,088
  151,460,417
  151,460,419
  151,460,450
  151,460,477
  151,460,518
  151,460,537
  151,467,872
  151,477,141
  151,483,116
  151,483,143
  151,483,309
  151,483,646
  151,491,301
  151,492,850
  151,499,739
  151,500,144
  151,500,273
  151,500,293
  151,500,501
  151,500,524
  151,500,528
  151,500,903
  151,500,917
  151,501,179
  151,501,289
  151,501,335
  151,501,565
  151,501,613
  151,502,217
  151,502,263
  151,502,495
  151,502,612
  151,502,978
  151,503,268
  151,503,348
  151,503,449
  151,503,450
  151,503,521
  151,503,857
  151,503,859
  151,504,460
  151,504,878
  151,504,881
  151,504,882
  151,505,188
  151,505,199
  151,505,232
  151,505,240
  151,505,554
  151,505,613
  151,505,657
  151,505,804
  151,505,853
  151,505,909
  151,506,022
  151,506,134
  151,506,275
  151,506,322
  151,506,358
  151,506,370
  151,506,386
  151,506,419
  151,506,483
  151,506,543
  151,506,553
  151,506,816
  151,506,817
  151,506,906
  151,506,912
  151,506,966
  151,507,101
  151,507,115
  151,507,128
  151,507,314
  151,507,347
  151,507,696
  151,507,732
  151,507,733
  151,507,773
  151,507,838
  151,507,843
  151,507,906
  151,507,954
  151,508,003
  151,508,154
  151,508,194
  151,508,217
  151,509,004
  151,509,382
  151,509,751
  151,509,906
  151,510,068
  151,510,069
  151,510,145
  151,510,376
  151,510,417
  151,510,661
  151,511,044
  151,511,059
  151,511,064
  151,511,174
  151,511,278
  151,511,309
  151,511,410
  151,511,416
  151,511,506
  151,511,806
  151,511,807
  151,511,858
  151,511,909
  151,511,911
  151,511,991
  151,512,108
  151,512,169
  151,512,275
  151,512,497
  151,512,524
  151,512,577
  151,512,581
  151,512,645
  151,513,251
  151,513,279
  151,513,449
  151,513,487
  151,514,085
  151,514,153
  151,514,287
  151,514,937
  151,514,939
  151,515,061
  151,515,083
  151,515,104
  151,515,122
  151,515,131
  151,515,156
  151,515,165
  151,515,170
  151,515,184
  151,515,513
  151,515,517
  151,515,873
  151,516,385
  151,516,992
  151,517,108
  151,517,505
  151,517,761
  151,517,793
  151,517,992
  151,517,995
  151,517,996
  151,518,068
  151,518,178
  151,518,189
  151,518,531
  151,518,765
  151,518,881
  151,518,883
  151,519,262
  151,519,304
  151,519,437
  151,520,056
  151,520,061
  151,520,280
  151,520,904
  151,520,922
  151,521,035
  151,521,125
  151,521,516
  151,521,813
  151,521,911
  151,522,267
  151,522,411
  151,522,504
  151,522,589
  151,522,677
  151,523,428
  151,523,756
  151,524,427
  151,524,735
  151,524,998
  151,525,031
  151,525,082
  151,525,171
  151,525,340
  151,525,411
  151,525,623
  151,525,849
  151,525,864
  151,525,928
  151,526,048
  151,526,646
  151,526,849
  151,526,856
  151,527,588
  151,528,001
  151,528,553
  151,528,913
  151,529,030
  151,529,101
  151,529,318
  151,529,331
  151,529,451
  151,529,673
  151,529,745
  151,529,794
  151,529,948
  151,530,394
  151,530,438
  151,530,591
  151,530,794
  151,531,013
  151,531,185
  151,531,425
  151,531,428
  151,531,441
  151,531,487
  151,531,622
  151,531,665
  151,531,908
  151,531,946
  151,532,317
  151,532,375
  151,532,531
  151,532,568
  151,532,656
  151,532,718
  151,532,799
  151,532,803
  151,533,172
  151,534,531
  151,534,838
  151,534,852
  151,535,758
  151,535,808
  151,535,897
  151,536,584
  151,536,837
  151,536,846
  151,536,994
  151,537,362
  151,537,439
  151,537,585
  151,537,696
  151,537,712
  151,537,842
  151,538,090
  151,538,519
  151,539,422
  151,539,805
  151,540,984
  151,541,905
  151,542,234
  151,544,138
  151,544,346
  151,544,574
  151,544,877
  151,544,945
  151,545,036
  151,545,571
  151,545,598
  151,545,600
  151,545,943
  151,546,529
  151,546,592
  151,546,993
  151,548,679
  151,552,954
  151,553,279
  151,554,171
  151,554,630
  151,554,784
  151,554,954
  151,555,867
  151,555,971
  151,557,524
  151,557,834
  151,559,330
  151,559,884
  151,561,902
  151,562,461
  151,563,068
  151,563,607
  151,564,057
  151,564,530
  151,564,781
  151,565,374
  151,565,376
  151,565,570
  151,565,577
  151,565,581
  151,565,584
  151,565,588
  151,565,592
  151,565,596
  151,565,599
  151,565,607
  151,565,834
  151,566,201
  151,566,229
  151,566,682
  151,566,756
  151,566,986
  151,567,207
  151,567,357
  151,567,741
  151,568,094
  151,568,369
  151,568,780
  151,568,924
  151,569,131
  151,569,217
  151,569,413
  151,569,447
  151,569,518
  151,569,559
  151,569,893
  151,570,021
  151,570,043
  151,570,324
  151,571,483
  151,571,602
  151,571,681
11
C
T
T
C
A
G
-
G/T
C
A
G
C
T
T
G
T
A
G
T
A
G
G
C
T
T
C
A
C
2
C
G
G
T
-
A
A
G
-
A
G
C
T
G
T
C
A
T
A
G
C
G
T
A
A
-
A
A
G
G
C
-
T
A
G
C
T
C
A
-
G
G
A
-
C
C
A
G
C
C
T
C
G
-
G
11
-
9
C
G
C
G
C
T
A
T
A
C
A
C
G
G/A
-
G/-
-
G
C
-
-
G
C
C
C
A
-
G/T
A
T
G
G
T
A
T
G
A
2
T
G
G
G
3
C
T
T
5
T
T/C
T/C
C/T
C/T
C/T
C/T
C
T
T
A
C
C
-
G
5
C/3
-
C
A
T
A
G
G
7
C
C
T
C
-
C
3
C
T
-
-
A
2
C
A
A
-
-
A
C
A
4
TG/C
C
T
G
C
2/-
C/T
T
4
T/G
A/3
2
2
2
A
A
T
2/-
C/T
C/T
G
C
A
G
T
C
T
-
G
G
A
G
A
C
A
G
A
T
G
T
-
-
G/-
C
T
G
2
A
-
2
G
A
G
T
G
G
A
A
G
C
A
T
G
A
A
T
C
G
A
G
G
C
A
A
G
G
C
T
T
T
G
T
C
A
G
-
T
C
A
C
T
T
T
C
T
T
T
T
G
-
T
A
A
A
T
G
A
A
T
G
-
A
A
T
7
-
-
-
-
A
A
A
G
-
5
T
G
A
C
2
-
-
G
-
-
A
-
A
A
G
T
T
T
C
G
-
3
C
3
T
T
T
G
C
-
-
G
G
C
-
-
C
-
G
-
G
G
A
G
T
C
C
A
C
2
C
T
T
G
C
T
G
G
A
A
T
3
G
G
C
T
A
T
T
G
C
C
C
10
T
G
A
-
T
A
C
A
T
G
A
T
C
A
G
G
T
-
4
T
A
A
-
A
-
A
A
T
A
G
-
-
C
G
A
G
A
-
C
C
A
T
T
C
C/T
A
T
T
A
A
T
T
-
C
A
C
-
-
C
10/-
-
A
C
T
C
T
A
A
A
A
A
C
A
A
A
G
2
T
T
5/3
G
C/T
G
C
A
G
-
T/C
G/C
G/-
A/C
G/C
G/C
G/-
A/C
C/T
A
T
A
C
A
-
C
T
A
T
C
-
C
A
G
9
-
C
G
C
C
C
T
G
C
A