Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 175,703 (bp)   Positions: 401
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.39
.0
.0
.007
.002
.019
.055
.022
.003
.005
.006
.007
.065
.006
.0
.011
.005
.0
.013
.002
.002
.031
.001
.003
.003
.001
.0
.033
--
--
.054
.002
.034
.133
.0
.078
.095
.149
.116
.334
.465
.339
.183
.021
.121
.049
.082
.006
.002
.019
.0
.0
.005
.231
.009
.002
.044
.022
.053
.008
.028
.029
.606
.036
.007
.034
.012
.042
.174
.211
.04
.054
.006
.019
.007
.036
.022
.011
.023
.062
.006
.005
.001
.002
.136
.004
.0
.002
.011
.001
.014
.0
.003
.0
.023
.176
.048
.065
.0
.0
.0
.004
--
--
.002
.002
.046
.012
.0
.002
.005
.053
.001
.0
.049
.028
.06
.001
.001
--
--
--
--
--
.11
.168
.0
.003
.004
--
--
.016
.003
.696
.04
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.027
.302
.002
.001
.0
.0
.014
.01
--
--
--
.329
.0
.0
.002
.0
.345
.037
.011
.002
--
.072
.022
.001
.926
.0
.005
.638
.017
.444
.0
.006
.006
.055
.0
.0
.022
.0
.004
.0
.007
.001
.262
.027
.005
.011
.004
.001
.009
.036
.11
.011
.445
.043
.037
.032
.001
.0
.005
.015
.002
.012
.001
.005
.0
.0
.001
.0
.155
.003
.0
.002
.328
.013
.003
--
--
--
.335
.462
.001
.018
.006
.007
.005
--
--
--
--
.005
.038
.056
.032
.012
.9
.063
.011
.0
.001
.035
.0
.165
.0
.0
.002
--
.007
--
--
--
.003
.008
.003
.313
.018
.039
.005
.016
.076
.001
.009
.004
.061
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.118
.94
.021
--
--
--
--
--
--
.011
.0
.002
.028
.002
.001
.018
.047
.006
.0
.002
.001
.002
.009
.002
.044
.011
.0
.0
.049
.313
.002
.0
.462
.091
.003
.014
.007
.004
.187
.002
.0
.048
.005
.003
.85
.156
.004
.004
.001
.008
.022
.011
.006
.14
--
--
--
--
--
--
--
.011
.01
.013
.011
.912
.01
.0
.342
.134
.918
.722
.014
.001
.0
.001
.0
.005
.0
.002
.002
.313
.043
.01
.001
.001
.001
.0
.007
.009
.002
.624
.764
.814
.901
.0
.01
.007
.001
.001
.01
.005
.002
.003
.001
.001
.001
.007
.0
.0
.762
.01
.103
.028
--
.463
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
G
A
G
T
G
T
C
G
G
A
G
T
T
G
G
T
A
G
T
A
G
G
A
7
C
T
C
G
A
G
G
A
A
3
A
A
A
T
A
A
A
T
C
G
T
C
A
T
G
T
A
G
A
T
T
A
A
A
T
G
G
G
G
A
G
C
A
A
T
G
G
C
A
13
A
T
G
G
T
A
A
G
C
G
G
A
A
A
T
T
G
T
C
A
C
A
T
A
G
A
C
A
T
T
G
T
G
A
G
G
G
C
G
G
A
T
T
T
T
G
G
A
G
A
C
G
A
A
G
A
A
C
T
8
C
T
C
A
T
A
A
C
G
C
A
A
T
A
G
16
G
T
C
C
10
2
2
A
A
C
T
G
C
A
T
2
A
G
T
A
G
A
T
T
A
C
G
C
G
A
A
G
G
T
A
G
T
T
T
A
C
G
A
T
T
A
C
T
G
G
2
2
A
9
C
T
C
C
C
T
G
A
G
G
C
T
A
A
T
A
T
T
C
T
T
C
A
5
T
A
A
G
T
A
12
A
A
G
T
A
T
C
A
C
C
T
A
G
G
G
T
G
T
A
G
4
A
T
C
C
C
T
C
C
T
A
C
C
T
C
G
A
C
A
T
G
A
T
C
C
C
C
T
G
G
C
T
G
T
C
A
C
C
A
C
T
G
T
C
G
C
C
C
C
G
A
C
A
T
C
G
T
G
G
C
C
2
C
A
G
T
T
2
G
T
3
6
G
T
A
G
G
A
T
T
A
A
25
G
A
T
G
T
T
A
T
G
A
T
A
C
T
T
A
G
G
T
C
G
2
T
A
T
T
A
A
G
T
A
C
C
C
T
A
C
A
T
T
G
T
C
A
T
T
C
G
G
6
G
T
G
C
A
G
G
G
G
A
G
G
A
  137,657,658
  137,657,829
  137,658,590
  137,660,358
  137,660,363
  137,660,390
  137,660,391
  137,660,438
  137,660,570
  137,660,766
  137,660,781
  137,660,850
  137,661,112
  137,661,116
  137,661,149
  137,661,248
  137,661,323
  137,661,328
  137,661,622
  137,662,535
  137,663,324
  137,663,948
  137,664,015
  137,664,115
  137,664,121
  137,665,190
  137,665,297
  137,666,346
  137,667,122
  137,667,142
  137,667,985
  137,668,083
  137,669,783
  137,670,124
  137,670,298
  137,670,312
  137,670,998
  137,671,103
  137,671,150
  137,671,162
  137,671,233
  137,671,248
  137,671,285
  137,671,597
  137,671,642
  137,671,678
  137,672,484
  137,672,876
  137,673,099
  137,673,103
  137,673,179
  137,673,183
  137,673,282
  137,673,450
  137,673,462
  137,673,520
  137,673,608
  137,673,651
  137,673,667
  137,673,804
  137,673,809
  137,673,812
  137,673,952
  137,674,049
  137,674,066
  137,674,234
  137,674,254
  137,674,273
  137,674,419
  137,675,188
  137,675,305
  137,675,312
  137,675,368
  137,675,380
  137,675,521
  137,675,551
  137,675,592
  137,675,596
  137,675,663
  137,675,736
  137,675,794
  137,676,033
  137,676,061
  137,676,079
  137,676,224
  137,676,427
  137,676,660
  137,676,862
  137,677,227
  137,677,594
  137,677,607
  137,678,296
  137,678,374
  137,678,664
  137,679,170
  137,681,221
  137,681,918
  137,682,632
  137,683,304
  137,683,485
  137,683,889
  137,684,979
  137,685,326
  137,685,669
  137,686,034
  137,686,063
  137,687,705
  137,688,438
  137,688,699
  137,688,767
  137,689,264
  137,689,306
  137,691,684
  137,691,763
  137,691,950
  137,694,230
  137,694,406
  137,694,920
  137,695,005
  137,695,772
  137,695,784
  137,695,790
  137,695,791
  137,695,793
  137,695,823
  137,695,852
  137,696,200
  137,696,403
  137,698,220
  137,698,304
  137,698,344
  137,700,685
  137,703,996
  137,706,231
  137,706,858
  137,708,708
  137,712,086
  137,712,226
  137,712,227
  137,712,909
  137,712,934
  137,712,951
  137,713,055
  137,713,340
  137,713,365
  137,714,103
  137,715,761
  137,716,042
  137,717,556
  137,717,707
  137,722,573
  137,723,738
  137,723,985
  137,724,011
  137,724,271
  137,724,366
  137,724,392
  137,724,397
  137,724,408
  137,724,513
  137,724,600
  137,724,840
  137,725,160
  137,725,222
  137,725,421
  137,725,544
  137,726,018
  137,726,072
  137,726,590
  137,727,283
  137,727,714
  137,728,369
  137,729,635
  137,729,799
  137,730,909
  137,730,960
  137,731,185
  137,731,578
  137,732,699
  137,732,729
  137,733,102
  137,733,519
  137,733,917
  137,734,059
  137,735,102
  137,735,716
  137,736,259
  137,736,675
  137,736,709
  137,736,751
  137,736,893
  137,737,359
  137,737,677
  137,737,890
  137,738,174
  137,738,277
  137,738,402
  137,738,741
  137,738,920
  137,740,331
  137,740,640
  137,740,697
  137,740,700
  137,740,702
  137,740,855
  137,741,029
  137,741,259
  137,741,294
  137,741,301
  137,741,521
  137,741,771
  137,741,781
  137,742,181
  137,742,970
  137,743,129
  137,743,634
  137,743,744
  137,744,562
  137,745,571
  137,745,900
  137,747,689
  137,748,111
  137,749,408
  137,750,121
  137,752,870
  137,753,556
  137,754,488
  137,754,490
  137,754,586
  137,754,887
  137,755,433
  137,755,570
  137,755,735
  137,755,906
  137,755,908
  137,755,936
  137,756,076
  137,756,915
  137,757,459
  137,757,483
  137,758,827
  137,759,121
  137,759,585
  137,759,653
  137,760,498
  137,761,132
  137,761,212
  137,761,652
  137,762,674
  137,762,730
  137,762,771
  137,762,780
  137,763,531
  137,763,792
  137,764,756
  137,765,653
  137,765,715
  137,765,735
  137,766,096
  137,766,722
  137,770,274
  137,772,869
  137,777,176
  137,777,217
  137,777,290
  137,777,551
  137,777,566
  137,777,606
  137,777,613
  137,778,148
  137,778,167
  137,778,769
  137,779,490
  137,779,572
  137,779,626
  137,779,789
  137,779,947
  137,780,016
  137,780,114
  137,780,170
  137,780,347
  137,780,377
  137,780,482
  137,780,583
  137,780,631
  137,780,677
  137,780,707
  137,780,840
  137,781,700
  137,781,807
  137,782,199
  137,782,242
  137,783,672
  137,783,782
  137,783,823
  137,783,864
  137,783,998
  137,784,181
  137,784,222
  137,784,784
  137,786,774
  137,788,615
  137,788,973
  137,789,008
  137,789,079
  137,789,648
  137,790,500
  137,790,726
  137,791,234
  137,791,270
  137,791,416
  137,791,427
  137,791,557
  137,791,790
  137,791,914
  137,791,959
  137,792,160
  137,792,347
  137,792,524
  137,792,536
  137,792,545
  137,795,350
  137,795,635
  137,796,506
  137,797,068
  137,798,299
  137,799,062
  137,799,067
  137,799,973
  137,800,178
  137,800,206
  137,800,710
  137,801,773
  137,803,230
  137,803,349
  137,805,060
  137,805,404
  137,813,981
  137,814,307
  137,815,066
  137,815,337
  137,815,354
  137,815,796
  137,815,808
  137,815,877
  137,816,099
  137,816,158
  137,816,163
  137,816,241
  137,818,082
  137,818,194
  137,818,746
  137,819,359
  137,820,384
  137,820,913
  137,821,042
  137,821,453
  137,821,603
  137,821,607
  137,821,620
  137,821,625
  137,821,668
  137,821,868
  137,822,227
  137,822,417
  137,822,591
  137,822,635
  137,823,076
  137,823,235
  137,824,341
  137,824,425
  137,824,813
  137,825,148
  137,825,388
  137,825,496
  137,826,366
  137,826,395
  137,826,646
  137,826,687
  137,827,341
  137,827,493
  137,827,534
  137,828,312
  137,828,320
  137,828,329
  137,828,331
  137,828,333
  137,828,340
  137,828,349
  137,828,362
  137,828,619
  137,828,790
  137,829,304
  137,829,322
  137,829,614
  137,829,967
  137,830,479
  137,830,498
  137,830,904
  137,832,533
  137,833,043
A
-
G/A
T/G
G/A
T/C
C/T
G/A
G/C
A/G
G/A
T/-
T/C
G/A
G/A
T/-
A/C
G/C
T/C
A/G
G/2
G/C
A/G
7/-
C/6
T/C
C/A
G/A
A/C
G/A
G/10
A/-
G
3/-
A/G
A/G
A/G
T/G
A/T
A/G
A/2
T/G
C/A
G/A
T/C
C/G
A/G
T/8
G/A
T/C
A/G
G/A
A/G
T/C
T/A
A/G
A/G
A/G
T/C
G/A
G/A
G/A
G/T
A/2
G/A
C/T
A/2
A/G
T/C
G/A
G/T
C/T
A/G
13/-
A/G
T/C
G/-
G/T
T/A
A/-
A/G
G/A
C/T
G/A
G/A
A/G
A/G
A/G
T/C
T/C
G/A
T/C
C/-
A/G
C/A
A/G
T/C
A/C
G/A
A/T
C/A
A/G
T/G
A
G/A
T/G
G/C
A/G
G/A
G/A
G/A
C/T
G/A
G/A
A/C
T/A
T/-
T/A
T/A
T
G/T
-/G
G/A
A/2
C/G
G/A
A/G
A/G
G/A
A/G
A/G
C/5
T/2
-
C/T
T/C
-
T
A
A/C
A/G
C/A
G/A
C/G
A/G
2
T/C
A/T
G/A
16/-
A
T/C
C/T
C/T
10/-
2/-
2/-
A/8
A/8
C/T
C
G/C
C/T
A/G
T/C
2/-
A/C
G/A
T/C
A/C
G/T
G
T/C
T/G
A/G
C/T
G/A
C/T
G/A
A/G
A/T
G/-
G/A
T/C
A/G
G/A
T/C
T/C
T/G
A/C
C/T
G/A
A/T
T/C
T/-
A/G
C/G
T/C
G/A
G/A
2/-
-
C
-
C/T
C
C/A
C/T
C/T
T/C
G/A
A/C
G/C
G/A
C/A
T/C
A/C
A/G
T/C
G
C
-
C/T
T/3
C
C/T
A/-
5/-
T/C
A/G
A/G
G/A
-
A/-
12/-
A/C
A/G
G/A
T/-
A/G
T/A
C/T
A/G
C/T
C/T
T/G
G
G/A
G/A
G/A
T/C
G/C
T/A
A/-
G/A
-
A/G
T/A
C/T
C/2
C/2
T/C
C/T
C/T
T/G
A/G
C/T
C/9
T/A
C/T
G/A
A/C
C/A
A/G
T/C
G/A
A/G
T/C
C/T
C/T
C/T
C/G
C
G/A
G/C
C/T
T/G
G/A
T/C
C/T
A/G
C/A
C/T
A/-
C/G
T/C
G/2
T/C
C/T
G/A
C/T
C/T
C/T
C/-
G/A
A/G
C/T
A/G
T/C
C/T
G/T
T/A
G/A
G/A
C/T
C/2
2/-
C/2
A/G
G/A
T/C
T/A
2/-
G/A
T/C
3/-
-
8
T/G
A/G
G/2
G/A
A/G
T/C
T/C
A/2
A/T
25/-
G/C
A/C
T/G
G/A
T/-
2
A/T
T/C
T
T
T/C
A/3
C/T
T/C
T/C
A/G
G/A
G/3
T/C
C/T
G/T
2/-
T/C
A/9
T/C
T/C
A/G
A/G
G/A
T/C
A/G
C/G
C/-
C/T
T/A
A/G
C/A
A/3
T/3
-
G/A
T/C
C/T
A/G
T/C
T/C
C/A
G/A
G/A
6/-
G/A
T/C
G/A
C/A
A/C
G/-
G/A
G/A
G/13
A/T
G/C
G/A
A/2