Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 175,703 (bp)   Positions: 297
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.007
.003
.002
.002
.034
.15
.823
.013
.02
.0
.006
--
.046
.115
.049
.002
.028
.009
--
.003
.04
.003
.008
.008
.002
.004
.152
--
.042
.163
.0
.018
.055
.024
.205
.051
.006
.019
.018
.004
.018
.004
.039
.257
.01
.001
.071
.51
.477
.007
.005
.052
.098
.008
--
.001
.0
.026
.003
.001
.001
.0
.003
.006
.209
.003
.003
.033
.023
.017
.016
.004
.375
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.229
.001
.001
.001
.001
.024
.0
.0
.0
.002
.003
.019
.0
.252
.005
.037
.013
.056
--
.002
.001
--
.0
.0
.002
.018
.101
.013
.012
.034
.001
.926
.006
.006
.001
.0
.007
.0
.299
.022
.0
.001
.001
.114
.005
.011
.004
.001
.001
.036
.032
.0
.0
.006
.001
.0
.155
.001
.002
.056
.041
.0
.001
.328
.076
.013
.252
.001
.0
.001
.077
.0
.001
.0
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.028
.005
.063
.004
.284
.0
.0
.001
.06
.0
.002
.008
.313
.109
.016
.076
.001
.009
.004
.061
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.011
.0
.0
.002
.028
.002
.001
.018
.006
.0
.002
.001
.002
.0
.0
.009
.002
.044
.011
.0
.0
.049
.313
.002
.0
.462
.003
.014
.007
.004
.004
.187
.055
.002
.0
.004
.85
.004
.001
.008
.022
.006
.13
.001
--
--
--
.004
.01
.013
.912
.342
.052
.134
.918
.722
.001
.014
.001
.002
.0
.0
.002
.002
.313
.043
.029
.01
.001
.001
.0
.009
.814
.919
.901
.0
.01
.007
.001
.001
.007
.0
.0
.028
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
T
A
G
A
A
C
T
A
G
T
T
T
G
A
A
A
T
A
G
A
34
G
T
C
A
C
G
T
T
2
G
C
C
G
T
T
G
7
G
T
A
A
T
G
T
T
A
G
C
C
C
G
G
T
78
A
G
G
C
C
T
C
T
C
C
T
G
A
A
G
C
A
G
A
T
C
C
T
C
T
A
A
T
C
G
T
T
C
A
G
T
C
T
T
G
A
T
A
G
T
C
T
4
G
G
T
T
G
C
T
A
G
T
T
A
T
A
A
A
G
T
T
G
A
C
G
A
A
C
T
T
A
C
T
9
T
C
C
C
T
A
8
A
A
A
T
G
T
T
T
T
T
A
C
A
G
G
C
C
C
A
A
T
C
A
T
A
G
C
A
A
T
T
A
T
G
T
G
G
G
G
T
C
A
A
T
C
A
C
C
T
C
T
A
A
C
C
T
C
G
A
C
A
T
G
A
T
C
C
C
T
A
A
A
C
T
G
T
C
G
C
C
C
G
A
G
6
C
A
T
C
G
T
G
G
C
C
2
A
G
T
G
T
2
A
G
T
G
T
G
A
T
T
A
C
A
G
T
A
2
G
A
A
T
G
A
G
G
G
T
C
T
T
T
T
A
A
G
T
T
A
C
C
A
T
G
G
T
C
A
T
G
C
A
G
A
A
  137,660,850
  137,661,024
  137,663,324
  137,668,083
  137,669,783
  137,672,261
  137,672,770
  137,674,313
  137,675,593
  137,678,296
  137,678,320
  137,685,669
  137,687,705
  137,689,808
  137,691,950
  137,693,757
  137,694,230
  137,695,186
  137,695,772
  137,696,403
  137,696,795
  137,697,006
  137,697,141
  137,698,012
  137,698,049
  137,699,014
  137,699,255
  137,699,590
  137,700,000
  137,700,220
  137,700,550
  137,701,213
  137,702,761
  137,702,792
  137,703,119
  137,703,283
  137,703,479
  137,703,882
  137,704,024
  137,704,155
  137,704,171
  137,704,587
  137,704,738
  137,705,153
  137,705,326
  137,705,333
  137,705,996
  137,706,298
  137,706,300
  137,706,426
  137,706,481
  137,706,616
  137,707,442
  137,707,467
  137,707,539
  137,707,809
  137,707,921
  137,707,947
  137,708,024
  137,708,026
  137,708,708
  137,709,060
  137,709,076
  137,709,093
  137,710,054
  137,710,142
  137,710,144
  137,710,488
  137,710,523
  137,710,620
  137,710,717
  137,711,083
  137,711,196
  137,711,347
  137,711,478
  137,711,969
  137,712,086
  137,712,529
  137,712,571
  137,713,693
  137,714,103
  137,715,909
  137,716,997
  137,717,026
  137,717,795
  137,717,838
  137,718,270
  137,718,349
  137,718,655
  137,718,693
  137,718,827
  137,718,830
  137,719,109
  137,719,372
  137,719,385
  137,719,472
  137,719,833
  137,719,956
  137,719,991
  137,720,002
  137,720,027
  137,720,064
  137,720,992
  137,722,573
  137,723,832
  137,724,407
  137,724,600
  137,724,840
  137,725,160
  137,726,271
  137,727,346
  137,727,432
  137,727,445
  137,727,661
  137,728,369
  137,729,635
  137,732,729
  137,733,102
  137,733,221
  137,733,917
  137,734,115
  137,734,235
  137,735,090
  137,735,102
  137,735,695
  137,736,558
  137,736,751
  137,737,189
  137,737,491
  137,737,890
  137,738,174
  137,738,277
  137,738,303
  137,738,741
  137,740,702
  137,741,029
  137,741,394
  137,742,746
  137,743,289
  137,743,634
  137,743,744
  137,745,850
  137,745,900
  137,746,051
  137,747,027
  137,747,054
  137,747,129
  137,747,689
  137,748,017
  137,748,111
  137,748,137
  137,748,200
  137,748,720
  137,748,766
  137,748,935
  137,748,972
  137,748,999
  137,749,038
  137,749,286
  137,749,436
  137,749,602
  137,750,037
  137,750,121
  137,750,325
  137,750,527
  137,750,531
  137,750,582
  137,750,699
  137,750,902
  137,750,966
  137,751,210
  137,751,235
  137,752,428
  137,752,794
  137,752,870
  137,752,967
  137,753,027
  137,753,135
  137,753,179
  137,754,077
  137,755,040
  137,755,735
  137,759,653
  137,759,726
  137,760,107
  137,761,132
  137,761,142
  137,761,212
  137,762,181
  137,762,675
  137,763,531
  137,766,722
  137,772,869
  137,773,302
  137,777,551
  137,777,566
  137,777,606
  137,777,613
  137,778,148
  137,778,167
  137,778,769
  137,779,490
  137,779,572
  137,779,626
  137,779,789
  137,779,947
  137,780,016
  137,780,114
  137,780,170
  137,780,377
  137,780,482
  137,783,766
  137,783,782
  137,783,788
  137,783,823
  137,783,864
  137,783,998
  137,784,181
  137,784,222
  137,784,784
  137,788,615
  137,788,973
  137,789,008
  137,789,079
  137,789,648
  137,789,939
  137,789,968
  137,790,500
  137,790,726
  137,791,234
  137,791,270
  137,791,416
  137,791,427
  137,791,557
  137,791,790
  137,791,914
  137,791,959
  137,792,160
  137,792,524
  137,792,536
  137,792,545
  137,795,263
  137,795,350
  137,795,635
  137,796,100
  137,796,506
  137,797,068
  137,797,588
  137,799,973
  137,800,206
  137,801,773
  137,803,230
  137,803,349
  137,805,404
  137,805,634
  137,813,244
  137,814,307
  137,815,337
  137,815,877
  137,815,977
  137,816,158
  137,816,163
  137,818,082
  137,819,359
  137,820,304
  137,820,384
  137,820,913
  137,821,042
  137,821,317
  137,821,453
  137,821,603
  137,821,617
  137,821,621
  137,821,868
  137,822,227
  137,822,417
  137,822,591
  137,822,635
  137,822,659
  137,823,076
  137,823,235
  137,824,341
  137,824,813
  137,825,388
  137,826,646
  137,826,685
  137,826,687
  137,827,341
  137,827,493
  137,827,534
  137,828,362
  137,828,619
  137,828,790
  137,829,304
  137,829,322
  137,830,498
  137,833,043
T/-
A/T
G/2
A/-
A/G
21
T/A
A/G
G/-
T/C
T/-
A
G/C
A/G
A/-
A/G
T/A
A/G
T
A/G
34/-
G/A
T/C
C/T
A/G
C/T
G/A
T/C
T/C
2/-
G/A
C/A
C/T
G/T
T/C
T/C
G/T
7/-
G/A
T/C
A/G
A/G
T/G
G/C
T/A
T/27
A/C
G/C
C/A
C/T
C/T
G/A
G/T
T/C
78/-
A/T
G/A
G/A
C/2
C/12
T/C
C/2
T/A
C/G
C/T
T/G
G/A
A/G
A/G
G/2
C/G
A/C
G/A
A/C
T/2
C/A
-
T/G
C/T
T/G
A/2
A/C
T/2
C/T
G/A
T/C
T/G
C/T
A/G
G/A
T/A
C/T
T/G
T/G
G/A
A/T
T/C
A/G
G/-
T/C
C/8
T/C
4/-
G/A
G/A
T/C
T/C
G/C
C/T
T/C
A/-
G/-
T/C
T/G
A/G
T/C
A/G
A/T
A/G
G/A
T/C
T/C
G/A
A/G
C/A
G/A
A/C
A/C
C/A
T/C
T/-
A/G
C/T
T/C
9/-
T/C
C/T
C/T
C/T
T/C
A/C
8/-
A/G
A/G
A/G
T/C
G/A
T/C
T/C
-
T/A
T/2
A/T
C/T
A/-
G/2
G/A
C/T
C/T
C/T
A/T
A/-
T/7
C/A
A/G
T/C
A/G
G/A
C/G
A/G
A/G
T/G
T/C
A/G
T/C
G/A
T/C
G/A
G/A
G/4
G/2
T/-
C/T
A/C
A/G
T/G
C/T
A/G
C/T
C/2
T/A
2
T/C
A/T
A/G
C/T
C/9
T/A
C/T
G/A
A/C
C/A
A/G
T/C
G/A
A/G
T/C
C/T
C/T
C/G
C
A/T
A/-
T
C/G
T/C
G/2
T/C
C/T
G/A
C/T
C/T
C/-
G/A
A/G
G/T
6/-
C/T
A/G
T/C
C/T
G/T
T/A
G/A
G/A
C/T
C/2
-
A/G
G/A
T/C
G/T
T/A
2/-
A/-
G/A
T/C
G/A
T/G
G/2
A/G
T/C
T/C
A/T
C/-
A/2
G/C
T/G
A/T
2/-
G/T
A/T
A/3
T/C
G/C
A/G
G/A
G/3
G/A
T/C
C/T
T/3
T/C
T/C
T/C
A/G
A/G
G/A
T/-
T/C
A/G
C/G
C/T
A/G
T/-
G/C
G/A
T/C
C/T
A/G
T/C
G/A
C/A
A/C
G/-
A/T
A/2