Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 126,154 (bp)   Positions: 389
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.004
.006
.0
.018
.005
.038
--
--
.005
--
--
--
.081
.006
.161
.606
.594
.01
.003
.805
.15
.004
.188
.003
.019
.002
.003
.025
.013
.003
.228
.206
.002
.232
.038
.004
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
.009
.135
.001
.0
.061
.0
.249
.001
.004
.003
.084
.091
.0
.0
.178
.133
.114
.004
.011
.002
.0
.004
.0
.108
.003
.003
.001
.002
.016
.011
.045
.0
--
.121
.0
.001
.027
.0
.979
.0
.0
.107
.002
.289
--
--
--
.005
.11
.0
.007
.0
.37
.999
.001
.0
.01
.003
.0
.002
.001
1.0
.945
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.006
.018
.018
.013
.046
.0
.957
.003
.018
.019
.087
.002
.457
.084
.478
.042
.041
.138
--
--
.087
.419
--
.069
.056
.054
.256
.034
.003
.007
.019
.022
.0
.071
.003
.001
.883
.002
.007
--
.39
.005
.0
.001
.35
.034
.0
.0
.0
.037
.326
.003
.001
.0
.112
.0
.0
.002
.001
.084
.043
.0
.004
.003
.001
.014
.005
.009
.003
.017
.007
.001
.005
.026
.007
.974
.996
.006
.001
.001
.021
.007
.044
.645
.007
.001
.038
.017
.01
.016
.096
.185
.02
.004
.251
.009
.018
.018
.003
.001
.002
.023
.0
.0
.002
.0
.0
.0
.001
.005
.003
.001
.012
.004
.106
--
--
--
.407
.48
.49
.327
.008
.339
--
--
.059
.024
.005
.002
.004
.003
.045
.023
.001
.001
.008
.003
.001
.077
.257
.249
--
.073
.057
.006
.988
.923
.067
.001
.002
.101
.001
.064
.002
.0
.016
.0
.0
.0
.001
.004
.009
.107
.003
.419
.004
.406
.018
.766
.653
.001
.0
.001
.003
.0
.718
--
.0
.53
--
--
--
.744
.0
.002
.001
.006
.001
.104
.131
.001
--
--
--
.002
.0
.831
.993
.926
.981
.284
.014
.088
.489
.0
.008
.008
.0
.157
.157
.002
.001
.0
.003
.28
.209
.016
.0
.003
.023
.015
.02
.002
.008
.598
.586
.66
.651
.04
.009
.02
--
--
--
.299
.297
.264
--
--
--
--
--
--
.011
.006
.049
.0
.045
.001
.003
.002
.0
.143
.0
.0
.005
.011
.001
.004
.002
.017
.015
.0
.15
.003
.86
.001
.024
.0
.0
.032
.0
.001
.021
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
Sptb
G
C
T
C
G
T
4
2
3
C
16
24
C
T
G
A
C
G
T
T
A
G
T
G
G
A
C
T
A
A
C
A
C
G
T
A
A
C
A
C
C
G
T
T
4
G
C
A
G
A
A
A
2
T
T
2
T
G
T
G
A
C
2
A
A
G
T
C
G
C
T
T
C
T
3
T
A
C
T
G
C
C
C
C
G
C
C
A
T
T
3
2
G
C
A
A
G
C
T
G
G
G
T
G
G
C
G
T
T
C
G
A
C
A
T
G
8
A
A
T
G
T
2
A
T
C
2
116
C
T
T
C
A
C
T
A
T
A
A
C
C
G
T
26
C
A
G
6
A
A
G
G
T
C
T
4
G
A
T
G
T
G
T
T
G
G
C
C
C
T
A
C
G
T
A
C
G
A
T
G
C
G
4
C
T
C
T
2
T
T
A
C
G
C
A
C
T
G
G
T
C
A
A
C
A
A
G
A
G
G
G
C
C
G
C
G
T
A
C
T
G
T
A
C
G
A
G
A
C
T
C
C
C
2
G
G
G
3
A
G
A
G
A
C
7
C
A
G
A
T
G
T
C
C
G
G
C
T
C
A
G
C
T
A
A
G
A
A
G
A
T
T
A
T
C
G
G
G
G
A
G
A
G
C
T
3
2
G
A
7
C
14
T
A
T
T
A
T
A
A
A
C
A
C
G
G
C
A
9
A
G
G
A
G
G
14
25
G
G
A
C
T
T
C
15
A
T
T
C
C
A
T
T
T
G
G
4
A
A
C
C
G
A
G
T
112
C
T
7
G
6
4
14
G
A
T
T
A
T
G
C
A
A
T
C
A
T
C
G
A
G
T
C
4
C
G
T
T
C
A
G
T
G
A
A
G
4
3
C
  109,056,056
  109,056,727
  109,056,768
  109,056,970
  109,057,808
  109,058,987
  109,059,210
  109,059,244
  109,059,257
  109,059,543
  109,059,701
  109,059,769
  109,059,865
  109,060,431
  109,060,471
  109,060,639
  109,060,987
  109,061,058
  109,061,107
  109,061,163
  109,061,442
  109,061,709
  109,061,764
  109,061,787
  109,061,941
  109,061,955
  109,062,020
  109,063,059
  109,063,529
  109,063,613
  109,063,872
  109,063,900
  109,064,213
  109,064,289
  109,065,701
  109,066,673
  109,066,750
  109,066,792
  109,067,319
  109,067,515
  109,067,639
  109,067,773
  109,067,812
  109,067,813
  109,067,977
  109,067,997
  109,068,019
  109,068,202
  109,068,397
  109,069,469
  109,072,207
  109,072,326
  109,072,364
  109,072,373
  109,074,855
  109,074,897
  109,074,898
  109,075,312
  109,075,347
  109,076,572
  109,076,586
  109,076,590
  109,076,616
  109,076,787
  109,077,011
  109,077,452
  109,077,463
  109,078,381
  109,079,080
  109,079,881
  109,079,886
  109,080,349
  109,080,371
  109,080,438
  109,080,441
  109,081,114
  109,081,265
  109,082,430
  109,082,455
  109,082,774
  109,083,029
  109,083,098
  109,083,509
  109,083,865
  109,083,949
  109,084,255
  109,084,623
  109,085,624
  109,088,611
  109,090,264
  109,090,452
  109,090,453
  109,091,098
  109,091,837
  109,093,744
  109,094,352
  109,094,731
  109,095,343
  109,096,500
  109,097,172
  109,097,786
  109,098,460
  109,098,886
  109,099,153
  109,100,603
  109,100,679
  109,101,077
  109,102,005
  109,102,212
  109,102,409
  109,102,560
  109,104,698
  109,104,705
  109,104,983
  109,105,394
  109,105,516
  109,105,543
  109,105,628
  109,105,927
  109,106,095
  109,106,541
  109,107,537
  109,108,722
  109,108,723
  109,110,315
  109,110,551
  109,110,682
  109,111,533
  109,111,716
  109,111,818
  109,112,248
  109,112,525
  109,112,752
  109,112,795
  109,113,118
  109,113,321
  109,114,026
  109,114,103
  109,114,104
  109,114,105
  109,114,188
  109,114,413
  109,114,888
  109,114,997
  109,115,122
  109,115,170
  109,115,346
  109,115,436
  109,115,481
  109,115,546
  109,115,785
  109,116,322
  109,116,356
  109,116,526
  109,116,582
  109,116,631
  109,116,638
  109,116,658
  109,117,326
  109,117,469
  109,117,477
  109,117,481
  109,117,484
  109,117,491
  109,117,497
  109,117,502
  109,117,509
  109,117,519
  109,117,812
  109,118,120
  109,118,123
  109,119,551
  109,120,088
  109,120,409
  109,120,448
  109,120,496
  109,121,017
  109,121,039
  109,121,237
  109,121,435
  109,122,189
  109,122,373
  109,122,441
  109,122,578
  109,123,032
  109,123,152
  109,123,857
  109,123,896
  109,123,914
  109,124,778
  109,124,872
  109,126,442
  109,127,534
  109,127,570
  109,128,298
  109,128,372
  109,131,281
  109,131,638
  109,131,856
  109,132,319
  109,132,451
  109,132,591
  109,132,990
  109,133,235
  109,133,448
  109,133,566
  109,133,624
  109,133,644
  109,134,009
  109,134,304
  109,134,552
  109,134,563
  109,134,811
  109,135,200
  109,135,204
  109,135,403
  109,135,610
  109,135,786
  109,135,902
  109,135,990
  109,135,991
  109,136,033
  109,136,079
  109,136,298
  109,136,300
  109,136,435
  109,136,587
  109,136,679
  109,136,942
  109,137,192
  109,137,284
  109,137,288
  109,137,449
  109,137,478
  109,137,480
  109,137,499
  109,137,618
  109,138,019
  109,138,079
  109,138,351
  109,138,672
  109,138,781
  109,138,830
  109,138,843
  109,138,847
  109,138,913
  109,138,987
  109,139,113
  109,139,366
  109,139,369
  109,139,802
  109,139,889
  109,140,475
  109,140,501
  109,140,632
  109,140,633
  109,140,678
  109,141,201
  109,141,856
  109,141,982
  109,142,090
  109,142,121
  109,142,891
  109,142,957
  109,143,185
  109,143,216
  109,143,308
  109,143,374
  109,143,588
  109,143,599
  109,143,603
  109,143,691
  109,143,988
  109,144,008
  109,144,294
  109,144,473
  109,144,757
  109,144,924
  109,145,083
  109,146,939
  109,147,748
  109,147,871
  109,148,775
  109,149,333
  109,150,040
  109,150,656
  109,150,657
  109,152,885
  109,154,280
  109,154,649
  109,155,460
  109,155,664
  109,155,856
  109,156,130
  109,156,806
  109,156,818
  109,157,257
  109,158,896
  109,159,170
  109,159,469
  109,159,756
  109,160,924
  109,161,417
  109,161,718
  109,161,985
  109,164,162
  109,164,845
  109,165,095
  109,165,213
  109,165,533
  109,165,605
  109,165,724
  109,165,740
  109,165,784
  109,165,879
  109,165,918
  109,165,957
  109,166,517
  109,166,620
  109,166,760
  109,167,563
  109,167,687
  109,167,752
  109,168,430
  109,168,432
  109,168,619
  109,168,642
  109,168,700
  109,168,899
  109,169,245
  109,169,328
  109,169,385
  109,169,471
  109,169,645
  109,169,692
  109,169,939
  109,170,010
  109,170,049
  109,170,055
  109,170,332
  109,170,333
  109,171,161
  109,171,167
  109,171,815
  109,171,870
  109,172,019
  109,172,141
  109,172,226
  109,172,228
  109,172,438
  109,173,286
  109,173,288
  109,173,332
  109,173,363
  109,173,409
  109,173,412
  109,173,415
  109,173,417
  109,173,728
  109,173,938
  109,174,120
  109,174,454
  109,175,348
  109,175,475
  109,175,501
  109,175,621
  109,176,101
  109,176,477
  109,176,673
  109,176,783
  109,177,047
  109,177,183
  109,177,431
  109,177,824
  109,178,071
  109,178,595
  109,178,684
  109,179,271
  109,179,364
  109,179,367
  109,179,495
  109,179,947
  109,180,527
  109,180,687
  109,180,688
  109,180,701
  109,180,755
  109,180,756
  109,180,765
A
T
C
T
T
C
-
-
-
2
-
-
G
C
11/9
-
T
A
C
C
A/2
C
C
A
A
G
G
C
G
T
T
27
T
A
C
G
G
G
T
6
T
-
C
C
-
2
G
G
2
G
G
7/9
-
A
C
2/-
T/-
A
11
4
C
-
-
G
G
A
C
T
A
11
A
A
A
-
-
C
G
-
-
A
G
T
T
T
A
T
T
G
G
9
3/-
2/-
-
7
G
C
A
T
C
A
T
A
C
A
A
A
A
G
C
-
A
G
T
G
C
A
8/-
G
G
C
A
C
-
A/-
G
T
-
-
T
C
C
A
G
3
C
G
2
T
T
T
T
A
-
-
T
G
A
6/-
G
G
A
A
C
T
3
-
3
G
C
-
-
-
A
-
-
-
-
-
T
3
G
T
A
C
12
T
A
G
C
T
T
A
-
A
G
A
3
-
2
C
G
T
2
T
5
T
C
C
C
-
T
G
2
A
G
G
T
T
T
A
A
T
G
-
T
A
C
C
T
G
C
C
G
-
A
40
A
G
T
C
-
A
T
-
T
2
A
-
3
A
T
C
T
-
-
T
C
2
C
A
C
C
A
T
G/2
G/16
T
C
A
G
A
A
G
G
3
A
G
T
A
G
C
C
T
C
T
A
A
A
A
G
A
G
G/2
T
G
3/-
2/-
A
T
-
9
-
2
G
-
A
C
C
G
5
G
G
G
T
T
A
A
T
-
G
C
A
G
C
C
-
-
A
A
G
T
C
C
-/17
15/-
G
C
C
C/51
A
5
A
C
C
A
A
-
3
7
A
G
A
G
A
C
-
T
C
-
13
6/-
-
-
3
3
C
A
7
-
C
T
G
G
G
T
G
C
T
A
C
T
C
G
-
T
9
C
C
T
C
A
C
A
G
C
T
4/-
-
A