Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 79,698 (bp)   Positions: 541
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.953
.306
.001
.0
.936
1.0
1.0
1.0
.968
.765
1.0
.017
.015
.008
.016
.003
.007
.008
.878
.007
.0
.001
.002
1.0
.127
.018
.034
.025
.325
--
.023
.004
.856
.11
.006
.101
.015
.006
.045
.007
.003
.006
.011
.04
.964
.0
.002
.0
.013
.055
.002
.041
--
--
--
--
.023
.007
.0
.002
.182
.015
.014
.003
.007
.0
.008
.005
.003
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.067
.002
.018
.002
.014
.0
.0
.0
.0
.006
.014
.653
.749
.004
.011
.02
.002
.001
.001
.0
.001
.158
.013
.0
.502
.001
.005
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.01
.124
.004
.0
.0
.036
.0
.013
.003
.009
.001
.007
.545
.001
.001
.0
.942
1.0
.244
.001
--
--
.001
.001
.964
.998
.506
.001
.0
.0
.008
1.0
.975
.824
.922
.0
.001
.001
.005
.0
.069
.003
.046
.0
.008
.002
.001
.01
.008
.003
.013
.003
.019
.003
.066
.948
.987
.968
.978
.004
.007
.159
.001
.0
.001
.0
.221
.0
.006
.027
.37
.158
.015
.0
.0
.002
.039
.002
.219
.0
.0
.0
.038
.001
.004
.001
.0
.037
.278
.0
.0
.004
.005
.0
.001
.243
.084
.003
.001
.0
.001
.005
.001
.001
.005
.001
.753
.006
.001
.026
.064
.108
.001
.002
.128
.013
.008
.004
.005
.0
.0
.015
.01
.0
.007
.0
.001
.007
.058
.197
.012
.001
.135
1.0
1.0
.002
.001
.0
.002
.524
.898
.022
.016
.015
.019
.021
.046
.135
.555
.59
.561
.0
.004
.002
.001
.001
.0
.001
.0
.002
.0
.0
.001
.11
.001
.298
.001
.0
.005
.003
.014
.034
.0
.188
.735
.0
.015
.0
.627
.026
.215
.006
.556
.159
.021
.006
.014
.161
.01
.009
.089
.017
.572
.049
.008
.0
.001
.0
.006
.002
.0
.0
.004
.07
.006
.008
.568
.005
.001
.0
.001
.001
.001
.039
.0
.074
.068
.013
.194
.006
.005
.027
.02
.022
.021
.0
.001
.018
.0
.0
.0
.003
.001
.002
.005
.476
.029
.001
.0
.801
.014
.0
.0
.0
.0
.001
.003
.001
.001
.004
.001
.001
.005
.0
.001
.002
.002
.042
.178
.001
.0
.0
.001
.235
.042
.01
.047
.085
.113
.046
.0
.001
.001
.001
.025
.01
.111
.077
.054
.002
.028
.001
.0
.055
.0
.0
.002
.0
.002
.019
.0
.0
.003
.002
.002
.0
.0
.001
.003
.009
.115
.003
.0
.0
.0
.0
.002
.0
.0
.011
.007
.001
.001
.001
.0
.043
.009
.002
.004
.001
.004
.007
.001
.004
.026
.003
.204
.016
.001
.004
.001
.003
.003
.007
.031
.392
.029
.157
.036
.046
.207
.21
.202
.196
.188
.179
.167
.007
.03
.264
.228
.431
.06
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.018
.099
.113
.008
.028
.046
.035
.007
.132
.109
.001
.019
--
--
--
.096
.049
.085
.173
.18
.195
.204
.179
.07
.614
.342
.003
.007
.05
.001
.014
.017
.016
.158
.067
.998
.985
.823
.002
.011
.003
.0
.001
.063
.173
.013
.001
.001
.0
.0
.009
.002
.001
.0
.0
1.0
.0
.0
.001
.0
.011
.006
.012
.257
.256
.0
.0
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
Scn9a
C
T
C
T
A
A
A
G
A
A
C
A
C
G
C
T
G
C
G
A
A
C
T
G
A
C
A
A
G
2
C
C
A
A
T
C
G
C
A
A
4
4
A
A
G
G
A
C
C
A
G
G
A
A
T
A
A
G
T
6
C
T
A
T
T
A
T
T
A
T
T
A
G
G
G
A
C
T
T
G
T
C
A
T
A
A
T
C
C
C
C
C
C
C
G
G
G
A
A
C
T
A
G
T
A
T
A
A
T
A
A
T
A
T
T
C
G
T
C
A
C
G
T
2
G
A
T
T
A
C
A
C
2
T
C
A
A
C
C
T
C
C
C
A
A
A
T
A
G
A
T
A
C
G
T
A
8
3
4
5
C
T
T
G
T
4
T
T
G
T
G
C
A
C
G
3
T
A
A
A
G
G
T
G
G
T
2
A
T
G
G
A
G
C
A
T
G
C
T
A
G
A
C
C
G
T
C
C
T
C
A
C
T
C
T
G
G
T
C
G
A
T
T
C
A
T
T
T
C
T
G
C
G
C
G
T
10
G
C
A
A
C
C
A
T
C
T
14
A
T
T
C
A
T
G
G
G
G
C
T
T
A
G
G
T
T
A
G
T
T
G
G
T
C
C
C
A
T
16
T
T
G
A
G
C
G
C
A
2
T
A
A
G
G
C
C
A
A
A
T
T
C
C
T
C
T
C
C
G
C
A
T
G
C
T
C
T
C
C
A
C
A
T
G
T
T
T
A
C
C
T
G
G
C
6
G
C
G
T
T
T
G
G
G
A
T
A
G
A
G
G
T
T
T
G
G
G
A
C
T
A
G
T
A
A
C
G
G
C
C
C
G
A
G
C
A
A
T
T
C
T
G
G
T
T
C
A
A
G
A
A
T
T
A
A
G
C
T
C
G
G
A
T
T
A
G
G
C
T
T
G
G
G
T
G
A
T
A
G
A
C
G
G
A
G
T
G
T
T
C
G
T
G
G
C
C
C
C
T
G
A
A
A
T
C
C
T
A
C
T
T
T
T
T
T
T
G
C
A
G
A
T
C
A
C
3
C
G
T
C
T
C
C
T
A
A
T
C
4
A
G
C
T
G
A
C
T
T
G
G
T
G
10
2
2
2
2
G
G
C
C
T
G
C
A
A
C
A
G
A
A
T
C
C
C
T
C
T
C
A
G
A
G
G
A
T
C
C
8
C
A
G
A
T
A
A
T
T
C
A
T
  59,207,530
  59,208,845
  59,210,381
  59,210,388
  59,211,163
  59,211,274
  59,211,277
  59,211,355
  59,211,427
  59,211,430
  59,211,475
  59,212,002
  59,212,248
  59,212,251
  59,212,286
  59,212,805
  59,212,808
  59,212,993
  59,214,707
  59,217,436
  59,219,608
  59,219,779
  59,220,653
  59,221,043
  59,221,099
  59,223,819
  59,224,534
  59,225,213
  59,225,708
  59,225,920
  59,226,926
  59,227,389
  59,229,412
  59,230,290
  59,230,446
  59,230,484
  59,230,538
  59,230,698
  59,230,703
  59,231,215
  59,231,343
  59,231,348
  59,231,869
  59,231,879
  59,231,933
  59,232,950
  59,232,977
  59,233,002
  59,233,775
  59,234,313
  59,234,484
  59,234,599
  59,234,718
  59,234,949
  59,235,124
  59,235,447
  59,236,165
  59,236,259
  59,236,280
  59,236,282
  59,236,510
  59,236,648
  59,236,698
  59,237,091
  59,237,269
  59,237,369
  59,238,083
  59,238,084
  59,238,096
  59,238,179
  59,238,187
  59,238,313
  59,238,612
  59,238,618
  59,238,631
  59,238,681
  59,238,783
  59,238,894
  59,238,967
  59,239,048
  59,239,254
  59,239,370
  59,239,411
  59,239,586
  59,239,607
  59,239,765
  59,239,890
  59,240,490
  59,240,495
  59,240,629
  59,240,656
  59,240,719
  59,240,778
  59,240,793
  59,241,138
  59,241,482
  59,241,534
  59,241,561
  59,241,641
  59,241,731
  59,241,806
  59,241,831
  59,241,966
  59,242,184
  59,242,346
  59,242,352
  59,243,082
  59,243,680
  59,243,716
  59,244,109
  59,244,302
  59,244,390
  59,244,570
  59,244,576
  59,244,687
  59,244,761
  59,244,864
  59,244,958
  59,245,237
  59,245,382
  59,245,633
  59,245,649
  59,245,956
  59,247,341
  59,247,964
  59,248,859
  59,248,952
  59,249,052
  59,249,245
  59,250,620
  59,250,621
  59,251,374
  59,251,389
  59,251,445
  59,251,767
  59,251,835
  59,252,874
  59,252,882
  59,252,885
  59,253,294
  59,253,734
  59,253,773
  59,253,776
  59,254,069
  59,254,100
  59,254,137
  59,254,229
  59,254,271
  59,254,464
  59,254,531
  59,254,563
  59,254,583
  59,254,929
  59,255,074
  59,255,092
  59,255,100
  59,255,159
  59,255,160
  59,255,163
  59,255,166
  59,255,214
  59,255,228
  59,255,240
  59,255,270
  59,255,290
  59,255,301
  59,255,304
  59,255,352
  59,255,608
  59,255,609
  59,255,724
  59,255,839
  59,256,226
  59,256,278
  59,256,519
  59,256,787
  59,256,909
  59,257,061
  59,257,190
  59,257,242
  59,257,276
  59,257,322
  59,257,385
  59,257,420
  59,257,436
  59,257,535
  59,257,542
  59,257,692
  59,257,917
  59,257,920
  59,258,014
  59,258,074
  59,258,158
  59,258,169
  59,258,200
  59,258,372
  59,258,413
  59,258,454
  59,258,709
  59,258,740
  59,258,751
  59,258,765
  59,258,776
  59,258,883
  59,258,903
  59,258,905
  59,258,935
  59,258,989
  59,258,992
  59,259,014
  59,259,026
  59,259,057
  59,259,115
  59,259,123
  59,259,140
  59,259,161
  59,259,178
  59,259,208
  59,259,248
  59,259,259
  59,259,332
  59,259,387
  59,259,448
  59,259,456
  59,259,472
  59,259,530
  59,259,533
  59,259,536
  59,259,577
  59,259,685
  59,259,701
  59,259,734
  59,259,746
  59,259,823
  59,259,855
  59,259,962
  59,260,154
  59,260,201
  59,260,330
  59,260,418
  59,260,433
  59,260,465
  59,260,858
  59,260,900
  59,260,982
  59,260,990
  59,260,992
  59,261,092
  59,261,219
  59,261,224
  59,261,281
  59,261,305
  59,261,316
  59,261,320
  59,261,321
  59,261,322
  59,261,325
  59,261,343
  59,261,345
  59,261,363
  59,261,389
  59,261,401
  59,261,412
  59,261,439
  59,261,465
  59,261,474
  59,261,490
  59,261,500
  59,261,503
  59,261,632
  59,261,634
  59,261,639
  59,261,663
  59,261,701
  59,261,773
  59,261,879
  59,261,920
  59,261,963
  59,262,641
  59,262,722
  59,262,786
  59,263,022
  59,263,148
  59,263,355
  59,263,431
  59,263,481
  59,263,931
  59,264,123
  59,264,486
  59,264,701
  59,264,786
  59,265,079
  59,265,189
  59,265,203
  59,265,229
  59,265,242
  59,265,385
  59,265,464
  59,265,616
  59,265,772
  59,266,122
  59,266,376
  59,266,615
  59,266,703
  59,266,955
  59,266,995
  59,267,054
  59,267,092
  59,267,115
  59,267,130
  59,267,133
  59,267,178
  59,267,204
  59,267,220
  59,267,221
  59,267,261
  59,267,310
  59,267,366
  59,267,397
  59,267,406
  59,267,426
  59,267,440
  59,267,462
  59,267,577
  59,267,586
  59,267,609
  59,267,619
  59,267,628
  59,267,653
  59,267,673
  59,267,690
  59,267,700
  59,267,703
  59,267,767
  59,267,778
  59,267,828
  59,267,837
  59,267,964
  59,268,001
  59,268,005
  59,268,030
  59,268,057
  59,268,192
  59,268,194
  59,268,285
  59,268,299
  59,268,490
  59,268,679
  59,268,747
  59,268,994
  59,269,010
  59,269,047
  59,269,049
  59,269,099
  59,269,116
  59,269,140
  59,269,181
  59,269,184
  59,269,186
  59,269,219
  59,269,220
  59,269,249
  59,269,323
  59,269,326
  59,269,328
  59,269,329
  59,269,504
  59,269,507
  59,269,521
  59,269,542
  59,269,737
  59,269,860
  59,269,967
  59,270,283
  59,270,287
  59,270,289
  59,270,295
  59,270,424
  59,270,459
  59,270,570
  59,270,573
  59,270,627
  59,270,803
  59,270,912
  59,270,972
  59,271,068
  59,271,186
  59,271,188
  59,271,204
  59,271,232
  59,271,282
  59,271,466
  59,271,478
  59,271,710
  59,271,719
  59,271,724
  59,271,731
  59,271,756
  59,271,824
  59,272,138
  59,272,140
  59,272,244
  59,272,326
  59,272,460
  59,272,463
  59,272,469
  59,272,695
  59,272,755
  59,272,872
  59,272,910
  59,272,936
  59,272,974
  59,272,979
  59,273,076
  59,273,095
  59,273,171
  59,273,198
  59,273,200
  59,273,219
  59,273,257
  59,273,298
  59,273,421
  59,273,422
  59,273,549
  59,273,569
  59,273,623
  59,273,661
  59,273,776
  59,273,820
  59,273,823
  59,273,841
  59,273,948
  59,273,949
  59,273,960
  59,274,071
  59,274,172
  59,274,198
  59,274,210
  59,274,496
  59,274,497
  59,274,841
  59,274,859
  59,274,881
  59,274,955
  59,275,230
  59,275,284
  59,275,323
  59,275,534
  59,275,570
  59,275,606
  59,275,614
  59,275,626
  59,275,630
  59,275,634
  59,275,638
  59,275,642
  59,276,038
  59,276,045
  59,276,145
  59,276,164
  59,276,491
  59,276,618
  59,276,899
  59,277,291
  59,277,324
  59,277,339
  59,277,354
  59,277,392
  59,277,813
  59,277,922
  59,277,988
  59,278,023
  59,278,095
  59,278,190
  59,278,218
  59,278,320
  59,278,338
  59,278,345
  59,278,353
  59,278,511
  59,278,530
  59,278,545
  59,278,559
  59,278,581
  59,278,651
  59,278,735
  59,278,793
  59,278,803
  59,278,978
  59,279,005
  59,279,011
  59,279,028
  59,279,031
  59,279,039
  59,279,051
  59,279,073
  59,279,097
  59,279,160
  59,279,399
  59,279,490
  59,279,659
  59,279,783
  59,280,155
  59,280,218
  59,280,323
  59,280,845
  59,281,196
  59,281,230
  59,281,895
  59,281,897
  59,281,933
  59,282,026
  59,282,141
  59,282,166
  59,282,203
  59,282,219
  59,282,302
  59,282,328
  59,282,407
  59,282,426
  59,282,455
  59,282,691
  59,282,864
  59,282,907
  59,282,961
  59,282,979
  59,282,981
  59,283,025
  59,283,108
  59,283,360
  59,283,369
  59,283,462
  59,283,531
  59,283,570
  59,284,725
  59,284,937
  59,285,583
  59,285,604
  59,285,777
  59,285,956
  59,286,039
T
C
A
G
A/G
G
G
A
G
G
G
G
C/T
G/T
C/T
C
A
G
G/5
G
A/C
T
C
A
G
2
C
G
A
2/-
3
A
G
G
TC/C
T
A
G
G
T
-
-
A/-
C/AC
-
T
G
T
T
C
A
A
G
G
2
-
C
A
C
-
2
A
G
C
5
G
C
C
G
A
11
G
A
C
A
G
A
C
C
T
G
T
T
C
T
G
C
T
T
T
T
T
A
A
T
A
A
-
G
T
A
G
C
G
3
3
G
7
C
G
G
C
T
C
C
T
T
T/A
C/T
G
T
A
C
2/-
A
G
G
C
G
T
G
C/G
-
C
G
T
C
T
A
C
C/G
C/G
C/T
G
G
C
C
T
T
C
C
2
-
A
C
C
-
3/-
4/-
-
C/T
T/C
T/C
A
C
-
T/-
C
A
G
A
T
G
T
A
-
-
G
G
G
C
-
C
A
A
-
-
T
C
C
A
G
A
G
2
A
T
A
C
G
A
G
T
T
T
A
A
T
C
T
G
T
C
A
C
A
A
G
G
2
G
G
C
A
G
G
-
C
T
G
A
T
T
G
A
-
-
A
-
G
G
G
G
G
C
T
A
-
-
A
C
T
C
C
A
A
A
A
-
5
C
G
A
A
C
C
C
C
3
C
C
T
A
T
T
T
G
G
16/-
C
6
C
G
A
T
A
T
G
-
2
G
G
A
C
A
T
G
G
G
C
G
T
T
C
G
A
T
T
A
T
T
C
T
G
A
T
C
T
T
G
T
C
G
A
A
A
C
T
G
A
C
T
A
T
-
C
T
C
G
A
-
A
C
A
C
C
G
A
C
A
A
G
C
G
A
A
C
T
G
C
G
A
A
6
6
2
A
-
A
7
A
A
G
6
5
-
G
G
9
15
T/C
T
A
C
G
T
G
G
A
T
G
C
G
G
G
A
T
G
T
T
A
G
C
-
2
C
A
G
A
G
A
C
C
A
C
G
-
2
A
G
T
A
T
G
A
C
T
C
C
A
A
C
A
T
A
T
T
T
C
T
C
3
T
C
T
T
A
G
T
T/C
T/C
T/C
T/C
T/C
T/C
T/C
T
T
A/5
C
-
C
T
A/T
A
-
A
C
C
T
G
T
T
C
C
C
A
T
-
G
A
T
C
A
T
T
C
A
C
A
3
G/C
10/-
2/-
2/-
2/-
2/-
G/A
A
T
A
C
T
T
C
C
T
-
A
C
T
C
16
T
T
G
T
C
T
G
A
G
A
T
T
C
T
T
-
T
G
A
T
C
G
T
-
C
T
G
2