Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 192,917 (bp)   Positions: 369
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.004
.035
--
--
.19
.202
.329
.004
.118
.002
.006
.056
.27
--
.0
.0
.024
.036
.001
.974
.0
.011
1.0
--
--
--
--
.022
.639
.014
--
.001
.017
.014
.003
.001
.777
.003
.196
.179
.021
.001
.35
.026
--
--
--
--
--
--
.006
.328
.058
.569
.016
.009
.006
.126
--
.021
.126
--
--
.0
.002
.04
.058
.041
.001
.0
.245
.002
.002
.01
.008
.081
.001
.281
.41
.822
.319
.524
.458
.587
.02
.49
.525
.333
.311
.02
.142
.004
.018
.045
.046
.06
.014
.168
.176
.011
.139
.172
.012
.051
.069
.006
.181
.184
.006
.017
.019
.05
.116
.287
.464
.584
.089
.226
.619
.032
.011
.008
.003
.067
.042
.131
.147
.056
.134
.126
.006
.001
.004
--
--
--
--
--
.007
.001
.042
.011
.029
.054
--
--
.114
.108
.004
.002
.118
.002
.003
.0
.0
.001
.066
.506
.022
.015
.227
.003
.022
.009
.002
.0
.002
.004
.032
.002
.003
.027
.045
.006
.013
.004
.069
.182
.289
.221
.001
.001
.144
.0
.002
.049
.0
.001
.001
.027
.118
.043
--
.001
.14
.574
.52
.42
.014
.0
.012
.147
.095
.052
.029
.012
.039
.058
.001
.0
.0
.004
.046
.053
.418
.019
.037
.012
.076
.072
.063
.042
.006
.005
.024
.061
.013
.037
.132
.36
.04
--
--
--
--
.009
.216
.024
.249
.606
.279
.026
.015
.028
.014
.058
.008
.003
.343
.055
.002
.009
.0
.012
.003
.001
.001
.007
.023
.013
.1
.449
.002
.695
.322
.0
.134
.022
.137
.084
.009
.288
.057
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.998
.749
--
--
.0
.001
.008
.002
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.005
.002
.003
1.0
.044
.007
.004
.07
.025
.003
.764
--
--
--
.012
.053
.002
--
.027
.282
.334
.586
.004
--
.038
.042
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
Rxfp1
C
T
A
3
C
A
A
C
A
C
T
G
G
G
T
C
C
C
C
G
G
C
C
A
T
2
4
G
C
C
4
2
A
C
T
T
A
T
G
G
A
8
G
A
T
14
A
A
A
A
G
T
C
2
8
C
A
49
A
C
T
T
C
T
A
C
A
G
A
C
C
4
C
C
T
G
C
A
2
C
T
G
G
C
C
C
T
C
A
A
T
C
G
A
A
A
T
G
C
G
T
C
T
C
G
T
C
T
A
A
A
T
G
T
T
T
T
T
T
4
T
A
A
C
T
T
C
T
C
C
C
T
A
C
6
3
6
C
3
A
G
G
G
C
6
T
8
A
C
G
C
T
C
C
C
C
A
116
G
T
T
C
G
T
12
A
T
G
C
T
C
G
A
4
T
G
A
T
A
T
G
A
T
G
T
C
C
A
T
A
A
C
T
G
T
G
T
C
C
G
G
C
A
T
C
C
A
T
C
T
T
C
C
G
T
C
G
C
C
T
T
A
G
A
C
A
A
G
C
C
C
C
C
C
A
3
A
A
T
T
T
14
C
A
G
G
A
A
C
T
T
G
C
A
T
A
A
G
C
T
T
T
G
2
20
G
C
15
T
G
C
A
G
T
C
G
T
T
C
A
T
A
C
T
A
C
T
G
T
G
2
C
T
C
A
A
14
12
A
G
C
T
G
A
T
T
G
C
G
C
T
T
T
G
T
A
C
G
C
A
G
G
C
A
C
A
T
G
C
C
A
G
T
G
C
T
A
T
G
C
C
C
T
G
C
G
G
G
A
C
G
C
A
2
T
T
A
A
A
C
T
6
4
C
G
G
C
A
A
  197,737,838
  197,738,454
  197,738,512
  197,738,869
  197,738,871
  197,739,066
  197,739,155
  197,739,174
  197,739,313
  197,739,335
  197,740,071
  197,740,141
  197,740,204
  197,740,492
  197,740,550
  197,740,912
  197,740,987
  197,741,363
  197,741,441
  197,741,462
  197,741,597
  197,741,781
  197,743,636
  197,745,544
  197,746,329
  197,746,364
  197,746,678
  197,747,615
  197,747,650
  197,748,064
  197,748,363
  197,748,924
  197,749,288
  197,749,734
  197,749,788
  197,750,491
  197,751,496
  197,751,571
  197,751,887
  197,752,004
  197,752,005
  197,752,618
  197,753,621
  197,754,500
  197,756,790
  197,758,323
  197,758,760
  197,758,977
  197,760,641
  197,761,986
  197,762,717
  197,763,235
  197,763,916
  197,764,183
  197,764,230
  197,765,025
  197,765,026
  197,765,398
  197,766,229
  197,766,678
  197,767,347
  197,768,218
  197,768,490
  197,770,521
  197,773,131
  197,773,150
  197,773,248
  197,773,249
  197,773,262
  197,773,404
  197,773,414
  197,773,497
  197,773,528
  197,773,650
  197,773,731
  197,773,732
  197,773,814
  197,774,245
  197,774,255
  197,774,285
  197,774,296
  197,774,482
  197,774,538
  197,774,553
  197,774,583
  197,774,729
  197,774,769
  197,774,878
  197,774,883
  197,774,884
  197,774,921
  197,775,010
  197,775,042
  197,775,049
  197,775,074
  197,775,078
  197,775,127
  197,775,158
  197,775,191
  197,775,339
  197,775,368
  197,775,394
  197,775,400
  197,775,431
  197,775,511
  197,775,571
  197,775,654
  197,775,703
  197,775,705
  197,775,829
  197,775,898
  197,775,907
  197,775,937
  197,775,959
  197,776,230
  197,776,301
  197,776,389
  197,776,669
  197,776,689
  197,776,711
  197,776,788
  197,776,888
  197,777,028
  197,777,057
  197,777,080
  197,777,440
  197,777,449
  197,777,455
  197,777,595
  197,777,665
  197,777,799
  197,777,833
  197,777,839
  197,777,954
  197,777,976
  197,777,993
  197,778,010
  197,778,036
  197,778,066
  197,778,093
  197,778,099
  197,778,105
  197,778,183
  197,778,194
  197,778,212
  197,778,251
  197,778,278
  197,778,379
  197,778,380
  197,778,549
  197,778,559
  197,778,609
  197,778,846
  197,779,647
  197,779,669
  197,779,673
  197,779,785
  197,779,911
  197,780,793
  197,780,888
  197,780,942
  197,780,982
  197,781,136
  197,781,627
  197,781,628
  197,781,872
  197,781,902
  197,781,904
  197,781,956
  197,781,982
  197,782,009
  197,782,052
  197,783,869
  197,783,899
  197,784,265
  197,785,073
  197,785,144
  197,785,297
  197,785,360
  197,785,401
  197,785,416
  197,785,954
  197,786,385
  197,786,766
  197,786,835
  197,787,085
  197,787,119
  197,787,187
  197,787,237
  197,787,242
  197,788,085
  197,788,286
  197,788,398
  197,788,405
  197,788,602
  197,789,537
  197,789,945
  197,789,951
  197,790,309
  197,790,399
  197,790,513
  197,790,848
  197,791,526
  197,791,528
  197,791,645
  197,791,835
  197,791,930
  197,791,951
  197,791,953
  197,792,118
  197,792,133
  197,792,134
  197,792,172
  197,792,192
  197,792,681
  197,792,787
  197,792,826
  197,792,859
  197,793,060
  197,793,084
  197,793,120
  197,793,123
  197,793,139
  197,793,159
  197,793,160
  197,793,441
  197,794,548
  197,794,615
  197,794,627
  197,794,812
  197,795,060
  197,795,202
  197,795,370
  197,795,380
  197,795,410
  197,795,415
  197,795,597
  197,796,078
  197,796,379
  197,796,516
  197,796,543
  197,796,546
  197,797,602
  197,797,605
  197,797,841
  197,798,380
  197,798,712
  197,799,023
  197,799,200
  197,799,592
  197,799,772
  197,800,556
  197,800,749
  197,800,754
  197,800,975
  197,801,014
  197,801,177
  197,801,432
  197,801,481
  197,801,532
  197,801,618
  197,801,790
  197,801,983
  197,802,042
  197,802,146
  197,802,531
  197,802,593
  197,802,764
  197,802,779
  197,803,020
  197,803,114
  197,803,143
  197,803,214
  197,803,424
  197,803,599
  197,803,887
  197,803,902
  197,803,923
  197,804,016
  197,804,076
  197,804,232
  197,804,291
  197,804,426
  197,804,435
  197,804,549
  197,804,605
  197,804,654
  197,804,657
  197,804,853
  197,805,199
  197,805,436
  197,805,476
  197,805,501
  197,805,513
  197,805,815
  197,805,960
  197,806,281
  197,806,283
  197,806,593
  197,806,656
  197,806,751
  197,806,776
  197,806,788
  197,806,909
  197,807,028
  197,807,037
  197,807,902
  197,808,017
  197,808,542
  197,808,761
  197,809,194
  197,809,466
  197,809,543
  197,809,704
  197,809,907
  197,809,927
  197,809,982
  197,810,087
  197,810,299
  197,810,660
  197,811,072
  197,811,313
  197,811,491
  197,811,557
  197,812,092
  197,812,191
  197,812,279
  197,812,624
  197,812,706
  197,812,766
  197,812,910
  197,812,977
  197,813,007
  197,813,068
  197,813,080
  197,813,129
  197,813,395
  197,813,570
  197,813,746
  197,813,795
  197,813,796
  197,814,064
  197,814,071
  197,814,086
  197,814,094
  197,814,179
  197,815,058
  197,815,488
  197,815,616
  197,815,978
  197,816,572
  197,816,799
  197,817,053
  197,817,247
  197,817,252
  197,818,143
  197,818,370
  197,818,735
  197,819,325
  197,821,371
  197,825,038
  197,830,583
  197,830,585
  197,833,141
  197,898,611
  197,923,495
  197,930,181
  197,930,186
  197,930,429
T
C
T
-
3
G
G
T
G
A
C
T
A
11/13
-
T
T
6/4
T
A
A
T
13
T
2
-
-
2
101
T
-
-
G
T
-
A
G
-
T
A
T
-
A
G
-
14/-
13
G
G
G
T
C
C/5
-
-
3
G
-
2
A
5
C
2
C
C
T
-
C
G
T
T
-
T
G
C
A
A
-
-
A
2
A
T
A
T
T
C
3
T
C
A
T
A
G
G
G
C
A
A
T
C
T
C
T
2
C
T
A
G
G
T
C
A
4
G
-
A
3
G
-
G
G
T
G
C
C
T
G
2
T
A
C
G
T
-
-
-
T
-
T
A
9/5
A
T
-
C
-
C
T
C
A
A
T
T
T
T
C
-
A
C
C
T
A
T/5
12/-
C
C
A
C/A
T/9
T
A
2
-
-
A
C
G
G
C
C
G
A
A
A
T
T
G
C
G
G
T
C
A
C
T
27
T
T
5
A
T
G
2
T
T
C
C
A
G
C
T
T
C
G
G
A
T
T
C
C
2
A
2
G
G
-
A
A
T
T
T
G
G
A/3
3/-
C
-
C
G
-
-
T
G
A
A
G
G
T
C
C
C
T
G
C
G
G
T
T
C
A
C
A
-
-
T
T
-
G
A
T
G
A
C
T
A
C
A
T
G
2
G
T
C
T
T
C
A
C
A
-
T
C
T
T
-
-
12/-
G
A
T
C
T
2
C
C
G/T
C/-
2
T
C
G
C
A
-
G
T
C
T
-
A
A
2
G
T
G
C
T
A
T
T
T
C
A
T
C
C
16
A
G
T
G
C
C
T
A
15
A
2
T
A
T
-
-
C
C
T
3
6
T
C
-
4/-
2
A
2
T
G
9