Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 107,756 (bp)   Positions: 242
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.083
.006
.066
.118
.553
.846
--
--
--
--
--
.196
.2
.788
.001
.006
.009
.383
.054
.022
--
--
.107
--
--
--
--
--
--
--
.018
.0
.0
.258
.618
.101
.023
.0
.0
.0
.003
.002
.328
.061
.725
.712
.005
.017
.032
.042
.312
.015
.042
.133
--
.093
.019
--
--
--
.035
.163
.435
.593
.086
.181
.019
--
--
.048
.104
.446
.43
.434
--
--
--
--
--
.812
--
--
.45
.062
.009
--
.002
.002
.023
.005
.028
.0
.121
.24
.067
.107
.035
.08
.013
--
--
.033
--
.08
.064
--
.031
.037
.006
.006
.751
.002
.495
--
--
--
--
.035
.529
--
.0
.03
.008
.026
.055
.0
.174
.025
.145
.039
.074
.002
.134
.019
.913
.029
.011
--
.662
.773
.112
.018
.554
.001
.001
.011
.071
.057
.038
.239
.117
1.0
.016
.002
.002
--
--
--
.002
.315
.001
.056
.036
.012
.013
.051
.021
.008
.003
.063
.001
.669
.049
.052
.052
.051
.06
.011
.004
.004
.005
.017
.026
--
.011
.0
.021
--
.927
.174
.006
--
--
--
.0
.0
.0
.0
.014
.011
.002
.006
.003
.003
.016
.026
.085
.202
.279
.07
.095
.869
.005
1.0
.008
.003
.54
.058
.022
.999
.999
.996
.991
.04
.001
.02
.021
--
--
--
--
--
--
--
.004
.992
.003
.155
.004
.0
.001
.006
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
A
T
T
T
C
C
C
2
C
G
4
2
A
T
T
G
G
2
T
T
C
T
G
C
A
A
T
T
T
T
C
T
C
A
G
G
T
C
T
A
G
C
G
2
A
C
C
C
C
T
G
4
8
A
3
A
G
3
C
A
G
A
16
A
T
C
C
C
C
G
A
A
G
C
G
4
4
4
2
7
A
C
A
C
G
4
C
T
2
C
T
G
C
T
A
A
C
A
T
2
2
2
G
A
A
T
G
T
G
4
A
A
T
G
C
C
A
G
C
A
T
C
C
T
G
T
C
T
G
A
A
T
A
4
A
A
C
T
T
T
C
T
A
C
T
A
T
A
6
A
T
C
A
G
G
C
T
A
G
T
A
T
C
A
C
G
T
G
A
G
A
A
A
A
C
G
T
A
2
C
C
A
A
T
T
4
T
G
C
T
G
C
G
G
A
A
T
T
A
C
G
2
A
C
C
T
C
G
G
G
T
G
T
2
A
T
G
T
A
T
C
T
T
G
2
A
G
9
G
T
5
G
G
A
T
T
T
T
A
A
G
  129,477,424
  129,477,512
  129,480,942
  129,481,386
  129,482,220
  129,483,106
  129,483,361
  129,483,397
  129,483,406
  129,483,407
  129,483,431
  129,483,664
  129,483,666
  129,484,045
  129,484,230
  129,485,156
  129,486,170
  129,486,851
  129,487,894
  129,487,895
  129,488,858
  129,489,273
  129,490,649
  129,491,126
  129,491,311
  129,491,370
  129,491,497
  129,491,885
  129,491,903
  129,491,983
  129,492,874
  129,493,050
  129,493,061
  129,493,320
  129,493,546
  129,494,032
  129,494,583
  129,495,146
  129,495,159
  129,495,171
  129,495,578
  129,497,492
  129,497,931
  129,498,411
  129,498,798
  129,498,799
  129,499,341
  129,499,345
  129,499,349
  129,499,353
  129,503,559
  129,503,712
  129,503,716
  129,503,721
  129,504,031
  129,504,536
  129,506,513
  129,506,630
  129,506,641
  129,506,878
  129,506,896
  129,507,061
  129,507,495
  129,508,063
  129,508,629
  129,508,788
  129,508,844
  129,509,524
  129,509,528
  129,509,742
  129,510,058
  129,510,397
  129,510,841
  129,510,848
  129,511,441
  129,511,876
  129,512,129
  129,512,244
  129,512,274
  129,512,815
  129,513,257
  129,513,298
  129,514,116
  129,514,138
  129,514,252
  129,515,392
  129,515,916
  129,515,976
  129,515,987
  129,516,757
  129,516,771
  129,516,793
  129,517,181
  129,517,182
  129,517,395
  129,517,398
  129,517,921
  129,518,475
  129,519,142
  129,519,165
  129,519,171
  129,519,361
  129,519,564
  129,519,859
  129,519,923
  129,520,753
  129,521,426
  129,522,640
  129,522,693
  129,523,971
  129,526,765
  129,527,167
  129,527,328
  129,527,576
  129,527,606
  129,527,619
  129,527,637
  129,527,802
  129,527,937
  129,528,130
  129,529,772
  129,529,842
  129,531,345
  129,531,569
  129,531,780
  129,532,659
  129,532,752
  129,533,630
  129,534,686
  129,534,811
  129,535,103
  129,535,781
  129,536,350
  129,536,370
  129,536,773
  129,537,488
  129,537,763
  129,537,896
  129,538,318
  129,538,401
  129,538,439
  129,538,569
  129,539,253
  129,539,797
  129,539,803
  129,539,991
  129,540,403
  129,540,598
  129,540,656
  129,540,908
  129,540,988
  129,541,215
  129,542,412
  129,543,319
  129,543,915
  129,544,432
  129,544,445
  129,544,459
  129,544,680
  129,545,913
  129,546,074
  129,546,659
  129,547,284
  129,547,390
  129,547,654
  129,548,313
  129,550,269
  129,550,277
  129,550,281
  129,550,850
  129,550,984
  129,551,593
  129,551,924
  129,551,988
  129,552,103
  129,552,106
  129,552,138
  129,552,392
  129,552,780
  129,552,781
  129,552,782
  129,553,426
  129,553,748
  129,555,244
  129,556,170
  129,557,582
  129,557,773
  129,559,409
  129,559,814
  129,560,853
  129,560,934
  129,562,457
  129,562,507
  129,562,889
  129,564,149
  129,564,588
  129,564,667
  129,565,375
  129,567,987
  129,568,591
  129,568,765
  129,569,215
  129,570,231
  129,570,232
  129,570,247
  129,570,265
  129,570,285
  129,570,289
  129,570,293
  129,570,311
  129,570,355
  129,570,388
  129,570,945
  129,571,241
  129,571,876
  129,571,877
  129,572,517
  129,572,797
  129,573,234
  129,575,155
  129,575,180
  129,575,289
  129,576,184
  129,576,406
  129,576,468
  129,576,556
  129,576,557
  129,576,967
  129,577,099
  129,577,116
  129,577,118
  129,577,129
  129,577,133
  129,577,377
  129,580,051
  129,580,509
  129,580,682
  129,580,804
  129,580,961
  129,581,681
  129,581,843
  129,582,157
G
A/G
C
G
C
6
C/G
C/G
2/-
C/G
G/A
4/-
2/-
G
2
A
A
C
2/-
T/-
-
T
-
A
C/T
A/G
G
T/-
-
C
A
T
G
T
G
C
A
C
T
T/C
G
A
A
A
2/-
-
T
T
T
T
C
G/-
4/-
8/-
3
-
G
2
3/-
3
T
C
G
-
G
C
T
C/A
C/A
G
A
5
T
A
2
A
4/-
-
-
-
7/-
G
T
T
-
2
-
-
G
-
T
C
A
A
C
G
T
T
G
T/G
-
-
-
A
G
G
4/-
A
C
A
-
C
G
C
G/A
C/T
C/T
T
5
T
T
G
T
T
C
A
2
T
9/A
2
G
G
C
2
4/-
G
G
2
-
C
C
T
T/C
G
T
C
G
C
-
-
G
A
T
G
A
3
C/3
C/3
G
A
TG/3
G
3
T
3
A
12
2
T
G
A
G
C
C
G
T
C
C
A/-
2/-
C/-
G
G
G
-
A
-
3/5
A
T
8
A
T
A
A
G
G
C
C
G
T
A
2/-
A/-
C/G
C/G
T/C
C/T
G/A
A
C
T/A
A
C
2/-
A/-
G
A
C
2
C
3/5
C
C
G/5
2/-
-
A
-
G/-
T/3
5/-
3
2
A/G
G
G
C
A
G
G
G/2