Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 1,191,090 (bp)   Positions: 169
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.103
.035
--
--
--
.006
--
.243
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.002
.005
.004
.0
.002
.0
--
.001
.244
.203
.078
--
.002
.062
.781
--
--
--
--
.005
.003
.005
.012
.009
.087
--
.0
.015
.132
.663
.138
.005
.137
.07
.001
.041
.06
.002
.001
--
.032
.063
.017
.148
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.212
.319
.004
.019
.128
.005
.039
.023
--
--
--
.264
--
--
--
--
.001
.101
.056
.014
.018
.01
.263
.066
.007
.129
--
.061
.216
--
.802
.996
1.0
.998
.312
.141
.001
.086
.004
--
--
.083
.007
.33
.015
.001
--
.057
.024
.022
.0
.012
.02
.0
--
.905
.009
.036
.001
.445
.005
.02
.033
.05
.005
.058
.041
.002
.025
.117
.14
.186
.191
.067
.134
.216
--
.002
.894
.623
--
.78
.971
.079
.001
--
.612
--
--
--
.072
.566
.579
.032
.822
.036
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
A
T
A
T
2
A
A
T
G
C
C
A
C
T
G
G
A
T
T
A
G
G
T
G
C
C
G
2
C
G
C
G
3
2
C
T
C
C
G
C
G
T
T
T
A
3
T
A
C
C
2
G
A
G
G
G
G
G
G
2
C
A
T
G
T
C
C
T
C
G
C
A
G
G
C
A
A
A
G
2
G
C
A
A
A
A
C
C
4
T
4
2
4
T
G
C
C
C
A
T
2
2
G
C
A
2
4
A
G
T
G
G
C
A
G
A
4
2
G
C
3
T
T
2
G
G
G
4
2
G
4
A
A
C
G
C
G
3
C
G
A
A
A
C
C
2
2
2
G
T
T
G
G
G
T
C
C
T
T
C
A
T
2
T
2
C
T
  49,693,348
  49,693,429
  49,713,889
  49,713,934
  49,758,807
  49,759,003
  49,788,636
  49,798,020
  49,798,027
  49,802,185
  49,802,224
  49,802,225
  49,802,404
  49,802,409
  49,802,595
  49,802,600
  49,802,601
  49,802,619
  49,802,673
  49,802,724
  49,802,760
  49,802,821
  49,809,055
  49,809,062
  49,809,074
  49,809,079
  49,809,086
  49,822,006
  49,822,018
  49,845,565
  49,854,692
  49,857,924
  49,857,928
  49,887,255
  49,898,242
  49,915,080
  49,921,141
  49,923,155
  49,931,075
  49,931,132
  49,931,304
  49,931,334
  49,946,826
  49,946,828
  49,946,829
  49,946,833
  49,956,288
  49,957,637
  49,959,407
  49,988,608
  49,997,442
  50,007,582
  50,012,919
  50,031,214
  50,051,079
  50,051,120
  50,051,124
  50,051,146
  50,051,154
  50,051,162
  50,051,207
  50,052,608
  50,056,842
  50,068,330
  50,068,346
  50,069,026
  50,074,044
  50,075,398
  50,075,399
  50,075,402
  50,075,466
  50,075,470
  50,078,932
  50,081,114
  50,085,215
  50,085,717
  50,095,509
  50,096,832
  50,096,868
  50,096,952
  50,111,107
  50,122,245
  50,122,725
  50,122,776
  50,159,744
  50,182,133
  50,182,135
  50,187,409
  50,203,333
  50,210,065
  50,213,267
  50,213,305
  50,257,901
  50,257,903
  50,259,335
  50,272,685
  50,279,941
  50,281,005
  50,284,140
  50,297,254
  50,330,323
  50,336,592
  50,350,273
  50,357,016
  50,371,447
  50,371,560
  50,371,571
  50,397,142
  50,417,513
  50,454,394
  50,461,497
  50,468,809
  50,469,600
  50,471,284
  50,479,451
  50,496,309
  50,504,344
  50,505,115
  50,515,082
  50,529,025
  50,530,770
  50,545,730
  50,545,829
  50,545,922
  50,547,111
  50,559,973
  50,583,544
  50,590,254
  50,603,983
  50,617,491
  50,619,780
  50,632,892
  50,634,557
  50,676,086
  50,676,097
  50,676,103
  50,676,109
  50,676,127
  50,678,566
  50,694,184
  50,732,848
  50,739,847
  50,739,898
  50,739,903
  50,739,919
  50,739,922
  50,739,980
  50,752,616
  50,762,159
  50,773,683
  50,781,907
  50,810,144
  50,810,193
  50,813,782
  50,814,450
  50,814,477
  50,829,914
  50,831,692
  50,838,106
  50,838,705
  50,847,152
  50,847,176
  50,847,221
  50,847,531
  50,858,556
  50,858,557
  50,861,281
  50,867,448
  50,872,968
-
G/C
2
3
A/G
T/G
2/-
2
2
T/C
G/A
C/A
C/T
A/T
C/-
T/C
G/A
G/A
A/G
T/C
T/A
A/T
2
-
2
A
A
2
2
-
C/3
-
A
A
-
-
-
T/G
T
2
C
C/2
G/-
T/6
T/G
T/G
3
3/-
T/2
-
C/A
5
2/-
G/T
-
G/C
G/A
C
A
T
T
2/-
C/G
3
2
2
T/G
3
T/CA
12
2
-
-
10
7
G/2
C/A
2
A/-
3
22
2/-
-
-
3
A/G
A/2
A/-
A
C/G
-
T/G
4/-
2/-
4/-
T/C
G/3
C/T
2
C/3
A/C
T/C
2/-
2/-
G/C
C/G
A/G
2/-
4/-
T
T
2
G/A
G/-
C/2
A/C
G/T
5
-
2/-
A
C/G
-
2
T/-
2/-
2
C
-
4/-
2/-
-
4/-
T
T
T
T
-
G/2
3/-
C/T
2
G
T
T
G
2
-
2/-
2/-
G/T
T/3
T/2
-
G/-
-
T/G
-
4
T/G
T/-
C/T
2
T/A
2/-
T/-
2/-
T
2