Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 347,618 (bp)   Positions: 423
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
RGSC 3.4  
.001
.026
.0
.0
.0
.0
.005
.001
.012
.109
.001
.009
.0
.0
.005
.005
.005
.011
.001
.008
.007
.002
.035
.003
.004
.005
.01
.004
.0
.003
.001
.042
.047
.019
.006
.001
.003
.008
.183
.003
.0
.003
.003
.003
.0
.005
.001
.01
.028
.048
.003
.0
.003
.007
.0
.009
.002
.001
.0
.002
.0
.0
.003
.002
.0
.05
.0
.001
.002
.004
.001
.0
.008
.002
.012
.0
.001
.0
.0
--
.374
--
--
--
.0
--
.0
.041
.011
.011
.05
--
.071
.0
.001
.0
.043
.0
.0
.006
.002
.0
.004
.018
.001
.0
.001
.003
.016
--
.004
.003
.032
.002
.013
.0
.001
.225
.006
.003
.0
.002
.004
.002
.0
.0
.002
.001
--
.001
.001
.0
.001
.211
.054
.0
.0
--
--
.0
.002
.003
.0
--
.021
.038
.0
.002
.003
.001
.0
.0
.0
.006
.001
.026
.002
.001
.011
.0
.001
.001
.002
.002
.01
.092
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.002
.002
.008
.0
.002
.0
.001
.011
.001
.156
--
--
--
.19
.123
.002
.003
.016
.004
.001
.0
.0
.066
.0
.004
.008
.003
--
.006
.0
.0
.0
.138
.007
.022
.0
.002
.0
.004
.012
.0
.884
.001
.001
.0
.002
--
--
--
--
--
--
.006
.001
.001
.0
.0
.003
.0
.029
.016
.0
.005
.0
--
--
--
.001
.001
.0
.097
.004
.0
.0
.001
--
.063
.004
.001
.005
.009
.0
.003
.0
.0
.001
.0
.018
.001
.026
.002
.001
.001
.005
.003
.0
.0
--
.0
.035
.0
.0
.006
.093
.001
.0
.001
.014
.0
.186
.742
.115
.0
.116
.0
.0
.007
.006
.001
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
--
.005
.001
1.0
1.0
.085
.014
.001
.0
.004
.004
.001
.0
.004
.005
--
.994
.001
.007
.001
.001
.013
.001
.204
.0
.004
.002
--
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.003
.083
.015
.001
.001
.001
.0
.0
.994
.012
.0
.0
.0
.002
.003
.01
.0
.001
.628
.003
.775
.005
.003
.142
.0
--
.987
.081
--
.014
.003
.001
.0
.978
.001
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.013
.0
.156
.0
.011
.008
.361
.02
.012
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rps27a-ps6
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
G
G
G
A
T
T
A
C
A
G
C
A
C
G
C
T
G
T
A
T
A
C
G
G
A
A
A
C
T
T
C
G
T
G
T
G
A
T
T
C
T
G
G
T
G
A
C
C
G
T
C
G
G
A
T
A
C
A
G
C
C
C
A
T
C
C
C
A
G
A
T
T
C
A
A
C
C
G
A
C
T
G
A
C
T
A
T
G
C
A
C
G
A
T
C
A
A
T
A
C
A
T
A
C
T
T
T
G
G
G
C
T
C
G
A
A
G
G
T
G
C
G
T
C
A
C
A
T
T
G
C
T
A
G
T
G
T
G
C
C
T
G
C
A
A
T
A
G
C
A
T
C
T
C
G
C
G
C
C
T
A
G
T
A
G
T
C
A
G
G
T
G
G
T
A
A
T
C
C
G
A
T
T
G
G
T
T
G
A
G
G
C
A
T
G
C
G
T
C
C
C
C
C
A
C
C
G
G
C
C
A
C
C
G
T
G
A
G
A
G
T
C
G
A
C
C
T
C
C
C
G
A
T
C
T
T
G
A
T
T
C
A
A
G
G
G
C
A
G
C
G
A
A
C
A
A
A
A
A
T
T
C
C
T
A
G
T
A
C
T
G
A
A
T
A
G
A
C
C
A
T
A
A
C
T
G
G
G
T
G
T
A
T
A
A
C
T
C
C
A
G
G
A
A
T
G
A
G
G
C
T
A
C
C
A
G
G
T
A
G
C
C
C
T
T
A
C
A
C
A
T
T
T
T
T
G
C
A
T
C
C
C
T
T
G
T
C
A
G
T
G
G
C
T
T
G
C
A
C
G
A
A
T
C
C
C
C
C
A
C
G
A
T
G
C
A
G
T
C
G
A
T
C
G
A
C
A
T
T
G
G
G
T
C
C
A
C
C
G
A
G
G
G
T
G
T
C
A
A
T
G
T
T
C
A
A
T
G
T
C
G
C
T
  32,528,437
  32,528,866
  32,528,982
  32,530,435
  32,530,437
  32,530,716
  32,530,763
  32,531,230
  32,532,098
  32,532,217
  32,532,462
  32,532,537
  32,532,673
  32,532,725
  32,532,758
  32,532,772
  32,532,774
  32,532,790
  32,533,048
  32,533,149
  32,533,154
  32,533,309
  32,533,517
  32,534,614
  32,535,279
  32,535,280
  32,536,002
  32,536,087
  32,536,276
  32,536,791
  32,537,363
  32,537,543
  32,537,563
  32,537,593
  32,537,915
  32,538,016
  32,538,546
  32,538,561
  32,538,787
  32,539,185
  32,539,320
  32,539,501
  32,539,740
  32,539,898
  32,540,066
  32,540,361
  32,540,507
  32,540,587
  32,543,715
  32,543,874
  32,544,287
  32,545,396
  32,546,026
  32,546,999
  32,547,552
  32,547,853
  32,548,592
  32,548,700
  32,548,908
  32,555,477
  32,555,832
  32,557,396
  32,558,012
  32,558,031
  32,558,042
  32,558,212
  32,558,602
  32,561,321
  32,561,467
  32,561,748
  32,562,025
  32,562,052
  32,562,128
  32,562,231
  32,562,334
  32,563,373
  32,563,780
  32,563,978
  32,564,799
  32,565,778
  32,566,227
  32,566,825
  32,567,039
  32,567,193
  32,567,243
  32,568,795
  32,569,240
  32,569,968
  32,570,113
  32,570,115
  32,570,458
  32,571,227
  32,571,603
  32,572,347
  32,572,447
  32,572,891
  32,573,169
  32,574,423
  32,574,923
  32,578,049
  32,578,800
  32,578,956
  32,579,658
  32,580,208
  32,580,281
  32,580,616
  32,581,179
  32,581,268
  32,581,273
  32,582,434
  32,582,819
  32,583,262
  32,583,336
  32,583,794
  32,583,820
  32,584,287
  32,584,336
  32,584,417
  32,584,695
  32,586,055
  32,586,108
  32,586,150
  32,586,655
  32,586,787
  32,588,456
  32,588,857
  32,590,213
  32,590,365
  32,590,476
  32,590,847
  32,591,437
  32,592,193
  32,592,318
  32,592,523
  32,592,537
  32,594,477
  32,595,144
  32,595,459
  32,595,489
  32,595,609
  32,595,667
  32,595,669
  32,596,165
  32,596,546
  32,596,696
  32,597,594
  32,597,669
  32,598,056
  32,598,171
  32,598,443
  32,599,029
  32,599,525
  32,599,780
  32,600,599
  32,600,824
  32,600,862
  32,600,950
  32,601,038
  32,601,301
  32,601,623
  32,601,877
  32,602,066
  32,602,229
  32,602,677
  32,602,700
  32,604,834
  32,604,931
  32,605,068
  32,606,199
  32,606,847
  32,606,852
  32,606,853
  32,606,916
  32,606,932
  32,606,933
  32,607,279
  32,607,281
  32,607,287
  32,607,382
  32,607,405
  32,607,417
  32,607,431
  32,607,484
  32,607,486
  32,607,533
  32,607,564
  32,607,590
  32,607,731
  32,607,732
  32,607,733
  32,607,862
  32,609,294
  32,609,457
  32,609,619
  32,609,808
  32,609,853
  32,609,887
  32,610,091
  32,610,356
  32,610,374
  32,610,706
  32,610,970
  32,611,208
  32,611,447
  32,611,631
  32,615,393
  32,615,415
  32,617,629
  32,619,195
  32,619,376
  32,619,822
  32,620,888
  32,621,752
  32,621,884
  32,622,233
  32,622,444
  32,623,587
  32,625,655
  32,628,122
  32,630,665
  32,635,309
  32,639,253
  32,639,256
  32,639,919
  32,641,372
  32,643,163
  32,643,571
  32,643,701
  32,643,871
  32,644,044
  32,645,007
  32,646,467
  32,647,031
  32,647,611
  32,648,190
  32,648,480
  32,649,616
  32,649,856
  32,650,031
  32,650,033
  32,650,072
  32,650,082
  32,650,114
  32,650,243
  32,651,672
  32,656,618
  32,656,867
  32,657,027
  32,657,055
  32,657,143
  32,657,156
  32,657,306
  32,657,734
  32,657,926
  32,659,633
  32,659,989
  32,664,619
  32,664,649
  32,664,654
  32,665,892
  32,666,261
  32,667,041
  32,668,141
  32,668,252
  32,671,500
  32,674,900
  32,675,833
  32,676,967
  32,677,551
  32,678,231
  32,681,149
  32,682,198
  32,683,007
  32,685,662
  32,686,711
  32,690,171
  32,691,277
  32,692,228
  32,694,803
  32,694,862
  32,697,135
  32,697,183
  32,697,653
  32,697,776
  32,698,895
  32,700,209
  32,700,454
  32,703,028
  32,703,030
  32,704,952
  32,707,690
  32,708,331
  32,708,573
  32,708,645
  32,709,281
  32,709,520
  32,713,143
  32,714,014
  32,715,137
  32,716,077
  32,716,371
  32,716,720
  32,717,425
  32,717,496
  32,717,713
  32,718,001
  32,719,823
  32,720,212
  32,721,445
  32,721,447
  32,721,497
  32,722,509
  32,722,834
  32,722,846
  32,722,856
  32,722,907
  32,722,908
  32,722,925
  32,723,399
  32,723,700
  32,723,762
  32,723,801
  32,724,378
  32,724,577
  32,724,919
  32,724,954
  32,725,070
  32,725,071
  32,725,771
  32,725,889
  32,726,750
  32,727,059
  32,727,328
  32,727,866
  32,728,594
  32,729,061
  32,729,201
  32,729,608
  32,729,925
  32,730,003
  32,730,109
  32,731,393
  32,731,622
  32,732,130
  32,732,775
  32,733,164
  32,734,031
  32,735,430
  32,735,743
  32,737,151
  32,737,364
  32,738,853
  32,739,426
  32,740,014
  32,741,068
  32,741,096
  32,741,713
  32,742,347
  32,742,359
  32,742,365
  32,742,621
  32,742,806
  32,744,293
  32,744,511
  32,744,542
  32,744,544
  32,744,757
  32,745,427
  32,747,108
  32,747,865
  32,747,953
  32,749,626
  32,758,182
  32,758,936
  32,759,917
  32,760,211
  32,761,832
  32,766,364
  32,766,380
  32,766,487
  32,766,643
  32,766,862
  32,767,296
  32,767,523
  32,768,738
  32,769,568
  32,771,087
  32,772,277
  32,772,278
  32,774,053
  32,774,699
  32,776,707
  32,782,909
  32,787,035
  32,791,218
  32,794,615
  32,796,886
  32,797,548
  32,798,012
  32,798,244
  32,800,477
  32,806,556
  32,806,557
  32,815,694
  32,815,695
  32,815,696
  32,815,713
  32,815,714
  32,815,717
  32,815,723
  32,815,748
  32,815,775
  32,829,414
  32,869,072
  32,870,113
  32,870,380
  32,870,887
  32,871,098
  32,871,110
  32,871,228
  32,873,129
  32,873,493
  32,874,029
T
A
A
G
A
C
G
A
T
A
T
G
T
T
T
G
A
C
G
C
G
G
A
A
C
C
T
T
C
A
T
T
C
A
C
A
C
C
C
T
C
A
A
A
A
G
A
T
A
C
T
A
T
G
C
T
T
G
C
A
T
T
C
G
G
T
G
C
A
G
C
C
T
G
T
T
T
T
G
T
C
C
G
T
C
G
C
T
G
G
T
A
G
G
T
G
T
C
G
T
G
C
T
A
A
C
C
A
T
G/A
T
C
T
A
G
G
A
C
C
A
T
T
G
A
G
T
G
C
A
A
C/G
C
G
A
C
A
A
G/A
C/T
T
G
A
A
G
G
C
G
A
T
C
C
T
C
A
A
A
A
T
T
C
G
T
C
G
A
C
T
G
T
A
C
A
A
C
T
G
G
T
C/G
T
G
T/C
T/A
G/T
A
G
G
C
C
T
G/C
T
G
C
T
T
A
C
T
T
A
T
C/T
A/T
C/T
G
C
C
T
A
G
T
T
T
C
A
C
A
T
C
C
T
T
G
T
T
C
T
T
T
A
G
G
T
C
C
A
G
T/A
T/C
A
T
A/G
T
A
T
G
G
T
T
A
T
C
A
G
T
G
T
G
C
C
A
T
C
G
A
A
A/G
A
A
A
C
G
C
G
A
G
T
T
G
C
G
C
T
G
A
T
T
C
G/T
C
G
C
C
C
T
C
T
T
C
A
A
T
C
C
A
C
A
A
T
C
G
A
T
G
A
C
C
G
A
G
T
A
C
C
G
A
T
C/T
A/C
C
G
C
A
G
A
T
G
C
T
T
T
C
G
A
T/A
T
G
T
C
A
A
T
C
C
T
T
G
A
A
G
G
C
T
T
T
T
G
G
C/A
T
G
C
T
A
G
A
C
T
A
G
C
G
A
T
T
G
C
C
G/T
A
G/C
G
A
T
A/G
T
A
A
G
A
A
A
C
T
A
G
T
G
C
G/A
C
A
T
G
G
C
A
C
T
T
T
G