Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 347,618 (bp)   Positions: 422
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
RGSC 3.4  
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.005
.003
.047
.046
.0
.0
.011
.003
.008
.003
.0
.002
.003
.003
.004
.991
.0
.001
.0
.0
.004
.007
.033
.03
.002
.001
.001
.0
.026
.005
.001
.0
.011
.018
.107
.0
.003
.0
.0
.001
.001
.0
.0
--
.01
.374
--
--
--
--
.0
--
.009
.004
.0
.071
.0
.056
.0
.043
.001
.002
.0
.0
.0
.004
.004
.001
.075
.002
.0
.001
.001
.003
.016
.004
.003
.013
.727
.0
.001
.0
.001
.004
.002
.001
.0
.0
.0
.049
.002
.002
.001
--
--
.001
.0
.004
.0
.001
.211
.054
.0
.0
.0
.0
.0
.002
.003
.0
.038
.0
.002
.003
.0
.001
.0
.0
.0
.006
.001
.026
.002
.001
.011
.954
.0
.001
.001
.002
.01
--
.092
.0
--
--
--
--
--
--
--
.004
.09
.001
.001
--
.001
.15
.003
.017
.096
.001
.0
.003
.002
.0
.005
.0
.0
.001
.001
.0
.066
.001
.0
.004
.001
.004
.003
--
.0
.003
.006
--
.006
.001
.001
.007
.006
.0
.008
.003
.001
1.0
.05
.0
.022
.002
.0
.003
.004
.0
.0
.003
.0
.005
.006
.012
.0
.001
.017
--
.0
.124
.0
.0
.001
.0
.002
.0
.006
.003
.0
.036
.017
.0
.001
.0
.0
.007
.001
.001
.0
.128
.072
.002
.001
.026
.0
.001
.001
.845
.004
.031
.0
.139
.022
.0
.005
.022
.009
.016
.014
.0
.0
.0
.0
.008
.528
.021
.0
.085
.0
.001
.001
.026
.002
.001
.005
.0
.0
.007
.001
.031
.0
.0
.656
.14
.003
.03
.0
.0
.005
.003
.012
.0
.001
.014
.0
.004
.186
.115
.0
.116
.8
.0
.347
.418
.0
.001
.001
.013
--
.002
.001
1.0
1.0
1.0
.001
.0
.004
.001
.129
.004
.002
--
--
.0
.001
.002
.0
.001
.026
.001
.053
.019
.0
.013
.001
--
--
.002
.0
.0
.0
.12
.239
.083
.003
.022
.015
.003
.0
.022
.002
.0
.0
.001
.001
.063
.0
.007
.0
.0
.001
.001
.0
.008
.006
.006
.001
.0
.006
.001
.0
.002
.018
.0
.084
.734
.0
.009
.017
.002
.002
.0
.002
.002
.003
.002
.003
.009
.001
.005
.003
.029
.006
.006
.081
.001
.0
.0
.001
.014
.2
.0
.004
.001
.003
.001
.154
.978
.001
.0
.0
.0
.0
.023
.004
--
.001
--
.001
.0
.007
.013
.001
.0
.156
.0
.011
.008
.361
.02
.012
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rps27a-ps6
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
Nr3c2
G
C
G
A
T
T
A
G
A
G
T
T
C
A
T
C
T
G
G
T
-
G
A
C
C
T
C
A
-
A
C
A
C
C
T
T
A
T
T
C
C
C
A
C
C
A
A
A
G
C
G
T
G
A
G
C
C
A
-
A
C
A
T
A
A
A
-
A
T
T
A
C
G
C
T
A
T
T
T
G
G
G
T
A
A
G
4
C
C
T
C
A
A
C
A
A
-
A
T
T
T
G
C
-
T
A
G
T
G
G
G
T
C
T
G
C
T
A
G
C
T
A
T
C
T
C
G
C
G
C
C
-
T
A
G
T
G
A
T
A
G
C
C
G
G
A
C
A
G
G
C
G
T
C
C
A
T
C
T
C
G
C
T
T
A
-
C
G
T
T
C
A
2
T
A
G
A
C
T
C
T
G
C
3
T
A
A
C
C
C
G
G
T
C
C
C
G
T
G
T
C
C
G
A
T
T
T
C
T
T
G
C
C
G
-
G
C
G
G
A
A
C
A
G
A
A
T
T
C
A
C
T
T
C
A
C
A
G
T
T
A
C
G
T
A
G
A
G
C
C
C
T
T
A
G
A
A
C
C
C
T
A
A
T
G
G
C
A
T
C
G
A
T
G
G
T
G
T
A
C
A
C
C
A
G
-
G
A
T
G
3
A
C
A
G
T
T
A
C
T
T
G
T
C
C
C
C
T
T
T
G
A
T
G
G
G
C
A
C
T
C
G
A
T
T
G
2
A
A
T
C
T
A
C
C
G
A
T
G
C
C
T
C
C
C
T
A
C
G
G
6
A
G
A
C
A
-
G
G
G
C
G
G
C
A
C
G
A
A
C
C
T
A
-
G
T
T
A
T
T
T
G
A
G
C
-
C
A
G
A
2
C
C
A
C
C
T
A
G
C
G
G
A
C
G
G
T
G
G
G
C
C
C
A
A
T
G
T
C
G
C
T
  32,528,437
  32,528,745
  32,528,982
  32,530,435
  32,530,437
  32,530,716
  32,530,763
  32,533,310
  32,535,607
  32,535,881
  32,536,276
  32,537,397
  32,538,415
  32,538,546
  32,538,561
  32,539,185
  32,539,320
  32,539,658
  32,539,740
  32,539,898
  32,540,894
  32,542,828
  32,543,083
  32,543,666
  32,544,093
  32,544,096
  32,545,320
  32,546,999
  32,548,191
  32,548,508
  32,548,592
  32,548,700
  32,548,977
  32,548,983
  32,549,065
  32,549,858
  32,551,434
  32,552,060
  32,552,639
  32,553,306
  32,556,934
  32,557,918
  32,558,012
  32,558,042
  32,558,202
  32,559,833
  32,561,321
  32,564,799
  32,564,965
  32,565,778
  32,566,001
  32,566,227
  32,566,825
  32,567,045
  32,567,092
  32,567,193
  32,567,478
  32,568,795
  32,569,909
  32,570,133
  32,571,565
  32,571,603
  32,572,347
  32,572,555
  32,572,891
  32,573,169
  32,573,294
  32,574,155
  32,574,423
  32,574,922
  32,574,923
  32,575,182
  32,575,252
  32,576,583
  32,578,203
  32,578,800
  32,578,956
  32,580,281
  32,581,179
  32,581,268
  32,581,273
  32,582,820
  32,583,262
  32,583,820
  32,585,257
  32,585,764
  32,585,816
  32,585,817
  32,586,389
  32,586,655
  32,586,787
  32,587,809
  32,588,456
  32,588,857
  32,588,913
  32,589,210
  32,589,748
  32,590,213
  32,590,365
  32,590,372
  32,590,476
  32,590,847
  32,590,948
  32,591,149
  32,592,193
  32,592,318
  32,592,523
  32,592,537
  32,593,104
  32,593,838
  32,594,477
  32,595,144
  32,595,609
  32,595,667
  32,595,669
  32,596,165
  32,597,594
  32,597,669
  32,598,056
  32,598,171
  32,598,308
  32,598,443
  32,599,029
  32,599,525
  32,599,780
  32,600,599
  32,600,824
  32,600,862
  32,600,950
  32,601,038
  32,601,301
  32,601,349
  32,601,623
  32,601,877
  32,602,066
  32,602,229
  32,602,700
  32,604,206
  32,604,834
  32,605,068
  32,606,199
  32,606,599
  32,606,807
  32,606,916
  32,606,983
  32,607,107
  32,607,289
  32,608,723
  32,608,927
  32,610,230
  32,610,706
  32,614,532
  32,614,931
  32,616,020
  32,616,312
  32,616,358
  32,616,626
  32,617,069
  32,617,361
  32,617,401
  32,617,629
  32,617,738
  32,618,953
  32,619,027
  32,619,064
  32,620,133
  32,620,888
  32,621,884
  32,622,233
  32,622,471
  32,622,923
  32,623,587
  32,627,168
  32,627,972
  32,628,122
  32,630,665
  32,632,610
  32,632,718
  32,635,309
  32,636,914
  32,638,408
  32,639,215
  32,639,219
  32,639,764
  32,639,768
  32,639,919
  32,639,993
  32,640,529
  32,641,052
  32,641,489
  32,641,643
  32,641,867
  32,643,571
  32,643,871
  32,644,044
  32,644,395
  32,645,007
  32,645,013
  32,645,087
  32,645,096
  32,645,318
  32,645,464
  32,646,271
  32,646,467
  32,647,031
  32,648,190
  32,648,673
  32,650,269
  32,653,957
  32,654,731
  32,655,102
  32,655,453
  32,656,867
  32,657,055
  32,657,129
  32,657,156
  32,657,204
  32,657,231
  32,657,235
  32,657,313
  32,657,837
  32,657,926
  32,658,055
  32,659,345
  32,659,989
  32,664,840
  32,665,892
  32,666,261
  32,667,450
  32,668,933
  32,669,087
  32,669,178
  32,669,682
  32,671,205
  32,671,500
  32,671,968
  32,674,796
  32,676,436
  32,678,231
  32,678,997
  32,679,151
  32,682,054
  32,682,083
  32,682,162
  32,682,198
  32,682,379
  32,683,007
  32,685,270
  32,685,292
  32,685,315
  32,685,335
  32,685,344
  32,685,662
  32,686,818
  32,689,623
  32,690,383
  32,691,277
  32,693,185
  32,694,803
  32,696,455
  32,697,135
  32,697,183
  32,697,653
  32,698,895
  32,700,209
  32,700,770
  32,702,947
  32,702,971
  32,703,351
  32,703,586
  32,704,123
  32,704,189
  32,704,414
  32,704,822
  32,706,035
  32,706,069
  32,706,404
  32,706,676
  32,707,733
  32,709,342
  32,709,875
  32,714,014
  32,715,137
  32,716,077
  32,716,371
  32,716,524
  32,716,720
  32,717,496
  32,717,713
  32,718,001
  32,718,029
  32,719,823
  32,719,991
  32,720,003
  32,720,212
  32,721,497
  32,722,248
  32,722,348
  32,725,273
  32,727,059
  32,728,594
  32,729,127
  32,729,129
  32,729,201
  32,729,348
  32,729,377
  32,731,393
  32,732,130
  32,733,134
  32,733,164
  32,733,210
  32,735,430
  32,735,626
  32,736,769
  32,736,781
  32,736,784
  32,736,838
  32,736,990
  32,737,060
  32,737,151
  32,737,258
  32,737,392
  32,739,112
  32,740,014
  32,741,068
  32,742,365
  32,742,371
  32,742,621
  32,742,806
  32,744,293
  32,744,544
  32,745,294
  32,745,394
  32,745,427
  32,745,914
  32,746,786
  32,747,108
  32,748,347
  32,748,731
  32,749,465
  32,749,727
  32,750,576
  32,751,070
  32,751,841
  32,752,503
  32,753,656
  32,756,249
  32,757,527
  32,758,577
  32,758,936
  32,759,210
  32,759,731
  32,760,808
  32,761,123
  32,761,356
  32,761,443
  32,762,619
  32,763,151
  32,764,933
  32,765,238
  32,766,380
  32,766,487
  32,767,349
  32,767,468
  32,767,627
  32,768,018
  32,768,675
  32,768,700
  32,768,988
  32,769,002
  32,769,250
  32,769,287
  32,769,459
  32,769,512
  32,769,550
  32,769,563
  32,769,720
  32,770,013
  32,770,435
  32,772,277
  32,772,278
  32,774,020
  32,775,019
  32,780,400
  32,787,035
  32,787,125
  32,789,050
  32,789,053
  32,793,162
  32,794,615
  32,795,580
  32,795,856
  32,795,864
  32,796,315
  32,796,886
  32,797,548
  32,797,783
  32,798,244
  32,800,477
  32,805,442
  32,806,556
  32,806,557
  32,806,563
  32,807,254
  32,807,292
  32,815,675
  32,829,414
  32,850,163
  32,850,208
  32,859,070
  32,859,119
  32,869,072
  32,869,880
  32,870,113
  32,870,380
  32,870,887
  32,871,098
  32,871,110
  32,871,228
  32,873,129
  32,873,493
  32,874,029
T
A
A
G
A
C
G
C
G
A
C
C
T
C
C
T
C
A
A
A
A
A
T
T
T
C
T
G
A
G
T
G
C/-
G
-
G
T
C
C
T
T
T
C
G
T
G
C
G
A
T
A
C
C
-
T
T
T
G
T
G
T
G
G
A/-
G
T
-/A
G
C
-
G
C/-
G/-
T
C
G
C
A
C
A
T
A
C
G
T
A
4/-
G
T
G
A
T
G
T
G/3
-
C
G
C
T/-
T/A
A
T
-/A
C
G
A
C
A
A
A
A
T
G
A
A
C
G
A
T
-
C
C
T
C
A
A
A
A
T
T
-/A
C
G
T
C
A
T
C
G
T
T
T
A
A
G
C/A
G
C
T
A
T
C
T
T
G
-
G
C
A
C
T
C
A
T
-/2
T
T
C
-
T
C
2/-
A
T
C
C
T
C
T
-
T
T
3/-
A
G
G
T
A
T
T
G/C
C
T
T
T
A
C
A
C
T
G
A
G
G
C
C
T
A
T/-
A
T
G
T
5
A
G
T
A
C
T
A
G
A
T
G
C
C
-
-
T
C
C
A
G
T
G
A
A
C
G
T
A
C
C
A
G
A
T
A
T
C
C
G
C
-
G
T
T
T
C
G
C
G
A
A
T
G
C
T
A
C
C
A
G/A
A
A
C
G
T
C
T
T
C
A
T
A
C
C
A
3/-
C
C/-
C
A
C
T/-
C
T
G
G
G/A
G
T
T
T
T
G
A
T/A
A
G
A
T
A
A
T
G
T
C
T
A
G
C
C
A
-
G
G
C
T
A
-
G
T
A
G
C
A
C/-
T
G
T
T
T
A
C
G
A
T
6/-
T
A
G
T
C
GC/T
A
T
A
T
A
C
G
G
T
A
T
T
T
T
C
G
3
A
A
T/C
C
C
C
C
T
G
T
A
A
C/-
A/T
C
G
2/-
T
T
G
T
A
A
G
A
C/-
A
A
C
-
A
G/C
A
A
-
-
-
T
C/-
G
G
C
A
C
T
T
T
G