Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 160,282 (bp)   Positions: 327
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.003
.022
.018
.194
.069
.078
.845
--
--
--
--
--
.006
--
--
.042
.354
.092
.022
.003
.004
.009
.023
.0
.0
.029
1.0
.323
.038
.009
.163
.005
.013
.013
.009
.118
.133
.035
.002
.986
.0
.002
.0
.001
.0
.995
.003
.017
.089
.019
.01
.012
.002
.06
.031
.067
.326
.043
--
.087
.075
.001
.0
.04
.021
.005
.014
.001
.001
.002
.287
.039
.021
.02
.855
--
--
--
.1
.062
.004
.053
.116
.006
.001
.139
.162
.02
.064
.401
.172
.051
.004
.005
.017
1.0
.012
.028
.498
.001
.002
.026
.716
.0
.028
.3
.009
--
--
--
--
--
.016
.019
.018
--
.059
--
.027
.013
.087
.019
.206
.205
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.002
.001
.001
.138
.015
.023
.032
.003
.02
.042
.008
.06
.001
.007
.007
.008
.017
.024
.3
.313
.016
--
--
.003
.004
.028
.091
.518
.481
.004
.21
.195
.025
.016
.008
.006
.031
.036
.306
.067
--
--
.007
.0
.066
.072
.034
.018
.338
.003
.005
.026
.081
--
.028
.021
.013
.009
.009
.001
.001
.001
.011
.004
.073
.005
.006
.166
.167
.097
.02
.001
.002
.004
.002
.205
.014
.09
.002
.169
.001
.08
--
--
--
--
.844
.006
.422
.0
.0
.027
.992
.99
.0
.005
.019
.169
.003
.103
.626
.662
--
.01
.001
.013
.002
.154
.001
.081
.101
.095
.0
.0
.002
.002
.002
.037
.039
.005
.005
.007
.012
.001
.009
.001
.284
1.0
.084
.034
.063
.061
.127
.0
.014
.001
.001
.029
.0
.0
.043
--
--
--
--
--
--
.053
--
.033
.054
.052
.019
.001
--
.02
.069
.001
.026
.009
.004
.407
.071
.183
.034
.032
.243
.004
.039
.002
.023
.037
.015
.21
.0
.0
.577
.014
.004
.149
.002
.013
.018
.009
.005
.058
.0
.001
.002
.0
.011
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
6
T
4
C
A
T
G
A
4
G
C
A
T
T
T
G
T
C
C
G
T
T
G
C
T
A
G
T
C
A
A
C
T
G
C
G
C
A
C
T
G
C
G
C
G
A
T
A
G
A
T
G
11
A
A
T
A
C
C
G
A
C
T
A
A
C
T
A
A
T
T
4
G
2
C
A
C
2
2
C
C
C
G
T
G
T
C
50
T
G
G
A
C
T
G
C
G
G
C
C
T
G
G
A
G
C
T
C
G
C
T
G
T
T
T
G
T
T
G
C
C
G
A
G
5
11
G
T
12
G
T
A
A
G
C
3
G
T
C
A
A
C
G
4
T
C
A
C
C
A
T
G
C
G
97
13
12
C
G
A
T
C
A
G
2
2
C
G
C
A
C
3
T
G
G
C
C
7
C
C
T
A
G
T
T
T
G
G
A
C
C
C
2
A
49
G
A
T
G
2
G
14
12
T
G
T
A
T
T
A
T
A
G
T
T
G
6
C
G
C
T
G
A
2
T
T
A
T
A
T
C
T
A
24
10
8
A
A
A
T
G
C
A
T
4
G
T
T
T
G
C
A
C
A
A
T
T
A
C
C
T
G
T
4
G
G
A
A
C
A
T
G
A
T
T
T
G
C
C
C
G
T
C
T
A
T
T
4
G
G
C
T
G
T
C
G
T
A
C
C
G
G
A
T
T
A
T
G
T
C
G
C
T
C
C
T
A
8
6
G
T
A
G
G
7
A
  46,049,331
  46,049,734
  46,050,337
  46,050,704
  46,050,730
  46,050,733
  46,050,743
  46,051,026
  46,051,187
  46,051,263
  46,051,383
  46,051,474
  46,051,600
  46,051,995
  46,052,065
  46,052,412
  46,052,462
  46,053,066
  46,053,107
  46,053,311
  46,053,362
  46,053,838
  46,054,003
  46,055,192
  46,055,194
  46,055,199
  46,055,331
  46,055,936
  46,056,242
  46,056,629
  46,056,766
  46,056,933
  46,056,961
  46,057,094
  46,057,131
  46,057,198
  46,057,304
  46,057,604
  46,057,795
  46,058,566
  46,058,650
  46,058,690
  46,058,785
  46,058,896
  46,059,036
  46,059,279
  46,059,585
  46,059,663
  46,059,738
  46,059,772
  46,059,787
  46,060,016
  46,060,141
  46,060,181
  46,060,404
  46,060,522
  46,060,910
  46,060,982
  46,061,007
  46,061,131
  46,061,134
  46,061,387
  46,061,467
  46,061,534
  46,061,611
  46,061,751
  46,061,784
  46,061,862
  46,061,869
  46,061,881
  46,062,276
  46,066,555
  46,066,564
  46,066,572
  46,067,896
  46,080,736
  46,080,739
  46,080,740
  46,085,332
  46,085,916
  46,086,662
  46,086,983
  46,087,803
  46,087,836
  46,087,868
  46,088,041
  46,089,249
  46,091,957
  46,092,248
  46,093,070
  46,093,586
  46,094,259
  46,095,796
  46,095,908
  46,097,627
  46,099,561
  46,102,468
  46,105,340
  46,105,372
  46,106,274
  46,106,576
  46,106,756
  46,107,105
  46,107,541
  46,107,797
  46,109,067
  46,109,201
  46,110,322
  46,110,382
  46,110,392
  46,111,636
  46,111,671
  46,112,263
  46,112,285
  46,112,286
  46,112,958
  46,113,225
  46,113,892
  46,114,557
  46,114,752
  46,115,144
  46,115,244
  46,116,009
  46,116,096
  46,117,815
  46,118,004
  46,118,012
  46,118,047
  46,118,429
  46,118,480
  46,118,521
  46,118,623
  46,118,647
  46,118,657
  46,118,729
  46,118,733
  46,118,750
  46,118,762
  46,118,781
  46,118,821
  46,118,831
  46,118,834
  46,118,866
  46,118,889
  46,118,921
  46,118,982
  46,119,024
  46,119,039
  46,119,048
  46,119,049
  46,119,054
  46,119,091
  46,119,098
  46,119,132
  46,119,134
  46,119,179
  46,119,278
  46,119,295
  46,119,311
  46,119,313
  46,119,355
  46,119,555
  46,119,842
  46,119,880
  46,119,964
  46,120,042
  46,120,046
  46,120,099
  46,120,337
  46,120,543
  46,120,574
  46,120,613
  46,120,744
  46,121,080
  46,121,235
  46,121,580
  46,121,822
  46,122,171
  46,122,215
  46,122,647
  46,122,718
  46,123,313
  46,123,503
  46,123,552
  46,123,820
  46,124,120
  46,124,524
  46,124,739
  46,125,006
  46,125,234
  46,144,719
  46,145,415
  46,150,106
  46,151,345
  46,153,618
  46,154,041
  46,154,713
  46,155,104
  46,155,228
  46,156,291
  46,156,678
  46,156,679
  46,156,843
  46,156,845
  46,156,877
  46,156,959
  46,157,160
  46,157,163
  46,157,175
  46,159,286
  46,160,792
  46,160,809
  46,160,920
  46,161,217
  46,161,240
  46,161,598
  46,161,771
  46,161,790
  46,161,865
  46,161,888
  46,161,892
  46,162,075
  46,162,318
  46,162,419
  46,163,282
  46,163,327
  46,163,352
  46,163,500
  46,163,502
  46,163,810
  46,164,198
  46,165,850
  46,166,020
  46,166,414
  46,167,814
  46,167,889
  46,167,891
  46,169,461
  46,169,821
  46,170,136
  46,170,409
  46,171,297
  46,172,675
  46,173,419
  46,174,363
  46,174,665
  46,175,328
  46,175,356
  46,175,357
  46,175,362
  46,176,429
  46,176,643
  46,176,698
  46,176,748
  46,176,815
  46,177,145
  46,177,686
  46,177,688
  46,178,254
  46,180,349
  46,180,996
  46,182,397
  46,182,753
  46,182,943
  46,183,053
  46,183,415
  46,183,417
  46,183,602
  46,183,855
  46,184,105
  46,184,113
  46,184,340
  46,184,733
  46,184,754
  46,184,888
  46,185,124
  46,185,243
  46,185,947
  46,186,247
  46,186,305
  46,186,812
  46,187,496
  46,187,594
  46,187,705
  46,188,400
  46,188,460
  46,188,462
  46,188,480
  46,188,524
  46,189,152
  46,190,513
  46,191,121
  46,191,158
  46,191,229
  46,191,535
  46,191,670
  46,191,829
  46,191,887
  46,191,909
  46,192,024
  46,192,641
  46,192,713
  46,193,235
  46,193,906
  46,194,886
  46,196,240
  46,196,254
  46,196,660
  46,196,761
  46,197,771
  46,197,826
  46,200,689
  46,201,242
  46,202,470
  46,202,564
  46,203,062
  46,203,518
  46,203,814
  46,204,517
  46,204,519
  46,204,806
  46,205,493
  46,206,349
  46,206,710
  46,206,931
  46,207,134
  46,207,816
T
6/-
C
-
T
97
C
2
C
-
T
T
G
T/-
C
C
A
C
-
T
A
3
C
A
G
G
G
A
G
G
-
G
T
C
A
G
T
G
G
T
A
A
T
A
T
A
G
C
G
A
G
C
3
-
G
G
C
G
T
T
T
2
T
C
G
-
T
C
2
G
5
3
-
T
-
5
2
2
2/-
-
A
T
T
C
G
A
C
A
-
7
A
2
G
T
G
A
T
A
A
T
T
C
A
A
C
C
-
T/-
7
30
2
3
T
2
5
4
C
T/-
2
A
T
T
A
T
A
-
-
17
2
-
A
G
4
G
C
G
-
-
C
T
G
T
T
C
-
C
T
T
T
A
G
C
A
T
C
-
-
-
G
C
G
C
T
C
C
-
-
-
A
T
2
T
-
C
A
21
2
-
-
A
G
C
G
A
7
C
C
A
G/2
G
T
T
2
2/-
G
-
A
G
C
A
2/-
-
14/-
12/-
C
T
2
2
2
-
C
C
G
A
C
C
A
-
T
A
T
2
3
G
-
3
C
C
C
G
-
T
2
T
-
10/-
8/-
3
G
G
C
A
C/2
G
7
-
-
A
A
A
A
T
G
T
G
G
-
-
G
T
T
G
A
C
-
A
A
3
G
G
G
C
T
G
C
C
C
-
T
T
G
A
A
T
2
2
3
3
-
A
A
A
-
A
C
T
2
C
G
T
G
A
A
G
G
2
T
C
A
C
T
A
A/T
C
T
T
2
G
8/-
6/-
A
C
G
A
A
7/-
G