Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 41,435 (bp)   Positions: 232
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.04
.88
.004
.0
.011
.02
.001
.077
.001
.0
.0
.0
.001
.004
.036
.082
.083
.004
.001
.001
.007
.001
.004
.007
.284
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.027
.008
.01
.008
.099
.157
.001
.996
.004
.0
.0
.241
.012
.002
.016
.001
--
--
.735
--
.0
.983
.558
.537
.074
.391
.084
--
--
--
--
--
--
--
.227
.006
.024
.014
.0
.038
.049
.223
.348
.007
.004
.299
.005
.006
.006
.004
.002
.002
.951
--
--
.008
.128
.0
.457
.006
.005
.016
.062
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.019
.021
.036
.043
.013
.01
.001
.0
.001
.017
.001
.001
.0
.0
.001
.003
.002
.01
.0
.005
.007
.004
.006
.08
.15
.089
.322
.269
.225
.0
.0
.0
.001
.0
.006
.028
.015
.01
.249
.114
.078
.018
.01
.007
--
--
--
--
--
--
.01
.008
.019
.047
.06
.0
.018
.017
.056
.036
.005
--
--
--
.492
.022
.006
--
.07
.113
.027
.008
.055
.329
.156
.021
.839
--
--
.004
.001
.008
.032
.072
.068
.048
.094
--
--
.302
.022
.563
.155
.028
.035
.018
.425
.308
.513
--
--
--
.229
--
.03
.002
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
Lct
T
T
C
C
G
G
T
A
A
C
C
C
G
T
A
A
T
C
G
G
A
A
6
A
A
G
A
A
C
4
2
T
G
T
A
T
C
T
C
A
107
T
T
A
A
42
G
A
G
G
T
C
T
A
T
C
A
C
A
C
G
A
T
T
C
G
T
A
A
T
T
C
C
T
C
A
A
G
A
T
C
C
C
A
T
C
C
T
G
55
7
T
A
C
T
T
C
G
C
A
G
C
A
A
C
A
A
A
G
2
C
T
G
G
A
G
G
A
C
C
T
G
A
T
T
T
G
G
G
C
T
C
T
G
A
G
G
T
C
A
G
T
C
C
C
T
A
A
C
G
A
A
A
C
G
C
A
G
C
C
C
C
T
A
C
A
T
A
C
G
G
A
C
A
G
T
C
C
T
T
A
C
G
T
C
T
C
G
T
G
T
A
G
C
T
2
A
C
C
G
T
C
A
G
A
A
C
A
A
G
G
C
A
A
T
A
C
C
C
A
C
T
A
C
A
A
C
T
2
A
G
T
  50,085,618
  50,085,664
  50,085,912
  50,085,969
  50,086,123
  50,086,291
  50,087,097
  50,087,220
  50,087,454
  50,087,744
  50,087,745
  50,087,747
  50,087,757
  50,087,841
  50,087,999
  50,088,012
  50,088,015
  50,088,226
  50,088,383
  50,088,384
  50,088,448
  50,088,475
  50,088,964
  50,089,181
  50,089,244
  50,089,724
  50,090,248
  50,090,252
  50,090,314
  50,090,329
  50,090,334
  50,090,341
  50,090,344
  50,090,404
  50,090,438
  50,090,549
  50,090,652
  50,090,653
  50,090,784
  50,090,901
  50,090,909
  50,091,126
  50,091,256
  50,092,270
  50,092,609
  50,093,608
  50,093,853
  50,094,077
  50,094,195
  50,095,611
  50,095,905
  50,096,133
  50,096,226
  50,097,007
  50,097,181
  50,099,216
  50,099,359
  50,099,484
  50,099,486
  50,099,547
  50,099,588
  50,099,789
  50,099,927
  50,100,159
  50,100,348
  50,100,366
  50,100,586
  50,100,628
  50,100,907
  50,101,538
  50,101,643
  50,101,677
  50,101,884
  50,102,439
  50,102,798
  50,103,452
  50,103,567
  50,103,620
  50,103,850
  50,103,874
  50,104,444
  50,104,548
  50,104,553
  50,104,566
  50,104,922
  50,104,932
  50,104,935
  50,105,557
  50,106,753
  50,106,773
  50,108,698
  50,108,999
  50,109,983
  50,111,317
  50,111,420
  50,111,649
  50,112,209
  50,112,264
  50,112,581
  50,112,686
  50,112,702
  50,112,703
  50,112,762
  50,112,824
  50,112,869
  50,112,909
  50,112,927
  50,112,972
  50,113,042
  50,113,044
  50,113,046
  50,113,138
  50,113,173
  50,113,177
  50,113,224
  50,113,243
  50,113,249
  50,113,273
  50,113,366
  50,113,378
  50,113,427
  50,113,435
  50,113,451
  50,113,452
  50,113,529
  50,113,536
  50,113,537
  50,113,539
  50,113,620
  50,113,639
  50,113,640
  50,113,645
  50,113,646
  50,113,725
  50,113,789
  50,113,804
  50,113,811
  50,113,832
  50,113,917
  50,113,921
  50,113,938
  50,113,942
  50,113,971
  50,114,007
  50,114,024
  50,114,151
  50,114,163
  50,114,165
  50,114,172
  50,114,175
  50,114,220
  50,114,268
  50,114,277
  50,114,279
  50,114,586
  50,114,626
  50,114,675
  50,114,679
  50,114,684
  50,114,802
  50,114,871
  50,114,978
  50,114,995
  50,115,039
  50,115,112
  50,115,338
  50,115,429
  50,115,512
  50,115,514
  50,115,559
  50,115,672
  50,115,697
  50,115,701
  50,116,036
  50,116,102
  50,116,203
  50,116,262
  50,116,310
  50,116,355
  50,116,360
  50,116,528
  50,116,557
  50,116,649
  50,116,725
  50,116,727
  50,116,791
  50,116,806
  50,116,810
  50,117,194
  50,117,273
  50,117,289
  50,117,551
  50,117,596
  50,117,763
  50,117,899
  50,117,909
  50,118,081
  50,118,104
  50,118,408
  50,118,434
  50,118,470
  50,118,607
  50,119,096
  50,119,413
  50,119,655
  50,119,691
  50,120,069
  50,120,237
  50,120,652
  50,120,728
  50,120,730
  50,121,111
  50,121,249
  50,121,250
  50,121,513
  50,121,631
  50,121,781
  50,121,833
  50,121,873
  50,121,934
  50,121,998
  50,122,179
  50,122,234
  50,122,912
  50,122,981
  50,122,993
  50,123,068
  50,123,249
  50,124,070
  50,124,339
  50,124,488
  50,124,490
C
C
C/G
T
A
A
T/-
G
G
T
T
G
A
T/C
G
A/5
T/10
G
A
A
G
C
-
T
G
A
3
G
T
-
-
T/3
G/3
T/3
A/G
C
2
3
A
-
-
C
C
G
T
42/-
A
G
T
A
C
T
C
A/T
A
T
T
T
T
T
A
-
2
C
T
A
5
G
G
C
C
C/A
T
C
T
G
A/G
2
C
T/G
T
T
A
G
C
T
T
C
2
-
-
C
G
T
C
C
T
A
C/T
G
T
T
G
T
T
C
T
T
-
-
3
C
A
A
G
A
A
A/G
T
T
G
A
A/G
T/C
C
C
T
T
A
T
2
T
2
C
G
A
A
C
G
T
A
C
C/16
T
T
C
T
G
2
C
G
G
-
T
A
G
C
A
-
A
T
G
C
G
T
G
C
T
A
A
G/A
2
T
G
G/A
C
T
T
C
G
G
T
A
-
A
T/-
-
A
C
3
C
G
3
T
G
-
G
A
T
A
C
5
G
A
G
G
C/G
G
A/-
A
A
T
2
T
T/G
G
G
C/A
G
G
G
C
T
T
T
T
T
C
-
G
G/A
T/2