Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 140,633 (bp)   Positions: 306
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.022
.993
.135
.052
.001
.006
.146
.009
.06
.065
.035
.601
.421
.013
--
.016
.0
.014
.039
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.121
.063
.649
.002
.001
.017
.108
--
.002
.991
.037
.082
.05
.021
.308
.083
.041
.006
.152
.0
.021
.075
.147
.011
--
--
--
--
--
--
--
.03
.212
.055
.025
.805
--
--
--
--
--
.084
.718
.006
--
.036
.692
.724
.051
.03
--
.658
.011
.058
.002
.333
.007
.113
.002
.002
.002
.041
.001
.026
.006
.001
.262
.027
.055
.088
.319
.001
.189
.004
.72
.031
.003
.097
.108
.065
.002
.001
.01
.008
.168
.034
.098
.214
.013
.205
.023
--
--
--
--
--
.212
.047
.078
.029
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.005
--
--
.065
1.0
.082
.0
.719
.028
.125
.135
--
.065
.152
.107
.018
.326
.004
.023
.166
--
--
--
.004
.095
--
--
.002
.044
.001
.005
.011
.002
--
--
--
.436
.002
.005
.02
.005
.231
--
.085
.02
.034
.243
.081
.001
.007
.024
.108
.034
.016
.001
.019
.024
.017
.047
.795
.277
.054
.43
.102
.004
.015
.051
.005
.002
--
--
.044
.017
.167
.03
.021
.221
.067
.826
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.066
.385
.001
.094
.145
.05
.095
.008
.202
.277
--
--
--
--
--
--
.477
.45
.003
.588
.512
.311
.301
.29
.216
.033
.489
.496
.095
.255
.398
.458
.169
.791
.011
.345
.293
.084
.025
.012
.899
--
--
.025
.0
.021
.411
.022
--
--
--
.144
--
--
--
--
--
--
--
.021
.193
.402
.062
.194
.175
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
T
T
A
C
8
G
G
G
12
10
C
G
4
T
A
C
A
T
T
2
T
2
5
2
7
5
7
A
4
G
G
T
9
G
G
G
A
T
G
C
C
C
C
G
G
A
2
A
G
2
14
4
8
7
19
16
15
7
18
T
A
C
4
A
T
2
A
C
A
T
C
A
A
G
A
A
T
G
C
G
G
T
C
C
G
G
A
A
C
T
G
17
G
4
4
A
T
C
G
T
G
G
T
A
C
2
4
G
2
G
T
T
C
A
A
6
6
G
C
T
G
4
T
8
G
A
A
C
C
C
4
2
T
T
A
G
C
G
16
4
2
A
A
A
6
4
4
2
4
2
16
2
C
6
4
4
A
T
10
G
C
A
2
T
G
C
G
G
A
2
A
A
C
2
5
C
A
6
4
G
C
A
G
T
A
A
64
66
A
A
G
A
C
C
G
C
T
T
T
27
C
A
G
A
A
C
T
T
2
A
G
A
A
T
G
A
G
A
C
G
9
G
G
C
C
A
4
2
A
T
C
C
A
2
A
A
G
T
15
A
C
C
2
C
A
8
T
G
G
C
12
4
3
4
12
8
G
C
C
A
G
4
2
C
G
C
T
C
T
C
C
C
G
T
C
T
C
T
C
G
G
G
A
G
G
A
T
A
T
G
C
G
A
T
4
4
G
A
A
G
T
T
10
3
G
G
  3,850,752
  3,851,040
  3,852,371
  3,852,423
  3,852,453
  3,852,708
  3,853,122
  3,854,648
  3,857,129
  3,857,131
  3,857,702
  3,859,123
  3,859,195
  3,859,400
  3,860,293
  3,862,059
  3,863,234
  3,864,013
  3,864,388
  3,864,675
  3,865,893
  3,866,147
  3,866,156
  3,866,157
  3,866,164
  3,866,176
  3,866,184
  3,866,371
  3,866,572
  3,868,051
  3,868,263
  3,870,327
  3,870,980
  3,875,657
  3,876,208
  3,877,816
  3,879,089
  3,880,569
  3,881,327
  3,881,373
  3,881,380
  3,881,666
  3,881,706
  3,881,888
  3,882,522
  3,882,585
  3,882,703
  3,883,582
  3,883,619
  3,883,676
  3,883,695
  3,883,853
  3,883,860
  3,883,870
  3,883,878
  3,883,900
  3,883,919
  3,883,936
  3,883,945
  3,883,999
  3,884,198
  3,884,450
  3,885,204
  3,885,375
  3,886,873
  3,886,919
  3,887,129
  3,887,150
  3,887,286
  3,887,510
  3,887,916
  3,887,954
  3,888,199
  3,888,292
  3,888,424
  3,888,438
  3,889,968
  3,890,549
  3,890,911
  3,892,519
  3,893,060
  3,893,574
  3,893,905
  3,896,515
  3,896,922
  3,897,430
  3,897,937
  3,897,938
  3,898,505
  3,898,671
  3,898,725
  3,898,731
  3,898,984
  3,899,041
  3,899,534
  3,899,781
  3,899,934
  3,899,999
  3,900,049
  3,900,139
  3,900,760
  3,900,840
  3,901,322
  3,901,728
  3,902,236
  3,902,272
  3,902,278
  3,902,310
  3,902,323
  3,902,328
  3,902,351
  3,902,353
  3,903,025
  3,903,044
  3,903,285
  3,903,880
  3,904,181
  3,904,236
  3,904,380
  3,904,490
  3,904,504
  3,904,507
  3,904,518
  3,904,673
  3,904,820
  3,904,886
  3,905,057
  3,905,239
  3,905,797
  3,906,034
  3,906,362
  3,907,470
  3,907,485
  3,908,446
  3,908,639
  3,908,698
  3,908,973
  3,909,807
  3,910,559
  3,910,603
  3,910,605
  3,910,607
  3,911,185
  3,911,338
  3,912,972
  3,912,974
  3,913,040
  3,913,068
  3,913,085
  3,913,087
  3,913,205
  3,913,381
  3,913,709
  3,915,240
  3,915,242
  3,915,437
  3,916,216
  3,916,982
  3,918,295
  3,919,053
  3,920,780
  3,921,027
  3,921,088
  3,922,145
  3,922,585
  3,922,701
  3,923,787
  3,923,871
  3,924,405
  3,924,770
  3,924,771
  3,924,846
  3,924,941
  3,924,967
  3,925,101
  3,925,448
  3,925,496
  3,927,046
  3,927,048
  3,927,406
  3,929,811
  3,929,990
  3,930,688
  3,931,340
  3,931,764
  3,932,324
  3,932,345
  3,932,348
  3,935,461
  3,935,545
  3,935,866
  3,936,052
  3,936,250
  3,937,030
  3,937,177
  3,937,689
  3,937,779
  3,938,357
  3,938,397
  3,938,907
  3,939,638
  3,940,027
  3,940,833
  3,940,957
  3,941,211
  3,941,215
  3,941,589
  3,941,597
  3,942,501
  3,942,502
  3,943,360
  3,943,586
  3,943,736
  3,943,799
  3,944,271
  3,944,764
  3,944,990
  3,945,168
  3,945,176
  3,946,219
  3,946,686
  3,948,019
  3,948,033
  3,949,900
  3,950,223
  3,950,251
  3,950,426
  3,950,428
  3,950,758
  3,950,792
  3,951,117
  3,953,854
  3,953,855
  3,954,049
  3,954,380
  3,954,628
  3,955,613
  3,956,699
  3,956,972
  3,957,312
  3,957,715
  3,957,862
  3,958,213
  3,959,361
  3,959,915
  3,961,764
  3,962,470
  3,962,768
  3,963,967
  3,964,210
  3,964,753
  3,964,802
  3,965,062
  3,965,111
  3,965,153
  3,965,157
  3,965,366
  3,965,401
  3,965,621
  3,966,542
  3,966,864
  3,966,912
  3,966,914
  3,967,060
  3,967,532
  3,967,644
  3,967,797
  3,968,755
  3,969,351
  3,969,366
  3,969,378
  3,969,647
  3,970,148
  3,972,062
  3,972,568
  3,972,803
  3,972,946
  3,973,040
  3,973,502
  3,973,510
  3,973,839
  3,975,062
  3,975,226
  3,975,484
  3,975,504
  3,976,656
  3,977,052
  3,977,900
  3,978,174
  3,978,967
  3,979,456
  3,981,907
  3,982,295
  3,982,368
  3,982,446
  3,982,477
  3,982,952
  3,982,967
  3,983,051
  3,984,080
  3,986,194
  3,986,336
  3,987,244
  3,987,546
  3,987,567
  3,988,386
-
2
3
C/5
8/-
A
2
A
12/-
-
T
5
-
9/11
-
G
G
G
C
-
T/-
2/-
5/-
2/-
7/-
5/-
7/-
11/6
-
A
-
C
-
A
A
12
G
3
A
T
T
G
T
C
C
G
-
17
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
6
T
-
T
C
-
G
T
G
C
T
13
-
A
-
T
C
A
4/3
3
A
C
T
T
-
A
G
C
T
T/-
A
-
5
-
4/-
G
A
T
T
G
A
A
G
G
G
-
-
3
-
3
G
G
T
G
G
-
-
A
T
G
T
-
5
-
A
G
G
T
T
A
-
-
C
4
T
A
T
2
-
4/-
2/-
G
T
T
6/-
4/-
-
-
4/-
-
16/-
2/-
A
6/-
4/-
-
G
C
10/-
A
T
2
-
6
17
11
A
T
G
2/-
-
T
4
2/-
5/-
C/3
A/6
6/-
4/-
A
T
G
A
C
2
G
-
66/-
4
G
A
6
G
T
A
T
3
?
3
-
T
-
-
G
G
A
C
11
2/-
A/-
A
G
-
5
5
G
A
G
G
C
-
G/2
G/A
-
G
C
4/-
2/-
5
T/9
2
T
G
2/-
-
G
A
C
-
C
T
CA/3
-
3
T
-
C
A
GT/3
T
-
-
-
-
12/-
-
9
T
T
G
A
4/-
2/-
-
A
T
C
T
4
T
10
C/5
A
A
T
2
C/2
13/9
A
A
G/2
-
17
-
19/31
T
9
G
A
A
C/6
A
5
C
-
-
3
T
2
18
4
C
-
3/-
T
A