Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 140,633 (bp)   Positions: 274
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.265
.05
.091
.061
.496
.013
--
--
--
.053
.016
.08
.0
.0
.0
.069
.014
.039
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.119
.015
.015
.024
.035
.002
.015
--
.015
.006
.001
.001
.052
.025
.005
.004
.056
.014
.002
.005
.97
.037
.021
.308
.083
.041
.006
.193
.15
.0
.021
.075
.119
.011
--
--
--
--
--
--
--
.03
.212
.012
.055
.458
.805
.029
--
--
--
--
--
--
--
--
.084
.006
--
.692
.724
.836
.998
.001
.189
.002
.051
.653
.072
.01
.047
.023
.016
.679
.099
.266
.025
.003
.069
.469
.116
.058
.002
.071
.004
.285
.064
.076
.001
.013
.047
--
.047
.078
.042
.018
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.101
--
--
.07
.002
.005
--
1.0
.368
.082
.008
.043
.676
.031
.305
.024
.135
.076
--
--
--
--
.065
.152
.046
.107
.018
.326
.004
.023
--
--
--
.049
.334
--
.044
.001
.039
.088
.011
.189
.002
--
--
.001
.043
.021
.436
.002
.031
.028
.202
.011
.02
.034
.243
.001
.007
.037
.108
.034
.016
.017
.004
.017
.047
.481
.268
.082
.479
.09
.102
.015
.051
.005
.005
.024
.306
.007
.16
--
--
.026
.021
.347
.006
.018
--
.066
.358
.184
--
--
.64
.348
.303
.314
.078
.017
.159
.169
.025
.206
.001
.791
.345
.293
.084
.064
.025
.875
.004
--
--
--
--
--
.025
.411
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
.021
.001
.193
.07
.175
.026
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
10
2
A
G
T
T
G
C
2
T
C
A
A
C
C
G
T
T
2
T
2
5
2
7
5
G
A
G
C
A
T
A
T
2
4
A
C
4
G
G
G
A
12
G
4
A
A
2
G
C
C
G
G
A
G
T
A
G
2
12
4
8
7
19
16
15
7
18
T
A
C
C
C
A
12
8
C
T
2
T
A
C
A
T
A
A
A
A
G
G
C
A
G
T
C
T
A
T
C
T
2
A
2
G
C
A
C
G
T
C
G
8
A
C
8
2
6
4
A
A
A
G
G
G
4
C
2
G
A
C
G
G
A
4
A
8
A
A
A
G
2
16
8
T
C
6
A
G
T
2
C
T
G
3
T
2
T
8
2
T
G
G
C
T
G
G
A
2
A
C
2
6
C
C
G
C
A
T
T
T
G
A
A
66
A
C
G
A
A
G
A
G
C
T
T
T
T
A
C
A
A
C
A
G
G
G
C
G
4
18
G
A
A
C
G
42
C
G
A
G
A
4
T
G
T
G
G
A
C
T
T
8
4
T
4
10
6
T
A
C
G
C
G
3
T
T
C
T
G
C
A
C
G
A
A
A
A
G
T
90
T
T
T
A
T
2
A
A
G
C
T
20
G
C
  3,850,014
  3,852,424
  3,853,123
  3,857,128
  3,859,144
  3,859,400
  3,860,207
  3,860,227
  3,860,292
  3,860,615
  3,862,059
  3,862,274
  3,863,234
  3,863,284
  3,863,373
  3,863,404
  3,864,013
  3,864,388
  3,864,675
  3,865,893
  3,866,147
  3,866,156
  3,866,157
  3,866,164
  3,866,176
  3,866,279
  3,866,371
  3,866,571
  3,866,851
  3,866,966
  3,869,530
  3,869,678
  3,870,327
  3,870,970
  3,871,953
  3,871,986
  3,872,163
  3,874,016
  3,874,695
  3,875,449
  3,876,177
  3,876,331
  3,878,490
  3,878,574
  3,878,631
  3,879,089
  3,880,030
  3,880,566
  3,881,327
  3,881,666
  3,881,706
  3,881,888
  3,882,522
  3,882,585
  3,882,700
  3,882,742
  3,883,582
  3,883,619
  3,883,676
  3,883,697
  3,883,853
  3,883,860
  3,883,870
  3,883,878
  3,883,900
  3,883,919
  3,883,936
  3,883,945
  3,883,999
  3,884,198
  3,884,321
  3,884,450
  3,884,770
  3,885,375
  3,886,228
  3,886,286
  3,886,726
  3,886,873
  3,886,919
  3,886,965
  3,887,129
  3,887,150
  3,887,286
  3,887,510
  3,887,954
  3,888,199
  3,888,424
  3,888,438
  3,888,617
  3,888,757
  3,889,091
  3,889,675
  3,889,785
  3,889,968
  3,890,834
  3,890,894
  3,891,215
  3,891,561
  3,891,880
  3,891,925
  3,892,520
  3,893,132
  3,893,210
  3,893,296
  3,893,335
  3,893,348
  3,893,369
  3,893,419
  3,893,574
  3,893,905
  3,897,271
  3,899,037
  3,899,529
  3,901,247
  3,902,242
  3,902,325
  3,904,181
  3,904,183
  3,904,580
  3,904,886
  3,905,057
  3,905,436
  3,905,564
  3,905,784
  3,906,362
  3,906,967
  3,907,470
  3,907,471
  3,908,447
  3,908,973
  3,909,807
  3,910,521
  3,910,556
  3,910,562
  3,910,564
  3,910,599
  3,910,607
  3,911,338
  3,912,000
  3,912,609
  3,913,068
  3,913,204
  3,913,309
  3,913,368
  3,913,709
  3,915,240
  3,916,216
  3,916,461
  3,916,982
  3,917,118
  3,917,293
  3,917,558
  3,917,768
  3,918,383
  3,920,371
  3,921,088
  3,921,318
  3,922,002
  3,922,152
  3,922,180
  3,922,181
  3,922,585
  3,922,701
  3,923,747
  3,923,787
  3,923,871
  3,924,405
  3,924,770
  3,924,771
  3,924,941
  3,924,967
  3,927,046
  3,927,136
  3,928,217
  3,928,434
  3,929,811
  3,929,990
  3,931,273
  3,931,323
  3,931,340
  3,931,541
  3,931,764
  3,932,324
  3,932,348
  3,933,457
  3,934,244
  3,935,237
  3,935,461
  3,935,545
  3,935,967
  3,936,044
  3,937,041
  3,937,748
  3,937,779
  3,938,357
  3,938,397
  3,939,943
  3,940,027
  3,940,832
  3,940,957
  3,941,211
  3,941,215
  3,942,502
  3,942,791
  3,942,876
  3,943,360
  3,943,543
  3,943,735
  3,943,800
  3,944,272
  3,944,458
  3,944,764
  3,945,168
  3,945,176
  3,946,219
  3,946,653
  3,947,128
  3,947,228
  3,947,370
  3,947,707
  3,947,951
  3,948,030
  3,948,292
  3,948,691
  3,949,136
  3,949,593
  3,949,667
  3,957,603
  3,957,715
  3,961,826
  3,963,968
  3,964,839
  3,965,161
  3,965,397
  3,965,479
  3,966,906
  3,966,910
  3,969,345
  3,969,490
  3,969,626
  3,970,148
  3,970,597
  3,971,246
  3,971,981
  3,972,062
  3,972,803
  3,972,946
  3,973,040
  3,973,080
  3,973,502
  3,973,840
  3,973,965
  3,975,062
  3,975,124
  3,975,145
  3,975,208
  3,975,226
  3,975,484
  3,977,052
  3,977,513
  3,978,174
  3,978,739
  3,979,410
  3,982,341
  3,982,368
  3,982,953
  3,982,967
  3,983,051
  3,984,080
  3,985,697
  3,986,194
  3,987,234
  3,987,567
  3,987,635
-
-
-
G/3
T/3
7
2
T
-
C
G
G
G
T
T
A
G
C
-
-
-
5/-
2/-
7/-
5/-
-
A/11
7/9
T
G
C
G
C
-
-
G
T
-
A
A
A
73
-
12
-
G
T
-
A
G
T
C
C
G
3
C
17
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
6
T
T
T
T
-
-
T
C
-
7
G
T
G
C
13
-
-
T
A
A
T
T
7
C
T
-
G
A
T
C
-
G
-
A
T
G
T
A
C
T
2
-
9
A
-
-
6/-
-
3
G
G
A
T
A
4/-
3
2/-
-
-
T
2
C
G
-
G
-
G
T
C
11
-
-
-
G
A
-
G
A
C
-
T
C
C
-
C
-
-
-
-
C
A
9
11/7
A
A
T
G
-
A/-
C/4
2/-
-
T
5
A
T
G
2
2
C
A
A/2
G
-
G
T
A
4
G
A
-
C
A
3
11
3
C
-
3
G
G
A
-
A
A
A
2
2
-
18/-
A
G
G
G
C
-
T
A
G
5
G
-
G
A
C
A
C
G
T
5
-
-
-
9
-
10/-
6/-
16
G
T
A
A
C
3/-
A
2
-
13
A
A
-
-
-
4
4
5
13
-
15
-
A
G
T/3
T
C
-
T
2
18
T
4
-
T
T