Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 990,844 (bp)   Positions: 215
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
--
--
.41
--
.01
.997
.088
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.029
--
--
.019
.03
.235
.001
.156
.37
--
.118
.001
--
.038
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.09
.07
.011
.012
--
--
.287
.111
.0
.002
.001
.036
.002
.201
.219
.015
--
--
.145
.095
.279
.027
--
--
--
--
--
--
--
--
.097
--
.011
.001
.002
.003
.007
.03
.034
.011
--
.461
--
--
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
--
.004
--
.585
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.004
.001
.133
.56
.554
--
--
.001
.217
--
--
--
--
--
.0
.003
.0
--
--
.129
.013
.005
--
.028
.001
.013
.023
.465
.569
.184
--
.006
.0
.001
.001
--
.002
--
.005
.34
--
--
--
--
.006
.035
.245
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
--
--
--
--
.035
1.0
.018
.002
--
--
--
--
--
.001
.0
.01
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
T
A
T
A
2
2
2
T
C
A
G
A
A
T
G
8
C
A
C
T
G
G
A
C
G
G
A
C
T
T
T
T
T
T
C
C
A
C
3
G
G
G
A
T
A
4
T
2
T
G
G
G
T
T
C
T
A
T
C
G
G
A
5
4
2
G
G
G
G
T
A
A
2
2
T
T
T
A
A
G
C
A
T
A
A
C
G
G
G
A
T
G
A
T
C
A
2
A
A
C
C
C
T
C
A
A
T
T
T
T
C
A
T
T
C
T
2
A
T
T
G
A
C
C
C
A
A
A
G
A
C
2
C
C
C
C
A
T
A
G
C
T
T
C
A
T
2
G
T
G
G
A
A
A
C
A
A
T
A
T
A
T
G
G
G
G
G
C
A
2
T
A
A
A
A
A
T
T
T
G
2
A
G
T
T
C
A
A
A
T
A
T
A
A
18
G
T
T
G
T
T
2
G
T
T
T
T
G
C
A
T
T
A
2
2
  55,637,098
  55,637,168
  55,649,360
  55,658,045
  55,666,828
  55,675,350
  55,683,574
  56,560,052
  56,571,688
  56,571,728
  56,571,805
  56,571,810
  56,571,813
  56,571,816
  56,571,861
  56,577,031
  56,583,743
  56,592,179
  56,611,365
  56,615,639
  56,617,573
  56,621,620
  56,627,976
  56,636,834
  56,645,706
  56,651,905
  56,651,911
  56,651,920
  56,652,054
  56,652,057
  56,652,082
  56,652,096
  56,652,100
  56,652,102
  56,652,105
  56,652,109
  56,685,446
  56,688,514
  56,689,178
  56,697,878
  56,697,887
  56,702,615
  56,702,672
  56,702,727
  56,702,974
  56,703,215
  56,711,951
  56,714,845
  56,715,690
  56,715,789
  56,716,042
  56,719,256
  56,736,109
  56,743,426
  56,743,658
  56,744,978
  56,745,033
  56,745,229
  56,745,309
  56,773,872
  56,773,873
  56,790,205
  56,790,469
  56,790,647
  56,790,649
  56,799,501
  56,804,646
  56,806,328
  56,816,483
  56,849,077
  56,849,086
  56,849,092
  56,852,558
  56,854,617
  56,869,175
  56,869,179
  56,879,161
  56,881,296
  56,903,402
  56,938,088
  56,938,158
  56,938,949
  56,939,069
  56,943,394
  56,943,399
  56,943,485
  56,943,554
  56,943,594
  56,943,623
  56,945,743
  56,945,759
  57,000,193
  57,002,003
  57,019,529
  57,019,535
  57,019,539
  57,019,541
  57,019,547
  57,019,569
  57,019,659
  57,061,549
  57,073,926
  57,094,645
  57,097,275
  57,097,283
  57,105,524
  57,117,234
  57,117,259
  57,118,172
  57,118,336
  57,118,340
  57,118,366
  57,118,387
  57,118,495
  57,118,515
  57,120,957
  57,129,157
  57,136,558
  57,138,569
  57,142,858
  57,143,375
  57,144,855
  57,144,858
  57,144,861
  57,144,874
  57,144,875
  57,144,880
  57,144,884
  57,144,899
  57,144,902
  57,144,905
  57,144,911
  57,144,915
  57,144,924
  57,144,927
  57,144,933
  57,155,580
  57,155,738
  57,157,049
  57,163,986
  57,170,511
  57,170,668
  57,170,673
  57,174,285
  57,174,313
  57,176,985
  57,182,918
  57,186,141
  57,186,173
  57,186,210
  57,186,258
  57,186,269
  57,189,019
  57,189,021
  57,201,929
  57,203,071
  57,210,978
  57,216,933
  57,217,478
  57,220,492
  57,225,322
  57,227,485
  57,227,913
  57,227,971
  57,228,078
  57,228,092
  57,228,103
  57,228,136
  57,238,674
  57,240,107
  57,243,269
  57,243,274
  57,243,275
  57,258,882
  57,260,811
  57,260,850
  57,262,968
  57,266,273
  57,277,318
  57,287,013
  57,287,016
  57,287,022
  57,315,394
  57,317,598
  57,335,107
  57,348,456
  57,348,457
  57,348,470
  57,348,478
  57,348,480
  57,348,482
  57,348,503
  57,348,505
  57,348,542
  57,348,553
  57,348,559
  57,369,928
  57,402,283
  57,412,444
  57,412,456
  57,412,465
  57,440,661
  57,469,163
  57,480,715
  57,482,945
  57,483,006
  57,483,025
  57,491,002
  57,513,001
  57,515,579
  57,536,486
  57,536,495
  57,536,519
  57,536,688
  57,536,921
-
A/-
5
A/G
2/-
-
2/-
T/C
C/G
A/C
T
A/G
A/T
T/G
G/A
-
-
A/C
T
4
G/T
-/GA
A/-
-
G/A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A/3
-
-
G/C
G/T
2
2
-
2
-
5
-
3
G/2
G/A
2
T/C
T/G
C/2
T/C
A/G
T/A
C/A
C
A
-/AC
-
4/-
2/-
-
2
2
G/-
2
G
C
-
2/-
T/C
T/C
T/2
A/C
A/G
A
A
4
-
C
T/C
C/T
G/T
G/A
G/T
A/G
T/A
-
A/2
2
A
C
-
T
T
A
-
2
G
C/G
A/T
-
T/C
T/G
T/A
T/C
C/T
A/C
T/A
T/C
C/A
2
-
2
T/3
T/G
A
T
T
T
T
T
T
T
T
T
T
-
2
C/T
C/A
-
A/C
T/C
A/7
3
2
T/-
T/G
C/T
A/G
C
2/-
G/T
T/C
G/C
G/A
A/C
A/T
A/T
2
C
A/T
2
-
2
G
2
A
A
-
T
T
2
A/-
2/-
A
T
T
G
G
A/2
-
T/3
2
-
-
2
A
2
2
T
G
G
G
G
G
C
G
2
-
-
A
T/G
G/T
T/C
T/A
2/-
G/C
T/-
-
T/A
2
A
-
A/G
-
-
-
-
-