Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 234,718 (bp)   Positions: 377
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.999
.998
.305
.002
.061
.008
--
.548
.455
.446
.0
.007
.003
.004
.002
.431
.002
--
.281
.059
.012
.014
.007
.003
.037
.022
.178
.216
.001
.006
.009
.134
.135
.196
.002
.0
.001
.213
.185
.256
--
.05
.594
.004
.005
.421
.871
.001
.004
.001
.313
.011
.005
.001
.0
.008
.001
.001
.007
.002
.009
.009
.008
.028
.057
.005
.036
.109
.001
.004
.113
.274
.949
.898
.839
.731
.865
.543
.005
.728
.006
.015
.0
.003
.14
.004
.047
.037
.046
--
.313
.003
.0
.0
.006
.002
--
.012
.001
.006
.056
.0
.0
.001
.034
.591
.0
.242
.015
.002
.003
.009
--
--
--
--
.655
.998
.014
.017
.005
.021
.021
.067
--
--
--
.142
.044
.039
.0
.001
.002
--
--
.008
.021
--
--
--
--
--
.54
.039
.244
.01
.006
.003
.003
.0
.002
.001
.995
--
.006
.011
--
.012
.006
.003
.034
--
--
.001
.007
.801
.001
.0
.006
.001
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.175
.247
.0
.024
.002
.006
.006
.004
.144
.037
.02
.001
.077
.0
.144
.229
.206
.119
.001
.003
.007
.405
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.0
.004
.003
.002
.46
.02
.311
.0
.012
.002
.098
.828
.721
.008
.094
.002
.007
.986
1.0
.009
.013
.017
.16
.186
.177
--
.02
--
--
.123
.002
.071
.06
.077
.111
.148
.174
.016
.026
.017
.018
.157
.149
.02
--
--
--
.162
.024
.005
.012
--
--
.009
.028
.258
.007
.032
.004
.001
.298
.116
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.04
.007
--
.014
.012
.017
--
--
--
--
--
--
--
.0
.009
.008
.013
.019
.001
.001
--
--
--
--
.068
--
--
.18
.006
.019
.148
.024
--
.0
--
--
--
--
--
--
.036
--
.001
.023
.052
.03
.0
.148
--
--
--
--
--
--
.018
.022
.017
.235
.179
.035
--
.038
.746
.08
.002
.447
.459
.489
.538
.577
.654
.631
.522
.506
.009
.063
.005
.0
.156
.004
.007
.0
.002
.0
.012
.072
.003
--
--
.001
.041
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
2
T
10
T
G
3
G
T
A
A
A
A
A
C
A
A
G
A
6
23
T
3
C
T
4
G
G
C
T
G
C
A
G
C
T
5
C
C
15
A
G
T
C
C
2
T
T
A
A
T
G
2
T
G
G
G
A
T
C
G
T
G
G
C
A
T
T
A
C
G
G
3
T
C
4
5
5
G
C
T
T
A
3
T
C
A
C
G
G
C
T
T
G
T
G
G
T
C
C
G
G
C
T
C
T
T
A
A
G
T
4
6
4
A
G
C
T
C
T
A
C
A
6
12
A
T
2
G
G
G
12
C
C
C
C
C
T
C
C
T
G
C
G
C
A
T
G
G
A
A
A
6
T
A
G
C
G
G
C
C
T
G
A
A
C
T
C
T
T
T
G
T
C
T
A
T
T
C
T
T
A
C
A
C
C
A
G
C
C
T
G
C
G
A
A
C
T
A
C
G
T
T
G
T
T
G
A
11
A
A
G
G
G
2
G
G
C
G
10
T
G
A
G
C
2
C
8
G
G
C
T
C
C
A
C
T
C
C
G
A
T
A
4
3
C
C
A
2
T
5
T
G
A
A
G
T
C
A
A
T
T
A
C
T
2
4
C
A
G
A
T
A
G
4
C
C
G
G
A
G
A
T
T
T
G
C
C
T
A
A
A
A
C
C
A
A
A
A
T
G
A
T
C
G
T
T
G
C
C
T
A
C
G
T
G
G
G
A
4
G
T
T
T
T
T
7
G
T
G
C
A
C
G
T
G
T
C
A
C
T
C
3
2
G
G
C
T
A
C
C
2
A
T
T
A
A
6
4
T
5
G
T
9
A
A
T
C
A
T
A
T
T
C
A
9
T
T
  118,227,644
  118,227,993
  118,228,074
  118,228,160
  118,228,844
  118,229,096
  118,229,428
  118,231,353
  118,231,721
  118,231,724
  118,231,725
  118,231,802
  118,232,826
  118,233,337
  118,233,368
  118,233,375
  118,233,960
  118,234,484
  118,234,852
  118,234,882
  118,235,010
  118,236,021
  118,236,036
  118,236,040
  118,236,044
  118,236,199
  118,236,209
  118,236,216
  118,236,219
  118,236,253
  118,236,271
  118,236,276
  118,237,506
  118,237,951
  118,237,956
  118,238,019
  118,238,023
  118,238,046
  118,240,119
  118,240,151
  118,240,404
  118,240,705
  118,240,871
  118,241,806
  118,242,784
  118,242,785
  118,243,387
  118,243,500
  118,244,656
  118,245,334
  118,246,131
  118,246,843
  118,246,959
  118,246,960
  118,246,965
  118,246,987
  118,249,458
  118,249,616
  118,249,622
  118,249,690
  118,249,809
  118,249,921
  118,250,619
  118,251,422
  118,251,509
  118,251,643
  118,251,662
  118,251,748
  118,252,664
  118,252,674
  118,252,679
  118,252,690
  118,252,699
  118,252,793
  118,252,797
  118,252,803
  118,252,810
  118,252,882
  118,253,000
  118,253,131
  118,254,963
  118,255,100
  118,255,102
  118,255,554
  118,255,617
  118,255,786
  118,255,813
  118,256,902
  118,256,980
  118,257,231
  118,257,270
  118,258,488
  118,258,830
  118,259,085
  118,261,924
  118,262,423
  118,264,256
  118,267,906
  118,268,551
  118,268,760
  118,269,336
  118,269,877
  118,271,360
  118,271,480
  118,271,487
  118,271,634
  118,272,340
  118,272,835
  118,273,498
  118,274,399
  118,275,057
  118,275,075
  118,275,644
  118,277,291
  118,277,508
  118,277,760
  118,277,837
  118,278,308
  118,278,569
  118,279,852
  118,279,940
  118,280,418
  118,280,904
  118,280,990
  118,282,089
  118,282,234
  118,282,642
  118,282,645
  118,284,335
  118,284,367
  118,284,405
  118,284,457
  118,284,470
  118,284,662
  118,284,828
  118,284,831
  118,285,150
  118,285,638
  118,286,262
  118,286,807
  118,286,823
  118,287,220
  118,287,671
  118,288,906
  118,289,089
  118,290,651
  118,292,298
  118,292,319
  118,292,672
  118,292,722
  118,292,841
  118,293,191
  118,293,573
  118,294,006
  118,295,665
  118,296,895
  118,296,999
  118,307,476
  118,307,800
  118,307,954
  118,308,015
  118,308,805
  118,309,187
  118,309,206
  118,310,551
  118,311,114
  118,311,240
  118,312,326
  118,312,410
  118,312,698
  118,313,368
  118,313,525
  118,318,819
  118,318,831
  118,318,847
  118,318,857
  118,318,866
  118,318,872
  118,318,900
  118,318,954
  118,319,435
  118,320,042
  118,320,187
  118,320,550
  118,321,061
  118,321,667
  118,321,769
  118,321,854
  118,322,237
  118,323,480
  118,323,562
  118,323,623
  118,323,627
  118,323,973
  118,324,609
  118,325,131
  118,326,551
  118,326,567
  118,326,584
  118,326,775
  118,327,212
  118,327,278
  118,327,641
  118,328,012
  118,328,880
  118,328,944
  118,330,653
  118,330,656
  118,330,756
  118,331,280
  118,331,399
  118,331,558
  118,331,661
  118,332,312
  118,332,729
  118,333,031
  118,333,721
  118,333,983
  118,335,450
  118,335,863
  118,336,289
  118,336,602
  118,337,234
  118,337,723
  118,338,092
  118,339,318
  118,340,172
  118,340,993
  118,341,169
  118,342,072
  118,342,101
  118,342,580
  118,342,585
  118,343,228
  118,343,241
  118,343,595
  118,343,791
  118,344,688
  118,346,591
  118,347,457
  118,348,151
  118,349,481
  118,349,906
  118,351,117
  118,351,210
  118,352,057
  118,352,063
  118,352,065
  118,352,070
  118,352,073
  118,352,080
  118,352,138
  118,352,145
  118,353,201
  118,353,414
  118,354,257
  118,354,732
  118,356,133
  118,359,350
  118,364,173
  118,364,767
  118,368,145
  118,368,878
  118,369,006
  118,369,744
  118,369,825
  118,369,841
  118,372,120
  118,373,392
  118,374,159
  118,375,307
  118,375,851
  118,375,862
  118,376,384
  118,380,152
  118,380,437
  118,381,008
  118,381,168
  118,381,658
  118,381,758
  118,382,491
  118,383,051
  118,383,718
  118,383,789
  118,384,009
  118,384,094
  118,385,414
  118,385,637
  118,385,921
  118,386,792
  118,387,105
  118,387,332
  118,388,263
  118,388,305
  118,391,261
  118,391,262
  118,391,391
  118,391,456
  118,391,520
  118,391,953
  118,392,060
  118,392,326
  118,392,552
  118,392,994
  118,393,681
  118,394,305
  118,398,189
  118,399,028
  118,399,329
  118,399,359
  118,401,824
  118,402,741
  118,402,798
  118,402,836
  118,402,867
  118,402,884
  118,402,989
  118,403,404
  118,403,675
  118,405,932
  118,407,832
  118,409,558
  118,410,622
  118,411,279
  118,412,059
  118,412,241
  118,413,314
  118,413,323
  118,413,735
  118,413,852
  118,414,199
  118,414,326
  118,414,623
  118,414,916
  118,415,956
  118,415,996
  118,416,064
  118,418,304
  118,418,514
  118,418,542
  118,419,164
  118,419,169
  118,419,395
  118,421,127
  118,426,202
  118,429,358
  118,438,842
  118,441,564
  118,441,798
  118,441,994
  118,442,134
  118,443,285
  118,443,287
  118,443,288
  118,443,290
  118,443,292
  118,443,301
  118,443,309
  118,443,316
  118,443,320
  118,443,423
  118,443,690
  118,444,240
  118,444,292
  118,444,423
  118,444,945
  118,445,174
  118,446,221
  118,448,028
  118,449,316
  118,450,661
  118,450,781
  118,452,055
  118,453,035
  118,453,051
  118,456,751
  118,458,421
-
5
-
13
A
3/5
T
C
G
2
G
3/13
T
T
C
T
A
T
6/-
-
-
-
G
G
-
-
A
G
C
A
T
T
T
-
-
-
7
A
-
G
A
C
T
A
2/-
T/-
A
G
T
G
C
-
A
T
2
A
4
C
3
A
G
A
A
T
C
A
G
C
-
-
-
-
-
-
-
-
-
2
T
C
A
C
-
G
T
G
G
C
A
2
-
A
A
C
T
A
C
T
T
A
T
9
G
T
C
2
T
G
A
G
-
-
-
G
A
T
C
-
C
G
A
T
-
-
T
-
2/-
G/3
-
2
-
-
-
A
-
A
C
T
G
G
A
4
C
2
T
A
T
A
T
C
-
-
A
C
A
2
C
-
T
T
-
12
-
T
A
C
T
2
C
C
C
A
-
G
-
-
C
G
C
C
G
T
C
A
T
G
A
T
T
2
A
2
C
9
C
T
G
G
T
C
C
-
A
C
-
A
A/-
11/-
G
A/T
3
A
A
-
A
A
T
A
10/-
5/9
2
G
A
T
-
2
-
A
3
T
G
A
A
A/-
C/A
4
A
A
C
-
C
G
-
3/-
T
C/3
A/2
2/-
T/3
5/-
T/4
G/-
A/2
G
A
13
T
C
T
C
A
19
G
A
-
-
G
G
A
G
C
-
-
-
T
T
59
A
G
A
G
T/-
2
C
C
2
T
C
G
T
T
72
2
T
-
T
G
T
C
T
G
G
T
2
7
A
A
T
G
9
-
T
2
2
T
C
2
G
-
T
G
G
A
C
A
-
A
-
A
T
T
2
A
C
A
-
A
17
T
C
G
-
-
C
A
G
G
G
A
A
-
A/T
T/2
T/3
A/4
A/6
6/-
4/-
T/19
5/-
A
G
-
G
2
C
T
G
-
C
4
-
2
-
-
9
-