Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 234,718 (bp)   Positions: 263
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.002
.057
.03
.124
.008
--
.007
.003
.004
.431
.002
.059
.012
.0
.002
.001
.001
.0
.03
.009
.037
.022
.001
.011
.185
.256
.05
.594
.004
.004
.421
.871
.001
.004
.003
.001
.0
.044
.008
.001
.009
.007
.002
.009
.153
.576
.009
.028
.057
.005
.018
.274
.865
.543
.005
.018
.007
.728
.0
.003
.004
.0
.032
.0
.003
.039
.006
.002
.104
.045
.001
.116
.012
.09
.0
.006
.005
--
--
--
.655
.021
.67
.142
.044
.002
.001
.0
.0
.0
.0
.004
--
.012
.003
.178
.001
.209
.007
.801
.001
.0
.243
.0
.233
.084
.006
--
--
--
--
.175
.039
.001
.069
.193
.003
--
.011
--
--
--
--
.001
.0
.004
.003
.0
.018
.007
.986
1.0
.017
.193
.001
.327
.02
--
--
.001
.002
.017
.02
--
--
.089
.141
.005
.005
.001
--
--
.01
.009
.182
.133
.102
.022
.008
.07
.011
.047
.006
.007
.258
.01
.004
.003
.009
.01
.004
.007
.032
.004
.007
.181
.004
.002
.007
--
--
--
.014
.117
.02
.101
.142
.298
.116
--
--
--
--
--
--
--
.002
.04
.007
.012
.003
.017
--
--
--
.0
.008
.004
.004
.019
.003
.001
.063
.058
--
--
--
--
.068
.004
--
.18
.019
.024
.0
--
--
--
--
--
--
.053
.023
.052
.0
--
--
--
.019
.029
--
--
.018
.017
.035
.003
.315
.038
.002
--
--
.003
.166
.007
.261
.005
.0
.001
.002
.061
.0
--
.041
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
C
5
A
G
T
T
C
A
G
A
T
3
4
C
T
T
C
G
C
G
G
G
T
A
G
C
C
2
A
T
A
A
T
G
G
A
G
A
T
A
G
T
G
A
A
G
A
T
T
T
T
G
C
T
G
A
T
T
C
C
G
A
T
A
G
G
T
G
G
G
G
C
T
T
C
C
T
A
T
C
6
C
G
G
C
C
T
2
T
A
G
3
C
T
C
C
G
T
C
A
T
A
T
T
G
C
C
T
T
A
A
G
A
T
G
T
T
A
C
A
T
G
G
G
G
C
A
G
T
C
C
T
A
G
G
T
A
T
G
C
A
A
A
T
C
A
G
T
14
C
C
T
A
3
T
T
A
G
C
T
A
A
G
A
A
T
C
T
A
G
T
A
G
C
C
G
T
A
G
T
G
A
G
A
T
C
C
C
G
A
C
C
T
G
C
T
C
T
A
G
A
C
A
T
G
T
G
C
G
G
T
T
T
G
C
C
T
A
C
C
T
G
A
G
T
T
T
T
T
T
A
C
A
G
G
T
C
C
A
C
T
C
2
C
G
T
A
2
T
C
3
A
C
T
G
A
C
T
2
A
T
T
  118,228,844
  118,228,963
  118,229,094
  118,229,098
  118,229,428
  118,231,353
  118,232,266
  118,233,337
  118,233,368
  118,233,960
  118,234,484
  118,235,010
  118,236,021
  118,236,115
  118,236,124
  118,236,128
  118,236,135
  118,236,136
  118,236,176
  118,236,196
  118,236,199
  118,236,209
  118,236,253
  118,236,861
  118,240,151
  118,240,404
  118,240,871
  118,241,806
  118,242,784
  118,243,209
  118,243,387
  118,243,500
  118,244,656
  118,245,334
  118,246,084
  118,246,131
  118,246,156
  118,246,299
  118,249,458
  118,249,616
  118,249,646
  118,249,690
  118,249,809
  118,249,921
  118,250,247
  118,250,316
  118,250,619
  118,251,509
  118,251,643
  118,251,662
  118,252,429
  118,252,699
  118,252,882
  118,253,000
  118,253,131
  118,253,864
  118,253,876
  118,254,963
  118,255,554
  118,255,617
  118,255,813
  118,256,405
  118,258,243
  118,259,085
  118,261,422
  118,262,342
  118,262,423
  118,264,256
  118,265,952
  118,268,619
  118,268,760
  118,269,530
  118,269,761
  118,270,429
  118,271,360
  118,271,623
  118,275,660
  118,276,602
  118,277,291
  118,277,837
  118,278,308
  118,280,904
  118,284,019
  118,284,335
  118,284,367
  118,284,662
  118,286,687
  118,290,256
  118,291,063
  118,292,339
  118,292,841
  118,296,834
  118,307,474
  118,307,800
  118,308,015
  118,308,337
  118,310,551
  118,310,724
  118,311,114
  118,311,240
  118,312,327
  118,312,410
  118,313,242
  118,313,525
  118,315,279
  118,317,300
  118,317,318
  118,318,907
  118,318,954
  118,319,017
  118,319,435
  118,320,187
  118,320,333
  118,323,973
  118,324,206
  118,325,032
  118,327,278
  118,328,187
  118,328,879
  118,329,336
  118,330,779
  118,330,780
  118,331,558
  118,332,629
  118,332,729
  118,333,031
  118,333,721
  118,336,602
  118,340,276
  118,342,101
  118,342,580
  118,342,585
  118,343,595
  118,343,946
  118,344,105
  118,347,180
  118,348,151
  118,349,481
  118,349,906
  118,350,259
  118,351,210
  118,353,201
  118,356,133
  118,359,350
  118,364,173
  118,367,995
  118,368,123
  118,368,939
  118,369,006
  118,369,764
  118,369,841
  118,370,909
  118,371,705
  118,372,120
  118,373,280
  118,373,310
  118,373,324
  118,373,493
  118,373,502
  118,373,541
  118,373,663
  118,373,704
  118,373,770
  118,373,771
  118,374,159
  118,374,356
  118,374,685
  118,374,693
  118,374,844
  118,374,993
  118,375,161
  118,375,307
  118,375,851
  118,375,862
  118,376,394
  118,376,439
  118,376,600
  118,376,764
  118,376,795
  118,376,944
  118,377,040
  118,377,063
  118,377,601
  118,377,850
  118,378,361
  118,378,765
  118,379,139
  118,380,152
  118,380,437
  118,381,168
  118,381,658
  118,382,747
  118,383,019
  118,383,789
  118,384,009
  118,384,094
  118,385,295
  118,385,414
  118,385,637
  118,387,105
  118,387,339
  118,388,023
  118,388,263
  118,391,456
  118,391,520
  118,391,953
  118,392,326
  118,392,513
  118,392,562
  118,392,994
  118,393,551
  118,394,305
  118,395,712
  118,396,605
  118,398,189
  118,399,028
  118,399,329
  118,399,359
  118,401,824
  118,402,020
  118,402,741
  118,402,836
  118,402,884
  118,403,404
  118,405,932
  118,406,802
  118,407,832
  118,409,558
  118,411,279
  118,411,536
  118,412,059
  118,412,455
  118,413,852
  118,414,199
  118,414,623
  118,415,956
  118,415,996
  118,416,064
  118,416,884
  118,417,776
  118,418,514
  118,418,542
  118,419,164
  118,419,395
  118,429,358
  118,432,757
  118,437,399
  118,441,564
  118,442,134
  118,442,135
  118,442,199
  118,444,246
  118,445,050
  118,445,174
  118,445,484
  118,445,913
  118,446,221
  118,448,027
  118,448,028
  118,448,217
  118,449,316
  118,452,757
  118,458,421
A
2
-
5
T
T/C
C
C/T
C
A
T
-
-
-
A
A
T/G
C/A
A
T
-
A
A
A
A/G
A
T
C/A
-
G
A
G
T
G
C
C
G
A
4
C
G
A
G
A
T
G
A
C
T/A
T/G
-
-
2
T
C
T
A/T
A
G
T
G
A
A/T
T/C
T
3
A
C
C
A
G/A
T
T
T/2
G
G
C/T
C
G
C
-
6/-
A
-
2
A
T
A
-
T/G
-
A
3/-
T
-
T
A
A
C
T
-
C
2
A
C
G/17
T
T
T/C
G
A/G
C
C
9
2
A
-
G
3
T
C
A
A
G/A
A
A
T
G
2
T/G
A
A
4
A/G
A
G/3
C
G
G
A
T
G
C
T
C
T
A/15
A
A
-
G
T
G
G
3/-
T/C
T/G
G
A
C/G
-
C
A/G
G/A
A/G
G
G
G
C
C
T
C
-
-
C/15
5
T
C
G
T
T/2
A
G
A
G
C
G
T
T
A
G
T
A
C
G/C
2
C
T
C
T
T
G
2
T
C
T
G
T
T
2
A
A
-
C
A
T
G
9
-
T
T
2
C
G
T
2
G
G
C
T/C
T/A
T
T
T
A
A
-
A
T
G
T
C
G
-
G
A
A
G
2/-
T/-
G
-
A/G
T
C
2
G
C/2
T/-
-
C
G
-