Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 82,207 (bp)   Positions: 330
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.041
1.0
.001
.003
.001
.021
.001
.045
.015
.001
.004
.005
.0
.002
.008
.012
.007
.0
.0
.002
.005
.001
.003
.009
.005
.0
.004
.001
.001
.006
.166
.606
.003
.005
.216
.001
.027
.042
.154
.07
.031
.013
.01
.429
.022
.27
--
.121
.014
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.036
.541
.04
.0
.0
.005
.141
--
--
.001
.002
.001
.003
.035
.092
--
--
--
--
--
.007
.162
.155
.058
.025
.113
.071
.001
.009
.187
.0
.0
.0
.032
.01
.005
.001
.032
.085
.027
--
--
--
--
.002
.0
.006
.089
.086
.014
.12
.069
.166
.04
.006
.009
--
--
--
--
.005
.013
.017
.003
.043
.091
.001
.144
--
--
--
--
--
--
.001
.014
.012
.387
.005
.002
.878
.002
.01
.002
.0
.001
.009
.003
.095
.054
.083
.053
.205
.11
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
1.0
.002
.031
.154
.026
.061
.401
.001
.026
.036
.003
.022
.006
.039
.016
.003
.008
.031
.345
.003
.0
.0
.005
.012
.001
.0
.001
.003
.0
.008
.001
.0
.002
.428
.202
.003
.016
.008
.0
.05
.438
.391
.022
.171
.001
.981
.965
.306
.638
.001
.283
.257
.404
.001
.127
.132
.132
.0
.995
.009
.012
.979
.875
.0
1.0
.26
.003
.0
.065
.001
.4
.017
.001
.072
.003
.012
.226
.331
.301
.023
.183
.247
.247
.25
.674
.049
.003
.319
.003
.016
.021
.005
.023
.001
.005
.07
.03
.008
.036
.258
.021
.002
.023
.002
.001
.001
.016
.015
.06
.001
.039
.032
.047
.0
.0
.962
.062
.007
.001
.002
.003
.001
.001
.0
.004
.0
.005
.004
.001
.008
.001
.075
.149
.066
.001
.002
.0
.004
.0
.001
.001
.003
.003
.001
.002
.0
.001
.002
.0
.0
.002
.007
.018
.0
.005
.001
.025
.005
.004
.019
.024
.067
.184
.001
.404
.036
1.0
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
G
A
2
A
G
T
G
C
A
A
T
C
C
C
A
T
T
2
C
C
8
4
T
G
A
T
G
A
T
G
T
A
T
G
A
T
A
G
G
T
G
A
A
A
C
G
C
A
A
C
T
C
T
2
A
C
T
G
T
A
G
T
C
A
G
G
C
12
T
4
G
C
A
G
C
T
C
C
G
A
A
A
T
G
G
A
T
A
A
A
G
T
A
A
A
T
T
T
A
3
G
A
A
C
T
G
T
T
C
C
A
T
T
C
A
C
G
A
6
T
A
G
4
T
A
A
G
G
G
T
C
G
G
T
T
G
5
C
A
C
G
T
G
G
A
C
C
T
C
T
T
A
A
A
A
G
6
2
A
C
A
T
A
T
C
C
A
A
C
G
C
T
A
G
A
C
T
C
A
T
9
A
G
T
A
G
G
A
G
A
2
A
T
C
A
G
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
G
T
T
C
T
A
T
A
2
2
C
5
C
T
T
A
G
C
C
A
C
G
T
T
A
T
G
C
G
G
G
G
G
G
T
8
T
C
T
A
C
C
T
T
A
C
T
G
T
A
C
G
A
G
T
T
C
A
A
2
T
A
G
G
C
C
G
A
A
T
G
T
T
T
T
A
G
A
C
G
C
T
G
A
T
G
C
G
G
T
T
G
A
C
C
A
A
C
C
C
G
C
C
C
C
C
G
G
C
G
G
G
G
G
A
T
G
T
2
  13,388,092
  13,388,326
  13,389,166
  13,389,168
  13,389,169
  13,389,511
  13,389,676
  13,390,426
  13,393,405
  13,393,463
  13,393,509
  13,393,515
  13,393,521
  13,393,544
  13,393,555
  13,393,565
  13,393,572
  13,393,626
  13,393,629
  13,394,235
  13,394,372
  13,394,794
  13,394,798
  13,397,538
  13,398,793
  13,399,140
  13,399,761
  13,400,255
  13,400,347
  13,402,371
  13,403,130
  13,405,218
  13,405,775
  13,405,854
  13,406,293
  13,407,933
  13,409,048
  13,409,467
  13,409,540
  13,409,583
  13,409,588
  13,409,684
  13,410,123
  13,410,563
  13,410,925
  13,411,692
  13,412,598
  13,413,392
  13,413,503
  13,413,907
  13,414,103
  13,414,178
  13,414,313
  13,414,428
  13,414,918
  13,414,919
  13,415,085
  13,415,555
  13,415,603
  13,415,944
  13,416,391
  13,416,421
  13,416,884
  13,417,130
  13,417,313
  13,417,778
  13,417,822
  13,418,621
  13,419,000
  13,419,585
  13,419,599
  13,420,188
  13,420,244
  13,420,767
  13,420,856
  13,421,388
  13,421,400
  13,421,414
  13,421,462
  13,421,516
  13,421,913
  13,421,999
  13,422,002
  13,422,196
  13,422,244
  13,422,961
  13,423,552
  13,424,010
  13,424,148
  13,424,966
  13,425,489
  13,426,090
  13,426,645
  13,427,258
  13,427,279
  13,427,640
  13,427,950
  13,428,029
  13,428,395
  13,429,325
  13,429,439
  13,429,460
  13,429,478
  13,429,487
  13,429,737
  13,430,706
  13,430,889
  13,430,903
  13,431,010
  13,431,044
  13,431,104
  13,431,350
  13,431,509
  13,431,520
  13,432,186
  13,432,764
  13,432,895
  13,432,931
  13,432,971
  13,432,981
  13,433,059
  13,433,066
  13,433,122
  13,433,154
  13,433,261
  13,433,283
  13,433,637
  13,433,712
  13,433,751
  13,433,753
  13,433,779
  13,433,781
  13,433,835
  13,433,887
  13,433,915
  13,435,316
  13,435,417
  13,435,593
  13,435,874
  13,435,967
  13,436,620
  13,436,748
  13,436,915
  13,437,077
  13,437,155
  13,437,488
  13,437,731
  13,437,801
  13,437,933
  13,438,125
  13,438,370
  13,438,497
  13,438,554
  13,438,850
  13,439,283
  13,439,462
  13,439,512
  13,439,515
  13,439,529
  13,439,538
  13,439,568
  13,439,744
  13,439,757
  13,440,371
  13,440,918
  13,441,048
  13,441,167
  13,441,254
  13,441,333
  13,441,375
  13,441,761
  13,441,833
  13,441,931
  13,442,028
  13,442,564
  13,442,596
  13,442,706
  13,442,843
  13,442,909
  13,443,040
  13,443,051
  13,443,326
  13,443,712
  13,443,899
  13,443,931
  13,444,033
  13,444,129
  13,444,272
  13,444,412
  13,444,761
  13,445,381
  13,445,418
  13,445,428
  13,445,929
  13,445,936
  13,446,051
  13,446,302
  13,446,307
  13,446,429
  13,446,447
  13,446,465
  13,446,473
  13,446,491
  13,446,509
  13,446,545
  13,446,563
  13,446,573
  13,446,599
  13,446,609
  13,446,617
  13,446,627
  13,446,635
  13,446,752
  13,446,869
  13,446,929
  13,446,936
  13,447,990
  13,448,374
  13,448,484
  13,448,555
  13,450,061
  13,450,215
  13,450,293
  13,451,255
  13,451,316
  13,451,473
  13,451,628
  13,451,795
  13,451,811
  13,451,861
  13,451,865
  13,451,889
  13,452,123
  13,452,293
  13,452,374
  13,452,872
  13,453,384
  13,453,550
  13,453,619
  13,453,631
  13,453,668
  13,453,686
  13,453,696
  13,453,707
  13,453,738
  13,453,739
  13,453,744
  13,454,134
  13,454,189
  13,454,296
  13,454,313
  13,454,647
  13,454,860
  13,455,293
  13,455,577
  13,455,598
  13,455,799
  13,456,022
  13,456,381
  13,456,767
  13,456,924
  13,457,123
  13,457,322
  13,458,057
  13,458,107
  13,458,190
  13,458,279
  13,458,371
  13,458,803
  13,458,815
  13,458,849
  13,459,151
  13,459,320
  13,459,517
  13,460,592
  13,460,917
  13,461,000
  13,461,321
  13,461,753
  13,462,028
  13,462,179
  13,462,221
  13,463,043
  13,463,066
  13,463,395
  13,463,476
  13,463,530
  13,463,803
  13,464,962
  13,465,546
  13,465,635
  13,466,114
  13,466,334
  13,466,472
  13,466,695
  13,468,437
  13,468,506
  13,468,529
  13,468,541
  13,468,544
  13,468,568
  13,468,594
  13,468,607
  13,468,609
  13,468,632
  13,468,633
  13,468,640
  13,468,644
  13,468,646
  13,468,658
  13,468,661
  13,468,680
  13,468,684
  13,468,696
  13,468,699
  13,468,702
  13,468,706
  13,468,718
  13,468,752
  13,468,754
  13,468,762
  13,468,766
  13,468,770
  13,468,771
  13,468,773
  13,468,775
  13,468,806
  13,469,928
  13,470,041
  13,470,109
G
A
A/-
2/-
4
3
2
G/2
G
C
-
2
T
A
2
G
C
A
-
4/T
T
8/-
4/-
2
G/T
2
G
T
G
-
A
3
A/G
C
2
G
C
G
T
A
C
C
-
3
3
3
G/T
T
G
C
T
C
T
C
-
-
C/2
-
2
G
C
A
-
T
G
A
A
T
-
G
-
A
T
C
T
T
C
T
-
T
G
A/3
3
C
2
A
G
C
C
-
C
2
C
G
G
G
2
A
C
C
-
G/A
A/G
A/G
T
C
T
C
C
T
T
G
C
A
T
G
T
C
-
-
A
G
A
-
C
3
G
5/3
C
C
3
G
C
A
C
C
A
-
T
G
A
2
2
A
A
G
T
T
11/C
T
-
-
G
T
G
A/G
G/C
6/-
2/-
A/G
C/A
A/C
?
G
C
A
3
G
T
G
C
T
C
C
T
-
T
C
T
G
C
-
9
A
3
G
A
A
G
A
C
-
G
G
T
G
C
-
C/T
C/T
C/T
C/G
C/G
C/G
C/G
C/G
C/T
C/G
C/T
C/G
C/T
G/C
A
G
T
A
G
2
A/3
-
-
T
-
T
15/13
C
G
A
G
T
T
A
A
-
C
G
C
C
T
A
4
GT/3
4
G/T
G/3
T/-
8/-
A
G
C
G
G
4
C
C
-
T
A
A
C
G
CT/3
9
G
A
-
G
T
G
G
-
G
G
A
A
T
T
A
G
G
C
T
A
C
2
C
2
C
G
T
C
T
C
C
G
2
T
T
A
A
G
A
T
G
A
G
G
T
G
T
T
-
2
G
A
G
A
A
T
A
T
T
T
T
T
T
2
A
A
-