Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 82,207 (bp)   Positions: 188
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.041
1.0
.001
.001
.045
.015
.001
.004
.005
.0
.002
.008
.007
.0
.0
.002
.001
--
--
--
.009
.0
.001
.001
.0
.606
.005
.001
.336
.127
.138
.021
.065
.063
.143
.101
.013
.01
.27
--
.002
.006
.007
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.033
.0
--
.001
.001
.002
.001
.001
.003
.035
.092
.075
.001
.0
--
--
--
--
.162
.155
.149
.06
.004
.001
.0
.009
.0
.027
.187
.016
.0
.001
.001
.085
--
.002
.002
.007
--
--
--
--
.024
.003
.144
.009
.032
.029
.001
.028
.025
.109
.003
.997
.878
.001
.095
.404
--
--
--
--
.061
.022
.0
.024
.003
.005
.0
.05
.021
.141
.228
.875
.0
.4
.001
.301
.247
.247
.319
.0
.016
.036
.002
.002
.078
.015
.006
.962
.003
.0
1.0
.0
.0
.008
.003
.026
.129
.066
.001
.002
.0
.004
.0
.001
.001
.003
.003
.001
.002
.0
.001
.002
.0
.0
.007
.018
.0
.005
.001
.025
.005
.004
.019
.024
.067
.184
.001
.997
.883
.933
.404
1.0
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
Gnai1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
G
A
G
G
C
A
A
T
C
C
C
T
T
2
C
8
C
G
T
T
A
A
C
G
T
T
3
2
G
C
T
C
G
A
C
G
A
C
C
A
T
A
A
T
T
A
2
A
A
G
C
T
C
C
A
12
8
T
4
A
C
C
A
G
C
G
G
T
C
C
G
A
A
T
4
G
A
C
A
G
T
A
A
T
C
T
T
3
C
T
A
C
G
2
A
C
4
G
C
2
A
C
C
A
6
C
C
C
A
T
C
4
G
G
A
A
G
C
C
A
A
C
C
C
10
G
T
A
T
A
G
G
T
A
G
C
C
G
T
C
G
C
A
T
A
C
A
A
T
2
G
T
G
C
G
G
T
T
G
A
C
C
A
A
C
C
C
G
C
C
C
C
G
G
C
G
G
G
G
G
A
T
C
A
T
G
2
  13,388,092
  13,388,326
  13,389,169
  13,390,102
  13,390,426
  13,393,405
  13,393,463
  13,393,509
  13,393,515
  13,393,521
  13,393,544
  13,393,555
  13,393,572
  13,393,626
  13,393,629
  13,394,235
  13,394,794
  13,396,203
  13,396,349
  13,396,362
  13,397,538
  13,399,140
  13,400,347
  13,404,609
  13,404,640
  13,405,218
  13,405,854
  13,406,181
  13,406,294
  13,406,569
  13,407,249
  13,407,679
  13,408,838
  13,408,913
  13,408,982
  13,409,299
  13,409,684
  13,410,123
  13,411,692
  13,412,711
  13,413,440
  13,413,590
  13,413,868
  13,413,907
  13,414,114
  13,414,178
  13,414,353
  13,414,918
  13,414,919
  13,415,554
  13,415,603
  13,415,824
  13,415,944
  13,416,081
  13,416,618
  13,417,313
  13,419,000
  13,419,004
  13,419,585
  13,419,599
  13,420,119
  13,420,204
  13,420,244
  13,420,767
  13,420,856
  13,421,108
  13,421,127
  13,421,128
  13,421,400
  13,421,414
  13,421,462
  13,421,516
  13,421,999
  13,422,002
  13,422,004
  13,422,197
  13,423,758
  13,423,862
  13,423,872
  13,424,148
  13,424,428
  13,424,566
  13,424,966
  13,426,356
  13,426,645
  13,427,884
  13,427,950
  13,428,395
  13,429,439
  13,429,737
  13,430,531
  13,430,550
  13,432,895
  13,432,936
  13,432,985
  13,432,986
  13,433,009
  13,433,154
  13,433,712
  13,434,528
  13,434,606
  13,434,607
  13,434,629
  13,434,802
  13,435,219
  13,435,895
  13,435,965
  13,436,613
  13,436,620
  13,437,488
  13,437,933
  13,438,663
  13,439,643
  13,439,650
  13,439,678
  13,439,744
  13,441,333
  13,443,078
  13,443,117
  13,443,319
  13,443,712
  13,444,033
  13,446,473
  13,446,491
  13,447,949
  13,448,485
  13,448,518
  13,451,473
  13,451,865
  13,452,293
  13,452,872
  13,453,686
  13,453,738
  13,453,739
  13,454,313
  13,454,513
  13,454,860
  13,457,123
  13,458,107
  13,458,279
  13,458,670
  13,459,182
  13,460,526
  13,461,753
  13,463,066
  13,463,530
  13,464,401
  13,464,935
  13,464,962
  13,466,334
  13,466,366
  13,468,078
  13,468,436
  13,468,506
  13,468,529
  13,468,541
  13,468,544
  13,468,568
  13,468,594
  13,468,607
  13,468,609
  13,468,632
  13,468,633
  13,468,640
  13,468,644
  13,468,646
  13,468,658
  13,468,661
  13,468,680
  13,468,684
  13,468,699
  13,468,702
  13,468,706
  13,468,718
  13,468,752
  13,468,754
  13,468,762
  13,468,766
  13,468,770
  13,468,771
  13,468,773
  13,468,775
  13,468,806
  13,469,194
  13,469,248
  13,469,752
  13,469,928
  13,470,109
G
A
A/4
T
G/2
G
C
-
2
T
A
2
C
A
-
4
-
T
G/T
T/C
2
2
G
T
A
3
C
-
-
2
T
C
A
A
C
T
C
-
CT/3
C/T
-
C
G
C
C
C
G
-
-
2
4
T
G
T
T
G
12/-
-
G
-
T
T
T
C
T
T
G/2
GT/T
C
T
-
T
3
A/3
T/A
-
A
G
G
C
A
C
-
C
C
T
2
C
-
T
C
T
T
A
2/-
A/-
T
-
5
T
-
-
A
A
T
-
A
T
A
G
11/C
T
4/-
G/A
A
A/C
T
T
T
2
9
G
C/G
C/G
A
-
G/A
C
T
-
G
2
G/3
T/-
G
A
4
3/CT
A
G
T
A
T
G
C
2
T
G
G
C
-
T
-
T
T
A
A
G
A
T
G
A
G
G
T
G
T
T
-
2
A
G
A
A
T
A
T
T
T
T
T
T
2
T
G
A
A
-