Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 59,932 (bp)   Positions: 225
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
RGSC 3.4  
.001
.009
.0
.002
.001
.0
.077
.001
.0
.001
.0
.0
.001
.0
.0
.009
.001
.001
.006
.0
.0
--
--
.0
.001
.007
.001
--
.002
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.003
.002
.029
.064
.018
.997
.995
.993
.993
.942
.996
.995
.996
.994
.981
.998
.997
.995
1.0
1.0
.964
.008
--
--
--
.039
.347
.336
.319
.149
.045
.019
.945
.995
.996
--
.0
.0
.0
--
.0
.003
--
--
--
--
--
.001
.001
.002
.002
.007
.002
.0
.002
.0
.001
.0
.0
.0
.018
.014
--
.002
.002
.001
.002
.005
.004
.003
.022
--
--
--
--
.0
.204
.259
.0
.0
.0
.001
--
--
--
.0
.003
.001
--
.0
--
--
.001
--
.028
--
--
--
.0
.004
.0
.042
.014
.002
.002
.001
.001
.002
.004
.0
.0
.001
.001
.001
.001
.001
.0
.002
.003
.005
.001
.004
.003
.002
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
--
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.015
--
--
--
.0
.001
.0
--
--
--
--
.0
--
--
--
--
.0
.0
.001
.006
--
.002
--
--
.0
--
.0
.001
--
--
--
.001
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
Fanca
T
C
T
G
C
G
A
G
C
C
G
C
T
C
T
C
G
C
T
C
G
T
A
T
T
C
G
T
C
T
A
A
T
T
T
T
T
G
G
G
C
C
T
T
C
C
C
T
C
G
T
C
C
G
C
C
C
T
G
C
C
C
G
C
G
C
C
T
G
T
T
C
A
C
T
C
G
C
A
A
G
T
A
A
G
A
C
A
G
G
C
C
A
T
G
T
T
T
G
A
A
C
T
T
G
G
T
C
G
T
G
A
A
T
A
A
T
A
A
C
T
T
A
A
G
A
A
G
T
G
G
T
C
A
C
G
A
G
T
A
C
A
A
A
T
A
G
A
A
C
G
T
G
G
T
A
T
C
C
G
T
G
C
C
G
T
G
G
C
C
T
T
T
A
C
T
A
C
A
C
G
C
A
A
C
T
C
T
G
C
T
T
A
A
T
T
C
C
T
C
C
A
G
C
C
C
C
G
T
G
G
A
C
T
A
T
A
C
G
A
C
C
T
C
G
  53,589,004
  53,589,560
  53,589,997
  53,590,796
  53,591,068
  53,591,259
  53,591,542
  53,591,962
  53,591,980
  53,591,997
  53,592,006
  53,592,031
  53,592,088
  53,592,101
  53,592,127
  53,592,305
  53,592,340
  53,592,358
  53,593,871
  53,594,729
  53,595,065
  53,595,581
  53,595,744
  53,596,850
  53,596,899
  53,597,007
  53,598,797
  53,600,050
  53,602,754
  53,603,047
  53,604,601
  53,604,603
  53,604,640
  53,604,648
  53,604,651
  53,604,658
  53,604,666
  53,604,725
  53,604,733
  53,604,751
  53,604,771
  53,604,892
  53,608,018
  53,608,106
  53,608,139
  53,608,142
  53,608,176
  53,608,210
  53,608,212
  53,608,246
  53,608,247
  53,608,265
  53,608,280
  53,608,281
  53,608,282
  53,608,316
  53,608,318
  53,608,340
  53,608,388
  53,608,407
  53,608,425
  53,608,426
  53,608,458
  53,608,493
  53,608,494
  53,608,495
  53,608,513
  53,608,522
  53,608,529
  53,608,566
  53,608,588
  53,608,600
  53,608,845
  53,609,189
  53,610,448
  53,610,629
  53,611,436
  53,611,664
  53,611,751
  53,612,808
  53,612,978
  53,613,574
  53,613,871
  53,613,892
  53,614,556
  53,614,744
  53,615,326
  53,615,617
  53,616,765
  53,619,665
  53,619,830
  53,620,963
  53,621,295
  53,621,396
  53,621,563
  53,621,635
  53,622,194
  53,622,462
  53,622,554
  53,622,616
  53,622,916
  53,622,964
  53,623,066
  53,623,801
  53,624,146
  53,624,313
  53,624,472
  53,624,756
  53,625,541
  53,625,552
  53,625,553
  53,625,808
  53,630,896
  53,631,063
  53,631,097
  53,631,160
  53,631,268
  53,631,278
  53,631,428
  53,631,703
  53,631,713
  53,631,751
  53,632,216
  53,632,361
  53,632,556
  53,633,167
  53,633,657
  53,633,885
  53,633,899
  53,634,292
  53,635,133
  53,635,230
  53,635,410
  53,635,933
  53,635,962
  53,636,305
  53,636,938
  53,637,563
  53,637,588
  53,637,849
  53,637,878
  53,637,881
  53,637,889
  53,637,891
  53,637,894
  53,637,897
  53,637,913
  53,637,923
  53,637,956
  53,637,974
  53,637,977
  53,637,990
  53,637,993
  53,638,009
  53,638,022
  53,638,025
  53,638,029
  53,638,038
  53,638,070
  53,638,073
  53,638,086
  53,638,089
  53,638,115
  53,638,131
  53,638,134
  53,638,179
  53,638,182
  53,638,198
  53,638,224
  53,638,240
  53,638,272
  53,638,356
  53,638,365
  53,638,368
  53,638,397
  53,638,413
  53,638,416
  53,638,429
  53,638,432
  53,638,461
  53,638,464
  53,638,480
  53,638,496
  53,638,512
  53,638,528
  53,638,556
  53,638,572
  53,638,605
  53,638,656
  53,638,753
  53,639,076
  53,639,168
  53,639,252
  53,639,545
  53,639,754
  53,639,908
  53,639,937
  53,640,133
  53,640,226
  53,640,236
  53,640,294
  53,640,295
  53,640,941
  53,640,970
  53,641,464
  53,641,685
  53,641,783
  53,642,336
  53,642,385
  53,642,772
  53,643,612
  53,644,373
  53,644,818
  53,645,042
  53,645,155
  53,645,404
  53,645,489
  53,645,928
  53,646,049
  53,646,716
  53,646,787
  53,646,984
  53,647,195
  53,647,202
  53,647,499
C
T
C
A
T
A
G
C
C/T
C/G
G/A
G
C
C/G
T/C
C/G
G/C
C/T
C
T
C
C
G
C
C
T
A
C
T
C
C
C
A
A
G
A
A
G/C
G/C
G/C
C/G
T
C
T/C
C/T
C/A
C/T
T/C
C/T
G/A
T/C
C/T
C/T
G/A
C/T
C/T
C/T
T/C
G/A
C/T
C/T
C/A
G/A
C/T
G/A
C/T
C/T
C
G/A
T/C
T/C
C/T
G
T
C
T
T
T
G
G
A
C
G
G
A
G
G
G
A
A
T
T
G
C
A
C
C
C
A
T
G
T
C
G
A
T
C
A
C
C
C
T
C
C
G
G
C
A/G
G
T
T/C
C
G
G
A
G
G
A
T/G
A
A
C
T
G
G
C
G
T
A
A/G
C/T
A/G
A/T
A/G
T/C
A/G
G/A
A/G
T
C/T
G/A
T/C
G/A
G/A
T/C
A/G
T/C
C/T
C/T
G/A
T/C
G/A
C/T
C/T
G/A
T/C
G/A
G/A
C/T
C/T
T/G
T/C
T/C
A/G
C/T
T/C
A/G
C/T
A/G
C/T
G/A
C/G
A/G
A/G
G
T/C
C/T
T/C
A
T
C
C
G
G
C
C
T
G
T/C
C/A
C/T
A/G
C
T
C/T
A
G
A
C
A
A
G
T
C
G
C
G
G
A
T
T
T
C
T
C