Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 106,744 (bp)   Positions: 282
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.0
.0
.002
.0
.006
.0
.008
.0
.001
.013
.014
.001
.179
.0
.005
.001
.023
.001
.0
.033
.005
.48
.004
.038
.01
--
--
--
.57
.481
.398
.037
.041
.035
.003
.012
.009
.005
.02
.001
.782
--
--
--
.001
.001
.002
.146
.007
.036
.004
.798
.044
.043
.003
.0
--
.0
.003
.001
.089
.004
.037
.067
.008
.013
.005
.012
.002
.037
.029
.056
.063
.019
.001
.013
.001
.002
.001
.001
.002
.004
.017
.122
.001
.107
.001
.005
.021
.141
.293
.018
.007
.002
.017
.006
.121
.012
.152
.001
.021
.089
.266
.002
.048
.002
.001
.0
.0
--
.228
.0
.002
.004
.01
.028
.003
.003
.004
.089
.078
.28
.008
.002
.149
.173
.005
.035
.002
.025
.001
.002
.17
.097
.167
.271
.105
.105
.013
.001
.0
.03
.113
.001
--
--
.494
.385
.044
.021
.004
.002
.025
.01
.003
.447
.0
.0
.121
--
.023
.25
.012
.001
.003
.0
.031
.002
.001
.118
.001
.039
.175
.001
.898
.001
.903
.004
.001
.005
.016
.0
.003
.021
.159
.004
--
--
--
--
.002
.946
.024
.001
.003
.001
.012
.008
.046
.042
.095
.157
--
.127
.079
.196
.254
.32
.814
.87
--
.653
.072
--
--
.002
.0
.009
.011
.0
--
--
.052
.033
.496
.0
.229
.026
.003
.285
.048
.207
.579
.019
.0
.022
.652
.578
.015
.002
.006
.003
.031
.451
.484
.002
.001
.895
.247
.015
.0
.012
--
.002
.002
.003
--
--
.0
.0
1.0
.001
.021
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
T
G
3
T
C
T
G
C
G
T
T
A
T
T
A
A
G
G
T
T
G
A
G
C
T
G
2
G
A
G
A
A
T
A
T
G
C
G
G
C
C
T
A
T
T
2
C
T
T
C
16
C
A
C
A
C
A
G
C
2
64
G
C
G
G
C
G
A
C
10
C
A
T
T
T
A
C
T
G
G
C
C
8
T
A
G
A
C
A
G
T
C
C
T
A
T
C
A
G
A
A
G
G
T
A
C
G
G
C
G
T
G
C
C
C
T
4
T
C
G
69
C
A
G
G
G
A
G
G
G
T
C
G
62
C
A
2
C
C
A
G
A
A
C
G
G
2
C
5
A
A
A
T
A
C
A
T
2
T
C
T
T
C
G
T
G
G
C
T
G
A
T
G
3
T
C
C
A
C
A
G
G
2
5
A
A
6
20
A
12
G
C
C
G
G
A
C
G
G
C
T
G
4
G
G
T
A
2
8
C
8
A
3
2
10
T
T
A
A
4
2
2
G
C
C
G
T
T
A
G
G
C
A
C
A
2
3
G
G
A
T
T
C
G
G
T
G
T
A
C
G
C
C
A
G
T
9
T
G
8
A
G
C
A
T
G
27
G
G
C
A
A
G
T
C
2
T
C
G
A
  159,969,079
  159,969,679
  159,969,868
  159,970,328
  159,970,453
  159,970,654
  159,970,822
  159,971,276
  159,971,287
  159,971,463
  159,971,473
  159,972,380
  159,972,424
  159,972,599
  159,973,182
  159,973,566
  159,973,672
  159,975,844
  159,976,247
  159,976,867
  159,976,925
  159,977,788
  159,977,909
  159,978,024
  159,978,240
  159,978,287
  159,978,356
  159,978,386
  159,978,399
  159,978,605
  159,978,657
  159,978,661
  159,978,709
  159,978,752
  159,978,766
  159,979,011
  159,979,042
  159,979,294
  159,979,377
  159,979,749
  159,979,784
  159,980,028
  159,980,282
  159,980,301
  159,980,317
  159,980,847
  159,980,947
  159,981,020
  159,981,046
  159,981,156
  159,981,248
  159,981,328
  159,982,106
  159,982,322
  159,982,459
  159,983,203
  159,984,339
  159,985,574
  159,986,291
  159,986,438
  159,986,808
  159,987,494
  159,987,548
  159,988,631
  159,988,773
  159,989,842
  159,989,857
  159,990,510
  159,990,533
  159,991,071
  159,991,081
  159,991,083
  159,991,092
  159,991,108
  159,991,112
  159,991,122
  159,991,127
  159,991,374
  159,991,376
  159,992,089
  159,992,484
  159,992,515
  159,992,770
  159,992,772
  159,992,787
  159,993,910
  159,994,030
  159,994,284
  159,994,559
  159,996,772
  159,997,758
  159,998,349
  159,998,725
  159,998,727
  159,998,979
  159,999,281
  159,999,405
  159,999,469
  159,999,558
  160,000,196
  160,000,657
  160,001,066
  160,001,082
  160,001,116
  160,001,221
  160,001,252
  160,001,777
  160,001,893
  160,002,062
  160,002,079
  160,003,002
  160,003,535
  160,004,005
  160,004,006
  160,004,032
  160,004,128
  160,004,513
  160,004,746
  160,004,813
  160,005,200
  160,005,781
  160,005,782
  160,006,050
  160,006,302
  160,006,458
  160,006,607
  160,006,613
  160,006,631
  160,006,668
  160,006,686
  160,006,712
  160,006,731
  160,006,819
  160,009,216
  160,009,351
  160,010,304
  160,011,852
  160,011,853
  160,012,063
  160,012,289
  160,012,732
  160,013,935
  160,014,364
  160,014,424
  160,014,642
  160,015,556
  160,015,804
  160,016,264
  160,016,445
  160,017,634
  160,017,649
  160,017,665
  160,017,781
  160,017,796
  160,018,140
  160,018,184
  160,018,431
  160,018,718
  160,018,781
  160,019,179
  160,019,243
  160,019,728
  160,019,875
  160,020,388
  160,020,392
  160,020,548
  160,020,673
  160,021,147
  160,021,734
  160,021,759
  160,022,609
  160,022,642
  160,022,699
  160,022,718
  160,024,388
  160,024,494
  160,024,552
  160,024,858
  160,025,078
  160,025,366
  160,025,441
  160,026,419
  160,026,974
  160,026,992
  160,027,374
  160,027,697
  160,027,912
  160,028,288
  160,028,343
  160,028,410
  160,028,535
  160,028,620
  160,030,143
  160,030,405
  160,031,910
  160,032,434
  160,032,584
  160,032,869
  160,032,896
  160,033,003
  160,034,607
  160,034,899
  160,034,919
  160,035,271
  160,036,813
  160,036,843
  160,037,053
  160,037,124
  160,037,135
  160,038,653
  160,038,688
  160,039,006
  160,042,547
  160,042,607
  160,043,712
  160,043,713
  160,044,045
  160,044,813
  160,044,973
  160,044,975
  160,045,060
  160,046,188
  160,047,060
  160,047,241
  160,047,561
  160,047,934
  160,048,322
  160,048,537
  160,048,597
  160,049,113
  160,049,325
  160,049,388
  160,049,500
  160,049,553
  160,049,957
  160,051,059
  160,051,933
  160,052,043
  160,052,053
  160,052,317
  160,052,751
  160,053,013
  160,054,244
  160,054,504
  160,054,835
  160,054,894
  160,055,175
  160,057,270
  160,057,549
  160,057,580
  160,057,975
  160,058,052
  160,058,356
  160,059,080
  160,060,219
  160,060,488
  160,060,504
  160,060,525
  160,061,694
  160,062,260
  160,062,261
  160,066,170
  160,068,404
  160,069,023
  160,072,275
  160,072,297
  160,072,755
  160,072,757
  160,072,837
  160,073,185
  160,073,228
  160,073,387
  160,073,388
  160,073,430
  160,073,460
  160,073,667
  160,073,824
  160,073,963
  160,073,964
  160,074,023
  160,074,169
  160,074,504
G
2
G
A
-
C
A
5
A
G
C
C
C
-
C
A
G
G
A
A
C
C
A
G
A
T
C
2
-
9
2
-
G
G
C
G
C
A
T
2
T
T
A
C
T
G
C
-
T
C
G
T
-
T
2
T
C
9
G
3
T
-
-
A
T
A
A
T
3
4
G
-
11
11
G
G
G
G
T
C
C
A
-
-
-
C
C
A
G
T
C
T
-
G
T
A
C
7
A
-
T
C
G
2
A
C
G
T
A
C
A
C
C
A
T
T
A
G
-
2
2
T
-
T
G
A
A
T
G
A
T
A
G
G
T
-
5
6
-
3
T
G
A
3
G
T
11
3
2/-
T
-
C
G
G
C
G
46
G
C
-
-
4/CT
C
C
T
A
T/2
T
A
T
T/-
A
G
C
C
3/-
-
T
T
G
G
G
A
A
-
-
G
3
-
-
9
-
5
T
T
A
A
G
G
A
A
2
C
2
-
G/A
A
A
11
-
-
A
-
G
-
2/-
-
5/3
T/4
A/35
G
-
-
2/-
A
T
T
A
-
G
T
A
A
13/11
G
A
G
-
-
C
C
G
C
C
G
T
A
C
2
C
G
G
A
T
4/3
-
2
-
9/-
C
A
-
G
A
T
T
G
C
-
A
G/3
A
G
T
A
2
G
-
T/-
A
T
G