Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 106,744 (bp)   Positions: 244
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.02
.029
.006
.0
.008
.0
.001
.038
.016
.001
.179
.0
.001
.017
.052
.005
.001
.023
.033
.0
.017
.065
.066
.009
.02
--
--
.002
.001
.798
.043
.001
.0
--
.0
.001
.0
.089
.037
.008
.013
.02
.005
.012
.063
.019
.003
.001
.013
.001
.002
.001
.004
.017
.133
.001
.107
.001
.005
.021
.21
.141
.993
.991
.293
.018
.002
--
--
.013
.0
.0
--
--
--
--
--
--
.012
.01
.028
.003
.031
.029
.007
.089
.005
.008
.002
.149
.173
.005
.035
.002
.025
.001
.002
.003
.046
.07
.053
.021
.012
.016
.009
.025
.105
.137
.013
.001
.013
.0
.004
.001
.002
.001
.025
.001
.022
.446
.03
.121
--
.023
.011
.002
.0
.001
.014
.039
.175
.001
.004
.001
.016
.0
.021
.159
.004
--
--
--
.003
.003
.0
.02
.001
.012
.008
.046
.012
.042
.095
.157
.008
.0
.052
.254
--
.022
.8
--
.653
.072
.047
--
--
.0
--
--
.046
.033
.496
.358
.229
.026
.033
.003
.285
.048
.207
.579
.019
.141
.087
.022
.546
.049
.015
.002
.006
.003
.031
.451
.002
.001
.895
.247
.015
.0
.012
--
--
.002
.003
--
--
--
.0
.0
.043
.011
--
.513
.298
.973
.998
.998
.998
.994
.0
.003
--
--
--
.001
.993
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
Ece1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
A
T
G
T
G
A
G
2
T
A
C
G
G
G
T
A
A
T
A
G
C
C
G
G
T
C
G
T
4
A
A
A
C
A
C
C
2
G
G
G
T
C
G
A
T
T
T
T
A
C
T
C
C
8
T
A
G
A
C
G
A
C
C
G
T
T
G
A
G
G
G
A
C
C
G
T
T
C
C
C
T
C
C
C
C
C
C
A
G
G
G
A
G
G
G
T
10
T
2
2
C
C
A
5
T
4
2
C
C
G
A
G
12
A
G
A
G
G
T
2
2
T
C
T
G
C
G
A
A
T
G
C
A
A
G
T
5
A
T
8
A
C
C
G
G
C
A
C
G
C
G
C
T
G
G
14
T
T
C
A
C
2
A
C
2
T
A
4
2
A
G
C
C
G
T
A
T
A
G
G
C
A
T
G
A
T
G
G
G
A
T
T
C
G
T
G
T
A
C
G
C
G
C
G
T
9
T
T
G
A
A
A
C
T
C
C
C
C
C
3
5
A
G
T
A
T
T
G
C
T
C
G
G
C
C
C
T
G
C
A
T
A
G
  159,968,938
  159,970,153
  159,970,654
  159,970,932
  159,971,276
  159,971,287
  159,971,462
  159,971,604
  159,971,979
  159,972,424
  159,972,599
  159,973,375
  159,973,390
  159,973,450
  159,973,451
  159,973,566
  159,973,672
  159,975,844
  159,976,925
  159,977,405
  159,977,645
  159,979,156
  159,979,202
  159,979,294
  159,979,749
  159,980,183
  159,980,189
  159,980,530
  159,980,947
  159,982,106
  159,982,459
  159,982,754
  159,984,339
  159,985,574
  159,986,291
  159,986,576
  159,986,723
  159,987,494
  159,988,631
  159,989,842
  159,989,857
  159,990,125
  159,990,510
  159,990,533
  159,991,108
  159,991,112
  159,991,117
  159,991,122
  159,991,127
  159,991,374
  159,991,376
  159,992,089
  159,992,770
  159,992,772
  159,992,785
  159,993,910
  159,994,030
  159,994,284
  159,994,559
  159,996,772
  159,996,898
  159,997,758
  159,998,255
  159,998,256
  159,998,349
  159,998,725
  159,999,005
  159,999,827
  160,000,148
  160,000,388
  160,000,417
  160,002,062
  160,002,790
  160,003,002
  160,003,036
  160,003,044
  160,003,045
  160,003,162
  160,003,810
  160,004,128
  160,004,513
  160,004,746
  160,004,831
  160,004,835
  160,005,053
  160,005,781
  160,006,118
  160,006,302
  160,006,458
  160,006,607
  160,006,613
  160,006,631
  160,006,668
  160,006,686
  160,006,712
  160,006,731
  160,006,819
  160,009,082
  160,010,315
  160,010,332
  160,010,338
  160,010,347
  160,010,353
  160,010,356
  160,011,449
  160,011,586
  160,012,063
  160,012,065
  160,012,289
  160,012,732
  160,013,176
  160,013,935
  160,014,694
  160,015,805
  160,017,781
  160,017,785
  160,017,796
  160,017,910
  160,018,023
  160,018,434
  160,018,846
  160,019,179
  160,019,252
  160,019,728
  160,020,859
  160,021,734
  160,021,879
  160,022,642
  160,022,694
  160,022,699
  160,022,718
  160,024,388
  160,025,078
  160,025,366
  160,026,419
  160,026,974
  160,027,374
  160,027,697
  160,027,912
  160,028,294
  160,028,362
  160,028,375
  160,028,621
  160,028,623
  160,030,206
  160,030,406
  160,032,290
  160,032,869
  160,032,896
  160,033,003
  160,033,556
  160,034,607
  160,034,899
  160,034,919
  160,035,599
  160,036,189
  160,036,801
  160,037,124
  160,037,732
  160,038,400
  160,038,652
  160,039,006
  160,042,547
  160,042,607
  160,043,578
  160,043,712
  160,043,713
  160,045,060
  160,046,188
  160,047,060
  160,047,242
  160,047,561
  160,047,934
  160,048,503
  160,048,537
  160,048,597
  160,049,026
  160,049,113
  160,049,325
  160,049,388
  160,049,500
  160,049,553
  160,049,957
  160,050,742
  160,050,764
  160,051,933
  160,052,055
  160,052,157
  160,052,317
  160,052,751
  160,053,013
  160,054,244
  160,054,504
  160,054,835
  160,055,175
  160,057,270
  160,057,549
  160,057,580
  160,057,975
  160,058,052
  160,058,356
  160,059,080
  160,059,659
  160,060,219
  160,060,504
  160,060,525
  160,061,694
  160,061,718
  160,062,260
  160,062,261
  160,063,354
  160,064,175
  160,064,436
  160,065,534
  160,065,588
  160,066,164
  160,066,168
  160,066,172
  160,066,176
  160,066,180
  160,066,353
  160,066,646
  160,067,276
  160,067,297
  160,067,486
  160,068,404
  160,068,653
  160,072,755
  160,072,757
  160,072,851
  160,072,857
  160,072,907
  160,073,457
  160,073,460
  160,073,475
  160,073,806
  160,073,824
  160,073,963
  160,074,169
  160,074,204
  160,074,233
  160,074,257
  160,074,504
  160,074,610
-
3
C
A
5
A
4
A
-
C
-
-
A
C
A
A
G
G
C
G
A
T
G
A
2
T/-
C/-
T
C
-
2
G
C
C/T
G
T
T
-
A
A
A
C
T
3/GC
G
G
G
G
G
G
T
C
-
C/-
-
C
C
A
G
T
A
C
T
T
T
-
G
3
A/T
A
A
A
G
A
T
A
A
-
G
T
A
G
C/A
C/A
G
2
-
T
G
A
A
T
G
A
T
A
G
10/-
T/-
2/-
-
C/T
C/T
A/G
-
C
4/-
-
3
T
A
G
T
-
G
C
G
A
A
T/3
-
-
A
2
C
A
T
A
G
G
C
C
T
G
G
A
-
-
G
3
-
A/T
3
C/T
C
A
A
G
G
A
G
A
2
C
A
A
-
A
-
T
3
A
-
G
3
2/-
T/-
G
-
-
-
A
T
T
A
-
-
G
T
A
A
3
G
T/G
G/T
G
TG/-
A
C
C
G
C
C
G
A
C
2
C
G
G
A
T
6
3
2
-
-
T/2
C
A
G
G
G
T
4
T
T
T
T
T
-
-
G
C
C
G
A
G
C
C/T
C
A
G/A
G/A
T
T
G
-
T
-
G
C
G
A