Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 71,747 (bp)   Positions: 241
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.034
.331
.084
.1
.002
.002
.0
.0
.001
.451
.084
--
--
--
.064
.045
.071
.002
.002
.61
.001
.004
.18
.002
.038
.1
.138
.0
.013
.013
.001
.002
.021
.035
.009
.004
.003
.005
.004
.076
.001
.052
.223
.152
.148
.021
.555
.027
--
.34
.183
.011
--
.084
--
--
.494
.186
.019
.043
.15
.447
.32
.005
.011
.028
.412
.007
.011
.149
--
--
.008
.071
.358
.001
.098
.044
.003
.006
.031
1.0
.005
.006
.318
.0
.008
.0
.007
.0
.005
.095
.001
.012
.407
.003
.002
.001
.002
.0
.0
.0
.001
.0
.015
.001
.029
.276
.191
.03
.328
.003
.019
.443
.373
.046
.007
--
--
--
.004
--
.283
.313
.82
.326
.013
.049
.036
.001
.009
.014
.007
.489
.101
.194
.19
.41
.146
.128
.144
.009
.001
.001
.001
.001
.0
.003
.007
--
--
.0
.143
.491
.002
.062
.004
.0
.001
.03
.008
.669
.036
.015
.663
.009
.001
.749
1.0
.0
.0
.384
.075
.082
.071
.464
.018
.001
.007
.228
.001
.001
.0
.101
.001
.001
.028
.039
.011
.057
--
.029
.004
.0
.004
.01
.036
.018
.007
.043
.184
.268
1.0
.02
.533
.99
.652
.988
.997
1.0
.999
.997
.004
--
.001
.004
.001
.001
.043
.024
.005
.075
.003
.006
.203
.007
.012
.002
.983
.0
.004
.003
.005
.881
.001
.011
.009
.003
.001
1.0
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Cbx3l1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
A
G
G
4
T
G
C
G
G
G
C
C
G
A
G
G
G
G
T
C
A
G
C
G
A
T
G
28
12
A
G
T
A
A
T
T
T
G
T
G
A
A
A
A
G
G
T
C
C
T
G
A
2
T
T
G
T
C
G
T
A
A
T
C
G
A
C
C
A
A
G
A
A
A
A
T
C
C
C
A
A
A
T
G
A
G
C
A
G
C
G
C
G
3
C
C
G
C
T
A
C
C
G
A
T
T
A
A
G
A
G
G
G
G
T
C
G
A
G
C
G
T
C
3
A
A
C
G
C
4
C
C
G
G
A
A
2
G
C
G
G
T
A
T
T
T
T
A
G
T
T
G
T
C
G
T
G
C
C
T
G
A
C
A
G
G
C
G
T
G
T
C
C
C
A
G
G
A
5
2
A
T
A
A
T
A
T
C
G
T
T
A
T
C
A
T
C
A
G
T
4
G
G
2
T
G
4
12
12
C
C
A
C
T
C
C
2
4
A
G
T
C
C
A
G
A
C
A
T
G
G
T
A
T
G
G
G
G
A
  32,283,868
  32,284,513
  32,285,162
  32,285,294
  32,285,303
  32,285,513
  32,285,642
  32,285,733
  32,285,975
  32,286,364
  32,286,549
  32,286,900
  32,287,215
  32,287,546
  32,290,534
  32,290,942
  32,290,996
  32,291,093
  32,291,623
  32,291,928
  32,291,944
  32,291,981
  32,292,102
  32,292,340
  32,292,668
  32,293,040
  32,293,754
  32,293,791
  32,294,141
  32,295,204
  32,295,214
  32,295,374
  32,295,636
  32,295,683
  32,295,691
  32,295,700
  32,295,701
  32,295,706
  32,295,713
  32,295,715
  32,295,718
  32,297,092
  32,297,469
  32,297,623
  32,297,805
  32,297,859
  32,297,935
  32,297,970
  32,298,051
  32,298,384
  32,298,878
  32,299,384
  32,299,422
  32,299,435
  32,299,614
  32,299,728
  32,300,372
  32,300,706
  32,300,786
  32,300,900
  32,301,273
  32,301,659
  32,301,805
  32,301,914
  32,302,187
  32,302,211
  32,302,963
  32,303,063
  32,303,938
  32,304,423
  32,305,990
  32,306,289
  32,306,458
  32,307,238
  32,307,561
  32,308,837
  32,309,075
  32,309,771
  32,309,776
  32,310,095
  32,310,290
  32,310,326
  32,310,569
  32,311,451
  32,311,715
  32,312,076
  32,313,926
  32,314,357
  32,314,386
  32,314,658
  32,314,807
  32,315,145
  32,315,401
  32,315,519
  32,315,912
  32,316,409
  32,316,970
  32,317,121
  32,317,254
  32,317,255
  32,317,514
  32,317,809
  32,318,183
  32,318,215
  32,319,096
  32,319,375
  32,320,002
  32,320,927
  32,321,394
  32,321,511
  32,322,128
  32,322,246
  32,322,420
  32,322,652
  32,322,982
  32,322,988
  32,323,100
  32,323,153
  32,323,238
  32,323,290
  32,323,306
  32,323,574
  32,323,914
  32,324,173
  32,324,174
  32,324,198
  32,324,280
  32,324,413
  32,324,437
  32,324,637
  32,324,661
  32,324,845
  32,326,208
  32,326,957
  32,327,211
  32,327,482
  32,327,772
  32,327,875
  32,327,936
  32,328,311
  32,328,352
  32,328,988
  32,329,563
  32,329,595
  32,329,622
  32,330,647
  32,330,654
  32,330,691
  32,330,824
  32,331,027
  32,331,074
  32,331,423
  32,331,681
  32,331,898
  32,332,179
  32,332,610
  32,332,652
  32,332,920
  32,333,524
  32,333,590
  32,333,619
  32,334,476
  32,334,629
  32,335,053
  32,335,129
  32,335,236
  32,335,721
  32,336,109
  32,336,406
  32,336,413
  32,336,666
  32,336,821
  32,337,152
  32,338,355
  32,338,720
  32,338,722
  32,338,763
  32,338,846
  32,338,871
  32,338,933
  32,338,945
  32,339,030
  32,339,494
  32,339,545
  32,339,561
  32,340,132
  32,340,156
  32,340,538
  32,340,561
  32,340,577
  32,340,996
  32,341,509
  32,341,743
  32,341,757
  32,342,407
  32,342,431
  32,342,582
  32,342,592
  32,342,706
  32,342,792
  32,342,849
  32,343,112
  32,343,198
  32,343,275
  32,343,848
  32,343,876
  32,344,003
  32,344,084
  32,344,268
  32,344,341
  32,344,563
  32,344,593
  32,344,860
  32,345,151
  32,345,380
  32,346,445
  32,346,462
  32,346,600
  32,346,772
  32,346,988
  32,346,993
  32,347,014
  32,348,910
  32,348,956
  32,349,445
  32,349,778
  32,349,870
  32,350,775
  32,350,778
  32,352,076
  32,353,069
  32,354,281
  32,354,383
  32,354,454
  32,354,783
  32,354,832
  32,355,086
  32,355,093
  32,355,099
  32,355,141
  32,355,414
G/C
G/C
A/G
G/2
G/A
4/-
T/G
G/C
C/A
C
G/T
2
C/T
C/A
A
A/G
G/A
G/3
G/A
G/T
T/-
C/G
A/G
A
C/3
G/A
A/G
T/C
G/A
28/-
12/-
A/G
G/A
A
T
-
C
A
A
C
C
G/A
A/G
A/-
A/C
T
G/T
G/A
C
C/A
C/A
T/A
G/A
A/G
2/-
T/C
T/C
A
-
C/T
G/A
T/-
A/2
A/T
T/-
C/T
G/T
A/C
C/T
C/14
A/T
A/T
G/A
A/2
C
-
A/T
T/A
C/T
C/T
C/T
A/5
A/T
A/2
T/-
G/-
A/2
G/A
C/T
A/G
G/A
C/T
G/T
C/A
G/A
3/-
C/T
C/T
G/T
C/T
T/A
A/G
T
C/A
G/12
A/G
T/C
G
A/G
A/G
G/A
A/5
G/A
G/A
G/A
G/T
T/-
C/T
G/A
A/G
G/A
C/G
G/-
T/G
C/T
3/-
A/G
A/T
C/T
G/A
C/A
4/-
C/T
C/T
G/C
G/T
A/G
-
-
A
C/A
G/C
C
A
C
C
C
C
A
A/C
A
G
A
A
C
T
-
C
T
C/T
C/T
T/C
A
A/C
C/A
A/C
A
G/C
C/T
G/A
-
A
-
C/G
G
T
A/-
A
A
A/G
-
-
T
T/C
T
A/C
A
A/G
C
C/A
A
C
-
T
T/C
T
G
A
C/T
-
G/A
C
-
G/A
G/A
-
T/G
G/A
4/-
-
12/-
C/T
C/T
T
C/T
T/G
C/A
C/T
-
4/-
A/8
G/A
-
C/-
T
A/-
G/6
G
C/G
G
C
T/-
G/A
A
A/C
3
G/2
T
G/T
G/2
G