Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 71,747 (bp)   Positions: 313
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.034
.019
.009
.001
.004
.002
.05
.008
.001
.451
.084
--
--
.252
.236
.63
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.088
.028
.064
.007
.228
.085
.61
.004
.18
.002
.002
.008
.1
.138
.121
.004
.059
.184
.0
.013
.001
.002
.021
.035
.009
.003
.005
.004
.076
.123
.109
.065
.069
.073
--
.002
.148
.027
--
--
.183
.011
--
--
--
--
--
--
.186
.15
.01
.32
.041
.017
.001
.0
.002
.0
.0
.011
.228
.046
.008
.003
--
.149
--
--
--
--
--
--
.053
.043
.04
.008
.023
.071
.002
.0
.358
.018
.044
.003
.006
.031
.382
1.0
.98
.001
.006
.001
.03
.004
.115
.002
.004
.001
.601
.001
.0
.0
.008
.0
.007
.0
.085
.231
.005
.08
.095
.012
.0
.006
.003
.002
.005
.0
.0
.004
.002
.01
.0
.0
.186
.001
.0
.002
.0
.015
.007
.01
.001
.006
.308
.002
.029
.001
.001
.0
.0
.067
.117
.276
.191
.03
.328
.019
.064
.443
.373
.007
.013
--
--
--
--
.244
.004
--
.041
.283
.313
.82
.326
.019
.049
.036
.001
.006
.321
.488
--
--
--
.001
.489
.083
.101
.19
.41
.146
.128
.004
.001
.0
.144
.009
.001
.001
.003
.002
.001
.001
.0
.003
--
--
--
.0
.143
.047
.491
.002
.062
.004
.004
.0
.001
.003
.008
.669
.036
.009
1.0
.0
.0
.0
.384
1.0
.096
.129
.082
.071
.018
.001
.228
.001
.001
.101
.998
.001
.001
.028
.039
.011
.057
.022
--
.021
.029
.004
.001
.004
.01
.036
.007
.184
.367
--
.533
.993
.997
.004
.002
.002
.001
.001
.038
.024
.063
.075
.003
.006
.003
.271
.0
.983
.0
.459
.002
.004
.005
.225
.001
.011
.009
.005
1.0
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
Clcn3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Cbx3l1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
A
A
C
C
4
G
T
G
G
G
C
C
G
A
A
C
G
A
T
A
T
T
T
A
A
A
C
C
G
T
G
G
A
G
A
C
C
4
T
A
G
C
G
G
A
T
A
A
C
C
T
28
A
G
T
A
A
T
T
G
T
2
7
T
2
G
G
C
A
T
C
G
T
G
A
T
C
G
T
T
T
T
A
A
C
A
T
21
T
C
2
C
T
T
G
C
G
A
T
A
C
G
A
T
C
G
C
A
A
A
A
C
A
A
C
C
C
A
A
A
T
C
T
A
A
T
2
A
C
G
2
C
A
G
G
C
A
G
A
T
C
C
G
G
C
T
C
C
T
T
A
12
A
A
G
C
4
A
G
T
G
A
T
A
T
G
T
A
T
A
2
C
A
T
C
A
A
G
A
G
T
G
G
C
T
C
G
A
G
C
C
C
A
T
C
3
A
C
C
G
C
C
G
C
C
C
G
3
G
G
G
A
2
G
C
C
A
5
G
G
T
A
G
T
T
T
T
T
G
T
G
T
G
C
T
C
G
A
T
G
C
T
T
G
A
G
G
T
G
C
T
G
19
2
C
C
G
G
5
2
A
A
G
A
T
A
T
C
G
T
T
G
T
A
T
C
A
T
A
T
4
T
2
G
C
A
C
C
C
2
G
A
A
T
C
C
G
T
C
A
T
A
2
G
T
G
T
G
G
G
A
  32,283,868
  32,284,513
  32,284,719
  32,284,876
  32,285,121
  32,285,244
  32,285,513
  32,285,523
  32,285,637
  32,286,364
  32,286,549
  32,286,900
  32,287,215
  32,287,235
  32,288,016
  32,288,965
  32,289,212
  32,289,494
  32,289,496
  32,289,503
  32,289,836
  32,290,045
  32,290,064
  32,290,074
  32,290,114
  32,290,120
  32,290,152
  32,290,258
  32,290,513
  32,290,530
  32,290,534
  32,290,629
  32,290,646
  32,290,663
  32,290,886
  32,290,915
  32,290,942
  32,290,992
  32,291,022
  32,291,094
  32,291,944
  32,292,102
  32,292,340
  32,292,668
  32,292,685
  32,293,746
  32,293,754
  32,293,791
  32,294,041
  32,294,051
  32,294,597
  32,294,687
  32,294,777
  32,295,204
  32,295,374
  32,295,636
  32,295,683
  32,295,691
  32,295,700
  32,295,706
  32,295,713
  32,295,715
  32,295,718
  32,296,062
  32,296,063
  32,296,189
  32,296,205
  32,296,206
  32,296,287
  32,296,640
  32,297,859
  32,298,051
  32,298,354
  32,298,505
  32,299,384
  32,299,422
  32,299,435
  32,299,728
  32,299,813
  32,299,830
  32,300,223
  32,300,372
  32,300,786
  32,301,659
  32,301,681
  32,301,914
  32,302,827
  32,303,281
  32,303,457
  32,303,525
  32,303,744
  32,303,754
  32,303,755
  32,304,423
  32,304,457
  32,304,743
  32,305,107
  32,305,109
  32,305,533
  32,305,990
  32,306,286
  32,306,289
  32,306,428
  32,306,458
  32,306,520
  32,306,521
  32,306,576
  32,306,841
  32,307,050
  32,307,238
  32,307,301
  32,307,561
  32,307,736
  32,307,743
  32,308,837
  32,308,911
  32,309,776
  32,310,095
  32,310,290
  32,310,326
  32,310,536
  32,310,569
  32,310,604
  32,311,303
  32,311,715
  32,312,234
  32,312,348
  32,312,353
  32,312,383
  32,313,485
  32,313,572
  32,313,603
  32,313,786
  32,313,873
  32,313,926
  32,314,046
  32,314,357
  32,314,386
  32,314,658
  32,314,807
  32,314,915
  32,315,134
  32,315,145
  32,315,381
  32,315,401
  32,315,912
  32,316,231
  32,316,262
  32,316,970
  32,317,121
  32,317,341
  32,317,514
  32,317,809
  32,317,812
  32,317,933
  32,318,153
  32,318,160
  32,318,183
  32,318,504
  32,318,888
  32,318,893
  32,318,896
  32,319,096
  32,319,375
  32,319,412
  32,319,413
  32,320,002
  32,320,491
  32,320,665
  32,320,867
  32,320,927
  32,321,101
  32,321,102
  32,321,103
  32,321,107
  32,321,154
  32,321,328
  32,321,394
  32,321,511
  32,322,128
  32,322,246
  32,322,652
  32,322,898
  32,322,982
  32,322,988
  32,323,153
  32,323,155
  32,323,227
  32,323,238
  32,323,290
  32,323,306
  32,323,521
  32,323,574
  32,323,761
  32,323,946
  32,324,173
  32,324,174
  32,324,198
  32,324,280
  32,324,411
  32,324,437
  32,324,637
  32,324,661
  32,326,014
  32,326,083
  32,326,093
  32,326,375
  32,326,388
  32,326,418
  32,326,862
  32,327,211
  32,327,366
  32,327,482
  32,327,875
  32,327,936
  32,328,311
  32,328,352
  32,328,460
  32,328,860
  32,328,936
  32,328,988
  32,329,563
  32,329,595
  32,329,622
  32,329,755
  32,329,820
  32,330,647
  32,330,654
  32,330,691
  32,330,824
  32,331,074
  32,331,423
  32,331,494
  32,331,681
  32,331,898
  32,332,019
  32,332,179
  32,332,610
  32,332,652
  32,332,814
  32,332,920
  32,333,524
  32,333,590
  32,333,596
  32,334,476
  32,334,629
  32,335,053
  32,335,721
  32,336,413
  32,336,666
  32,336,821
  32,337,062
  32,337,152
  32,337,715
  32,338,668
  32,338,677
  32,338,720
  32,338,722
  32,338,846
  32,338,871
  32,338,945
  32,339,030
  32,339,494
  32,339,561
  32,339,882
  32,340,132
  32,340,156
  32,340,538
  32,340,561
  32,340,577
  32,340,996
  32,341,479
  32,341,509
  32,341,665
  32,341,743
  32,341,757
  32,341,937
  32,342,431
  32,342,582
  32,342,592
  32,342,792
  32,343,112
  32,343,199
  32,343,584
  32,343,876
  32,344,554
  32,344,860
  32,345,151
  32,345,355
  32,346,568
  32,346,600
  32,346,772
  32,346,987
  32,346,993
  32,348,753
  32,348,910
  32,348,956
  32,349,445
  32,350,008
  32,350,489
  32,351,688
  32,352,076
  32,353,069
  32,353,644
  32,354,280
  32,354,281
  32,354,454
  32,354,506
  32,354,832
  32,355,086
  32,355,093
  32,355,094
  32,355,414
C
C
G
G
T
A
-
A
G
C
2
2
T
T
A
G
T
C/3
2
6
T/C
A/T
T/A
T/G
T/C
C/3
A/G
G
T
A
A
T/G
G/A
G/T
T
A
G
-
T
-
-
G
A
3
A
T
G
C
-
G
A
T
C
28/-
G
A
A
T
-
-
A
C
C
-
-
-
-
-
A
T
T
C
G
A
A
A
G
C
A
A
T/2
C
-
-
C
T
T
-
A
-
-
C/2
-
14
-
C
T
T
A
T
A
T
T
A
3
5
T
A
T
2
G
C
G
T
-
G
T
T
T
5
T
T
C
T
-
5
A/2
T/C
-
C
T
A
-
-
2
A
A
T
G
A
3
C
T
T
T
A
A
G
T
T
C
A
G
-
G
C
A
T
-
G/AT
-
-
12
G
A
C/AC
C
A
G
G
G
A/G
2/-
3/3
A/G
T/C
A
G
G
A
5
A
-
A
T
T
A
T
A
G
A
T
G
A
5
G
T
-
G
2
T
A
A
T
G/2
T
3/4
C/T
A
-
C
A
T
-
-
A
A
A
C
-
C
C
A
C
C
C
C
C
C
A
A
G
A
A
A
T
C
T
-
A/T
C
T
-
-
C
A
C
A
A
-
A
A
-
A
-
-
G
T
A
A
-
-
T
T
A
C
A
G
C
A
A
T/-
C
G/C
-
T
A
T
G
A
-
C
-
2
-
G/A
T
T
T
T
T
-
3
2
4
-
-
T
T
-
-
G
C
G
-
-
A
A
3
2
T
T
G