Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 60,689 (bp)   Positions: 286
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.005
.0
.199
.008
.002
.555
.062
.115
.159
.007
.293
.782
.037
.121
.001
.034
.002
.059
.002
.049
.005
--
.028
.001
.001
.001
.098
.14
.159
.001
.546
.015
.0
.001
.002
--
--
.0
.0
.002
.613
.239
.437
.002
.001
.01
.003
.519
.002
.059
.5
.003
.005
.01
.011
.0
.013
.99
.577
.134
.002
.557
.039
.0
.014
.06
.007
.003
.003
.063
.088
.061
--
.018
.022
.006
.23
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.006
.001
.034
.005
.0
.001
.005
.0
.078
.001
.01
.848
.001
.005
.118
.317
.409
.369
.286
.065
.138
.005
.01
.0
.005
.124
.098
.044
.033
.007
.054
.148
.052
.049
.079
.14
.369
.686
.617
.611
.034
.007
.088
.399
.37
.327
.007
.002
.006
.037
.004
.02
.019
.023
.009
.682
.18
.235
.017
.363
.324
.315
.105
--
.0
.018
.005
.004
.178
.001
.0
.0
.015
.0
.0
.018
.001
.001
.005
.0
.075
.105
.023
.0
.0
--
--
--
--
.126
.224
.007
.011
.016
.368
.099
.543
.0
.002
.002
.0
.0
.013
.001
.035
.007
.0
.0
.024
.033
.006
.013
.006
.022
.001
.053
.0
.09
.016
.398
--
--
--
--
--
--
.002
.005
.66
.249
.023
.291
.264
--
--
--
--
.127
.169
.223
.311
.032
.013
.006
.006
.121
.115
.007
.004
.0
.001
.001
.0
.0
.009
.001
.361
.004
.002
.008
.008
--
--
--
--
--
--
--
.01
.03
.027
.021
.503
.555
.007
.003
.188
.019
.06
.0
.026
.0
.0
.333
.051
.213
.002
.0
.009
.027
.002
.001
.007
.011
.001
.988
1.0
.998
1.0
.833
.996
.021
.0
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
A
T
C
G
G
12
9
C
4
G
G
T
T
C
A
G
A
G
T
A
T
A
T
T
T
C
C
G
C
12
C
C
2
A
C
C
C
T
A
G
T
A
A
A
A
G
T
A
T
G
T
G
C
G
A
C
A
G
C
A
G
T
A
G
G
T
G
T
T
A
A
G
C
A
A
A
C
A
G
A
C
G
A
T
T
T
A
G
C
T
G
A
T
A
C
T
G
3
A
T
G
A
C
A
T
C
T
C
C
G
C
C
T
T
T
A
A
A
C
C
C
T
A
T
G
T
G
C
A
A
T
G
G
A
G
2
T
T
G
A
T
G
6
8
G
4
C
A
T
G
T
C
G
T
C
A
C
T
G
G
C
G
G
G
A
C
A
G
6
A
8
T
A
T
T
T
T
G
T
T
T
C
A
C
T
C
C
G
A
A
C
T
4
A
G
A
C
A
T
C
G
C
G
T
G
T
T
T
A
C
A
T
C
G
C
T
G
G
C
T
T
T
T
2
G
A
T
6
4
C
C
G
G
T
T
C
G
A
G
C
C
T
T
C
T
T
A
C
G
T
A
C
G
G
7
5
A
T
T
C
C
A
A
C
T
G
T
A
G
A
C
A
G
T
C
C
A
G
G
A
G
T
C
C
G
  128,096,092
  128,096,869
  128,097,267
  128,097,570
  128,097,847
  128,097,975
  128,098,153
  128,098,177
  128,098,194
  128,098,685
  128,098,852
  128,099,066
  128,099,330
  128,099,336
  128,099,398
  128,099,997
  128,100,301
  128,100,600
  128,100,765
  128,101,061
  128,101,377
  128,101,697
  128,101,941
  128,102,182
  128,102,210
  128,102,212
  128,102,252
  128,102,336
  128,102,340
  128,102,479
  128,102,547
  128,102,641
  128,103,902
  128,104,126
  128,104,145
  128,104,302
  128,104,318
  128,106,109
  128,106,404
  128,106,553
  128,107,209
  128,107,272
  128,107,288
  128,107,352
  128,107,358
  128,107,487
  128,107,530
  128,107,704
  128,107,945
  128,108,408
  128,108,579
  128,108,931
  128,108,932
  128,109,559
  128,109,637
  128,109,821
  128,110,820
  128,110,866
  128,110,961
  128,110,977
  128,111,139
  128,111,481
  128,111,500
  128,111,621
  128,111,772
  128,111,933
  128,112,282
  128,112,284
  128,113,077
  128,113,251
  128,113,441
  128,113,699
  128,113,991
  128,114,608
  128,114,609
  128,114,813
  128,116,029
  128,116,197
  128,116,258
  128,116,446
  128,116,635
  128,116,692
  128,116,959
  128,117,089
  128,117,370
  128,117,447
  128,117,576
  128,117,631
  128,117,634
  128,117,637
  128,117,875
  128,117,939
  128,118,259
  128,118,349
  128,119,054
  128,119,232
  128,119,277
  128,119,530
  128,119,552
  128,119,564
  128,119,670
  128,119,701
  128,119,803
  128,119,865
  128,120,098
  128,120,426
  128,120,535
  128,120,675
  128,121,624
  128,121,628
  128,121,635
  128,121,636
  128,121,656
  128,121,847
  128,122,129
  128,122,251
  128,122,486
  128,122,764
  128,123,221
  128,123,262
  128,123,289
  128,123,390
  128,123,406
  128,123,469
  128,123,797
  128,123,904
  128,123,957
  128,123,996
  128,124,014
  128,124,724
  128,124,791
  128,124,922
  128,124,991
  128,125,021
  128,125,043
  128,125,334
  128,125,342
  128,125,363
  128,125,423
  128,125,481
  128,125,971
  128,126,241
  128,126,292
  128,126,309
  128,126,312
  128,126,915
  128,127,457
  128,127,730
  128,128,079
  128,128,363
  128,128,458
  128,128,658
  128,128,673
  128,129,325
  128,129,422
  128,129,433
  128,129,480
  128,129,576
  128,129,650
  128,129,808
  128,129,971
  128,130,386
  128,130,503
  128,130,776
  128,130,785
  128,131,178
  128,131,315
  128,131,393
  128,132,639
  128,132,682
  128,132,794
  128,133,065
  128,133,690
  128,133,902
  128,134,111
  128,134,311
  128,134,614
  128,134,938
  128,135,106
  128,135,585
  128,135,871
  128,136,350
  128,136,419
  128,136,789
  128,136,838
  128,136,977
  128,137,010
  128,137,069
  128,137,362
  128,137,974
  128,137,980
  128,137,994
  128,137,995
  128,138,021
  128,138,289
  128,138,363
  128,138,494
  128,138,560
  128,138,902
  128,139,057
  128,139,154
  128,139,345
  128,139,498
  128,139,616
  128,139,969
  128,140,044
  128,140,061
  128,140,085
  128,140,163
  128,140,339
  128,140,563
  128,140,731
  128,141,068
  128,141,150
  128,141,330
  128,141,393
  128,141,460
  128,141,515
  128,141,579
  128,141,612
  128,142,077
  128,142,082
  128,142,089
  128,142,101
  128,142,331
  128,142,857
  128,142,996
  128,143,011
  128,143,330
  128,143,332
  128,143,368
  128,143,920
  128,143,967
  128,143,972
  128,144,020
  128,144,071
  128,144,195
  128,144,620
  128,144,647
  128,144,807
  128,144,923
  128,145,098
  128,145,155
  128,145,156
  128,145,460
  128,145,668
  128,145,964
  128,146,096
  128,146,140
  128,146,292
  128,146,317
  128,146,845
  128,146,880
  128,147,148
  128,147,210
  128,147,225
  128,147,227
  128,147,497
  128,147,561
  128,147,677
  128,148,424
  128,148,603
  128,148,617
  128,148,758
  128,148,776
  128,148,869
  128,148,940
  128,148,982
  128,149,270
  128,149,845
  128,149,992
  128,150,955
  128,150,975
  128,151,684
  128,151,685
  128,151,758
  128,152,587
  128,153,057
  128,153,200
  128,153,686
  128,153,788
  128,154,547
  128,154,677
  128,155,043
  128,155,146
  128,155,169
G
G
C
A
A
2
-
-
T
-
A
A
-
G
C/2
G
5
G
A
G
G
2
G
A
G
C
T
T
A
2
-
T
T
-
G
2
3/7
T
G
G
T
3
-
G
C
C
A
C
G
C
A
C
C
T
A
G
T
G
A
T
G
A
G
T
-
A
C
T
C
C
G
G
A
T
G
C
2
G
T
A
G
T
A
C
C
A
C
G
A
T
C
A
G
A
-
T
C
-
-
C
C
A
G
T
C
C
T
C
T
T
T
T
T
A
2
-
T
C
G
T
G
T
A
T
C
2
G
-
G
G
G
A
A
T
9
A
-
C
G
T
G
G
34
6/-
8/-
-
-
T
G
2
A
C
T
A
C
T
G
3/CT
2
A
A
T
A
A
A
G
T
G
A
-
T
-
A
2
2
C
C
C
T
C
C
C
T
G
T
C
T
T
A
G
T
T
C
-
G
T
G
T
G
G
T
A
T
A
6
-
3
C
A
T
G
G
C
T
2
T
C
A
T
T
2
17
G
-
-
A
G
G
6/-
4/-
T
G
A
A
2
G
-
A
G
A
T
T
2
3
T
C
9
T
T
A
62
G
A
A
A
7/-
5/-
G
C
C
T
T
G
G
T
C
A
C
C
T
T
-
G
2
9/16
T
A
G
A
A
G
A
C
G
11
-