Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 48,865 (bp)   Positions: 358
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.521
.996
.002
.0
.187
.186
.007
.005
.0
--
--
.008
.089
.009
.048
.268
.013
.153
.15
.129
.104
.005
.025
.006
.0
.004
.001
.002
.008
.31
.011
.001
.002
.001
.008
.013
.011
.085
.069
--
.005
.002
.341
.336
.099
.052
.089
.186
.03
.007
.018
.879
.078
.011
.03
.018
.027
.029
.086
.007
.008
.03
.017
.003
.045
.249
.11
.012
.016
.02
.076
.008
.057
.039
.026
.064
.952
.007
.085
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.0
.079
.879
.003
.003
.011
.059
.06
.04
.032
.003
.005
.003
.089
.001
.005
.023
.072
.585
.582
.063
.227
.007
.024
.001
.107
.058
.053
.109
.277
.001
.015
.131
.147
.264
.024
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.012
.163
.407
.011
.11
.11
.182
.004
.99
.0
.001
.054
.196
.017
.224
.166
.025
.029
.034
.025
.071
.16
.019
.02
.006
.003
.013
.022
.149
.29
.009
.046
.005
.005
.008
.0
.009
.011
.017
.027
.029
.031
.0
.001
.001
.001
.99
.001
.007
.002
.055
.002
.002
.001
.981
.003
.001
.007
.001
.007
.001
.115
.014
.007
.168
.605
.006
.002
.007
.051
.081
.025
--
--
--
--
.001
.124
.079
--
.007
.635
.007
.0
.011
.0
.002
.0
.987
.453
.086
.002
.018
.0
.874
.032
.001
1.0
.004
.0
.0
.083
.491
.815
.0
.004
.0
.011
.002
.002
--
--
.01
.122
.03
.002
.046
--
--
--
.002
.0
.109
.015
.178
.002
.001
.0
.0
.0
.002
--
--
.079
.009
.032
.001
.254
.022
.001
.0
.002
.0
.0
.005
.001
.001
.001
.001
.0
.059
.011
.001
.006
.001
.03
.333
.006
.124
.0
.008
.003
.002
.0
.002
.0
.031
.004
.009
.016
.82
1.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
A
T
C
2
A
A
A
38
14
2
G
C
A
G
A
G
G
T
G
G
A
G
C
T
T
T
T
T
A
G
A
C
A
G
C
T
C
T
T
T
A
T
T
G
G
T
G
T
G
G
T
C
T
A
A
G
G
G
A
C
A
T
C
A
A
G
G
C
A
A
T
C
G
G
C
T
G
C
G
G
T
A
A
A
A
T
A
G
T
C
G
A
G
C
C
A
C
A
T
A
G
A
A
C
G
A
T
A
A
C
A
G
T
T
T
2
T
T
C
G
T
G
A
C
C
G
T
C
T
C
T
T
C
G
G
T
A
G
G
A
G
G
T
G
T
T
T
2
A
T
T
C
T
G
C
G
T
C
T
T
G
A
T
G
T
G
C
T
C
C
C
C
G
A
2
C
2
2
C
T
T
G
A
C
T
G
A
A
C
A
T
T
T
T
C
T
T
G
G
G
T
C
T
3
A
G
A
C
T
G
2
T
A
G
G
G
G
A
T
A
G
T
T
A
G
C
A
T
G
5
T
G
A
G
A
C
A
C
G
A
A
T
A
T
G
C
G
A
C
T
A
A
T
T
C
C
G
2
G
A
G
T
2
T
C
2
T
A
C
C
7
C
G
8
G
A
T
A
C
8
A
A
G
G
G
A
G
C
T
G
C
A
A
G
C
8
12
T
G
G
A
G
C
C
C
G
A
G
G
G
G
T
A
T
G
C
C
C
G
T
A
A
C
C
A
T
T
C
2
C
T
2
G
A
G
C
G
10
G
C
G
T
20
A
A
A
G
G
T
T
A
C
C
8
4
A
G
  8,493,752
  8,495,512
  8,495,998
  8,496,084
  8,496,476
  8,496,477
  8,496,762
  8,497,116
  8,497,199
  8,497,216
  8,497,301
  8,497,340
  8,497,862
  8,497,889
  8,498,053
  8,498,222
  8,498,388
  8,498,440
  8,498,890
  8,498,891
  8,498,892
  8,499,017
  8,499,206
  8,499,256
  8,499,558
  8,499,640
  8,499,695
  8,499,742
  8,499,793
  8,500,210
  8,500,247
  8,500,356
  8,500,641
  8,500,683
  8,500,981
  8,501,077
  8,501,445
  8,501,552
  8,501,621
  8,501,639
  8,501,720
  8,501,772
  8,501,806
  8,501,807
  8,502,048
  8,502,050
  8,502,088
  8,502,192
  8,502,343
  8,502,384
  8,502,408
  8,502,864
  8,503,217
  8,503,424
  8,503,592
  8,503,769
  8,503,799
  8,503,845
  8,503,898
  8,503,913
  8,503,914
  8,503,975
  8,504,108
  8,504,136
  8,504,320
  8,504,362
  8,504,389
  8,504,496
  8,504,517
  8,504,518
  8,504,523
  8,504,612
  8,504,637
  8,504,717
  8,505,120
  8,505,363
  8,505,421
  8,505,511
  8,505,549
  8,505,566
  8,505,854
  8,506,009
  8,506,117
  8,506,137
  8,506,333
  8,506,403
  8,506,469
  8,506,555
  8,506,560
  8,507,127
  8,507,191
  8,507,336
  8,507,904
  8,507,957
  8,508,083
  8,508,244
  8,508,322
  8,508,361
  8,508,377
  8,508,413
  8,508,434
  8,508,447
  8,508,524
  8,508,601
  8,508,608
  8,508,661
  8,508,902
  8,508,957
  8,508,959
  8,509,069
  8,509,247
  8,509,292
  8,509,527
  8,509,860
  8,509,994
  8,510,008
  8,510,010
  8,510,184
  8,510,418
  8,510,454
  8,510,573
  8,510,651
  8,510,722
  8,510,991
  8,511,146
  8,511,337
  8,511,426
  8,511,536
  8,511,564
  8,511,622
  8,511,625
  8,511,721
  8,512,134
  8,512,235
  8,512,774
  8,514,004
  8,514,100
  8,514,731
  8,514,956
  8,515,128
  8,515,692
  8,515,751
  8,516,421
  8,516,499
  8,516,623
  8,517,097
  8,517,322
  8,517,340
  8,517,466
  8,517,469
  8,517,604
  8,517,768
  8,517,801
  8,517,989
  8,518,094
  8,518,156
  8,518,229
  8,518,570
  8,518,575
  8,518,717
  8,518,852
  8,518,854
  8,519,008
  8,519,195
  8,519,402
  8,519,420
  8,519,454
  8,519,504
  8,519,733
  8,519,777
  8,519,943
  8,520,095
  8,520,198
  8,520,267
  8,520,464
  8,520,550
  8,520,630
  8,520,639
  8,520,663
  8,520,697
  8,520,772
  8,520,805
  8,520,880
  8,520,898
  8,520,901
  8,520,914
  8,521,281
  8,521,394
  8,521,513
  8,521,609
  8,521,730
  8,521,759
  8,522,327
  8,522,707
  8,523,060
  8,523,770
  8,523,777
  8,524,286
  8,524,546
  8,524,674
  8,524,831
  8,524,886
  8,524,916
  8,524,931
  8,524,993
  8,525,091
  8,525,113
  8,525,131
  8,525,334
  8,525,396
  8,525,453
  8,525,487
  8,525,527
  8,525,800
  8,525,911
  8,525,917
  8,526,044
  8,526,147
  8,526,187
  8,526,269
  8,526,280
  10,603,601
  10,604,296
  10,604,297
  10,604,299
  10,604,301
  10,604,302
  10,604,304
  10,604,551
  10,604,576
  10,604,711
  10,605,011
  10,605,146
  10,605,528
  10,605,599
  10,606,057
  10,606,149
  10,606,716
  10,607,172
  10,607,308
  10,607,541
  10,609,367
  10,610,977
  10,611,527
  10,613,180
  10,613,328
  10,613,432
  10,616,125
  10,617,579
  10,617,581
  10,617,726
  10,617,796
  10,617,888
  10,617,891
  10,617,893
  10,617,897
  10,617,898
  10,618,625
  10,618,628
  10,618,648
  10,618,671
  10,618,690
  10,618,692
  10,619,623
  10,619,667
  10,620,885
  10,622,524
  10,623,193
  10,623,460
  10,623,769
  10,623,926
  10,624,499
  10,624,587
  10,624,688
  10,624,988
  10,625,019
  10,625,200
  10,625,284
  10,626,666
  10,627,354
  10,627,529
  10,627,563
  10,627,663
  10,628,062
  10,628,324
  10,628,632
  10,628,641
  10,629,881
  10,631,457
  10,631,471
  10,631,789
  10,631,868
  10,631,872
  10,632,308
  10,633,529
  10,633,530
  10,634,312
  10,634,726
  10,634,960
  10,635,043
  10,635,541
  10,635,871
  10,635,908
  10,635,994
  10,636,014
  10,636,079
  10,636,345
  10,636,764
  10,637,172
  10,637,341
  10,637,412
  10,637,653
  10,637,763
  10,637,986
  10,638,382
  10,638,604
  10,639,966
  10,640,104
  10,640,134
  10,640,465
  10,640,783
  10,641,606
  10,641,636
  10,641,871
  10,641,904
  10,641,969
  10,642,238
  10,642,299
  10,642,346
  10,642,352
  10,642,398
  10,642,696
  10,642,878
  10,642,880
  10,642,882
  10,642,938
  10,642,994
  10,643,230
  10,643,241
  10,643,681
  10,643,704
  10,644,038
  10,644,553
  10,644,589
  10,644,840
  10,645,184
  10,645,284
  10,645,523
  10,645,602
  10,646,323
  10,646,551
  10,646,887
  10,647,159
  10,647,211
  10,648,019
  10,648,576
  10,648,823
  10,649,786
5
T
C
A
2/-
A/-
G
G
38/-
14/-
-
A
T
G
T
G
A
A
C
A
C
G
A
T
C
C
C
G
G
G
A
18
T
T
-
T
C
T
C
A
C
G
A
G
A
A
C
2
C
3
A
C
T
A
T
C
A
A
A
G
T
-
C
T
G
G
A
T
T
G
G
C
G
C
A
T
C
A
-
C
A
G
T
G
G
G
A
G
2
C
T
A
G
C
T
T
G
T
G
C
T
A
G
G
A
A
G
C
C
G
T
G
A
C
C
-
-
C
C
T
A
2
A
G
T
A
A
G
A
G
T
C
2
T
A
-
G
C
C
A
G
A
A
C
A
C
A
G
-
3
G
C
T
C
A
G
A
C
T
A
A
A
G
C
A
G
A
G
C
T
2
T
T
A
G
-
G
-
-
G
C
C
C
C
T
C
A
G
C
G
C
G
C
C
C
T
2
-
T
A
T
C
A
A
-
T
2
15
T
G
T
-
G
G
A
A
G/4
A
G
C
G
A
2
7
C
2
5
47
A
A
-
G
A
T
T
G
T
T
A
T
G
G
G
AT/3
C
G/5
T
A
C
A
A
9
4
A
-
A
T
3
-
8
6
C
C
2/-
G
T
-
13/11
11
T
T
-
3
A
-
C
C
A
3
T
8/-
G
G
A
2
T
G
3
A
C
A
T
G
G
7
A
-
-
C
73
A
G
A
T
G
11
A
G
A
A
A
A
C
C
G
C
2
5
T
C
C
G
G
T
T
C
G
C
2
-
G
G
-
T
T
A
2
G/2
10/-
-
G
A
C
-
G
T
G
A
A
C
C
2
T
T
-
-
2
C