Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 48,865 (bp)   Positions: 298
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.498
.569
.008
.0
.996
.002
.187
.186
.0
--
--
.005
.089
.009
.003
.268
.013
.153
.058
.15
.129
.104
.005
.025
.006
.0
.0
.004
.03
.001
.002
.008
.001
.31
.011
.001
.029
.002
.001
.02
.008
.013
.011
.085
.069
--
.005
.341
.336
.099
.089
.186
.03
.007
.018
.879
.078
.011
.03
.018
.027
.029
.086
.007
.008
.03
.017
.003
.045
.249
.11
.012
.016
.02
.076
.008
.057
.039
.054
.105
.026
.952
.007
.085
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.001
.879
.003
.004
.011
.06
.032
.003
.005
.004
.254
.372
.435
.277
.264
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.163
.289
.407
.088
.027
.182
.004
.004
.017
.001
.046
.196
.005
.017
.254
.063
.003
.01
.005
.009
.011
.017
.027
.029
.031
.0
.001
.001
.99
.001
.007
.002
.077
.002
.068
.024
.005
.005
.029
.981
.0
.003
.002
.002
.001
.007
.001
.06
.004
.076
.115
.023
.014
.007
.168
.605
.438
.006
.002
.007
.051
.081
.025
--
--
--
--
.001
.013
.222
.134
.131
.058
.667
.007
.011
.0
.002
.0
.981
.765
.453
.086
.016
.032
.001
.05
.0
.0
.083
.069
.191
.143
1.0
.815
.189
.0
.0
.011
.002
.002
--
.01
.122
.08
.0
.015
.004
.001
.0
.0
.0
.0
.022
.05
.022
.036
.001
.002
--
.13
.009
.069
.032
.001
.001
.005
.002
.0
.002
.058
.0
.021
.334
.333
.22
.0
.008
.002
.0
.002
.0
.031
.004
.001
.008
.002
.016
.003
.037
1.0
.0
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
3
10
T
A
T
2
A
38
14
2
C
C
A
C
A
G
G
C
T
G
G
A
G
C
G
T
T
C
T
T
T
G
A
G
A
G
C
A
A
G
C
T
C
T
T
C
T
T
G
T
G
T
G
G
T
C
T
A
A
G
G
G
A
C
A
T
C
A
A
G
G
C
A
A
T
C
G
G
C
G
T
G
C
G
G
T
A
G
A
A
T
A
T
T
G
G
C
C
A
A
T
A
C
G
6
G
T
A
T
G
C
C
G
C
C
C
G
T
T
A
G
G
T
C
T
C
T
G
T
A
T
A
T
C
A
G
G
2
G
C
4
8
C
A
A
C
A
40
G
T
T
C
C
T
A
G
C
G
C
T
2
C
A
T
T
A
G
C
A
T
5
T
G
A
G
A
C
A
C
G
C
A
T
A
C
A
A
G
T
A
T
G
8
C
G
G
A
C
T
A
A
A
T
T
C
C
G
2
G
A
G
T
C
T
8
6
T
A
A
C
7
C
G
4
G
G
A
A
A
A
A
G
A
G
C
A
T
T
T
A
G
A
A
G
C
T
T
G
G
A
G
G
T
A
T
G
C
C
C
4
63
3
C
C
8
T
4
A
A
G
16
T
C
T
3
G
G
A
T
A
A
A
G
T
T
A
C
C
17
4
2
4
T
G
G
G
T
  8,493,750
  8,493,800
  8,493,806
  8,494,800
  8,495,512
  8,495,998
  8,496,476
  8,496,477
  8,497,199
  8,497,216
  8,497,301
  8,497,747
  8,497,862
  8,497,889
  8,498,041
  8,498,222
  8,498,388
  8,498,440
  8,498,800
  8,498,890
  8,498,891
  8,498,892
  8,499,017
  8,499,206
  8,499,256
  8,499,354
  8,499,558
  8,499,640
  8,499,681
  8,499,695
  8,499,742
  8,499,793
  8,499,849
  8,500,210
  8,500,247
  8,500,356
  8,500,365
  8,500,641
  8,500,683
  8,500,943
  8,500,981
  8,501,077
  8,501,445
  8,501,552
  8,501,621
  8,501,639
  8,501,721
  8,501,806
  8,501,807
  8,502,048
  8,502,088
  8,502,192
  8,502,343
  8,502,384
  8,502,408
  8,502,864
  8,503,217
  8,503,424
  8,503,592
  8,503,769
  8,503,799
  8,503,845
  8,503,898
  8,503,913
  8,503,914
  8,503,975
  8,504,108
  8,504,136
  8,504,320
  8,504,362
  8,504,389
  8,504,496
  8,504,517
  8,504,518
  8,504,523
  8,504,612
  8,504,637
  8,504,717
  8,504,877
  8,505,026
  8,505,120
  8,505,421
  8,505,511
  8,505,549
  8,505,566
  8,505,854
  8,506,009
  8,506,117
  8,506,121
  8,506,333
  8,506,403
  8,506,469
  8,506,555
  8,507,127
  8,507,145
  8,507,336
  8,507,957
  8,508,062
  8,508,083
  8,508,322
  8,508,377
  8,508,413
  8,508,434
  8,509,421
  8,509,667
  8,510,362
  8,510,393
  8,510,418
  8,510,991
  8,511,536
  8,512,018
  8,512,126
  8,512,348
  8,512,774
  8,513,799
  8,513,832
  8,513,851
  8,514,004
  8,514,100
  8,514,736
  8,515,384
  8,516,619
  8,516,623
  8,517,097
  8,517,187
  8,517,322
  8,517,510
  8,517,768
  8,518,229
  8,518,422
  8,518,816
  8,518,852
  8,519,008
  8,519,343
  8,519,504
  8,519,656
  8,519,955
  8,520,292
  8,520,550
  8,520,580
  8,520,630
  8,520,647
  8,520,657
  8,520,697
  8,521,044
  8,521,394
  8,521,488
  8,521,513
  8,521,724
  8,522,078
  8,522,327
  8,522,707
  8,522,848
  8,523,760
  8,523,777
  8,524,350
  8,524,546
  8,524,662
  8,524,674
  8,524,798
  8,525,114
  8,525,487
  8,525,520
  8,526,187
  10,604,296
  10,604,297
  10,604,299
  10,604,301
  10,604,302
  10,604,304
  10,604,551
  10,604,711
  10,605,011
  10,605,146
  10,605,528
  10,605,599
  10,606,057
  10,606,464
  10,606,716
  10,607,361
  10,607,375
  10,607,464
  10,607,465
  10,607,502
  10,607,541
  10,608,932
  10,609,367
  10,609,894
  10,610,765
  10,610,977
  10,611,527
  10,613,180
  10,613,243
  10,613,329
  10,613,740
  10,616,125
  10,617,310
  10,617,579
  10,617,581
  10,617,726
  10,617,796
  10,617,839
  10,617,888
  10,617,891
  10,617,893
  10,617,897
  10,617,898
  10,618,625
  10,618,628
  10,618,648
  10,618,671
  10,618,690
  10,618,692
  10,619,028
  10,619,307
  10,619,617
  10,619,619
  10,620,321
  10,620,356
  10,623,460
  10,623,926
  10,624,499
  10,624,587
  10,624,688
  10,624,992
  10,625,003
  10,625,019
  10,625,200
  10,626,955
  10,627,563
  10,627,663
  10,628,448
  10,628,632
  10,628,641
  10,629,881
  10,630,214
  10,630,296
  10,630,361
  10,631,139
  10,631,471
  10,631,563
  10,631,789
  10,631,872
  10,632,308
  10,633,529
  10,633,530
  10,634,700
  10,634,960
  10,635,043
  10,636,272
  10,636,764
  10,637,341
  10,637,521
  10,637,763
  10,637,986
  10,638,382
  10,638,604
  10,638,616
  10,638,856
  10,639,323
  10,639,757
  10,639,798
  10,639,965
  10,639,970
  10,640,134
  10,640,374
  10,640,783
  10,641,358
  10,641,606
  10,641,636
  10,641,895
  10,642,042
  10,642,299
  10,642,342
  10,642,580
  10,642,995
  10,643,151
  10,643,386
  10,643,965
  10,644,553
  10,644,770
  10,645,184
  10,645,284
  10,645,602
  10,646,323
  10,646,551
  10,646,887
  10,647,159
  10,647,211
  10,647,559
  10,648,023
  10,648,025
  10,648,576
  10,648,652
  10,649,177
  10,649,786
  10,651,848
  10,651,944
A
-
-
C
T
C
-
A/-
38/-
14/-
-
T
T
G
T
G
A
A
T
C
A
C
G
A
T
A
C
C
T
C
G
G
A
G
A
18
A
T
T
T
-
T
C
T
C
A
T
A
G
A
C
2
C
3
A
C
T
A
T
C
A
A
A
G
T
-
C
T
G
G
A
T
T
G
G
C
G
C
T
T
A
C
A
-
C
A
G
T
A
G
G
A
G
C
A
A
C
-
T
G
G
C
T
A
A
-
A
C
G
G
T
2
T
A
T
T
T
-
G
A
G
2
A
C
A
A
T
C
A
2
G
A
G
-
G
G
T
A
-
A
G
-
-
G
2
G
-
C
-
A
C
C
A
G
2
G
T
A
A
A
-
-
A
G
2
7
C
2
5
47
A
-
G
A
T
T
G
2
T
T
A
T
C
C
G
T
G
11
A
G
2
C
A
-
T
A
A
C
A
A
A/3
3
4
A
-
A
T
3
-
8
6
C
C
T
C
8/-
6/-
A
G
11
T
-
6
A
-
A
C
C
G
G
G
G
T
G
3
5
21
A
G
C
2
A
G
G
7
A
5
C
73/82
A
G
A
A
C
C
G
C
T
T
4
-
-
-
A
T
-
C
-
G
G
2
-
C
C/-
A
-
A
C
6
C
C
T
G
A
C
C
2
T
T
-
4/-
2/-
-
T/3
A
C
C
C