Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 48,865 (bp)   Positions: 388
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.008
.597
.996
.0
.0
.002
.186
.007
.005
.001
--
--
--
--
--
.005
.089
.009
.003
.268
.013
.153
.058
.15
.129
.104
.005
.025
.006
.0
.0
.004
.03
.001
.002
.008
.001
.31
.011
.001
.029
.002
.001
.02
.008
.013
.011
.085
.069
--
.005
.341
.336
.099
.089
.186
.03
.007
.018
.879
.971
.982
.952
.989
.983
.078
.011
.03
.018
.027
.029
.086
.007
.008
.03
.017
.003
.045
.249
.11
.012
.016
.02
.076
.008
.057
.039
.054
.105
.026
.952
.007
.085
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.001
.879
.003
.004
.011
.06
.032
.003
.005
.004
.254
.415
.435
.277
.264
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.163
.289
.407
.027
.182
.004
.004
.017
.001
.046
.196
.005
.017
.254
.063
.003
.01
.017
.005
.0
.0
.001
.001
.001
.99
.001
.007
.002
.055
.002
.002
.001
.981
.003
.004
.001
.001
.003
.006
.003
.04
.007
.002
.0
.0
.001
.01
.011
.0
.005
.023
.001
.01
.007
.068
.0
.0
.001
.0
.001
.0
.001
.0
.984
.013
1.0
.001
.0
.0
.0
.0
.569
--
--
.002
.268
.011
.07
.017
.03
.383
.522
.481
.038
.006
.0
.029
.115
.008
.1
.013
.054
.22
.201
.073
.177
.023
.023
.014
.007
.012
.168
.673
.605
.438
.381
.006
.002
.007
.051
.081
.145
.396
.222
.136
.016
.021
.067
--
.001
.01
.26
.216
.239
.026
.055
.018
.052
.049
.007
.312
.262
.139
.652
.0
.008
.001
.0
.0
.011
.002
.0
.584
.985
.987
.981
.877
.751
.746
.453
.086
.0
.909
.887
.032
.05
.0
.0
.042
.074
.034
.181
.001
.073
.815
.189
.0
.0
.011
.001
.151
.002
--
--
--
.01
.15
.007
.08
.0
.008
.109
.001
.0
.02
.0
.0
.001
.001
.007
--
--
--
.369
.009
.032
.001
.003
.001
.002
.0
.011
.001
.509
.001
.064
.005
.333
.0
.0
.001
.008
.002
.0
.0
.0
.0
.002
.0
.0
.031
.004
.036
.016
.004
.001
.001
.037
1.0
.007
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
C
A
G
C
T
A
A
A
2
G
G
C
G
2
C
C
A
C
A
G
G
C
T
G
G
A
G
C
G
T
T
C
T
T
T
G
A
G
A
G
C
A
A
G
C
T
C
T
T
C
T
T
G
T
G
T
G
G
T
G
G
G
T
T
C
T
A
A
G
G
G
A
C
A
T
C
A
A
G
G
C
A
A
T
C
G
G
C
G
T
G
C
G
G
T
A
G
A
A
T
A
T
T
G
G
C
C
A
A
T
A
C
G
G
G
T
A
T
G
C
C
G
C
C
C
C
G
T
T
A
G
T
C
T
C
T
G
T
A
T
A
T
C
A
G
G
2
G
C
2
4
8
2
T
C
A
A
C
A
G
T
T
C
C
T
A
G
C
G
C
T
2
C
C
A
G
T
G
5
T
G
A
G
A
C
A
C
G
A
G
G
T
G
C
G
A
G
A
G
T
G
C
T
G
A
A
5
T
A
A
T
A
A
T
T
C
C
G
C
A
C
T
T
T
G
A
G
T
A
C
A
G
T
C
C
A
T
A
A
A
T
T
T
G
T
G
C
A
2
G
T
A
G
A
A
C
C
T
T
A
A
4
A
T
T
C
C
T
T
T
16
C
A
T
A
A
C
G
C
5
G
2
T
T
G
2
3
G
A
14
C
4
A
T
T
C
C
G
2
C
8
4
G
C
4
G
A
C
T
T
A
A
G
A
C
10
G
5
G
G
T
A
G
A
A
C
A
G
A
T
G
T
G
G
G
A
C
G
T
A
G
T
G
3
C
C
C
T
3
C
T
A
A
C
A
T
G
G
T
C
C
G
T
T
C
A
C
A
G
T
T
T
C
T
A
12
C
C
C
12
T
C
G
G
G
G
T
  8,493,806
  8,494,492
  8,495,512
  8,495,810
  8,495,819
  8,495,998
  8,496,477
  8,496,762
  8,497,116
  8,497,205
  8,497,236
  8,497,248
  8,497,254
  8,497,260
  8,497,301
  8,497,747
  8,497,862
  8,497,889
  8,498,041
  8,498,222
  8,498,388
  8,498,440
  8,498,800
  8,498,890
  8,498,891
  8,498,892
  8,499,017
  8,499,206
  8,499,256
  8,499,354
  8,499,558
  8,499,640
  8,499,681
  8,499,695
  8,499,742
  8,499,793
  8,499,849
  8,500,210
  8,500,247
  8,500,356
  8,500,365
  8,500,641
  8,500,683
  8,500,943
  8,500,981
  8,501,077
  8,501,445
  8,501,552
  8,501,621
  8,501,639
  8,501,721
  8,501,806
  8,501,807
  8,502,048
  8,502,088
  8,502,192
  8,502,343
  8,502,384
  8,502,408
  8,502,864
  8,502,930
  8,502,948
  8,502,957
  8,502,965
  8,503,019
  8,503,217
  8,503,424
  8,503,592
  8,503,769
  8,503,799
  8,503,845
  8,503,898
  8,503,913
  8,503,914
  8,503,975
  8,504,108
  8,504,136
  8,504,320
  8,504,362
  8,504,389
  8,504,496
  8,504,517
  8,504,518
  8,504,523
  8,504,612
  8,504,637
  8,504,717
  8,504,877
  8,505,026
  8,505,120
  8,505,421
  8,505,511
  8,505,549
  8,505,566
  8,505,854
  8,506,009
  8,506,117
  8,506,121
  8,506,333
  8,506,403
  8,506,469
  8,506,555
  8,507,127
  8,507,145
  8,507,336
  8,507,957
  8,508,062
  8,508,083
  8,508,322
  8,508,377
  8,508,413
  8,508,434
  8,509,421
  8,509,667
  8,510,387
  8,510,393
  8,510,418
  8,510,991
  8,511,536
  8,512,018
  8,512,126
  8,512,348
  8,512,774
  8,513,744
  8,513,799
  8,513,832
  8,513,851
  8,514,004
  8,514,100
  8,514,736
  8,515,384
  8,516,619
  8,517,097
  8,517,187
  8,517,322
  8,517,510
  8,517,768
  8,518,229
  8,518,422
  8,518,816
  8,518,852
  8,519,008
  8,519,343
  8,519,504
  8,519,656
  8,519,955
  8,520,292
  8,520,550
  8,520,580
  8,520,630
  8,520,639
  8,520,647
  8,520,657
  8,520,663
  8,520,664
  8,520,697
  8,521,044
  8,521,394
  8,521,488
  8,521,513
  8,522,078
  8,522,327
  8,522,707
  8,522,848
  8,523,760
  8,523,777
  8,524,350
  8,524,546
  8,524,662
  8,524,674
  8,524,798
  8,525,114
  8,525,487
  8,525,520
  8,526,048
  8,526,187
  10,603,601
  10,604,551
  10,604,576
  10,604,711
  10,605,011
  10,605,146
  10,605,528
  10,605,599
  10,606,057
  10,606,149
  10,606,716
  10,607,172
  10,607,308
  10,607,541
  10,607,831
  10,608,030
  10,608,041
  10,608,072
  10,608,677
  10,609,153
  10,609,367
  10,609,385
  10,609,586
  10,609,733
  10,609,811
  10,609,829
  10,609,899
  10,610,200
  10,610,378
  10,610,463
  10,610,776
  10,610,884
  10,610,977
  10,611,301
  10,611,527
  10,611,566
  10,611,731
  10,611,774
  10,611,808
  10,611,836
  10,611,939
  10,612,106
  10,612,413
  10,612,774
  10,612,868
  10,613,055
  10,613,096
  10,613,180
  10,613,309
  10,613,401
  10,613,442
  10,613,464
  10,613,809
  10,614,045
  10,614,131
  10,614,444
  10,614,465
  10,615,035
  10,615,137
  10,615,259
  10,615,572
  10,615,632
  10,615,659
  10,615,663
  10,615,715
  10,615,791
  10,615,795
  10,615,914
  10,616,125
  10,616,259
  10,616,329
  10,616,557
  10,616,773
  10,616,838
  10,617,050
  10,617,224
  10,617,239
  10,617,310
  10,617,495
  10,617,579
  10,617,581
  10,617,658
  10,617,726
  10,617,790
  10,617,796
  10,617,839
  10,617,844
  10,617,888
  10,617,891
  10,617,893
  10,617,897
  10,617,898
  10,618,101
  10,619,268
  10,619,307
  10,619,609
  10,619,657
  10,620,272
  10,620,623
  10,620,935
  10,621,973
  10,622,047
  10,622,148
  10,622,164
  10,622,191
  10,622,260
  10,622,397
  10,622,412
  10,622,506
  10,622,511
  10,622,524
  10,622,560
  10,622,900
  10,622,981
  10,623,194
  10,623,288
  10,623,461
  10,623,710
  10,623,815
  10,623,866
  10,623,926
  10,624,587
  10,624,688
  10,624,932
  10,624,987
  10,624,988
  10,624,992
  10,624,999
  10,625,007
  10,625,008
  10,625,019
  10,625,200
  10,627,354
  10,627,521
  10,627,527
  10,627,563
  10,628,448
  10,628,632
  10,628,641
  10,629,626
  10,629,882
  10,629,968
  10,630,297
  10,630,585
  10,631,060
  10,631,471
  10,631,563
  10,631,789
  10,631,872
  10,632,308
  10,632,661
  10,633,446
  10,633,529
  10,634,311
  10,634,700
  10,634,737
  10,634,960
  10,635,605
  10,635,876
  10,636,272
  10,636,764
  10,636,991
  10,637,172
  10,637,763
  10,637,986
  10,638,166
  10,638,382
  10,638,604
  10,639,965
  10,639,967
  10,640,023
  10,640,134
  10,640,266
  10,640,334
  10,640,385
  10,640,783
  10,641,606
  10,641,636
  10,641,817
  10,641,969
  10,642,299
  10,642,353
  10,643,230
  10,643,237
  10,643,559
  10,643,731
  10,643,866
  10,643,880
  10,644,553
  10,645,013
  10,645,184
  10,645,192
  10,645,284
  10,645,602
  10,646,323
  10,646,327
  10,646,493
  10,646,494
  10,646,551
  10,646,887
  10,646,968
  10,647,159
  10,647,211
  10,647,662
  10,648,576
  10,648,654
  10,648,733
  10,649,137
  10,649,177
  10,649,786
  10,651,554
  10,651,944
C/3
T
T
C
T
C
-
G
G
-
G/C
G/C
C/G
G/C
-
T
T
G
T
G
A
A
T
C
A
C
G
A
T
A
C
C
T
C
G
G
A
G
A
18
A
T
T
T
-
T
C
T
C
A
T
A
G
A
C
2
C
3
A
C
G/A
G/A
G/A
T/C
T/C
T
A
T
C
A
A
A
G
T
-
C
T
G
G
A
T
T
G
G
C
G
C
T
T
A
C
A
-
C
A
G
T
A
G
G
A
G
C
A
A
C
-
T
G
G
C
T
A
A
G/A
G/A
C
G
G
T
2
T
A
T
T
T
T
-
G
A
G
2
C
A
A
T
C
A
2
G
A
G
-
G
G
T
A
-
A
G
-
-
-
-
2
G
2
G
-
C
A
C
C
A
G
2
G
T
A
A
A
-
-
A
3
G
A
A
A
-
G
A
T
T
G
T
T
A
T
G
T
A
C
A
T
-
G
A
-
A
C
3
T
C
T
T
G
-
G
T
3
G
G
G
G
C
A
T
A
T
C
A
C
C
C
A
G
A
2
G
T
7
A
C
G
T
G
C
G
G
G
C
-
C
A
C
A
T
G
-
A
3
G
A
G
C
A
T
A
C
3/5
A/3
-
4
A
-
A
T
C
2
C
16/-
A
C
C
T
G
G
A
T
-
T
-
3
C
-
-
-
C
G
-
A
-
G
C
C
T
3
A
-
C/5
8/-
4/-
G/A
C/A
4/-
C
C
T
C
G
G
G
T
G
T
-
-
-
T
A
C
2
A
G
G
T
A/G
7
5
5
G/C
C
A
T
A
G
T
A
C
C
-
G
C
3/-
C/2
C/A
C/T
C
3/-
C/-
C
G
G
T
C
C
-
4
C
A
T
A
C
C
T
T
-
G
A
C
A
A
A
C
2
-
T
T
T
-
T/A
T
A
A
C
A
C