Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 56,220 (bp)   Positions: 219
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.045
.011
.022
.217
.0
.004
.019
.049
.283
.0
.0
.002
.015
.0
.103
.04
.973
.551
.115
.004
.153
.014
.011
.732
.028
.006
.0
.009
.001
.001
.001
.009
.012
.061
.053
.043
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.52
.196
.093
.012
.102
.0
.0
.007
.004
.005
.002
.005
.001
.003
.001
.031
.004
.005
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.875
.002
.003
.015
.001
.001
.004
.004
.046
.043
.052
.075
.091
.014
.006
.026
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.264
.247
.005
.119
.004
.34
.788
.007
.0
.341
.01
.193
.054
.012
.016
.038
.002
.013
.013
.007
.002
.0
.0
--
--
--
.001
.036
.001
.003
.005
.017
.017
.005
.862
.0
.026
.102
.0
--
--
--
--
--
.016
.002
.055
.005
.951
.059
.001
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
Cckar
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
G
G
G
T
C
A
A
T
T
G
T
A
A
G
T
T
C
T
T
G
T
28
G
14
T
T
G
G
G
T
T
C
C
T
G
A
G
T
C
A
C
T
G
C
T
A
G
G
2
C
G
G
A
A
3
G
T
G
T
C
G
A
C
T
C
T
C
C
T
C
3
C
T
C
C
T
T
G
T
T
A
A
C
T
G
G
A
A
G
C
A
C
G
A
G
T
A
G
G
C
A
T
G
T
A
G
A
T
T
G
G
G
C
A
G
A
C
C
A
T
A
A
G
C
G
11
T
C
C
T
T
G
A
2
A
A
C
A
T
12
G
G
C
G
A
A
G
T
T
A
A
A
A
A
C
T
T
G
C
C
C
C
3
16
3
C
C
C
A
A
T
T
T
T
G
G
C
A
G
A
5
A
3
2
A
C
T
C
C
A
G
G
A
G
C
A
T
G
G
T
G
2
G
16
G
2
C
G
2
T
T
A
A
C
C
4
G
  59,692,259
  59,692,268
  59,692,299
  59,692,571
  59,692,885
  59,692,896
  59,692,928
  59,692,968
  59,692,989
  59,693,143
  59,693,207
  59,693,237
  59,693,322
  59,693,355
  59,693,879
  59,693,906
  59,693,987
  59,694,136
  59,694,386
  59,694,456
  59,694,459
  59,694,604
  59,694,729
  59,695,003
  59,695,011
  59,695,017
  59,695,223
  59,696,786
  59,696,863
  59,697,143
  59,698,004
  59,698,436
  59,698,634
  59,698,834
  59,699,801
  59,699,887
  59,700,018
  59,700,020
  59,700,028
  59,700,133
  59,700,167
  59,700,239
  59,703,060
  59,703,258
  59,703,271
  59,703,283
  59,703,299
  59,703,302
  59,703,314
  59,703,325
  59,703,326
  59,703,355
  59,703,359
  59,703,374
  59,703,435
  59,703,474
  59,703,541
  59,703,723
  59,703,728
  59,703,755
  59,703,793
  59,703,818
  59,703,835
  59,704,021
  59,704,253
  59,704,255
  59,704,279
  59,704,294
  59,704,299
  59,704,307
  59,704,313
  59,704,411
  59,704,434
  59,704,449
  59,704,461
  59,704,469
  59,704,472
  59,704,626
  59,704,645
  59,704,807
  59,704,835
  59,704,973
  59,705,124
  59,705,177
  59,705,254
  59,705,543
  59,705,632
  59,705,699
  59,705,750
  59,705,817
  59,706,159
  59,706,262
  59,706,365
  59,706,380
  59,706,741
  59,706,792
  59,706,824
  59,706,937
  59,706,959
  59,706,995
  59,707,354
  59,707,515
  59,707,548
  59,707,868
  59,707,898
  59,708,043
  59,708,059
  59,708,099
  59,708,139
  59,708,291
  59,708,338
  59,708,420
  59,709,249
  59,709,934
  59,710,278
  59,710,289
  59,710,426
  59,710,428
  59,710,706
  59,710,709
  59,711,360
  59,711,419
  59,711,997
  59,712,040
  59,712,073
  59,712,377
  59,712,470
  59,712,578
  59,713,370
  59,713,522
  59,713,658
  59,713,675
  59,714,423
  59,714,706
  59,714,791
  59,714,831
  59,714,882
  59,714,914
  59,715,201
  59,715,202
  59,715,253
  59,715,553
  59,716,056
  59,716,135
  59,716,186
  59,716,347
  59,716,484
  59,716,530
  59,716,626
  59,716,787
  59,717,156
  59,717,277
  59,717,281
  59,717,287
  59,717,289
  59,717,291
  59,717,316
  59,717,321
  59,717,493
  59,717,685
  59,717,822
  59,717,825
  59,717,828
  59,717,844
  59,717,857
  59,717,880
  59,718,056
  59,718,219
  59,718,424
  59,718,430
  59,718,590
  59,718,764
  59,719,187
  59,719,622
  59,719,708
  59,719,816
  59,719,988
  59,720,205
  59,720,256
  59,720,300
  59,720,305
  59,720,362
  59,720,508
  59,720,897
  59,723,336
  59,723,359
  59,723,360
  59,723,998
  59,725,152
  59,725,654
  59,725,656
  59,726,061
  59,726,171
  59,726,175
  59,726,645
  59,726,706
  59,726,969
  59,727,476
  59,728,328
  59,728,458
  59,728,466
  59,728,726
  59,728,949
  59,730,744
  59,732,951
  59,737,838
  59,739,529
  59,740,413
  59,740,423
  59,740,429
  59,740,432
  59,740,440
  59,740,938
  59,742,840
  59,742,909
  59,744,148
  59,746,322
  59,747,346
  59,747,368
T
A
C
A
A
C
T
C
T
C
G
A
G
2
3
T
3
G
T
17
T/A
T
G
-
G/-
-
G
3
A
A
C
C
C
T
A
A
T
G
G/A
T/C
C/A
A/G
2
T/G
G/A
C/T
T/C
A/T
G/T
G/2
2/-
C/A
G/A
G/C
A/G
G
-
G/C
T/G
G/A
T/C
C/T
G/A
A/T
C/A
T/G
2
T/C
C/T
C/T
T/A
C/T
3/-
C/T
T/G
C/G
C/T
T/C
T/A
G/T
T/C
T/G
C
C
C/G
T/A
G/-
G/A
A/C
A/G
A
C/T
G
A
A
G
A
G
G
A
C
T
G
A
2
G
G
T
T
A
G
A
A
A
T
G
A
T
C/-
-
G
C
-
G
A
T
2
-
C
A
T
C
C
A
G
2/-
2
G
T
G
C
-
A
T
A
A
G
C
-
C
C
5
G
A/G
A/G
A/G
T
C
A
T
C/2
C/2
C/2
C/T
-
-
-
T
A
T
G
G
C
C
C
G
T
C
T
G
A
G
-
4
-
-
3
-
C
T
T
G
C
A
G
A
A
G
C
A
A
-
2
-
A
-
7/5
2/-
C/G
G/C
-
T/C
2
G
C
-
T
-
A