Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 224,507 (bp)   Positions: 461
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.11
.012
.435
.045
.003
.015
.011
.0
.571
.048
.168
.034
--
.198
.471
.09
.538
.873
.997
.082
.348
.061
.188
.044
.027
.031
--
--
--
--
.23
.037
.011
.218
.005
--
--
--
--
.007
.001
--
--
.573
.007
.008
.516
.517
.203
.069
.104
.018
.017
.004
.019
.084
.057
.33
.341
.212
--
.003
.007
.011
.187
.019
.014
.06
.0
.194
.532
--
--
.025
.0
.008
.001
.094
.123
.269
.266
.003
.071
.049
.002
--
--
.002
.009
.159
.019
.228
.164
.124
.066
.318
.003
.006
.006
.138
.007
.148
.004
.068
.512
.012
.025
.003
.402
.157
.502
--
--
.072
.018
.002
.029
.027
.785
.041
.009
.284
.011
.017
.001
.017
.05
.205
.115
.122
--
.012
.0
.027
.0
.228
.016
--
.09
.002
.058
.601
--
.012
.263
.03
.058
.008
.006
.017
.005
.032
--
.013
.001
.063
.015
.072
.339
.792
.008
.007
--
.065
.018
.079
.002
.02
.002
.001
--
.008
.083
.095
.023
.032
.029
.008
.994
.024
.024
.001
.038
.139
.202
.114
.157
.145
--
--
.006
.998
.188
.131
.01
.525
.056
.022
.036
.005
.002
.152
.003
.225
.017
.018
.001
.03
.027
.016
.07
.097
.002
.008
.082
.012
.014
.007
.032
.001
.862
.0
.0
.0
.479
.173
.001
.509
.006
.284
.008
.004
.047
.008
.047
.16
.115
.008
--
.002
.142
.11
.012
.156
.011
.027
.009
.005
--
--
--
--
--
.004
--
--
.002
.012
.006
.08
.337
.041
.134
.055
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.405
.259
.001
.01
.0
.0
.001
.01
.002
.018
.02
.47
.005
.454
.051
--
.016
.0
.015
.053
.024
.012
.578
.003
.0
.002
.001
.026
.01
.008
.026
.007
.076
.141
.0
.01
.115
.004
.004
.002
.005
.006
.005
.001
.004
.0
.002
.0
.0
.003
.123
.122
.077
.018
.001
.041
.05
.076
.079
.06
.025
.054
.049
.051
--
.002
.003
.01
.052
.221
.291
.196
.286
.004
.001
.002
.099
.008
.001
.183
--
.006
.002
.002
.004
.742
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.14
.014
.65
.002
.093
.005
.035
--
--
--
.003
.0
.0
.113
.001
.095
.01
.004
.001
.002
.005
.007
.001
.0
.987
.01
.01
.005
.01
.052
.005
.028
.103
--
--
--
.072
.016
.003
.0
.028
.083
.014
--
.006
.694
.057
.999
.0
.0
.07
--
--
.079
.007
--
.187
.003
--
.035
.12
.213
--
--
.493
1.0
.017
.002
--
--
--
.005
1.0
1.0
.036
.008
--
--
1.0
.993
.005
.086
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
A
C
C
T
G
C
4
A
4
T
2
4
G
2
A
T
A
9
T
C
C
C
2
C
C
2
G
G
G
C
A
T
C
2
A
2
A
G
C
G
A
G
A
T
6
4
G
T
A
G
T
G
T
C
3
2
C
C
G
4
3
2
T
G
T
C
G
G
T
C
T
G
G
C
G
G
G
G
A
A
C
T
A
T
C
G
A
4
T
8
A
3
A
A
G
T
T
A
C
G
T
G
T
C
C
G
A
A
A
3
C
A
C
T
G
T
C
G
C
A
C
G
A
G
T
G
T
A
C
C
A
G
T
T
2
G
8
C
T
A
A
C
A
A
A
G
C
G
C
12
A
T
T
G
G
A
T
C
T
A
A
T
3
G
C
170
4
4
T
A
T
T
G
G
C
T
T
A
T
T
G
T
T
G
C
A
A
G
G
12
G
G
C
A
C
A
G
C
A
G
G
4
G
A
A
T
T
A
G
T
T
A
4
A
G
T
A
C
C
T
G
G
G
G
18
A
C
G
A
6
G
C
A
C
G
T
4
C
G
G
G
T
2
A
T
C
G
6
5
3
T
A
81
A
A
A
C
C
G
T
23
C
G
C
C
C
C
C
C
G
T
G
C
C
A
T
A
T
67
C
15
G
A
T
C
A
C
T
C
A
T
G
A
G
T
T
G
G
A
C
G
A
G
G
G
A
C
A
C
A
C
G
T
G
C
A
C
A
C
A
A
G
G
G
G
A
A
A
T
T
G
T
A
G
A
G
28
26
G
G
6
4
C
G
A
2
T
G
A
C
C
T
G
19
A
G
T
A
C
G
C
G
A
T
G
C
T
G
G
G
A
G
G
G
G
G
A
A
G
19
C
C
A
A
G
C
A
C
A
A
C
T
C
C
T
3
A
A
A
G
A
T
2
C
12
10
T
C
A
G
A
5
C
C
12
10
8
A
T
T
C
C
3
3
C
A
A
14
A
T
C
A
7
G
G
G
G
6
4
T
A
C
G
C
A
A
G
A
T
G
C
A
A
C
C
A
3
T
G
  36,502,910
  36,503,706
  36,503,892
  36,506,637
  36,506,647
  36,507,946
  36,508,415
  36,508,581
  36,510,656
  36,511,422
  36,514,495
  36,517,777
  36,517,811
  36,519,525
  36,519,627
  36,521,636
  36,523,212
  36,523,250
  36,526,790
  36,527,452
  36,527,705
  36,527,954
  36,529,340
  36,530,645
  36,530,647
  36,530,649
  36,531,397
  36,531,464
  36,531,472
  36,531,720
  36,533,069
  36,534,088
  36,536,185
  36,537,883
  36,539,107
  36,542,883
  36,544,865
  36,544,934
  36,544,935
  36,545,288
  36,545,633
  36,548,322
  36,548,538
  36,549,332
  36,549,756
  36,550,388
  36,554,146
  36,554,148
  36,554,317
  36,555,208
  36,556,079
  36,556,338
  36,557,742
  36,558,302
  36,559,673
  36,559,790
  36,560,304
  36,560,491
  36,561,007
  36,561,055
  36,562,581
  36,562,651
  36,562,652
  36,562,653
  36,563,340
  36,563,838
  36,564,443
  36,564,591
  36,564,645
  36,565,556
  36,565,928
  36,566,149
  36,566,218
  36,566,312
  36,566,514
  36,566,939
  36,566,981
  36,567,685
  36,567,756
  36,568,608
  36,568,609
  36,568,943
  36,570,118
  36,570,347
  36,570,381
  36,570,543
  36,570,642
  36,570,843
  36,571,233
  36,571,361
  36,571,419
  36,571,814
  36,573,023
  36,573,148
  36,573,217
  36,573,824
  36,573,924
  36,574,186
  36,574,188
  36,574,572
  36,574,793
  36,576,445
  36,576,609
  36,576,699
  36,576,835
  36,576,913
  36,576,989
  36,577,248
  36,579,094
  36,579,191
  36,579,445
  36,579,925
  36,580,683
  36,581,194
  36,582,268
  36,582,276
  36,582,332
  36,582,407
  36,582,490
  36,583,062
  36,583,104
  36,583,179
  36,583,417
  36,583,562
  36,583,992
  36,584,103
  36,584,291
  36,584,584
  36,585,001
  36,585,003
  36,585,174
  36,585,217
  36,585,737
  36,585,916
  36,585,936
  36,586,985
  36,587,267
  36,587,674
  36,588,387
  36,588,678
  36,589,629
  36,590,685
  36,591,143
  36,591,180
  36,591,850
  36,592,874
  36,594,284
  36,594,632
  36,594,757
  36,594,869
  36,594,872
  36,595,091
  36,595,400
  36,595,489
  36,595,929
  36,596,928
  36,597,068
  36,597,172
  36,597,442
  36,597,468
  36,597,636
  36,598,250
  36,598,541
  36,598,653
  36,600,021
  36,600,060
  36,600,662
  36,600,745
  36,600,762
  36,600,798
  36,601,022
  36,601,300
  36,601,591
  36,601,709
  36,601,909
  36,602,867
  36,604,232
  36,604,665
  36,604,841
  36,605,117
  36,605,187
  36,606,170
  36,606,260
  36,607,431
  36,607,491
  36,609,180
  36,609,483
  36,610,211
  36,610,331
  36,610,384
  36,610,773
  36,610,882
  36,611,132
  36,611,162
  36,611,284
  36,612,027
  36,612,117
  36,613,190
  36,613,958
  36,614,060
  36,614,360
  36,614,786
  36,615,480
  36,615,702
  36,616,106
  36,616,496
  36,616,976
  36,617,851
  36,617,852
  36,619,138
  36,619,362
  36,619,383
  36,620,079
  36,620,201
  36,620,520
  36,620,732
  36,621,397
  36,622,209
  36,622,222
  36,622,899
  36,623,048
  36,623,155
  36,623,165
  36,623,169
  36,623,763
  36,624,095
  36,624,857
  36,625,386
  36,625,671
  36,625,880
  36,626,131
  36,626,143
  36,627,072
  36,627,317
  36,627,775
  36,628,173
  36,628,828
  36,628,868
  36,629,018
  36,629,393
  36,629,455
  36,629,534
  36,629,556
  36,630,098
  36,630,623
  36,630,634
  36,632,668
  36,633,129
  36,634,609
  36,634,633
  36,635,064
  36,635,460
  36,635,585
  36,636,131
  36,636,335
  36,637,264
  36,638,193
  36,638,386
  36,638,712
  36,638,834
  36,639,054
  36,640,018
  36,640,149
  36,640,340
  36,640,392
  36,640,468
  36,640,470
  36,640,472
  36,640,474
  36,640,480
  36,640,482
  36,640,590
  36,640,591
  36,640,608
  36,640,611
  36,640,613
  36,640,752
  36,640,850
  36,640,892
  36,640,915
  36,641,211
  36,641,280
  36,641,282
  36,641,633
  36,642,338
  36,642,772
  36,643,369
  36,643,780
  36,644,496
  36,644,533
  36,644,979
  36,646,633
  36,647,070
  36,647,737
  36,647,864
  36,649,250
  36,649,547
  36,649,615
  36,651,200
  36,651,780
  36,652,292
  36,652,806
  36,654,652
  36,654,677
  36,654,711
  36,655,103
  36,655,326
  36,655,371
  36,655,460
  36,655,506
  36,655,626
  36,655,808
  36,656,348
  36,656,642
  36,656,650
  36,656,893
  36,656,935
  36,657,303
  36,657,345
  36,657,769
  36,657,846
  36,657,927
  36,657,939
  36,658,854
  36,658,892
  36,658,958
  36,659,276
  36,659,780
  36,659,944
  36,660,111
  36,660,446
  36,660,960
  36,661,062
  36,662,306
  36,662,315
  36,662,331
  36,662,358
  36,663,071
  36,663,145
  36,663,147
  36,663,246
  36,663,247
  36,663,770
  36,664,702
  36,665,367
  36,665,369
  36,665,477
  36,666,131
  36,666,842
  36,667,115
  36,667,361
  36,667,552
  36,668,304
  36,668,517
  36,668,621
  36,668,651
  36,668,889
  36,668,947
  36,668,995
  36,669,175
  36,669,234
  36,669,257
  36,669,296
  36,669,458
  36,670,048
  36,670,307
  36,670,829
  36,670,953
  36,672,595
  36,672,966
  36,672,968
  36,672,972
  36,672,975
  36,672,980
  36,672,982
  36,672,986
  36,673,005
  36,673,008
  36,673,292
  36,674,146
  36,674,228
  36,675,287
  36,675,399
  36,676,034
  36,676,045
  36,676,081
  36,679,973
  36,680,002
  36,680,442
  36,680,702
  36,681,017
  36,681,155
  36,681,477
  36,683,541
  36,684,767
  36,684,965
  36,685,680
  36,686,094
  36,686,248
  36,686,250
  36,686,252
  36,686,408
  36,686,552
  36,688,395
  36,689,471
  36,689,472
  36,691,204
  36,691,206
  36,691,495
  36,692,330
  36,693,223
  36,693,523
  36,694,797
  36,694,944
  36,695,132
  36,695,508
  36,695,610
  36,695,612
  36,695,614
  36,695,683
  36,696,117
  36,696,509
  36,697,071
  36,698,662
  36,700,251
  36,700,345
  36,701,930
  36,703,028
  36,703,617
  36,705,722
  36,706,482
  36,706,653
  36,707,056
  36,707,180
  36,707,298
  36,707,415
  36,708,485
  36,709,746
  36,709,970
  36,710,626
  36,710,628
  36,710,911
  36,712,998
  36,713,863
  36,714,974
  36,715,795
  36,715,805
  36,715,928
  36,716,536
  36,718,030
  36,719,789
  36,721,060
  36,721,072
  36,722,479
  36,723,109
  36,723,425
  36,723,482
  36,725,533
  36,725,649
  36,726,116
  36,726,683
T
G
G
2
G
C
A
T
-
G
-
T/9
2/-
-
A
2/-
A/9
T/16
C
-
G
A
5/7
4
-
A
C/3
-
A
A
-
G
G
G
9
-
C
2/-
-
T
T
2
G
A
G
A
6/-
-
A
G
C
7
C
2
C
T
-
2/-
T
T
T
4/-
3/-
2/-
4
T
A
T
-
A
3
CT/3
G
A
A
T
A
C
T
G/2
A/-
G
T
C
G
-
-
A
T
-
C
-
G
-
C
C
T
T/5
T/3
5
T
A
C
A
C
T
T
A
G
4
5
-
2
G
A
G
2
A
C/4
A
T
C
2
C
G
A
C
T
C
C
7/9
T
G
C
A
2
-
3
-
G
C
C
5
T
C
G
G
T
T
A
T
-
G
7
C
-
A
G
C
15/9
C
G
-
C
3/-
A
T
170/-
4/-
-
9
G
C
G
T
C
T
C
C
G
TG/3
C
A
C
15/13
T
2
5
G
9
T
12/-
3
T
A
T
T
G
T
T
G
A
A
-
A
G
G
2
6/8
G
3
5
C
G
-
G
2
C
G
G
T
C
A
A
A
A
-
C
2
A
4
-
A
T
G
T
15/43
3
-
T
3
3
13
C
-
G
C
T
T
-
-
-
G
2
81/-
G
G
G
2
-
C
G
-
A
11/5
T
T
T
T
T
G
A
G
T
G
G
G
G
G
C
67/-
C/-
15/-
A
G
2
T
G
5
C
3
G
C
A
G
A
C
4
2
A
G
2
A
G
T
T
A
G
2
G
A
G
T
G/A
23
-
T
T
T
G
T
G
G
A
T
T
-
G
G
2
C
G
C
C
G
A
-
A
28/-
-
A
A
-
-
A
C
G
-
C
A
C
T
T
C
A
-
G
A
C
G
A
A
13/15
6/4
G
4
A
T
-
G/-
G/-
G/-
3
-
2
A
A
A
C
G
T
-
T
T
G
G
A
T
G
T
G
11
T
2
T
T
G
-
2
T
-
A
G
C
2/-
C/-
12/-
-
C
-
G
A
G
-
T
A
12/-
10/-
8/-
G
C
C
6
T
-
-
G
T
C
-
-
4
T
6
-
C
A
5/3
9/11
6/-
4/-
2
2
5
A
-
C
C
G/2
9
A
2
10
-
G
T
9/7
-
-
C
A