Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 86,985 (bp)   Positions: 299
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.015
.0
.001
.002
.157
.014
.0
.001
.004
.009
.011
.006
.009
.007
.967
.206
.134
.102
.367
--
.002
.611
.512
.002
.939
--
--
.009
--
--
.139
--
.022
.035
--
--
--
.057
--
.045
.542
.218
.002
.287
.002
.086
.509
.527
--
--
.001
.022
.052
.03
.044
.169
.211
.162
.176
.033
.122
.022
.352
.113
.03
.031
.58
.592
.043
.844
.059
.004
.001
--
--
--
--
.114
.044
.279
.012
.009
.053
.015
.018
.511
.03
.004
.038
.077
.029
.009
.008
.002
.0
.001
.594
.249
.116
.087
.025
.841
.002
.012
.001
.001
.001
.454
.408
.235
.035
.045
.197
.014
.201
.606
.0
.039
.422
.315
.056
.155
--
--
--
--
--
--
--
.099
.404
.001
.018
.042
.066
--
.032
.036
.0
.439
.085
.016
.059
.298
.031
.027
--
.637
.029
.412
.223
.0
1.0
.991
.134
.003
.003
.004
.001
.396
.311
.0
.017
.014
.003
.001
.0
.001
1.0
.057
.637
.002
.009
.022
.0
.5
.005
.987
.039
.045
.917
.993
.993
.801
--
.688
.004
.506
.031
.043
.001
.272
.302
--
--
--
--
--
.275
.025
.012
.277
.517
.004
.009
.056
.32
.463
--
.013
.011
.0
.0
.048
.137
.016
.107
--
.058
.055
.017
.764
.015
.009
.002
.01
.06
.001
.168
.013
.025
.002
.009
.593
.184
.513
.956
.362
.002
.013
.008
.868
.826
.015
.002
.112
.036
.002
.009
.011
.009
.027
.0
.154
.012
.272
.16
.002
.101
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
--
--
--
.28
--
.056
.022
.182
.008
--
--
--
.664
.005
.017
.08
.246
.046
.045
--
.143
.005
.007
.107
--
.131
.024
.075
--
.018
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
Blm
C
A
A
T
2
T
G
C
5
T
T
C
T
A
T
T
A
C
5
G
T
T
C
T
G
A
A
A
C
G
2
A
A
7
G
A
A
C
T
A
T
A
C
A
A
C
2
A
C
G
C
A
G
A
T
T
T
T
T
T
T
A
G
2
C
T
3
2
C
C
T
A
C
A
C
C
T
C
T
C
T
C
T
T
T
A
A
T
C
G
3
2
G
C
C
A
C
T
C
C
C
C
A
C
G
G
T
G
G
T
G
C
G
C
C
T
A
T
3
15
3
17
C
C
T
C
31
A
T
G
C
T
A
C
G
C
C
C
A
T
T
C
C
T
2
T
G
A
T
C
2
G
T
T
G
A
G
C
A
4
G
C
T
C
C
A
T
G
T
G
T
G
3
C
C
T
T
G
A
T
A
C
T
A
T
G
C
A
A
C
A
G
G
T
T
C
A
G
A
A
A
T
A
3
A
G
A
T
G
G
A
G
T
T
A
T
G
G
A
T
G
C
A
G
G
T
A
T
A
T
A
T
C
A
C
T
G
A
A
G
A
G
T
A
T
T
G
C
G
C
A
3
A
C
G
T
A
C
C
T
G
A
T
C
C
C
T
T
A
5
A
2
G
2
T
T
T
3
5
T
G
G
C
C
G
G
C
A
G
G
C
C
T
C
C
T
G
A
T
  143,198,920
  143,199,122
  143,199,284
  143,199,385
  143,200,429
  143,200,621
  143,201,758
  143,202,030
  143,202,101
  143,202,940
  143,203,091
  143,203,132
  143,203,683
  143,203,790
  143,204,564
  143,204,715
  143,204,743
  143,204,815
  143,205,893
  143,206,046
  143,206,313
  143,209,115
  143,209,181
  143,209,296
  143,210,209
  143,210,567
  143,210,578
  143,211,178
  143,212,798
  143,212,939
  143,212,980
  143,213,245
  143,214,232
  143,214,234
  143,214,486
  143,214,502
  143,214,530
  143,215,193
  143,215,330
  143,215,446
  143,215,963
  143,216,603
  143,216,673
  143,216,868
  143,217,465
  143,217,823
  143,218,679
  143,218,680
  143,218,742
  143,218,826
  143,219,122
  143,219,378
  143,219,388
  143,219,635
  143,219,768
  143,219,858
  143,219,862
  143,219,930
  143,219,935
  143,220,116
  143,220,272
  143,220,801
  143,221,794
  143,222,349
  143,223,659
  143,223,760
  143,223,788
  143,223,789
  143,224,087
  143,225,131
  143,225,246
  143,225,402
  143,225,412
  143,226,153
  143,226,293
  143,226,333
  143,226,555
  143,227,071
  143,227,130
  143,227,311
  143,227,639
  143,227,662
  143,227,794
  143,227,803
  143,227,834
  143,228,168
  143,229,257
  143,229,333
  143,229,385
  143,229,409
  143,229,434
  143,229,452
  143,229,858
  143,229,860
  143,230,722
  143,230,727
  143,230,894
  143,230,908
  143,230,921
  143,231,037
  143,231,199
  143,231,544
  143,231,616
  143,231,634
  143,231,639
  143,231,646
  143,231,648
  143,231,667
  143,231,669
  143,231,675
  143,231,683
  143,231,732
  143,231,949
  143,233,065
  143,233,273
  143,233,716
  143,233,957
  143,234,279
  143,234,456
  143,234,807
  143,236,157
  143,236,175
  143,236,621
  143,236,929
  143,237,097
  143,237,256
  143,237,397
  143,237,742
  143,238,430
  143,238,622
  143,238,733
  143,238,970
  143,239,126
  143,239,279
  143,239,490
  143,239,691
  143,239,966
  143,240,332
  143,241,432
  143,241,790
  143,242,030
  143,242,244
  143,242,469
  143,242,547
  143,243,303
  143,243,305
  143,243,440
  143,243,862
  143,244,056
  143,244,137
  143,244,178
  143,244,531
  143,244,643
  143,244,658
  143,245,313
  143,245,391
  143,245,616
  143,245,818
  143,245,827
  143,247,121
  143,248,236
  143,249,144
  143,249,214
  143,249,368
  143,249,377
  143,249,525
  143,249,534
  143,249,582
  143,250,007
  143,250,948
  143,251,124
  143,251,165
  143,251,193
  143,251,196
  143,251,241
  143,252,038
  143,252,188
  143,252,387
  143,252,558
  143,253,010
  143,253,092
  143,253,293
  143,253,314
  143,253,524
  143,253,814
  143,253,913
  143,254,277
  143,254,300
  143,254,598
  143,255,110
  143,255,165
  143,255,912
  143,256,356
  143,256,522
  143,256,558
  143,256,596
  143,256,651
  143,256,672
  143,257,625
  143,257,683
  143,257,686
  143,257,774
  143,258,186
  143,258,787
  143,258,859
  143,258,868
  143,258,895
  143,258,938
  143,259,019
  143,259,107
  143,259,109
  143,259,278
  143,259,313
  143,259,337
  143,259,913
  143,259,922
  143,260,185
  143,260,392
  143,260,514
  143,260,526
  143,260,575
  143,260,944
  143,261,109
  143,261,144
  143,261,366
  143,261,389
  143,261,727
  143,261,800
  143,261,860
  143,261,924
  143,262,025
  143,262,053
  143,262,076
  143,262,419
  143,262,674
  143,262,910
  143,262,926
  143,263,152
  143,263,843
  143,263,913
  143,263,953
  143,264,116
  143,264,121
  143,264,250
  143,264,360
  143,264,488
  143,264,517
  143,264,566
  143,264,622
  143,264,785
  143,264,848
  143,264,908
  143,265,139
  143,265,343
  143,265,461
  143,266,082
  143,266,282
  143,266,833
  143,267,615
  143,268,216
  143,268,756
  143,268,813
  143,269,231
  143,269,380
  143,269,384
  143,269,388
  143,269,523
  143,270,434
  143,270,854
  143,271,436
  143,271,839
  143,272,536
  143,272,734
  143,273,193
  143,273,441
  143,274,037
  143,274,466
  143,274,591
  143,275,552
  143,275,705
  143,276,041
  143,276,999
  143,277,184
  143,277,227
  143,277,610
  143,279,846
  143,279,934
  143,279,940
  143,281,066
  143,281,495
  143,281,609
  143,282,015
  143,282,168
  143,282,456
  143,282,986
  143,283,085
  143,283,957
  143,284,479
  143,285,129
T
G
G
G
-
G
G/T
T
5/-
C
A
T
C
G
C
C
G
C/2
-
A
C
C
T
C
A
G
-
G
T
A
2/-
G
-
-
A
G
T
T
C
2
C
G
T
G
11
T
-
4
G
T
T
G
A
C
C
G
C
C
-
2
C
G
T
-
4
C
3/-
2/-
T
A
C
72
T
G
G
2
2
2
C
G
C
T
-
C
C
G
G
G
T
A
-
-
A
A
T
T
T
C
T
T
2
A
2
T
T
T
2
2
A
-
T
-
A
T
T
C
2
C
-
-
-
-
T
T
C
T
-
47
A
G/C
G
13
G
A
T
T
T
T
G
C
2
T
T
C
-
7
-
5
4
2
-
A
G
C
A
G
A
T
T
-
-
T
-
T
T
T
C
A
A
A
A
A
3/-
C/A
3
G
G
C
G
C
G
T
C
C
C
A
2
21
G
14
G
A
T
T/-
T/C
C/T
A/G
G/A
G
G
G
C
G
-
G
T
G
3/4
A
G/8
-
A
C
C
T
19
C
A
G
G
T
G
G
A
A
C
G
C
G
G
A/2
T/C
T
G
T
C
A
65
G
A
G
T
C
G
C
C
C
G
5
T
G
-
G
T
2
G
G
T
A
C
A
G
17
C/T
C/T
T
C
7
G
5/-
-
-
A
-
A
C
C
-
-
G
-
C
G
T
A
A
T
G
A
A
T
G
C
C/2
7
C
C
C
A