Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 124,913 (bp)   Positions: 342
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.976
.001
.007
.0
.0
.049
.001
.014
.031
.0
.001
.0
.0
.06
.0
.015
.175
.038
.011
.025
.004
.004
.001
.007
.039
.001
.003
.064
.002
.0
.0
.018
.027
.048
.073
.05
.054
.09
.009
.004
.001
.007
.016
.034
.002
.375
--
.002
--
--
--
.003
.0
.0
.033
--
.002
.005
.0
.0
.003
.002
.0
.0
.001
.0
.001
.093
.048
.352
--
--
.32
.037
.062
.079
.523
--
--
--
--
--
--
.169
.013
.268
.04
.052
.055
.048
.03
.595
.002
.006
.005
.018
.047
.001
.001
.0
.017
.003
.001
.0
.002
.956
.002
.0
.003
.037
.0
.0
.002
--
.04
.01
.0
.001
.028
.007
.998
1.0
.147
.001
.002
.011
.003
.01
.005
.001
.001
.0
.012
.0
.0
.002
.001
.003
.031
.01
.012
.008
.674
.124
.028
.0
.011
.001
.017
--
.013
--
--
.0
.0
.004
.001
.031
.0
.004
.02
.014
.002
.077
.337
--
--
--
.003
.972
.138
.139
.053
.0
.126
.0
.0
.353
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.002
.004
.997
.001
.141
.001
--
.026
.098
.002
.003
.241
.0
.0
.002
.001
.0
.001
.026
--
.004
.004
.014
.011
.054
--
.348
.007
.018
.042
.01
.0
.016
.015
.029
.03
--
.011
.037
.027
.005
.001
.0
.0
.004
.024
.001
.006
.001
.024
.0
.001
.028
.016
.001
.005
.006
.001
.002
.0
.01
.057
.007
--
--
.007
.005
.009
.049
.52
.002
.005
.128
.109
.128
.006
.003
.002
.095
.034
.006
.005
.002
.006
.0
.006
.001
.018
.005
.0
.003
.007
.094
.007
.001
.0
.005
.01
.336
.322
.258
.184
.003
.013
.065
.036
.139
.046
.257
.264
.001
.001
.001
.002
.949
.968
.021
.013
.015
.309
.0
--
.025
--
--
--
.018
.034
.014
.004
.001
.313
.003
.001
.002
.024
--
--
--
--
--
.311
.0
.002
.234
.002
.94
.016
.0
.015
.001
.002
.126
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
G
G
C
C
C
T
G
C
G
T
C
T
C
T
A
T
C
T
T
T
G
A
C
T
T
C
T
G
T
A
A
T
G
C
C
G
18
C
T
C
G
A
C
G
A
C
G
T
A
G
T
A
A
C
T
T
A
T
C
G
G
C
T
G
G
G
T
A
A
38
4
A
4
T
T
C
A
G
A
A
G
C
G
T
G
G
A
G
G
G
T
T
C
G
C
5
3
C
3
T
C
G
A
T
C
T
G
A
3
T
C
C
C
C
C
T
T
C
G
C
T
C
C
G
G
C
T
G
G
A
A
G
C
C
C
A
A
C
C
5
G
G
C
C
T
C
A
G
G
C
G
A
A
A
A
G
C
A
G
A
C
G
G
G
T
C
T
T
G
C
A
T
20
C
T
G
A
C
A
4
8
4
8
4
C
A
C
4
2
C
C
G
A
A
C
G
A
T
C
C
G
A
A
T
T
T
C
T
T
T
A
G
A
C
A
T
A
G
28
C
A
A
G
T
T
C
A
4
2
C
C
C
G
C
A
C
C
A
C
C
G
C
T
T
A
A
A
A
T
T
T
12
T
G
G
C
T
T
G
G
A
C
T
A
C
T
A
T
G
A
A
G
G
C
A
A
T
G
A
T
G
G
T
T
T
C
T
A
C
4
A
T
G
A
T
T
G
A
A
T
G
A
G
11
T
4
C
T
A
41
G
A
2
8
G
A
A
G
63
A
T
C
C
A
2
A
4
14
T
A
G
G
G
A
C
4
G
T
T
A
T
A
  16,604,481
  16,604,613
  16,605,147
  16,605,556
  16,605,561
  16,605,600
  16,605,725
  16,605,739
  16,605,792
  16,606,019
  16,606,210
  16,606,444
  16,606,584
  16,607,167
  16,608,557
  16,608,658
  16,608,818
  16,608,865
  16,609,205
  16,610,590
  16,611,278
  16,611,798
  16,611,873
  16,611,995
  16,612,076
  16,612,493
  16,612,514
  16,612,711
  16,613,071
  16,613,477
  16,613,851
  16,614,429
  16,614,432
  16,614,457
  16,614,485
  16,614,642
  16,614,650
  16,614,798
  16,615,117
  16,615,715
  16,615,778
  16,616,420
  16,617,923
  16,617,931
  16,618,299
  16,618,917
  16,619,535
  16,619,579
  16,619,958
  16,620,071
  16,620,903
  16,621,328
  16,621,541
  16,621,566
  16,622,216
  16,622,352
  16,622,806
  16,622,822
  16,623,434
  16,623,487
  16,623,536
  16,623,803
  16,623,810
  16,623,817
  16,624,452
  16,624,920
  16,625,175
  16,625,426
  16,625,505
  16,625,579
  16,625,885
  16,625,892
  16,626,031
  16,626,304
  16,626,305
  16,626,372
  16,626,460
  16,626,682
  16,626,685
  16,626,687
  16,626,691
  16,626,695
  16,626,724
  16,627,020
  16,627,540
  16,627,823
  16,627,913
  16,627,981
  16,628,102
  16,628,109
  16,628,341
  16,628,646
  16,630,349
  16,630,536
  16,630,689
  16,630,693
  16,630,699
  16,630,704
  16,630,707
  16,630,715
  16,630,767
  16,630,800
  16,631,137
  16,631,276
  16,631,279
  16,631,561
  16,631,661
  16,632,442
  16,633,084
  16,633,116
  16,633,391
  16,634,612
  16,634,664
  16,635,566
  16,635,589
  16,635,814
  16,636,568
  16,636,771
  16,636,778
  16,637,087
  16,637,175
  16,637,277
  16,637,293
  16,637,498
  16,637,590
  16,637,612
  16,637,642
  16,637,768
  16,637,772
  16,637,902
  16,637,908
  16,637,912
  16,637,976
  16,638,069
  16,638,078
  16,638,157
  16,638,217
  16,638,651
  16,638,759
  16,638,908
  16,639,296
  16,639,688
  16,639,754
  16,640,319
  16,640,693
  16,641,050
  16,641,283
  16,641,346
  16,642,373
  16,642,828
  16,642,966
  16,643,361
  16,643,412
  16,644,331
  16,644,446
  16,644,724
  16,644,957
  16,645,573
  16,646,987
  16,647,084
  16,647,089
  16,647,145
  16,647,307
  16,647,677
  16,647,851
  16,648,882
  16,649,213
  16,649,346
  16,649,836
  16,649,991
  16,651,285
  16,651,657
  16,652,057
  16,652,275
  16,652,554
  16,653,092
  16,653,276
  16,654,641
  16,656,229
  16,656,809
  16,656,866
  16,657,115
  16,657,176
  16,657,335
  16,657,426
  16,657,540
  16,657,665
  16,658,900
  16,660,175
  16,662,733
  16,664,075
  16,664,909
  16,665,003
  16,665,277
  16,666,083
  16,668,628
  16,669,752
  16,670,418
  16,671,567
  16,673,807
  16,675,155
  16,675,164
  16,675,239
  16,677,310
  16,677,717
  16,677,718
  16,678,629
  16,679,902
  16,680,614
  16,680,615
  16,681,372
  16,682,470
  16,682,853
  16,683,733
  16,683,881
  16,683,950
  16,684,683
  16,684,698
  16,684,908
  16,685,163
  16,685,509
  16,685,885
  16,686,008
  16,686,183
  16,686,384
  16,686,944
  16,686,980
  16,686,992
  16,687,598
  16,687,629
  16,687,645
  16,687,730
  16,687,983
  16,689,217
  16,689,698
  16,690,870
  16,691,463
  16,691,474
  16,691,763
  16,692,867
  16,694,065
  16,694,449
  16,694,591
  16,694,837
  16,695,117
  16,695,128
  16,695,913
  16,695,919
  16,696,087
  16,696,123
  16,696,598
  16,697,127
  16,697,185
  16,697,520
  16,698,025
  16,698,125
  16,698,160
  16,698,270
  16,698,986
  16,699,016
  16,700,410
  16,701,386
  16,701,640
  16,702,392
  16,702,474
  16,703,622
  16,704,070
  16,704,399
  16,704,416
  16,704,516
  16,704,626
  16,704,641
  16,704,671
  16,704,694
  16,704,770
  16,704,788
  16,704,872
  16,705,044
  16,705,151
  16,705,840
  16,705,851
  16,705,860
  16,706,011
  16,706,223
  16,706,253
  16,706,679
  16,706,774
  16,706,775
  16,706,777
  16,706,780
  16,706,843
  16,707,045
  16,707,140
  16,707,167
  16,707,576
  16,709,874
  16,709,927
  16,709,928
  16,710,180
  16,710,262
  16,710,387
  16,710,417
  16,714,641
  16,714,643
  16,715,876
  16,715,951
  16,716,759
  16,717,044
  16,717,143
  16,721,676
  16,723,064
  16,723,472
  16,723,504
  16,723,740
  16,724,018
  16,724,030
  16,724,189
  16,724,277
  16,724,279
  16,724,491
  16,724,522
  16,724,605
  16,724,891
  16,725,284
  16,725,324
  16,725,333
  16,725,354
  16,725,362
  16,725,413
  16,725,594
  16,725,668
  16,725,686
  16,726,067
  16,726,414
  16,726,525
  16,726,994
  16,727,347
  16,728,526
  16,728,539
  16,728,541
  16,728,557
  16,728,722
T
-
19
T
T
C
A
T
A
C
T
C
T
C
G
C
T
-
C
C
A
G
T
C
C
T
C
T
C
G
C
C
C
T
T
A
-
T
C
G
A
G
T
2
T
-
2
C
-
C
3
G
G
T
C
-
C
C
T
A
A
A
C
A
A
A
C
G
-
-
-
G
-
G
A
T
G
11
5
2
13
-
-
C
A
A
T
2
A
C
C
9
T
T
2
-
-
3
-
13
T
2
G
A
T
C
T
G
-
-
T
T
T
T
T
G
A
T
A
T
C
T
T
T
T
T
C
T
A
G
-
T
T
T
G
T
G
T
T
-
A
-
T
A
G
14
T
C
A
T
A
G
G
T
G
A
G
G
A
G
T
T
-
C
C
G
C
TA/3
T
T
G
C
-
T
C
A
G
G
A/5
-
-
-
-
-
9/5
5
C/9
-
2/-
T
T
A
G
G
5
C
G
C
4
T
A
G
G
A
C
C
T
C
4
2
G
A
C
T
-
G
C
2
-
T
G
C
A
C
T/-
19
G
-
2/-
A
2
T
A
T
G
4
G
G
T
61
A
-
C
C
2
G
G
C
15
C
C
12/-
C
A
C
T
C
C
A
A
9
T
G
G
T
G
T
C
9
5
G
9
A
T
G
G
C
A
G
C
A
A
C
C
C
A
2
G
4
-
G
A
A
G
C
A
G/2
A/-
G
C
C
G
-
-
5
-
T
C
G
-
A
3
-
-
A
8
2
-
-
G
C
T
T
G
-
G
-
-
C
-
3
2
A
G
C/2
-
C
C
G
2
G
2