Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 104,613 (bp)   Positions: 291
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.097
.012
.001
.321
.002
.003
.009
.015
.013
--
.252
.003
.0
.0
.0
.006
.016
.008
.008
.001
.003
.053
.293
.072
.066
.224
.007
.001
.001
.164
.07
.036
.007
.08
--
.533
--
--
--
--
.017
.128
.016
.003
.003
.005
.011
.002
.008
.073
.002
.014
.045
.001
.005
.046
.055
.02
.007
.0
.0
.002
.003
.955
.0
.064
.025
.002
.0
.024
.028
.008
.002
.001
.083
.028
.108
.058
.056
.222
.174
.001
.009
.006
.126
.001
.01
.016
.472
.003
.002
.001
.01
.014
.0
.002
.0
.0
.0
.02
.002
.001
.01
.001
.002
.002
.005
.145
--
--
--
--
--
.01
.008
.094
.001
.003
.52
--
--
--
--
.007
.07
--
--
--
--
--
--
.044
.103
.007
.006
.002
--
.039
.035
.017
.012
.167
.456
.026
.027
.025
.003
--
.016
.156
.2
.873
.004
.003
.003
.006
.002
.004
.351
.303
.026
.046
.108
.117
.371
--
.002
.022
.017
.401
.002
.743
.037
--
--
--
--
--
.033
.082
--
--
.002
.001
.016
.037
.123
.01
.037
.037
.001
.0
.0
.012
.0
.001
.003
.003
.407
.002
.001
.008
.006
.032
.012
.002
.001
.137
.001
.023
.018
.002
.642
.016
.011
.028
.106
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.0
.005
.011
.0
.105
.033
.004
.006
1.0
.003
.883
.876
.058
.063
.03
.005
.257
.002
.0
.0
.011
.001
.996
.002
.002
.0
.003
.054
.0
.007
.006
.027
.0
.995
.004
.816
.0
.002
.005
.006
.132
.008
.004
.018
--
.001
.56
.982
.002
.0
.02
.005
.006
.001
.053
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
G
T
G
G
A
C
T
T
C
G
C
T
C
A
G
G
G
A
G
A
T
G
3
T
G
C
C
A
T
G
C
A
T
G
A
A
G
A
A
T
T
A
G
T
G
G
G
G
C
C
T
T
A
C
T
C
C
A
T
A
C
A
A
G
G
A
G
C
T
A
A
G
G
C
C
G
A
C
A
T
G
G
A
A
6
2
G
G
G
A
T
T
A
4
G
C
C
G
C
A
G
G
C
T
G
A
C
C
T
T
T
G
C
A
T
T
C
A
A
C
A
T
T
T
G
T
A
G
T
T
C
G
C
G
A
C
C
A
A
G
G
G
G
T
A
C
T
T
C
T
A
A
T
T
G
T
C
A
T
A
C
A
G
A
T
T
G
T
T
2
A
A
T
T
T
C
A
T
C
A
C
G
C
T
C
G
C
T
T
C
G
A
2
C
G
A
A
G
A
A
T
G
C
A
T
A
C
C
T
T
G
G
2
A
A
C
A
C
C
C
2
T
T
G
A
G
A
G
T
G
G
A
A
A
A
C
G
T
G
A
C
G
T
C
C
G
A
G
A
T
A
G
C
C
C
A
A
T
T
T
T
C
T
C
C
C
A
G
C
G
A
A
A
T
4
T
T
C
2
G
G
A
A
C
G
A
T
A
C
C
G
  56,598,761
  56,601,393
  56,601,632
  56,601,705
  56,601,925
  56,602,041
  56,602,169
  56,602,300
  56,602,466
  56,602,579
  56,604,723
  56,604,801
  56,604,994
  56,605,000
  56,605,050
  56,605,401
  56,605,439
  56,605,857
  56,606,112
  56,606,113
  56,607,100
  56,607,311
  56,607,425
  56,607,601
  56,608,689
  56,608,773
  56,608,807
  56,609,363
  56,609,919
  56,610,057
  56,610,393
  56,610,490
  56,610,500
  56,610,655
  56,610,714
  56,610,798
  56,611,136
  56,611,679
  56,611,800
  56,611,874
  56,612,706
  56,612,988
  56,613,173
  56,613,432
  56,613,449
  56,613,460
  56,613,869
  56,613,903
  56,613,906
  56,613,962
  56,614,490
  56,614,541
  56,614,557
  56,614,857
  56,616,134
  56,616,418
  56,616,705
  56,616,723
  56,617,035
  56,617,242
  56,617,256
  56,617,257
  56,617,266
  56,617,305
  56,617,658
  56,617,756
  56,618,902
  56,619,564
  56,619,691
  56,619,961
  56,620,451
  56,620,578
  56,620,592
  56,621,200
  56,621,214
  56,621,299
  56,621,319
  56,621,785
  56,622,091
  56,623,304
  56,625,439
  56,625,449
  56,625,496
  56,625,956
  56,626,782
  56,626,879
  56,627,710
  56,629,881
  56,630,439
  56,630,495
  56,630,642
  56,630,787
  56,630,827
  56,630,863
  56,631,020
  56,631,035
  56,631,040
  56,631,384
  56,631,389
  56,631,545
  56,631,699
  56,631,842
  56,631,899
  56,632,087
  56,632,242
  56,632,583
  56,632,977
  56,633,127
  56,633,239
  56,633,402
  56,633,732
  56,633,778
  56,633,938
  56,633,939
  56,634,075
  56,634,092
  56,634,659
  56,634,799
  56,635,253
  56,635,469
  56,635,494
  56,635,666
  56,635,796
  56,635,823
  56,635,931
  56,636,108
  56,636,246
  56,636,293
  56,636,377
  56,636,817
  56,636,988
  56,637,036
  56,637,188
  56,637,324
  56,637,398
  56,637,399
  56,637,412
  56,637,987
  56,638,468
  56,638,478
  56,638,515
  56,638,568
  56,638,681
  56,639,423
  56,639,783
  56,639,845
  56,639,852
  56,640,777
  56,640,961
  56,641,195
  56,641,323
  56,641,340
  56,641,606
  56,642,324
  56,642,325
  56,642,352
  56,642,480
  56,642,607
  56,642,646
  56,643,072
  56,643,321
  56,643,414
  56,643,423
  56,643,448
  56,643,769
  56,643,907
  56,644,122
  56,644,270
  56,644,313
  56,644,374
  56,644,425
  56,644,667
  56,644,758
  56,645,422
  56,645,896
  56,645,916
  56,645,954
  56,645,956
  56,645,987
  56,646,437
  56,646,461
  56,646,629
  56,646,746
  56,647,564
  56,647,574
  56,647,856
  56,647,946
  56,648,014
  56,648,050
  56,648,117
  56,648,357
  56,648,461
  56,648,680
  56,648,827
  56,648,995
  56,649,157
  56,649,194
  56,649,427
  56,650,075
  56,650,352
  56,650,548
  56,650,885
  56,650,991
  56,651,107
  56,651,518
  56,651,659
  56,651,695
  56,651,965
  56,652,249
  56,652,372
  56,652,585
  56,652,759
  56,652,784
  56,653,098
  56,653,325
  56,653,430
  56,653,748
  56,653,842
  56,653,998
  56,654,005
  56,654,280
  56,654,312
  56,654,636
  56,654,682
  56,654,920
  56,654,952
  56,655,043
  56,655,195
  56,655,406
  56,655,512
  56,655,537
  56,655,577
  56,655,894
  56,656,386
  56,656,628
  56,656,807
  56,657,226
  56,657,535
  56,657,543
  56,657,592
  56,657,755
  56,657,836
  56,659,288
  56,659,295
  56,659,493
  56,659,598
  56,659,637
  56,659,670
  56,659,792
  56,659,821
  56,659,849
  56,659,879
  56,659,921
  56,659,927
  56,660,007
  56,660,189
  56,660,204
  56,660,912
  56,660,914
  56,661,729
  56,662,342
  56,663,370
  56,663,371
  56,663,862
  56,663,944
  56,664,310
  56,664,666
  56,665,350
  56,665,650
  56,665,704
  56,665,718
  56,668,075
  56,669,629
  56,669,671
  56,669,676
  56,670,428
  56,670,693
  56,671,845
  56,678,967
  56,680,775
  56,682,335
  56,684,480
  56,688,140
  56,689,163
  56,690,335
  56,690,844
  56,693,636
  56,693,721
  56,693,773
  56,694,951
  56,695,234
3
C
A
A
-
T
C
C
T
A
2
C
T
G
A
A
A
G
C
C
C
5
-
2
C
T
G
G
C
-
T
G
C
A
T
G
A
G
T
C
C
G
A
C
A
A
A
A
T
A
C
A
G
T
-
T
T
C
C
G
A
C
C
2
A
G
A
-
-
G
C
C
A
T
G
A
G
A
G
C
A
A
G
-
-
-
2
T
A
T
A
C
G
-
A
G
T
A
T
T
A
A
T
A
A
G
2
G
A
C
C
C
T
G
C
G
A
G
C
T
C
C
C
C
A
A
G
T
C
C
T
A
T
A
G
T
T
T
G
A
A
A
A
-
G
T
G
C
T
C
C
T
C
C
A
2
-
G
C
C
T
G
T
T
C
C
6
C
C
-
G
G
G
C
C
T
2
C
T
G
T
A
T
2
A
T
A
C
C
T
A
G
-
G
A
C
G
A
G
T
C
A
T
2
C
-
T
T
C
G
A
A
-
4
G
T
-
-
T
2
-
C
C
T
3
T
G
5
C
A
A
G
G
4
2
T
A
C
C
G
T
A
C
T
G
A
G
A
T
C
G
A
T
A
T
T
G
-
C
G
C
T
G
T
A
T
6
T
A
2
2
G
G
G
-
A
2
G
-
A
A
C
C
T
T
C
C
5
T
A
-