Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 104,613 (bp)   Positions: 361
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.113
.097
.97
.012
.002
.003
.009
.015
.013
.032
.019
.003
--
.252
.0
.0
.0
.016
.008
.008
.001
.003
.0
.426
.007
--
--
--
.187
.073
.045
.902
.075
.001
.012
.022
.004
.002
.003
.998
.0
.0
.981
.001
.025
.002
.0
.019
.058
.016
.02
.0
.352
.005
.001
.899
.009
.006
.005
.003
.002
.126
.017
.01
.003
.0
.01
.01
.008
.093
.001
.217
--
--
.103
--
--
.014
.026
.0
.008
.011
.016
.003
.004
.001
.401
.008
.002
.001
.039
.021
.0
.006
.032
.997
.028
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.31
.054
.004
.006
.009
.73
.699
.056
.842
.829
.827
.719
.651
.883
.876
.726
.091
.058
.03
.005
.019
.66
.257
.002
.0
.011
.001
.002
.002
.251
.45
.062
.0
.007
.006
.004
.137
.0
.002
.005
.006
.002
.203
.006
.622
.022
.132
.008
.004
.002
.018
--
.001
.043
.12
.858
.012
.004
.001
.02
--
--
--
--
.008
.013
.052
.031
.638
.982
.06
--
--
--
.084
.102
.091
.091
.001
.1
.001
.038
.263
.335
.02
.007
.0
.005
.001
.029
.011
.187
.211
.041
.148
.01
.006
.003
.015
.002
.006
.036
.006
.008
.0
.0
.0
.005
.004
.007
.005
.001
.001
.016
.012
.053
.008
.789
--
--
.04
.002
.004
.057
.194
.031
.007
.005
--
.003
.027
.063
.837
.24
.219
.235
.303
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.229
.047
.048
.001
.097
.246
.038
.085
.135
.049
.001
--
--
.012
.008
.002
.06
.133
.994
.89
.002
.004
.012
.02
.0
.0
.0
.003
.022
.011
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.43
.25
.14
.01
.257
.027
.017
--
.002
.0
.141
.978
.036
.006
.003
.001
.002
.097
.044
.004
.93
.0
.421
.881
.994
.003
.065
.045
.035
.084
.012
.009
.04
.254
.024
.057
.279
.318
.057
.365
.004
.03
.065
.001
.294
.002
.002
.007
.012
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
Atm
G
G
T
C
G
C
T
T
C
G
C
T
G
C
T
A
G
G
A
G
A
T
G
C
C
A
8
C
A
3
T
C
G
A
C
A
A
C
C
G
C
A
A
T
C
C
T
A
C
A
C
2
4
A
A
A
G
A
4
5
4
T
2
C
G
T
A
2
T
T
G
A
G
T
C
G
C
A
C
7
C
C
T
T
T
T
T
A
3
T
C
C
C
C
C
T
C
A
A
C
T
G
G
A
C
C
G
A
T
G
G
A
T
T
2
2
A
C
C
C
T
T
C
T
C
C
A
G
C
A
A
T
G
C
C
A
A
A
2
G
T
C
T
A
G
C
G
A
A
C
C
A
C
G
A
T
4
A
T
T
C
T
G
T
T
T
G
C
A
A
A
A
A
T
G
C
C
G
T
A
2
T
2
T
T
G
T
G
T
T
A
A
A
C
A
C
A
C
C
T
2
T
C
A
T
G
G
C
G
G
T
G
A
G
4
25
C
G
T
A
A
2
A
A
T
C
G
A
C
G
G
A
A
2
G
C
G
T
A
T
T
A
T
T
T
C
T
G
A
A
C
A
C
C
C
G
G
T
C
C
G
A
A
G
C
T
G
G
19
8
G
G
G
G
T
A
7
C
T
G
C
T
A
A
G
A
T
A
C
C
G
G
A
G
C
T
G
C
T
A
G
T
T
A
8
3
A
A
C
T
C
C
5
C
T
G
2
G
C
A
T
T
C
T
T
A
A
T
T
G
A
T
C
A
C
A
C
A
A
C
A
G
A
G
A
T
G
G
C
T
A
T
4
C
G
T
A
C
T
T
G
  56,598,761
  56,600,688
  56,601,393
  56,601,480
  56,601,632
  56,602,041
  56,602,169
  56,602,300
  56,602,466
  56,602,579
  56,602,682
  56,603,334
  56,603,693
  56,604,565
  56,604,801
  56,605,000
  56,605,050
  56,605,401
  56,605,857
  56,606,112
  56,606,113
  56,607,100
  56,607,311
  56,607,317
  56,608,429
  56,609,363
  56,610,751
  56,611,400
  56,611,679
  56,613,698
  56,614,490
  56,614,857
  56,614,928
  56,615,151
  56,615,421
  56,615,432
  56,615,578
  56,617,228
  56,617,236
  56,617,305
  56,617,629
  56,617,756
  56,618,525
  56,618,820
  56,619,358
  56,619,564
  56,619,629
  56,619,961
  56,621,087
  56,622,091
  56,622,740
  56,622,741
  56,622,889
  56,623,007
  56,625,096
  56,625,496
  56,625,710
  56,625,956
  56,626,782
  56,626,783
  56,626,784
  56,626,785
  56,626,879
  56,627,443
  56,629,881
  56,630,642
  56,631,545
  56,631,682
  56,634,075
  56,634,092
  56,634,661
  56,634,799
  56,635,355
  56,635,823
  56,636,649
  56,637,324
  56,637,908
  56,638,085
  56,638,607
  56,638,963
  56,638,971
  56,639,740
  56,640,021
  56,641,195
  56,642,352
  56,642,646
  56,644,185
  56,644,425
  56,647,326
  56,647,564
  56,647,574
  56,647,755
  56,647,863
  56,649,286
  56,650,290
  56,651,518
  56,652,465
  56,653,748
  56,654,244
  56,654,319
  56,654,574
  56,654,638
  56,654,911
  56,655,174
  56,655,214
  56,655,224
  56,655,512
  56,656,386
  56,656,636
  56,657,015
  56,657,543
  56,657,592
  56,657,890
  56,658,720
  56,658,721
  56,658,727
  56,658,740
  56,658,746
  56,658,749
  56,658,752
  56,659,256
  56,659,288
  56,659,295
  56,659,367
  56,659,376
  56,659,493
  56,659,637
  56,659,676
  56,659,735
  56,659,760
  56,659,792
  56,659,821
  56,659,879
  56,659,921
  56,659,927
  56,660,189
  56,660,204
  56,661,177
  56,661,201
  56,662,035
  56,662,342
  56,663,370
  56,663,371
  56,664,666
  56,665,089
  56,665,650
  56,665,704
  56,665,718
  56,666,553
  56,667,038
  56,667,491
  56,668,075
  56,669,441
  56,669,516
  56,669,629
  56,669,671
  56,669,676
  56,669,679
  56,670,428
  56,670,693
  56,671,845
  56,672,013
  56,672,899
  56,673,082
  56,673,411
  56,673,462
  56,674,082
  56,674,182
  56,674,931
  56,674,933
  56,674,968
  56,674,972
  56,674,984
  56,677,356
  56,677,491
  56,678,624
  56,680,754
  56,680,775
  56,681,241
  56,681,813
  56,681,967
  56,682,047
  56,682,184
  56,682,264
  56,682,488
  56,683,582
  56,684,795
  56,685,118
  56,686,299
  56,687,671
  56,688,005
  56,688,073
  56,688,140
  56,688,242
  56,689,106
  56,689,163
  56,689,427
  56,689,701
  56,689,812
  56,689,864
  56,689,867
  56,689,967
  56,689,981
  56,690,001
  56,690,068
  56,690,070
  56,690,077
  56,690,228
  56,690,335
  56,690,534
  56,690,564
  56,690,568
  56,690,596
  56,690,600
  56,690,603
  56,690,616
  56,690,727
  56,690,739
  56,690,817
  56,690,844
  56,690,945
  56,691,437
  56,691,438
  56,691,861
  56,691,869
  56,692,066
  56,692,409
  56,692,544
  56,692,692
  56,692,779
  56,692,820
  56,692,918
  56,692,972
  56,693,044
  56,693,266
  56,693,428
  56,693,740
  56,694,374
  56,694,429
  56,694,590
  56,694,717
  56,694,797
  56,694,800
  56,694,801
  56,694,807
  56,694,920
  56,694,939
  56,694,942
  56,694,947
  56,694,959
  56,694,974
  56,695,027
  56,695,054
  56,695,063
  56,695,067
  56,695,088
  56,695,111
  56,695,123
  56,695,138
  56,695,231
  56,695,238
  56,695,260
  56,695,288
  56,695,300
  56,695,304
  56,695,358
  56,695,494
  56,695,543
  56,695,553
  56,695,595
  56,695,684
  56,695,717
  56,695,893
  56,696,011
  56,696,014
  56,696,131
  56,696,182
  56,696,193
  56,696,226
  56,696,510
  56,696,702
  56,696,743
  56,697,068
  56,697,133
  56,697,275
  56,697,298
  56,697,357
  56,697,360
  56,697,380
  56,697,427
  56,697,441
  56,697,446
  56,697,639
  56,697,672
  56,697,734
  56,697,741
  56,697,791
  56,697,841
  56,697,850
  56,697,867
  56,697,889
  56,697,915
  56,697,935
  56,697,970
  56,698,790
  56,698,799
  56,698,800
  56,698,838
  56,698,846
  56,698,856
  56,698,925
  56,699,087
  56,699,110
  56,699,215
  56,699,264
  56,699,351
  56,699,383
  56,699,729
  56,699,737
  56,699,738
  56,699,750
  56,699,834
  56,699,988
  56,700,094
  56,700,103
  56,700,124
  56,700,134
  56,700,155
  56,700,165
  56,700,284
  56,700,414
  56,700,440
  56,700,497
  56,700,517
  56,700,538
  56,700,552
  56,700,608
  56,700,837
  56,700,848
  56,700,859
  56,700,871
  56,700,883
  56,700,893
  56,700,921
  56,701,176
  56,701,201
  56,701,214
  56,701,265
  56,701,271
  56,701,371
  56,701,373
  56,701,475
  56,701,545
  56,701,774
  56,701,898
  56,702,022
  56,702,207
  56,702,372
  56,702,443
  56,702,461
  56,702,604
3
A
C
T
A
T
C
C
T
A
T
C
A
T
C
G
A
A
G
C
C
C
5
3
T
G
-
G
G
-
C
T
C
-
A
AC/3
-
3
-
2
T
G
-
C
A
-
3
G
T
G
C/2
-
-
A/3
T
G
A
-
4/-
5/-
-
T/-
-
T
T
A
T
-
C
G
A
G
A
C
C/2
A
3
-
T
-
2
A
-
C
2
C
2
G
-
TA/3
A
T
A
T
T
C
T
-
-
T
C
C
2
3
T
A
A
4
A
A
C
G
G
T/3
2/-
-
A/2
C/4
C/A
A/CA
C
C
T
C
T
G
G
A
T
23
T
C
A
T
A
T
G
A/C
-
A
C
T
G
7
T
A
4
3
C
T
G
G
T
A
G
G
4/-
A/-
A
2
G
C
A
C
T/C
C
A
T
A/3
A/3
A/G
A/G
G
C
A
2
T
A
G
T
-
C
-
C
A
G/2
C
A
C
2
G
G
C
G
G
T
T
G
T
G
-
C
T
G
A
A
A
T
T
C
C
A
G
-
-
-
T
A
C
C
G
2/-
-
G
C
T
2
G
G
A
A
2
G
-
A
T
2
C
G
C
G
G
A
C
A
T
C
A
G
G
T
C
-
A
A
A
A
4
T
G
3
-
C
A
3
C
C
A
-
-
A
A
C
C
C
G
-
T
C
A
T
C
-
C
A
G
4
4
C/T
2
A
A
G
4
T
C
A
A
C
G
A
C
2
-
-
-
-
G
T
G
G
T
-
A
G
2
-
A
T
G
A
C
T
4
C
T
3
A
C
A
G
2
A
G
T
G
T
T
G
A
2
2
C
A
-
C
T
C
T
C
5
C
-
T
A
A
G
T
-
-
A