Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 305,413 (bp)   Positions: 546
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.0
.699
.002
.061
.254
.001
--
.151
.001
.0
.001
.556
.054
.019
.024
.065
.194
.063
.065
.001
.874
.004
.001
.01
.003
.014
.017
.005
.127
.998
.001
.002
.59
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.588
.009
.004
.097
--
.011
.074
.015
--
.013
.022
.03
.002
.074
.082
.021
.141
.092
.596
.142
.0
.043
.072
.073
.017
.407
.041
.082
.061
.465
.274
.006
.03
.077
.116
.0
.0
--
.02
.001
.299
.026
.019
.118
.126
.054
.361
.358
.142
.717
--
--
--
.041
.314
.023
.008
.0
.462
.027
.442
.129
.054
.001
.035
.018
.152
.035
.032
.042
.024
.032
.025
.081
.574
.352
.164
.128
.012
.247
.019
.0
.184
.226
.277
.432
.246
.011
.016
.119
.802
.0
.334
.104
.077
.016
.009
.004
.003
.002
.008
.015
.02
.016
.076
.022
--
.013
.0
.0
.003
.005
.008
.077
.081
.002
.202
.217
.001
.008
.001
.076
.012
.017
.008
.422
.422
.003
.089
.816
--
--
.088
.176
.005
.0
.004
.02
.001
.003
.014
.009
.157
.456
.011
--
--
.766
.005
.298
.02
.003
.017
.074
.171
.103
.082
.003
.455
--
.691
.055
.001
.041
.0
.001
.972
.0
.004
.01
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.022
.038
.19
.261
.014
.003
.023
.001
.007
.044
.266
.018
.004
--
.067
.0
.0
.118
.053
--
.229
.108
.0
.0
.225
.085
.05
.029
--
--
.053
.002
.0
.003
.271
.011
.002
.005
.001
.01
.034
.003
.032
.018
.01
.013
.022
--
--
--
.42
.034
.311
.009
.13
.122
.017
.391
.645
.0
.389
.446
.001
.015
.006
.002
.018
.067
.114
.203
.003
.001
.279
.011
.001
.003
.001
.001
.077
.006
.005
.001
.088
.384
.077
.005
.035
.017
.001
.025
.0
.002
.009
.0
.002
.004
.001
.053
.015
--
.079
.09
.193
.001
.666
.679
.0
.187
.07
--
--
.998
.018
.008
--
--
--
.187
.059
.452
.003
.306
.776
.002
.248
.007
.003
.0
.014
.041
.0
.002
.018
.012
.001
.096
.005
.009
.027
.004
.637
.029
.98
.001
.007
.0
.003
.078
.906
.0
.004
.005
--
.078
.242
.011
.002
.032
.361
.003
.342
.004
.998
.003
.058
.016
.03
.0
.075
--
--
--
--
--
.093
.024
.079
.088
.022
.179
.0
.896
--
.0
.003
.006
.0
.009
.371
.005
.759
.304
.085
.003
.003
.026
.044
.01
.153
.013
--
--
--
--
--
.009
.0
.001
.002
.961
.006
.009
.0
.003
.007
.002
.002
.003
.17
.04
.003
.939
.046
.0
.019
.174
--
--
.039
.166
.001
.004
.022
--
--
.015
.034
.127
.105
.662
.002
.022
.701
.016
.038
.007
.0
.005
.14
.001
.266
.304
.297
.008
.0
.001
.001
.002
.014
.005
.002
.005
--
--
.354
.112
.053
.063
.097
.044
.021
--
--
.033
.059
.001
.087
.001
--
.876
.011
.001
.002
.0
.019
.003
.157
.065
--
.019
--
.002
.753
--
--
.003
.031
.003
.998
.35
.015
.002
.303
.705
.468
.0
.05
.001
.003
.0
.001
.004
.029
.0
.0
.001
.001
.921
.007
.001
.007
.022
.009
.449
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
T
C
G
T
14
A
4
G
C
A
C
A
2
C
C
G
C
A
A
T
A
C
C
T
A
C
T
6
A
T
A
A
C
C
G
C
C
C
C
C
G
A
C
T
T
C
C
A
T
C
G
C
A
T
G
G
4
G
C
A
A
G
A
G
C
A
A
C
A
G
C
2
T
C
C
A
2
A
C
G
T
2
C
A
A
A
T
G
C
T
C
4
2
C
G
A
G
G
C
T
A
A
T
A
G
A
C
A
T
G
A
A
A
T
G
T
2
G
T
C
G
2
T
T
G
G
C
A
G
C
C
4
G
9
A
G
G
C
T
C
G
A
C
G
G
C
A
C
G
A
C
G
T
T
G
13
A
A
C
T
C
C
G
G
T
T
3
2
G
12
G
6
T
4
T
A
G
17
A
A
G
G
G
A
C
A
A
G
A
A
G
T
A
G
T
G
22
20
G
A
G
G
C
C
T
G
A
A
A
G
G
4
T
A
T
A
G
G
G
G
A
G
G
G
4
C
C
T
A
C
4
T
A
G
T
C
T
A
G
T
4
A
G
A
A
3
A
C
11
T
10
7
T
A
C
5
T
A
C
G
A
A
C
C
T
A
C
C
A
G
3
A
A
2
C
C
C
12
C
G
3
A
A
C
C
T
2
T
T
T
C
C
G
A
C
T
C
T
T
C
G
A
C
C
4
G
T
A
G
A
A
C
A
A
G
C
G
G
G
G
C
T
G
A
C
T
T
A
C
T
28
G
20
18
C
T
10
T
C
G
A
A
C
A
28
T
G
G
C
G
A
A
20
12
G
A
G
G
T
C
C
C
C
T
C
T
G
C
T
A
C
T
T
A
G
T
G
G
14
A
A
A
A
C
A
T
C
T
2
C
A
C
T
T
2
A
A
A
C
G
T
2
G
A
T
C
T
T
24
T
C
G
T
C
3
A
C
T
T
A
T
C
T
G
5
T
T
T
T
A
C
A
5
2
G
C
G
G
A
T
T
C
16
T
C
T
T
T
C
G
2
T
A
A
G
A
G
G
C
G
G
T
G
T
G
C
C
T
C
A
T
3
2
T
T
G
A
A
G
C
A
G
G
C
T
A
2
4
T
T
T
C
6
T
C
C
G
C
G
A
A
A
G
C
A
T
G
T
A
A
T
C
G
T
G
T
G
G
A
24
T
T
T
G
3
A
T
T
2
G
C
A
A
G
G
G
G
G
G
G
G
2
7
C
  138,008,638
  138,008,798
  138,009,153
  138,009,485
  138,010,055
  138,010,241
  138,010,376
  138,010,662
  138,010,706
  138,012,278
  138,012,279
  138,013,939
  138,014,869
  138,015,060
  138,015,148
  138,015,632
  138,015,964
  138,017,501
  138,018,525
  138,018,976
  138,020,420
  138,020,444
  138,020,568
  138,020,767
  138,021,784
  138,022,757
  138,023,209
  138,023,659
  138,024,259
  138,024,611
  138,025,411
  138,025,680
  138,025,961
  138,026,080
  138,026,292
  138,026,297
  138,026,299
  138,026,303
  138,026,305
  138,026,308
  138,026,310
  138,026,313
  138,026,336
  138,026,886
  138,027,727
  138,028,097
  138,029,295
  138,029,354
  138,029,423
  138,029,466
  138,029,850
  138,030,355
  138,030,659
  138,031,380
  138,031,735
  138,031,750
  138,032,033
  138,032,101
  138,032,851
  138,032,976
  138,033,311
  138,033,382
  138,034,832
  138,035,339
  138,035,702
  138,036,038
  138,036,776
  138,037,548
  138,037,758
  138,037,809
  138,038,024
  138,038,217
  138,038,266
  138,038,502
  138,038,513
  138,038,643
  138,038,772
  138,038,961
  138,039,577
  138,040,284
  138,041,542
  138,042,431
  138,042,997
  138,043,333
  138,044,409
  138,044,670
  138,045,887
  138,045,888
  138,046,041
  138,046,431
  138,046,432
  138,047,035
  138,047,621
  138,047,906
  138,047,908
  138,048,114
  138,049,197
  138,050,818
  138,051,285
  138,051,572
  138,051,795
  138,052,056
  138,052,364
  138,053,028
  138,053,355
  138,056,862
  138,056,873
  138,057,389
  138,057,542
  138,057,835
  138,058,122
  138,058,123
  138,058,937
  138,059,385
  138,059,979
  138,060,120
  138,060,777
  138,061,878
  138,061,893
  138,061,906
  138,061,910
  138,062,837
  138,063,052
  138,063,322
  138,065,592
  138,065,683
  138,066,314
  138,068,829
  138,068,882
  138,069,275
  138,069,320
  138,070,091
  138,070,101
  138,070,279
  138,070,589
  138,071,307
  138,071,931
  138,073,371
  138,073,374
  138,073,383
  138,073,404
  138,073,413
  138,073,415
  138,073,446
  138,073,450
  138,073,451
  138,073,855
  138,073,879
  138,074,007
  138,074,125
  138,074,687
  138,076,397
  138,076,832
  138,076,836
  138,077,062
  138,077,064
  138,077,135
  138,077,137
  138,077,476
  138,079,928
  138,080,562
  138,081,113
  138,081,235
  138,081,252
  138,081,638
  138,081,937
  138,081,941
  138,082,139
  138,082,677
  138,082,678
  138,085,773
  138,087,189
  138,087,422
  138,087,824
  138,087,889
  138,087,946
  138,087,950
  138,089,488
  138,093,622
  138,093,624
  138,094,193
  138,098,084
  138,098,598
  138,098,936
  138,099,015
  138,099,800
  138,100,178
  138,101,817
  138,103,733
  138,104,321
  138,104,793
  138,105,189
  138,106,497
  138,107,771
  138,107,775
  138,107,778
  138,109,250
  138,110,684
  138,112,265
  138,112,267
  138,112,935
  138,114,269
  138,114,493
  138,117,060
  138,118,072
  138,121,924
  138,128,505
  138,129,014
  138,129,736
  138,129,921
  138,130,333
  138,130,492
  138,131,276
  138,132,351
  138,132,776
  138,134,364
  138,134,865
  138,135,795
  138,137,430
  138,137,917
  138,137,996
  138,139,126
  138,141,561
  138,142,361
  138,142,988
  138,142,991
  138,146,028
  138,146,591
  138,146,610
  138,147,954
  138,148,761
  138,149,208
  138,150,244
  138,150,742
  138,150,839
  138,151,113
  138,151,447
  138,151,926
  138,152,312
  138,153,272
  138,154,013
  138,154,410
  138,154,552
  138,156,093
  138,157,070
  138,158,250
  138,158,327
  138,158,503
  138,158,667
  138,159,378
  138,159,917
  138,159,948
  138,160,505
  138,160,674
  138,160,913
  138,161,023
  138,161,841
  138,162,025
  138,162,039
  138,162,256
  138,162,378
  138,162,399
  138,163,776
  138,163,874
  138,165,150
  138,165,295
  138,165,341
  138,165,595
  138,166,412
  138,166,419
  138,166,431
  138,166,494
  138,167,317
  138,167,336
  138,168,206
  138,168,249
  138,168,537
  138,168,592
  138,168,759
  138,169,478
  138,170,818
  138,171,165
  138,171,301
  138,172,573
  138,173,036
  138,173,606
  138,173,670
  138,174,491
  138,174,705
  138,174,708
  138,174,710
  138,174,719
  138,175,171
  138,175,182
  138,175,418
  138,175,652
  138,175,900
  138,176,243
  138,176,322
  138,176,340
  138,177,027
  138,177,138
  138,177,739
  138,178,064
  138,178,240
  138,178,649
  138,178,696
  138,179,327
  138,179,416
  138,179,968
  138,182,328
  138,182,691
  138,182,989
  138,183,007
  138,183,022
  138,183,033
  138,183,036
  138,183,039
  138,183,059
  138,183,080
  138,183,084
  138,184,909
  138,185,153
  138,185,338
  138,186,932
  138,187,918
  138,190,477
  138,190,479
  138,191,058
  138,191,307
  138,191,694
  138,191,852
  138,192,752
  138,194,211
  138,194,315
  138,194,317
  138,194,406
  138,194,431
  138,194,435
  138,195,663
  138,195,833
  138,196,592
  138,197,156
  138,197,360
  138,198,030
  138,199,038
  138,200,438
  138,200,648
  138,201,874
  138,202,653
  138,202,792
  138,202,834
  138,203,684
  138,204,741
  138,205,769
  138,205,777
  138,206,543
  138,207,318
  138,208,081
  138,208,152
  138,209,057
  138,209,253
  138,210,184
  138,211,682
  138,213,094
  138,213,242
  138,213,298
  138,213,777
  138,215,726
  138,216,397
  138,217,879
  138,218,241
  138,218,937
  138,218,939
  138,219,156
  138,219,388
  138,219,748
  138,219,986
  138,220,000
  138,221,806
  138,222,548
  138,224,765
  138,225,770
  138,227,807
  138,228,733
  138,229,688
  138,229,965
  138,231,747
  138,232,213
  138,234,121
  138,234,998
  138,235,642
  138,235,646
  138,236,187
  138,236,208
  138,236,210
  138,236,719
  138,237,168
  138,237,231
  138,237,232
  138,238,206
  138,239,895
  138,242,257
  138,242,443
  138,245,234
  138,246,607
  138,246,821
  138,247,173
  138,247,533
  138,247,983
  138,248,401
  138,248,763
  138,249,499
  138,249,655
  138,250,734
  138,252,727
  138,253,215
  138,254,397
  138,255,065
  138,255,770
  138,256,137
  138,256,174
  138,256,473
  138,256,487
  138,256,517
  138,256,540
  138,256,551
  138,256,751
  138,257,364
  138,258,349
  138,258,555
  138,259,314
  138,259,550
  138,259,551
  138,259,735
  138,259,738
  138,259,978
  138,260,023
  138,260,112
  138,260,957
  138,260,999
  138,261,133
  138,261,138
  138,261,615
  138,261,852
  138,261,997
  138,262,566
  138,263,597
  138,265,310
  138,265,635
  138,266,395
  138,266,417
  138,266,852
  138,267,172
  138,267,206
  138,267,474
  138,267,642
  138,267,954
  138,268,289
  138,268,541
  138,268,547
  138,270,529
  138,271,324
  138,271,430
  138,271,455
  138,271,810
  138,272,242
  138,272,932
  138,273,297
  138,273,950
  138,274,935
  138,275,079
  138,275,127
  138,275,455
  138,275,456
  138,276,197
  138,276,411
  138,276,774
  138,277,437
  138,277,521
  138,277,805
  138,278,252
  138,278,493
  138,278,498
  138,279,772
  138,280,038
  138,280,421
  138,280,548
  138,280,749
  138,280,751
  138,280,777
  138,280,781
  138,280,785
  138,280,801
  138,280,808
  138,281,671
  138,282,655
  138,283,765
  138,283,833
  138,284,957
  138,285,675
  138,287,067
  138,287,571
  138,289,322
  138,289,382
  138,289,677
  138,289,946
  138,290,088
  138,290,096
  138,290,275
  138,290,355
  138,290,458
  138,291,196
  138,291,209
  138,291,434
  138,292,059
  138,292,611
  138,292,788
  138,292,805
  138,294,294
  138,294,358
  138,294,596
  138,295,125
  138,295,227
  138,296,027
  138,296,240
  138,296,266
  138,296,915
  138,297,481
  138,299,657
  138,301,435
  138,302,146
  138,302,592
  138,303,131
  138,306,329
  138,306,978
  138,307,729
  138,310,515
  138,310,591
  138,311,192
  138,311,259
  138,311,261
  138,311,283
  138,311,683
  138,311,715
  138,311,880
C
2
-
3
2
3
14/-
-
-
6
G
C
T
G
-
T
T
A
T
G
G
-
C
T
T
A
G
T
C
-
G
5
G
G
-
-
T
-
T
-
G
-
2
3
T
C
-
T
2
G
-
A
2
T
C
C
21
A
-
T
T
4/5
T
A
G
A
G
G
A/8
A
G
GT/3
-
-
C
A
G
G
-
C
T
C
C
-
T
2
-
C
C
T
T
-
2
4/-
-
T
A
C
2
A
T
2
G
2
A
G
T
G
T
2
G
C
2
G
-
2
A
A
-
T
T/2
5
A
2/-
C
2
A
A
T
G
A
-
-
-
A
-
4
-
T
-
C
A
C
2
-
T
A
A
G
2
C
G
T
A
-
T/-
G/-
13/-
G
T
-
C
-
-
T
-
-
C
3/-
2/-
A
-
A
-
C
-
G
T
-
-
G
G
A
T
A
G
T
6
9
A
-
G
A
6
-
A
C
11/13
22/-
-
A
A/-
-
T
2
G
A
A
-
G
G
T
A
-
C
G
A
3
A
A
C
C
2
A
2
C
-
C/3
5
-
G
T
-
C
G
A
C
T
A
T
2
G
-
G
-
T
G
-
-
T
-
C
10/-
-
-
11
T
-
7
G
G
A
G
G
T
T
G
T
5
4
T
-
-
114
T
-
12/10
G
T
-
G
A
-
G
G
G
2
4
-
C
A
A
A
G
A
2
G
-
6
-
C
5
A
G
A
T
-
A
A
T
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
C/5
C
T
C
C/2
T/-
5
T
T
-
-
3/GA
20/-
18/-
A
C
-
-
T
A
T
G
T
G
-
C
2
A
T
T
C
G
20/-
12/-
A
G
A
A
C
T
9/10
5
A
C
3
C
A
T
C
2
A
C
C
G
A
C
A
2
-
T
G
G
T
T
G
5
T
?
-
C/2
A/-
T
G
A
2/-
T
-
T
T
A
-
-
A
2
5
T
G
C
-
C
T
A
G
T
-
G
G
6
C
G
-
9
-
T
-
-
C
C
G
G
C/2
A/-
5/-
2/-
A
T
C
A
-
C
-
T
-
C
T
C
3
C
T
T
-
C
6
G
T
G
A
A
T
A
3
C
A
C
2
T
T
C
4
G
7
3/-
2/-
G
C
9
5
G
A
3
G
A
A
T
G
A/-
-
4/-
C
C
C
T
-
G
T
T
2
T
A
C
C
T
A
T
G
C
A
2
3
G
2
G
-
2
A
21
A
T
G
-
A
C
C
T
-
G
C
-
-
G/2
17
27
G
A
A
C
C
A
2
2
6
-
7/-
T