Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 4,175 (bp)   Positions: 292
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.002
.0
.051
.001
.003
.0
.003
.0
.0
.008
.001
.0
.0
.002
.0
.0
.011
.002
.002
.0
.005
.0
.0
.001
.001
.0
.003
.0
.004
.063
.005
.013
.001
.118
.077
.001
.0
.0
.001
.018
.005
.009
.11
.076
.008
.003
.037
.028
.023
.011
.036
--
--
--
--
.001
.001
.0
.0
.954
.01
.001
.003
.004
.001
.0
.056
.0
.0
.001
.002
.095
.002
.009
.203
.204
.188
.26
.005
.003
.002
.001
.0
.0
.01
.036
.559
.005
.009
.006
.013
.004
.001
.003
.0
.0
.001
.001
.0
.252
.002
.002
.083
.081
.015
.005
.0
.022
.005
.004
.001
.003
.002
.002
.003
.095
.001
.0
.002
.029
.055
.005
.001
.033
.016
.029
.072
.23
.809
.989
.0
.05
.0
.017
.139
.005
.001
.003
.85
.012
.029
.035
.011
.078
.003
.336
.012
.035
.025
.018
.007
.003
.004
.012
.044
.004
.114
.02
.028
.35
.239
.039
.051
.004
.587
.686
.139
.005
.003
.129
.029
.007
.135
.066
--
.031
.199
.055
--
--
--
.01
.012
.011
.01
.015
.085
.054
.027
.931
.001
.0
.005
.0
.002
.339
.46
.172
1.0
.013
--
--
.009
.006
.006
.002
.034
.013
.036
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.235
.215
.0
.0
.0
.095
.049
.038
.029
.364
.402
.05
.022
.006
.0
.002
.003
.003
.002
.001
.004
.065
.041
.025
.034
.001
.007
.002
.001
.013
.0
.006
.001
.001
.005
.004
.017
.082
.001
.0
.0
.0
.0
.752
.953
.0
.925
.006
.0
.049
.249
.006
.249
.352
.147
.024
.04
.086
.071
.085
.069
.04
.002
.0
.01
.021
.001
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Afm
Afm
Afm
A
A
G
A
A
T
C
A
T
G
G
T
A
G
C
T
A
C
T
T
C
C
A
C
C
A
A
G
T
T
11
T
C
T
T
G
C
G
C
A
C
A
G
C
T
A
A
17
C
A
A
8
16
66
16
T
T
C
A
A
A
C
A
4
G
C
A
T
G
T
G
A
C
A
C
T
C
C
T
C
A
A
T
3
G
G
C
T
T
C
2
G
T
C
A
T
G
T
A
G
G
A
A
G
C
A
A
T
T
T
G
G
C
C
C
A
G
G
G
T
T
C
A
A
A
T
G
C
G
A
C
G
18
G
A
A
A
G
C
G
C
A
7
A
A
A
T
A
2
G
C
C
G
A
T
A
G
C
A
T
T
T
G
G
T
A
T
A
C
T
T
A
A
G
T
T
2
66
A
G
T
G
A
A
A
C
C
G
T
T
T
A
T
A
C
T
A
T
A
C
T
C
C
C
A
C
A
A
C
T
G
A
T
G
G
T
A
4
2
10
G
A
C
G
T
A
A
G
2
G
A
T
T
G
C
T
C
3
3
6
G
A
5
A
G
G
A
T
C
T
C
C
C
G
G
C
A
G
T
T
G
G
T
T
T
T
G
G
C
C
T
G
C
G
G
T
A
T
C
A
G
T
G
C
A
T
G
C
G
T
2
A
  18,988,864
  18,988,919
  18,988,938
  18,988,998
  18,989,135
  18,989,175
  18,989,197
  18,989,202
  18,989,231
  18,989,247
  18,989,266
  18,989,287
  18,989,317
  18,989,411
  18,989,438
  18,989,440
  18,989,448
  18,989,493
  18,989,512
  18,989,539
  18,989,589
  18,989,592
  18,989,598
  18,989,602
  18,989,615
  18,989,727
  18,989,764
  18,989,912
  18,989,925
  18,990,008
  18,990,086
  18,990,208
  18,990,277
  18,990,307
  18,990,320
  18,990,333
  18,990,349
  18,990,361
  18,990,376
  18,990,400
  18,990,403
  18,990,410
  18,990,460
  18,990,484
  18,990,532
  18,990,537
  18,990,563
  18,990,569
  18,990,589
  18,990,600
  18,990,614
  18,990,740
  18,990,744
  18,990,752
  18,990,882
  18,991,114
  18,991,121
  18,991,265
  18,991,266
  18,991,443
  18,991,449
  18,991,597
  18,991,707
  18,991,750
  18,991,833
  18,992,008
  18,992,056
  18,992,077
  18,992,078
  18,992,137
  18,992,138
  18,992,311
  18,992,404
  18,992,421
  18,992,472
  18,992,478
  18,992,493
  18,992,586
  18,992,685
  18,992,935
  18,993,071
  18,993,074
  18,993,076
  18,993,184
  18,993,200
  18,993,232
  18,993,241
  18,993,263
  18,993,272
  18,993,295
  18,993,364
  18,993,423
  18,993,425
  18,993,431
  18,993,591
  18,993,614
  18,993,625
  18,993,676
  18,993,813
  18,993,930
  18,993,993
  18,994,019
  18,994,076
  18,994,080
  18,994,086
  18,994,671
  18,994,734
  18,994,793
  18,994,845
  18,994,865
  18,995,010
  18,995,099
  18,995,296
  18,995,297
  18,995,382
  18,995,426
  18,995,510
  18,995,623
  18,995,628
  18,995,718
  18,995,720
  18,995,724
  18,995,746
  18,995,773
  18,995,790
  18,995,927
  18,995,951
  18,995,998
  18,996,056
  18,996,119
  18,996,218
  18,996,445
  18,996,470
  18,996,585
  18,996,597
  18,996,605
  18,996,718
  18,996,787
  18,997,040
  18,997,129
  18,997,134
  18,997,149
  18,997,211
  18,997,237
  18,997,278
  18,997,435
  18,997,486
  18,997,494
  18,997,540
  18,997,543
  18,997,547
  18,997,550
  18,997,551
  18,997,562
  18,997,579
  18,997,625
  18,997,680
  18,997,774
  18,997,795
  18,997,826
  18,997,835
  18,997,861
  18,997,909
  18,998,017
  18,998,113
  18,998,120
  18,998,165
  18,998,180
  18,998,210
  18,998,295
  18,998,399
  18,998,409
  18,998,479
  18,998,500
  18,998,656
  18,998,692
  18,998,829
  18,998,865
  18,998,952
  18,998,997
  18,999,046
  18,999,096
  18,999,100
  18,999,123
  18,999,139
  18,999,142
  18,999,268
  18,999,273
  18,999,298
  18,999,308
  18,999,399
  18,999,430
  18,999,475
  18,999,583
  18,999,609
  18,999,747
  18,999,797
  18,999,833
  18,999,947
  19,000,048
  19,000,197
  19,000,489
  19,000,931
  19,000,952
  19,000,953
  19,000,956
  19,001,202
  19,001,236
  19,001,407
  19,001,689
  19,001,720
  19,001,952
  19,001,960
  19,001,988
  19,002,078
  19,002,352
  19,002,454
  19,002,649
  19,002,659
  19,002,668
  19,002,694
  19,002,711
  19,002,971
  19,002,987
  19,003,416
  19,003,540
  19,003,581
  19,003,807
  19,003,833
  19,004,145
  19,004,182
  19,004,258
  19,004,335
  19,004,593
  19,004,599
  19,004,899
  19,004,932
  19,004,951
  19,004,956
  19,005,007
  19,005,030
  19,005,033
  19,005,035
  19,005,047
  19,005,142
  19,005,191
  19,005,214
  19,005,219
  19,005,225
  19,005,352
  19,005,365
  19,006,555
  19,006,671
  19,006,719
  19,006,804
  19,006,844
  19,006,897
  19,006,912
  19,007,105
  19,007,192
  19,007,278
  19,007,442
  19,007,628
  19,007,631
  19,007,702
  19,007,876
  19,007,883
  19,008,007
  19,008,019
  19,008,040
  19,008,076
  19,035,663
  19,035,676
  19,035,887
  19,035,914
  19,036,113
  19,036,262
  19,036,439
  19,036,475
  19,036,485
  19,036,514
  19,036,890
  19,036,982
  19,037,007
  19,037,101
  19,037,162
  19,037,205
  19,037,492
  19,037,601
  19,037,656
  19,038,254
  19,039,322
A/-
G
7
A/8
G
C
A
G
C
C
T
G
G
A
-
A
G
T
G
C
T
G
C
T
T
G
G
A
T/C
-
-
C
T
A
C
T
T
T
T
T
T
T
C
T
-
G
4
-
T
C
C
8/-
16/-
66/-
-
C
A
T
G
G
C
C/9
-
4/-
A
G
G
C
T
C
A
G
T
G
T
A
T
T
C
T
G
G
C
-
A
T
A
C
A
T
-
A
A
T
C
G
T
T/C
G
A
A
G
G
A
G
G
G
C
A
C
T
A
A
G
5
-
A
-
A
C
C
A
2
C
G
C
A
A
A
G
T
A
-
C
G
G
32
T
T
C
T
G
-
G
G
C
G
G
-
-
3
-
4
G
C
C
C
T
2
G
C
C
T
57
C
C
C
G
T
C
4
G
G
T
C
4
-
-
T
A
33
A
G
G
G
3
T
A
C
C
A
G
G
G
T
C
G
C
G
-
C
T
T
T
3
T
G
C
13
C
A
G
C
A
T
C
G
-
-
-
5
3
3
A
A
G
-
A
-
A
4
A
A
T
T
C
11
-
-
-
T
-
-
C
A
A
G
A
T
C
A
2
G
A
A
T
G
A
C
4
A
-
C
C
A
C
A
A
T
T
C
A
11
A
-
C
G
2
3
T
A
T/7
A
T
G
C
A
C/T
A
G
2/-
2