Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 239,189 (bp)   Positions: 452
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.0
.0
.496
.008
.001
.002
.095
.001
.072
--
--
.041
.012
.107
.006
.165
.022
.012
.008
.638
.022
--
.001
.0
.003
.089
.105
.002
.005
.0
.001
.029
.115
.167
.0
.011
.172
.259
.031
.036
.002
.001
.005
.0
.534
.999
.366
.069
--
.123
.002
.036
.123
.013
.051
.0
.182
.001
.002
.001
.0
.035
.823
.142
.686
.024
.008
.0
.002
.01
.02
.01
.007
.0
.149
.263
.041
--
--
.329
.435
.173
.001
.011
.002
.003
.0
.001
.001
.0
.003
.0
.0
.002
.013
.0
.084
--
--
.04
--
.0
.001
.001
.027
.017
.15
.004
.0
.002
.003
.0
.0
.001
.01
.02
.0
.001
.058
.125
.003
.094
.003
.034
.002
.045
.938
1.0
.001
.004
.0
.001
.001
.008
.027
.0
.045
.024
.0
.004
.023
.032
.0
.0
.0
.0
.013
.0
.003
.001
.001
.308
.727
.437
.001
.008
.0
.795
.001
.008
.004
.003
.107
.006
.001
.0
.041
.0
.118
.008
.035
.009
.0
.033
.001
.0
.015
.048
.221
--
.15
.007
.499
.475
.008
.031
.005
.0
.003
.14
.003
.0
.0
--
--
--
--
--
--
.027
.525
.007
--
--
--
--
.055
.073
.078
.079
.077
.002
.251
.017
.014
.382
.08
.21
.0
.004
.296
.002
.01
.001
.005
.063
.003
.138
.001
.006
--
--
--
--
--
.0
.0
.0
.349
.0
.026
.001
.025
.012
.001
.008
.062
.011
.02
.002
.003
.005
.004
.0
.01
.001
.001
.0
.003
.0
.0
.023
.032
.016
.011
.001
--
.069
.126
.049
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.016
.005
.062
.002
.004
.647
.017
.007
.568
.006
.052
.712
.0
.136
.888
.004
.022
.003
.003
.007
.098
.052
.084
.004
.019
.006
.014
.13
.046
--
.001
.183
.064
.296
.001
.019
.0
.004
.001
.0
.001
.032
.005
.058
--
.001
.005
.038
.009
.0
.0
.028
.0
.034
.0
.024
.065
.204
.045
.011
.006
.159
.006
.001
.004
.001
.001
.008
.334
.052
.048
.272
.172
.182
.038
.001
.054
.001
.0
.111
.004
.004
.009
.025
.001
.022
.001
.0
.0
.004
.0
.001
.02
.005
.005
.067
.0
.047
.03
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.036
.001
.19
.104
.074
.001
.0
.016
.182
.316
.284
--
--
.0
.032
.0
.002
.008
.009
.004
.404
.005
.009
.089
.013
.009
.244
.122
.002
.0
.001
.004
.003
.0
.0
.031
.01
.001
.002
.309
.738
.765
.052
.03
.013
.026
.003
.999
.0
.0
.113
.889
.006
.006
.017
.015
.281
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
G
A
A
G
G
A
T
4
A
C
T
T
A
T
G
A
C
C
A
A
3
G
C
C
T
C
T
T
T
T
C
T
C
2
4
T
G
4
18
C
T
A
G
A
A
C
A
G
A
C
A
A
T
A
G
G
C
A
T
T
T
A
C
A
T
A
T
A
A
T
G
G
T
T
T
G
C
T
G
A
C
A
C
G
T
C
T
3
G
A
C
4
G
T
C
G
A
G
18
16
C
C
C
A
A
T
A
C
T
A
A
G
T
A
A
G
A
T
T
T
T
G
A
C
A
A
G
5
4
G
A
C
T
T
G
G
A
T
4
2
6
C
C
A
A
C
T
T
T
G
G
C
C
11
A
A
C
G
T
C
C
C
A
G
T
G
T
G
C
C
T
T
4
T
C
T
A
G
G
A
A
G
G
8
G
T
C
T
A
G
G
6
G
A
G
T
C
C
C
T
T
T
T
2
T
A
A
G
A
C
A
C
T
G
G
G
C
C
G
T
G
35
T
T
4
4
G
A
4
T
C
T
C
2
5
C
T
C
T
T
T
T
T
6
4
T
T
A
G
A
T
A
T
T
T
T
C
A
6
A
C
T
G
T
G
C
C
A
6
A
A
C
A
T
A
C
T
A
G
T
A
G
G
G
A
4
C
C
C
T
T
A
T
6
T
G
T
A
T
T
A
A
T
T
A
A
A
A
A
C
A
A
T
T
C
C
T
G
T
T
A
T
13
T
A
T
G
G
G
A
A
C
G
G
G
2
G
C
C
G
T
G
G
T
C
A
T
A
G
T
A
C
T
C
A
A
A
G
T
C
T
A
T
6
T
A
G
G
T
C
C
C
C
G
G
C
T
C
T
A
C
8
2
G
T
A
C
T
C
A
C
T
A
C
A
G
G
4
A
A
C
T
A
G
T
C
T
G
A
G
C
G
C
A
T
T
A
T
T
T
A
C
A
C
A
C
G
G
C
T
G
C
G
2
A
G
C
T
A
T
A
T
T
C
A
G
T
A
C
T
G
G
  105,302,544
  105,304,008
  105,304,009
  105,304,796
  105,305,729
  105,306,096
  105,307,054
  105,307,482
  105,308,471
  105,310,485
  105,312,006
  105,316,765
  105,326,179
  105,327,382
  105,327,518
  105,327,798
  105,327,873
  105,331,282
  105,332,286
  105,332,480
  105,334,657
  105,335,342
  105,335,578
  105,336,277
  105,336,523
  105,336,604
  105,336,688
  105,336,689
  105,337,156
  105,337,272
  105,338,171
  105,338,454
  105,338,740
  105,340,775
  105,343,363
  105,343,794
  105,344,909
  105,348,104
  105,348,122
  105,348,459
  105,348,784
  105,350,306
  105,350,685
  105,350,813
  105,351,828
  105,351,851
  105,352,718
  105,354,328
  105,355,021
  105,355,204
  105,355,828
  105,356,888
  105,357,082
  105,357,306
  105,357,389
  105,357,773
  105,357,817
  105,357,974
  105,359,354
  105,359,401
  105,359,558
  105,359,588
  105,360,079
  105,360,264
  105,360,799
  105,361,457
  105,362,018
  105,363,016
  105,363,595
  105,364,031
  105,364,215
  105,364,218
  105,364,715
  105,364,988
  105,365,187
  105,365,271
  105,365,618
  105,367,045
  105,367,266
  105,367,859
  105,369,100
  105,369,104
  105,369,135
  105,369,304
  105,369,401
  105,369,529
  105,376,180
  105,377,075
  105,377,494
  105,378,014
  105,378,078
  105,378,175
  105,378,301
  105,378,630
  105,379,086
  105,379,326
  105,379,528
  105,379,675
  105,379,717
  105,379,719
  105,379,833
  105,379,876
  105,380,274
  105,380,562
  105,380,683
  105,380,810
  105,380,832
  105,380,970
  105,381,083
  105,381,096
  105,381,266
  105,381,269
  105,381,384
  105,381,981
  105,382,097
  105,382,142
  105,382,339
  105,382,573
  105,382,655
  105,383,070
  105,383,301
  105,383,315
  105,383,616
  105,383,648
  105,383,750
  105,383,994
  105,384,396
  105,384,470
  105,384,772
  105,385,266
  105,385,406
  105,385,836
  105,385,918
  105,386,253
  105,386,849
  105,386,903
  105,387,375
  105,388,624
  105,389,599
  105,392,865
  105,393,127
  105,393,616
  105,394,216
  105,395,103
  105,395,208
  105,395,425
  105,397,913
  105,398,033
  105,398,302
  105,399,117
  105,399,576
  105,399,631
  105,399,718
  105,399,785
  105,399,867
  105,400,108
  105,400,202
  105,400,473
  105,400,754
  105,401,193
  105,401,196
  105,401,200
  105,401,212
  105,401,302
  105,401,420
  105,401,472
  105,401,541
  105,401,713
  105,402,103
  105,402,444
  105,402,563
  105,402,890
  105,403,506
  105,403,967
  105,404,130
  105,404,232
  105,404,281
  105,405,617
  105,405,742
  105,405,837
  105,406,167
  105,406,555
  105,407,123
  105,407,320
  105,407,401
  105,407,629
  105,407,714
  105,408,699
  105,409,028
  105,409,343
  105,409,413
  105,409,587
  105,409,603
  105,410,371
  105,415,221
  105,415,232
  105,416,012
  105,416,039
  105,416,246
  105,416,438
  105,421,696
  105,421,880
  105,422,543
  105,422,981
  105,423,388
  105,423,392
  105,423,912
  105,424,179
  105,424,182
  105,424,184
  105,424,185
  105,424,187
  105,424,905
  105,425,849
  105,427,132
  105,427,134
  105,428,691
  105,428,780
  105,431,442
  105,433,206
  105,433,362
  105,434,143
  105,434,553
  105,434,669
  105,434,693
  105,434,719
  105,435,372
  105,435,686
  105,435,839
  105,436,028
  105,437,123
  105,438,025
  105,438,150
  105,438,285
  105,438,372
  105,438,471
  105,439,189
  105,439,449
  105,439,472
  105,440,553
  105,440,780
  105,440,810
  105,443,072
  105,443,450
  105,443,452
  105,443,682
  105,444,066
  105,444,210
  105,444,973
  105,445,025
  105,445,484
  105,445,765
  105,447,672
  105,447,913
  105,449,354
  105,449,643
  105,452,539
  105,452,706
  105,454,279
  105,455,974
  105,457,484
  105,457,524
  105,458,109
  105,460,151
  105,461,308
  105,461,489
  105,461,714
  105,463,721
  105,464,013
  105,464,508
  105,465,516
  105,465,973
  105,466,257
  105,470,453
  105,470,464
  105,470,466
  105,470,940
  105,473,777
  105,474,302
  105,474,504
  105,474,761
  105,474,808
  105,477,471
  105,477,945
  105,478,025
  105,480,071
  105,480,375
  105,481,235
  105,481,444
  105,484,056
  105,486,272
  105,486,692
  105,486,891
  105,489,289
  105,490,056
  105,490,849
  105,491,286
  105,492,057
  105,492,305
  105,492,558
  105,492,716
  105,492,749
  105,493,015
  105,493,653
  105,493,844
  105,493,979
  105,494,301
  105,494,501
  105,494,521
  105,494,810
  105,495,159
  105,495,195
  105,495,342
  105,495,914
  105,496,067
  105,496,217
  105,496,437
  105,496,636
  105,496,676
  105,496,780
  105,496,804
  105,496,834
  105,497,196
  105,497,240
  105,497,403
  105,497,534
  105,497,606
  105,498,157
  105,498,498
  105,498,861
  105,499,185
  105,499,267
  105,499,387
  105,499,440
  105,499,574
  105,499,795
  105,499,894
  105,499,974
  105,500,182
  105,500,216
  105,500,293
  105,500,296
  105,500,300
  105,500,303
  105,500,319
  105,500,570
  105,500,861
  105,500,881
  105,500,897
  105,500,909
  105,500,982
  105,501,505
  105,501,607
  105,501,654
  105,501,719
  105,501,789
  105,502,225
  105,502,566
  105,502,716
  105,502,741
  105,502,764
  105,502,987
  105,503,133
  105,503,193
  105,504,009
  105,504,112
  105,504,199
  105,504,329
  105,504,835
  105,505,014
  105,505,063
  105,505,164
  105,505,232
  105,505,276
  105,505,391
  105,505,439
  105,505,526
  105,505,531
  105,505,632
  105,505,814
  105,505,965
  105,505,971
  105,506,207
  105,506,392
  105,506,956
  105,506,975
  105,507,013
  105,507,163
  105,507,218
  105,507,392
  105,507,497
  105,507,542
  105,507,569
  105,507,576
  105,511,693
  105,511,874
  105,511,972
  105,513,122
  105,513,221
  105,513,238
  105,514,601
  105,517,031
  105,518,945
  105,520,328
  105,521,508
  105,521,509
  105,522,226
  105,522,787
  105,522,957
  105,522,962
  105,524,496
  105,525,274
  105,525,279
  105,525,280
  105,525,391
  105,525,538
  105,525,779
  105,525,857
  105,526,956
  105,526,958
  105,527,192
  105,527,284
  105,527,926
  105,528,244
  105,529,602
  105,529,716
  105,530,239
  105,530,290
  105,530,422
  105,530,477
  105,530,541
  105,530,581
  105,530,632
  105,531,023
  105,531,299
  105,531,341
  105,531,346
  105,531,485
  105,531,525
  105,531,716
  105,531,725
  105,531,823
  105,531,967
  105,532,087
  105,532,207
  105,532,502
  105,532,779
  105,533,456
  105,534,067
  105,534,234
  105,534,407
  105,540,351
T
C
T
12
T
G
C
-
T
2
32/31
T/-
C
C
C
C
T
T
G
5
-
A
5/7
T
C
5
T/3
3
2
C
A
C
T
-
-
G
A
4/-
18/-
4
-
A/11
T
G
2
T
-
T
G
9
G
T
A
G
T
2
T
G
G
C
2
C
G
G
C
2
A
G
G
C
G/39
G/29
A
2
17
A
A
6
A
C
A
6
T
T
C
T
C
-
A
G
2
-
T
C
4
A
G
A
18/-
-
T
T
T
T
T
C
G
T
C
G
T
A
C
G
G
A
G
C
C
C
A
2
C
T
G
G
A
-
-
2
G
T
C
C
T
A
G
C
-
-
-
T
A
C
G
T
C
-
C
A
A
T
T
-
T
G
T
A
A
-
-
A
-
A
G
A
C
5
T
T
C
-
-
C
T
C
G
T
C
G
31
A
C
8/-
2
-
T
C
T
A
18
-
A
G
A
3
T
T
T
2
A
3
C
-
C
-
T
-
-
A
3
-
C
A
-
T
T
T
A
G
T
35/-
7
3
-
-
A
G
-
C
T
7/9
T
-
-
T
T/9
T
G
2
C
C
C
6/-
4/-
C
C
A/3
A
C
C
G
2
5
C
C
T
C
-
G
A
C
A
-
2
G
T
G
-
-
G
T
C
A
14
A
2
C
A
C
-
3
T
T
-
-
A
T
T
-
C
15/5
C
-
17/15
T
C
G
C
2
T
G
C
C
G
C
T
G
G
T
G
3
C
C
18
A
C
T
C
C
C
A
-
C
G
C
A
15
-
G
C
T
A
A
A
-
A
T
T
A
7
6
-
-
A
G
C
T
A
C
G
A
A
G
2
G
G
A
C
A
C
T
3
-
C
G
A
A
9
A
A
A
A
A
A
T
C
A
-
T
G
-
-
A
C
G
T
C
T
C
T
G
C
G
C
A
A
-
G
C
T
C
G
C
C
T
C
26
2
11
A
A
A
T
G
C
T
G
-
-
G
3
7
A
G
G
3
A
T
C
T
G
A
-
2
A
T
C
G
C
G
C
C
T
-
A
2
A/12
2
C
T
A