Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 93,224 (bp)   Positions: 256
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
--
.119
.994
.995
.999
.203
.0
.021
.139
.0
.002
.002
1.0
.001
.002
.0
.004
.0
.264
.046
.046
.02
.449
.007
.047
.001
.018
.087
.001
.017
.001
.003
.035
.0
.019
.001
.048
--
.016
.0
.0
.004
.004
.996
.001
.0
.032
.0
.001
.003
.003
.006
.003
.02
.001
.01
.001
.0
.044
--
--
.034
.011
.5
.0
.001
.0
.072
.003
.01
.001
.163
.011
.0
.0
.0
.0
--
.027
.557
.096
.227
.106
.011
.015
.015
--
--
.312
.161
.007
.163
.114
.001
.001
.003
.017
.136
.0
.018
.01
.029
.057
.003
.011
.004
.014
.606
.569
.038
.392
.825
.165
.187
.023
.094
.7
.004
.0
.641
.0
.006
.011
.046
.17
.001
.0
.019
.409
.652
.001
.013
.112
.111
.088
.007
.0
.001
.0
.007
.002
.0
.002
.0
.005
.001
.001
.001
.001
.057
.025
.002
.002
.037
.0
.61
.002
.174
.111
.001
.014
.029
.0
.001
.0
.018
.339
.02
.008
.007
.009
.148
.004
.744
.716
.001
.08
.003
.001
--
--
--
.439
.015
.021
.003
.0
.001
.402
.422
.0
.039
.004
.701
.016
.001
.165
.112
.065
.082
.09
.051
.097
.561
.222
.025
.105
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.059
.02
.037
.149
.005
--
.002
.013
.018
.262
.107
.023
.033
.0
.016
.132
.0
.128
.035
.0
.0
.002
.022
.0
.008
.021
.114
.0
.001
.012
.347
.239
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ndufaf2-ps1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
Actn1
A
3
C
C
T
A
4
T
C
T
T
A
A
T
4
G
T
G
A
G
A
G
C
G
A
A
T
A
G
C
G
G
G
25
A
6
G
C
A
C
C
T
C
T
A
T
G
A
G
C
4
T
G
G
T
C
T
C
A
A
A
C
T
G
G
A
A
A
G
T
G
A
A
A
A
G
A
T
T
C
G
C
C
C
5
C
T
T
C
A
T
T
T
A
C
C
C
C
A
A
C
A
C
G
8
T
2
C
G
5
A
G
C
A
G
G
G
4
A
G
A
G
T
C
T
T
C
A
G
G
T
T
C
A
A
T
T
C
T
G
T
G
A
C
T
C
A
A
A
C
G
C
C
G
A
T
A
T
C
A
A
A
T
G
G
G
T
T
G
C
A
T
A
2
C
A
C
G
C
A
C
T
A
G
T
G
T
T
A
A
A
C
G
T
A
T
T
C
T
G
C
A
A
T
A
G
T
A
C
C
T
T
T
A
C
T
C
C
C
C
C
C
C
4
G
C
A
A
G
G
T
A
A
A
G
C
G
C
T
T
C
G
T
A
G
6
G
C
G
G
2
T
C
T
G
2
  116,057,291
  116,057,540
  116,057,741
  116,057,795
  116,057,816
  116,057,876
  116,058,191
  116,058,208
  116,058,264
  116,060,300
  116,060,967
  116,061,463
  116,061,653
  116,062,079
  116,062,264
  116,063,964
  116,064,408
  116,064,937
  116,065,027
  116,065,124
  116,065,140
  116,065,314
  116,065,470
  116,065,758
  116,065,786
  116,065,976
  116,066,278
  116,066,317
  116,066,329
  116,066,350
  116,066,602
  116,066,874
  116,066,882
  116,067,081
  116,067,196
  116,067,376
  116,067,873
  116,068,258
  116,068,831
  116,069,688
  116,069,862
  116,070,014
  116,072,134
  116,073,225
  116,073,256
  116,073,347
  116,073,587
  116,074,555
  116,074,662
  116,075,482
  116,075,513
  116,075,618
  116,076,641
  116,077,084
  116,077,112
  116,077,872
  116,078,120
  116,078,378
  116,078,630
  116,078,950
  116,078,976
  116,079,029
  116,079,289
  116,079,483
  116,079,516
  116,079,936
  116,080,055
  116,081,479
  116,082,135
  116,082,431
  116,082,706
  116,083,332
  116,083,950
  116,084,497
  116,084,505
  116,084,589
  116,085,014
  116,086,232
  116,086,382
  116,086,638
  116,086,655
  116,086,680
  116,087,231
  116,087,668
  116,087,712
  116,087,897
  116,088,285
  116,088,286
  116,088,994
  116,089,003
  116,089,984
  116,090,054
  116,090,058
  116,090,079
  116,090,444
  116,091,818
  116,091,954
  116,092,218
  116,092,550
  116,092,821
  116,093,147
  116,093,369
  116,093,882
  116,093,960
  116,093,985
  116,094,507
  116,094,712
  116,095,069
  116,095,160
  116,095,465
  116,095,739
  116,096,108
  116,096,145
  116,096,151
  116,096,681
  116,096,740
  116,097,149
  116,097,311
  116,097,399
  116,097,508
  116,097,693
  116,097,729
  116,097,770
  116,098,366
  116,098,553
  116,098,795
  116,099,280
  116,099,385
  116,099,429
  116,099,489
  116,099,781
  116,099,827
  116,099,922
  116,099,929
  116,099,940
  116,100,035
  116,100,057
  116,100,116
  116,100,617
  116,100,799
  116,100,954
  116,100,958
  116,101,054
  116,101,158
  116,101,410
  116,101,998
  116,102,195
  116,102,365
  116,102,397
  116,102,670
  116,102,963
  116,103,172
  116,103,759
  116,104,688
  116,106,423
  116,106,935
  116,107,110
  116,108,970
  116,110,014
  116,110,861
  116,112,155
  116,112,273
  116,112,294
  116,114,065
  116,114,218
  116,114,226
  116,115,263
  116,116,202
  116,117,749
  116,117,809
  116,120,353
  116,121,459
  116,124,118
  116,124,676
  116,124,679
  116,124,843
  116,124,955
  116,125,169
  116,125,519
  116,125,818
  116,126,127
  116,126,228
  116,126,713
  116,126,902
  116,127,452
  116,127,463
  116,127,464
  116,128,982
  116,129,143
  116,129,145
  116,130,465
  116,131,050
  116,131,103
  116,132,005
  116,132,440
  116,133,328
  116,135,624
  116,135,639
  116,135,682
  116,135,688
  116,135,695
  116,135,722
  116,135,743
  116,135,747
  116,135,891
  116,135,966
  116,136,768
  116,136,926
  116,137,076
  116,137,084
  116,137,096
  116,137,118
  116,137,137
  116,137,159
  116,137,160
  116,137,170
  116,137,181
  116,137,201
  116,137,219
  116,137,232
  116,137,286
  116,137,296
  116,137,328
  116,137,380
  116,137,444
  116,137,755
  116,137,809
  116,137,840
  116,138,211
  116,138,218
  116,138,385
  116,138,495
  116,138,496
  116,138,577
  116,138,696
  116,138,766
  116,138,852
  116,139,169
  116,140,392
  116,140,953
  116,141,632
  116,142,489
  116,142,758
  116,143,440
  116,144,404
  116,145,042
  116,145,078
  116,145,211
  116,145,612
  116,145,935
  116,146,260
  116,146,945
  116,147,200
  116,147,327
  116,147,440
  116,147,487
G
-
T
T
G
G
-
C
T
C
A
G
G
C
-
A
G
C
G
A
G
C
A
2
G
G
C
G
A
T
A
C
2
-
G
-
A
4
G
G
A
C
T
G
G
G
A
G
T
2
-
A
A
A
G
T
3/5
T
G
6
A/-
G
C
A
A
G
G
G
A
C
A
-
G
C
G
A
G
C
C
A
A
T
T
T
-
A
T/2
A
2
A/T
C
T/C
T/C
G/12
T
T
T
2
G
G
2
5
T
A
-
T/-
-
T
A
-
4
A
T
G
A
A
A
-
G
T
G
T
G
T
-
2
T
G
-
C
C
-
4
A/G
3
T/7
T/C
T
C
A
C
A
G
T
C
T
G
3
G
T
A
A
T
GA/3
G
T/A
C
-
A
G
G
-
C
A
G/3
-
A
C
A
A
-
A
T
-
C/G
T
T
A
T
-
T
G
7
A
2
G/A
C
C
A/G
A/G
-
G
T
C
G
C
C
T
G
A
T
G
G
2
G
A
C
G
C/A
C/2
T/-
T/C
T/C
A/2
C/3
T/-
C/A
C/5
C/T
5
C/5
T
T
-
A
T
G
G
A
A
C
G
C
G
A
T
A
T
G
A
T
A
G
G
C
-
6
T
A
4
-
C
T
C
A
-