Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 70,813 (bp)   Positions: 291
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
RGSC 3.4  
.0
.01
.001
.0
.0
.003
.003
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.006
.0
.0
.285
.253
.034
.0
.0
.0
.001
.0
.067
.002
1.0
.0
.0
.009
.001
.006
.015
.009
.001
.058
.0
.002
.143
.0
.008
.998
.0
.004
.0
.002
.051
.198
.056
--
--
--
.0
.001
.0
.0
1.0
.765
.001
.0
.005
.0
.001
.0
.001
.0
.037
.0
.0
.002
.243
.029
.072
.003
.003
.002
.0
.001
.0
.001
.011
.0
.036
.0
.0
.001
.0
.226
.897
.133
.0
.001
.0
.0
.005
.0
.001
.003
.001
.002
.056
.168
.003
.0
.012
.03
.002
.003
.0
.003
.0
.972
.0
.0
.001
.001
.002
--
--
--
.0
.002
.001
.004
.0
.01
.025
.001
.008
.006
.0
.055
.366
.006
.004
.003
.002
.001
.066
.071
.002
.003
.0
.038
.0
.021
.026
.037
.0
.0
.015
.019
.001
.017
.008
.007
.008
.003
.032
.0
.002
.017
.006
.005
.002
.001
.003
.0
.004
.001
.015
.0
.002
.0
.0
.0
.007
.002
.001
.008
--
--
.005
.004
.001
.647
.638
.002
.001
.002
.001
.0
--
.0
1.0
.005
.002
.003
.006
.0
.006
.001
.002
.029
.007
.0
.002
.017
.001
.013
.0
.033
.003
.001
.0
.001
.001
.001
.041
.054
.001
.004
.0
.004
.004
.001
.002
.073
.039
.003
.003
.005
.002
.0
.0
.002
.001
.0
.001
.029
.009
.001
.002
.002
.001
.0
.003
.0
.009
.012
.001
.001
.001
.0
.001
.001
.002
.001
.002
.0
.007
.008
.034
.034
.007
.001
.0
.0
.0
.0
.002
.002
.013
.003
.001
.0
.416
.048
.0
.0
.226
.004
.007
.0
.002
.059
.962
.017
.104
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
Abcc9
G
T
C
G
A
T
G
G
G
G
A
C
A
A
T
C
A
A
2
-
A
C
C
A
T
C
G
A
G
G
A
G
T
A
G
G
C
A
T
C
T
A
A
T
G
T
T
T
A
T
2
T
G
A
A
A
G
A
G
A
C
C
G
G
T
G
G
C
C
C
C
C
C
G
C
T
C
A
T
A
C
A
C
G
A
G
A
A
G
-
T
G
G
G
T
T
T
C
C
A
A
C
C
G
T
C
T
A
A
G
A
G
G
G
G
C
G
A
G
G
T
G
T
T
C
T
C
G
5
A
A
C
G
G
T
G
A
T
G
A
G
G
T
T
T
A
A
C
A
A
T
T
T
T
A
G
G
T
G
C
G
C
T
-
A
A
G
G
A
T
G
G
A
T
C
A
T
G
T
C
T
T
G
C
G
G
C
T
G
C
G
G
T
T
T
T
C
T
T
A
T
C
G
A
G
T
A
C
T
C
G
C
A
-
G
T
A
C
A
A
C
T
G
C
T
T
C
T
T
G
G
G
C
C
C
G
A
C
T
C
C
A
T
C
T
G
C
A
5
T
C
A
C
A
G
T
A
T
G
A
C
A
T
A
T
G
T
A
T
G
A
G
G
A
C
A
C
G
T
A
G
A
T
T
T
G
G
A
A
G
G
  180,166,059
  180,166,138
  180,166,193
  180,166,387
  180,166,995
  180,167,049
  180,167,125
  180,167,160
  180,167,434
  180,167,445
  180,167,493
  180,167,593
  180,168,043
  180,168,050
  180,168,279
  180,168,696
  180,168,832
  180,168,966
  180,170,371
  180,170,375
  180,170,486
  180,170,655
  180,170,690
  180,170,741
  180,171,244
  180,171,374
  180,171,436
  180,171,456
  180,171,774
  180,171,953
  180,172,047
  180,172,253
  180,172,872
  180,173,288
  180,173,679
  180,173,768
  180,173,952
  180,174,180
  180,174,250
  180,174,620
  180,175,812
  180,175,904
  180,176,206
  180,176,450
  180,177,995
  180,178,307
  180,178,469
  180,178,884
  180,178,967
  180,179,021
  180,179,203
  180,179,489
  180,179,527
  180,179,651
  180,179,754
  180,179,939
  180,180,020
  180,180,221
  180,180,453
  180,180,477
  180,181,773
  180,181,977
  180,183,151
  180,183,267
  180,183,336
  180,183,349
  180,184,021
  180,184,030
  180,184,354
  180,184,579
  180,184,678
  180,184,729
  180,184,960
  180,184,987
  180,185,220
  180,185,252
  180,185,378
  180,185,429
  180,185,619
  180,185,797
  180,185,863
  180,185,867
  180,185,914
  180,186,053
  180,186,523
  180,186,677
  180,186,760
  180,186,835
  180,187,511
  180,187,610
  180,188,041
  180,188,101
  180,188,413
  180,188,487
  180,188,823
  180,188,928
  180,189,089
  180,189,248
  180,189,890
  180,189,891
  180,190,292
  180,190,783
  180,191,078
  180,191,146
  180,192,063
  180,192,733
  180,193,100
  180,193,322
  180,193,601
  180,193,731
  180,193,926
  180,194,116
  180,194,130
  180,194,172
  180,194,540
  180,194,561
  180,194,601
  180,194,867
  180,194,933
  180,195,168
  180,195,183
  180,195,406
  180,195,714
  180,195,965
  180,196,438
  180,196,584
  180,196,977
  180,197,235
  180,197,243
  180,197,559
  180,197,561
  180,197,716
  180,197,801
  180,197,922
  180,197,948
  180,198,531
  180,198,916
  180,198,918
  180,198,940
  180,199,050
  180,199,127
  180,199,646
  180,205,808
  180,205,913
  180,206,189
  180,206,231
  180,206,414
  180,206,731
  180,206,755
  180,206,795
  180,206,890
  180,207,009
  180,207,333
  180,207,361
  180,207,419
  180,207,519
  180,207,746
  180,207,777
  180,207,950
  180,208,240
  180,208,248
  180,208,345
  180,208,393
  180,208,575
  180,208,650
  180,209,340
  180,209,712
  180,209,749
  180,209,800
  180,210,138
  180,210,954
  180,211,179
  180,212,140
  180,212,507
  180,212,528
  180,213,383
  180,214,410
  180,214,473
  180,214,527
  180,214,631
  180,214,643
  180,214,826
  180,216,512
  180,216,567
  180,216,958
  180,217,471
  180,217,771
  180,219,302
  180,219,303
  180,219,831
  180,219,927
  180,220,016
  180,220,023
  180,220,136
  180,221,157
  180,221,418
  180,221,889
  180,222,647
  180,222,717
  180,222,722
  180,222,741
  180,222,802
  180,222,962
  180,222,968
  180,223,041
  180,223,231
  180,223,318
  180,223,331
  180,223,344
  180,223,496
  180,223,586
  180,223,673
  180,223,853
  180,223,917
  180,223,968
  180,224,061
  180,224,178
  180,224,191
  180,224,456
  180,224,460
  180,224,532
  180,224,596
  180,224,922
  180,225,103
  180,225,183
  180,225,223
  180,225,287
  180,225,355
  180,225,361
  180,225,470
  180,225,474
  180,225,516
  180,225,533
  180,225,538
  180,225,830
  180,225,898
  180,225,900
  180,225,921
  180,225,932
  180,225,993
  180,225,999
  180,226,030
  180,226,034
  180,226,138
  180,226,170
  180,226,195
  180,226,234
  180,226,278
  180,226,351
  180,226,370
  180,226,437
  180,226,492
  180,226,515
  180,226,531
  180,226,542
  180,226,572
  180,226,585
  180,226,592
  180,226,598
  180,226,611
  180,226,644
  180,226,656
  180,226,674
  180,226,675
  180,226,722
  180,226,724
  180,226,932
  180,227,032
  180,227,067
  180,227,201
  180,227,285
  180,227,658
  180,227,663
  180,227,684
  180,227,746
  180,227,777
  180,227,945
  180,228,660
  180,228,987
  180,229,083
  180,229,813
  180,229,825
  180,230,082
  180,230,332
  180,230,338
  180,231,367
  180,233,214
  180,234,109
  180,235,935
  180,236,394
  180,236,509
A
C
A
A
T
C
C
A
A
A
T
G
G
C
A
T
C
A/-
2/-
-/G
G
T
T
G
T/C
A
A
C
A
A
G
A
T/-
G
C
A
C/T
G
C
T
C
G
G
C
A
C
C
C
G
C
-
C
A
T
C
T
-
G
A
G
T
T
A
A
T/C
G/A
A
A
A
T
A
T
T
A
T
A
T
T
C
C
T
G
T
T
G
A
G
G
T
-/2
C
A
T
T
C
C
T/-
T
T
G
G
C/-
T
C
C
A
T/-
G
T
A
G
A
A
T
G/-
-
G/-
G
A
T
C
A
C
C
T
C
T
A
5/-
C
T
T
A
A
C
A
C
C
C
G
A
A
A
A
G
G
G
T
G
A/-
G
C
C
C
G
A
A
G
A
T
A
T
C
G
G
C
A
A
C
C
A
T
G
C
T
G
C
A
A
T
C
C
A
T
A
A
-
C
A
T
A
A
C
C
T/-
C
T
C
C
T
C
T
C
G
A
G
G
T
C
T
C
T
G
-/4
A
C
C
T
G
G
A
A
A
T
A
A
T
C
C
A
-
A
A
T
T
A
C
T
G
T
T
C
A
T
C
T
G
G
-
G
G
G
T
G
A
C
G
C
A
C
G
G
C
G
C
A
A
G
A
A
T
A
A
T
T
G
A
A
C
G
T
T
A
C
A
T
C
-
G
A
A