Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 229,590 (bp)   Positions: 404
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.007
.071
.001
.0
.011
.006
--
--
--
.0
.0
--
--
.009
--
.247
.264
.101
.147
.033
.0
.023
.001
.012
.034
.011
.011
.003
.002
.003
.001
.001
.949
.024
.184
.024
.001
.017
.0
.156
.0
.041
.503
.0
.011
.001
.001
.008
.001
.001
.0
.006
.001
.02
.001
.001
.024
.02
.008
.01
.01
.018
.023
.012
.051
.01
.02
.0
.001
.002
.0
.124
.002
.036
.013
.028
.002
.007
.004
.002
.361
.01
.003
.073
.054
.029
.011
.016
.02
.017
.0
.475
.001
.0
.001
.0
.001
.0
.0
.005
.002
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.001
.166
.185
.001
.003
.947
.004
.036
.002
.0
.028
.0
.001
.086
.987
.951
.055
.003
.001
.008
.001
.011
.013
.032
.008
.004
--
.0
--
--
.951
.889
.111
.006
.998
.002
.0
.042
.007
.016
.024
.036
.129
.238
.584
.044
.035
.003
--
.003
.0
.001
.0
.024
.206
.0
.024
.021
.007
.0
.007
.017
.024
.021
.123
.005
.005
--
.005
.024
.0
.005
.0
.005
.0
.001
.038
.0
.018
.003
--
.147
.51
.996
.989
.997
.922
.0
.0
.0
.0
.005
.029
.041
.009
.044
.038
--
.01
.004
.0
--
.003
.0
--
.043
.026
.0
.782
.035
.006
.842
.022
.016
.952
.014
.005
.0
.0
.0
.45
--
--
--
.058
.031
.005
.014
.001
.08
.005
.003
.015
.001
.0
.0
.002
.001
.0
.011
1.0
--
.0
.01
.004
--
.001
.997
.076
.128
.001
.184
.002
.01
.001
.001
.0
.0
.039
.0
.008
.015
.001
.001
.0
.023
.001
.002
.349
.0
.002
.0
--
.71
.98
.002
.001
.035
--
.002
.407
--
--
.043
.029
.014
--
.001
.02
.024
.004
.072
.005
.001
.003
.002
--
--
--
--
--
.003
.033
.006
.292
.002
.067
.044
.001
.003
.0
.008
.006
.085
.001
.003
.012
--
.095
.001
.19
--
.0
.003
.009
.378
.99
.002
.004
.004
.0
.014
.23
.247
.042
.001
.0
.001
--
.005
.0
.006
.019
.006
.156
.204
.057
.108
.037
.188
.281
.283
.075
.09
.001
.001
.007
.039
.104
.0
.0
.014
.02
.004
.004
.002
--
.008
.002
.004
.136
.141
.001
.009
.004
.001
.005
.0
.058
.052
.01
.042
.013
.02
.011
.018
.002
.017
.009
.032
.009
.016
.159
.004
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
A
A
G
C
G
C
G
C
A
C
A
G
C
A
G
T
A
G
C
A
A
G
A
A
A
T
C
T
G
G
A
T
T
T
T
T
T
T
G
A
5
G
T
2
A
T
A
2
T
C
G
G
A
A
T
A
C
G
G
A
8
T
G
26
G
G
C
3
A
G
A
A
G
G
C
A
C
T
A
G
T
A
C
G
T
G
T
C
C
A
T
A
T
T
T
T
G
A
A
T
T
G
T
G
G
C
G
A
A
G
T
G
A
A
T
C
G
G
G
T
G
C
C
G
C
A
A
A
T
A
5
T
T
A
T
T
A
T
2
C
C
T
A
T
C
G
T
T
C
A
G
A
2
T
G
C
G
A
C
A
T
A
C
T
G
C
C
A
G
C
G
129
G
T
G
G
C
A
G
T
C
G
A
C
G
A
C
C
A
G
A
C
C
G
T
C
C
C
C
T
A
A
C
C
G
A
2
C
A
T
A
G
C
2
G
C
C
T
C
A
C
T
T
C
C
T
C
G
A
C
C
A
C
T
C
G
C
T
A
A
T
C
G
4
T
A
A
G
A
G
A
T
C
T
A
A
C
A
A
A
A
A
C
A
T
G
C
4
A
T
C
A
A
T
A
T
G
A
A
T
G
T
A
A
T
A
A
G
T
C
G
A
T
A
G
A
C
T
T
T
T
T
3
3
5
A
A
A
A
T
A
A
T
A
T
G
C
C
A
T
A
T
T
T
A
6
C
G
C
141
T
A
A
G
G
A
T
G
A
G
G
C
T
T
G
C
G
A
A
T
A
T
C
C
G
G
A
C
T
T
T
G
T
A
C
T
A
A
G
C
C
2
A
A
A
C
C
C
C
T
G
G
G
A
C
G
A
5
T
C
A
G
C
G
C
C
T
C
G
T
G
A
10
G
  107,127,488
  107,129,681
  107,130,252
  107,130,644
  107,131,664
  107,132,200
  107,132,579
  107,132,672
  107,132,731
  107,133,261
  107,133,431
  107,134,173
  107,134,361
  107,134,514
  107,134,627
  107,135,111
  107,135,112
  107,135,278
  107,135,304
  107,135,551
  107,135,681
  107,135,701
  107,135,735
  107,135,819
  107,135,911
  107,135,946
  107,135,947
  107,136,005
  107,136,006
  107,136,007
  107,136,224
  107,136,696
  107,136,786
  107,136,889
  107,136,897
  107,137,458
  107,137,743
  107,139,071
  107,139,842
  107,140,695
  107,140,717
  107,140,722
  107,140,868
  107,141,140
  107,141,275
  107,141,410
  107,141,955
  107,141,998
  107,142,039
  107,142,046
  107,142,084
  107,142,103
  107,142,251
  107,142,590
  107,143,595
  107,143,870
  107,143,948
  107,143,974
  107,144,073
  107,144,112
  107,144,133
  107,144,216
  107,144,433
  107,144,440
  107,144,598
  107,144,632
  107,144,644
  107,144,985
  107,145,157
  107,145,357
  107,145,421
  107,145,462
  107,145,722
  107,145,802
  107,145,878
  107,145,922
  107,146,002
  107,146,046
  107,146,141
  107,146,201
  107,146,264
  107,146,439
  107,146,478
  107,146,499
  107,146,515
  107,146,535
  107,146,671
  107,146,674
  107,146,734
  107,146,745
  107,146,894
  107,146,936
  107,147,065
  107,147,069
  107,147,101
  107,147,103
  107,147,110
  107,147,162
  107,147,163
  107,147,167
  107,147,180
  107,147,186
  107,147,218
  107,147,222
  107,147,227
  107,147,229
  107,147,236
  107,147,238
  107,147,247
  107,147,390
  107,147,734
  107,147,827
  107,148,369
  107,148,442
  107,148,485
  107,148,880
  107,149,033
  107,149,335
  107,151,239
  107,151,252
  107,152,154
  107,153,403
  107,153,674
  107,155,028
  107,155,080
  107,157,609
  107,158,709
  107,159,478
  107,160,498
  107,161,938
  107,162,447
  107,164,115
  107,165,462
  107,165,471
  107,166,672
  107,167,289
  107,168,648
  107,169,469
  107,169,523
  107,170,224
  107,170,278
  107,170,332
  107,170,954
  107,171,337
  107,174,622
  107,177,613
  107,179,632
  107,179,647
  107,179,685
  107,179,732
  107,180,500
  107,180,579
  107,181,105
  107,181,361
  107,183,154
  107,183,288
  107,183,420
  107,183,662
  107,184,354
  107,184,588
  107,185,058
  107,185,278
  107,185,327
  107,185,898
  107,186,230
  107,186,486
  107,186,489
  107,186,583
  107,186,751
  107,187,353
  107,188,177
  107,188,431
  107,188,792
  107,189,496
  107,190,462
  107,190,463
  107,192,033
  107,192,055
  107,192,312
  107,192,753
  107,192,777
  107,192,803
  107,192,854
  107,192,897
  107,193,092
  107,193,189
  107,193,338
  107,193,488
  107,193,548
  107,193,786
  107,194,475
  107,194,534
  107,194,584
  107,194,605
  107,194,613
  107,194,629
  107,195,130
  107,195,184
  107,195,646
  107,195,685
  107,199,718
  107,199,764
  107,199,771
  107,200,614
  107,202,240
  107,203,044
  107,203,207
  107,203,474
  107,203,886
  107,203,941
  107,207,613
  107,209,178
  107,210,744
  107,212,039
  107,212,814
  107,214,346
  107,214,511
  107,215,100
  107,215,820
  107,216,560
  107,216,692
  107,216,873
  107,217,011
  107,217,038
  107,217,394
  107,217,606
  107,217,613
  107,217,636
  107,217,650
  107,217,733
  107,217,762
  107,217,925
  107,217,996
  107,218,646
  107,218,782
  107,219,075
  107,219,095
  107,219,307
  107,219,601
  107,220,712
  107,220,891
  107,221,021
  107,221,207
  107,221,987
  107,221,990
  107,222,103
  107,222,358
  107,222,579
  107,223,176
  107,224,732
  107,226,410
  107,227,892
  107,227,943
  107,228,711
  107,229,087
  107,229,400
  107,230,052
  107,230,074
  107,230,117
  107,231,962
  107,232,125
  107,233,199
  107,233,236
  107,233,866
  107,237,126
  107,237,356
  107,238,646
  107,239,573
  107,240,046
  107,241,229
  107,242,384
  107,242,489
  107,242,543
  107,242,813
  107,244,168
  107,244,436
  107,244,812
  107,245,660
  107,246,457
  107,247,756
  107,248,249
  107,248,525
  107,249,081
  107,253,823
  107,254,531
  107,255,222
  107,264,905
  107,265,526
  107,265,772
  107,266,623
  107,268,525
  107,268,809
  107,271,896
  107,271,951
  107,272,510
  107,279,540
  107,281,378
  107,282,531
  107,282,836
  107,284,819
  107,285,781
  107,286,050
  107,287,870
  107,287,875
  107,288,771
  107,292,150
  107,293,725
  107,294,079
  107,294,383
  107,294,702
  107,296,500
  107,297,699
  107,298,955
  107,300,486
  107,301,547
  107,302,391
  107,302,396
  107,303,784
  107,304,035
  107,304,649
  107,304,865
  107,304,996
  107,305,266
  107,305,609
  107,305,736
  107,306,256
  107,309,065
  107,311,076
  107,314,584
  107,315,526
  107,317,019
  107,317,254
  107,318,122
  107,318,744
  107,318,846
  107,319,309
  107,322,991
  107,324,127
  107,325,328
  107,328,656
  107,330,667
  107,331,002
  107,331,005
  107,331,166
  107,331,402
  107,331,842
  107,333,346
  107,333,478
  107,335,283
  107,337,193
  107,337,353
  107,338,154
  107,338,617
  107,339,623
  107,339,663
  107,339,959
  107,340,013
  107,340,339
  107,340,410
  107,340,436
  107,340,442
  107,340,754
  107,340,757
  107,341,140
  107,341,149
  107,341,179
  107,341,247
  107,341,283
  107,341,323
  107,341,325
  107,341,347
  107,348,425
  107,348,443
  107,348,493
  107,348,664
  107,348,752
  107,348,965
  107,349,156
  107,349,162
  107,349,282
  107,349,471
  107,349,530
  107,350,168
  107,350,222
  107,350,440
  107,350,692
  107,350,707
  107,350,736
  107,350,743
  107,351,011
  107,351,683
  107,352,718
  107,352,813
  107,353,928
  107,353,943
  107,354,187
  107,354,308
  107,354,819
  107,354,821
  107,355,745
  107,356,070
  107,356,090
  107,356,381
  107,356,457
G
2
A
T
A
T
T
C/T
G
T
T
A
T
G
T
T/A
A/T
C
T
G
A/G
A
G
G
G
T/C
C/T
3
6
A
G
C
C
C
C
C
C
C
T
G
-
A
A
-
G
C
G
2/-
C
G
A
A
A/13
G
C
C
T
G/T
3
3
-
G
A
-
A
A
T
-
G
A
T
G
A
A
T
G
T
C
G
G/A
C
C
T
A
C
T
G
T
G
G
G
G
C
C
A
A
C
T
T
C
A
C
A
C
T
G
A
C
C
A
C
T
4
G
T/C
T
A
A
A
A
G/2
T
-
A
T
-
2
G
C
G
5/-
C
T/2
A/G
C
C
C
5
-
A
T
C
G
A
T
-
G
C
T
13
A
-
2/-
G
A
A
A
-
T
G
2
C
T
C
A
C/2
T
G
A
T
A
-
A
C
2
2
T
G
A
C
T
A
G
A
A
T
T
T
G
A
4
C/T
T
A
C
G
C/G
C/G
G
A
G
G
T
T
-
T
2/-
T
G
C
C
A
T
-
5
T
T
C
T
G
T
G
G
T
A
C
T
A
C
5
T
G
T
C
T
T
3
T/A
A/C
C
A
T
2
-
6
G
G
A
G
A
G
C
A
A
-
G
C/2
-
T
A/G
G
A/-
T
G
2
T
C/4
-
A/G
C
3
G
2
C
3
A
A
G
C
G
G/A
T/45
G
G
C
G
A/C
C
C
3
A
G
3
G
A
9
T
C
C
A
T/A
C
3/-
-
-
C
4
G
G
C
C
G
T/3
3
C
G/C
C/T
T
A/23
C
C
3
C
A
G
-
4
A
T
141/-
5
G
G
T
A
A/T
C
A
G
A
3
T
C
A
C
T
G/A
G
A/4
C
G
T/C
T
A
2
C
G
T
C
C
C
A
G
G
2
C
G
G
A
T
T
2/-
-
A/-
T
T
T
T
T
-
A
A
T
C
T
A
G
-
-
G
T
A
T
G/A
T
C/G
C
T
T
C
A
2
-
A