Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 107,882 (bp)   Positions: 200
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.011
.009
.011
.02
.007
.017
.006
.021
.066
.093
--
--
--
.134
.604
.996
.999
--
--
.006
.016
.166
.136
.001
.002
.003
.001
.017
.103
.001
.007
.0
.001
.002
.001
.022
.022
.022
.021
.032
.2
--
.086
.807
.03
.027
.0
.011
--
.005
.034
.004
.0
.0
.116
.047
.002
.056
--
--
.986
.018
--
--
--
--
--
.5
.941
--
.096
.424
.005
.021
.049
.351
.005
.02
.034
.051
.205
.044
.007
.033
.02
.002
--
--
--
--
--
.08
.083
.128
.006
.014
.11
.0
.369
--
.044
--
--
.003
.457
.239
.389
--
.033
.021
.004
.0
.004
.0
.06
.002
.002
.082
.019
--
--
--
--
--
.003
.09
.003
.761
.002
.0
--
--
--
.276
.021
.002
.025
.007
.006
--
--
.908
.932
.097
.181
.042
.003
.0
.001
.006
.006
.002
.004
.091
.276
.067
.083
.109
.084
.003
.003
.0
--
--
.279
.839
.072
.001
--
.003
.085
.004
.067
.052
.008
.237
.063
.331
.037
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.035
.047
.076
.831
.002
.003
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
C
T
T
G
C
C
C
C
T
A
C
3
A
A
8
12
8
A
A
C
T
G
8
4
T
T
T
4
C
T
T
A
C
A
A
C
A
A
T
A
2
T
T
6
G
G
G
G
G
A
C
12
C
A
A
T
T
A
T
T
C
G
10
A
A
A
A
A
2
G
C
6
G
A
C
C
C
T
17
A
G
T
C
C
C
A
G
T
T
T
T
A
T
G
G
G
2
C
A
C
C
C
T
G
G
G
12
8
C
A
A
G
T
C
30
T
A
2
5
17
2
G
4
2
A
G
C
G
G
G
G
3
20
5
126
T
6
A
G
14
G
C
15
C
6
C
G
T
A
T
C
T
T
G
T
T
8
6
G
G
3
G
C
C
C
A
T
C
C
G
T
A
A
C
T
T
T
T
T
3
C
G
C
G
C
10
A
6
G
10
31
17
6
C
G
2
4
T
T
C
  5,896,129
  5,896,147
  5,896,158
  5,896,160
  5,896,180
  5,896,219
  5,897,709
  5,899,929
  5,900,081
  5,901,917
  5,903,648
  5,903,665
  5,906,714
  5,907,467
  5,909,395
  5,910,322
  5,910,326
  5,910,728
  5,910,786
  5,911,230
  5,911,247
  5,912,140
  5,912,205
  5,912,831
  5,912,834
  5,912,991
  5,912,993
  5,913,061
  5,913,630
  5,914,707
  5,915,819
  5,915,827
  5,915,834
  5,915,838
  5,915,846
  5,915,853
  5,915,860
  5,915,867
  5,915,871
  5,915,874
  5,917,809
  5,917,864
  5,918,805
  5,919,473
  5,920,363
  5,922,534
  5,922,713
  5,923,427
  5,924,475
  5,924,895
  5,925,638
  5,926,127
  5,926,431
  5,926,461
  5,927,235
  5,927,315
  5,928,304
  5,928,479
  5,929,483
  5,929,664
  5,930,063
  5,931,641
  5,932,702
  5,932,739
  5,932,825
  5,932,911
  5,933,286
  5,934,488
  5,934,497
  5,938,045
  5,939,635
  5,940,028
  5,940,424
  5,940,481
  5,941,656
  5,941,700
  5,941,732
  5,941,780
  5,941,784
  5,942,672
  5,942,723
  5,942,944
  5,942,953
  5,943,021
  5,943,538
  5,943,665
  5,943,980
  5,943,998
  5,944,055
  5,944,056
  5,944,057
  5,944,165
  5,944,754
  5,944,759
  5,945,056
  5,945,168
  5,945,289
  5,945,542
  5,946,520
  5,949,398
  5,949,731
  5,952,533
  5,952,738
  5,953,945
  5,954,896
  5,956,390
  5,956,623
  5,957,373
  5,958,645
  5,959,221
  5,959,227
  5,959,281
  5,959,410
  5,959,419
  5,959,591
  5,959,774
  5,959,775
  5,959,803
  5,959,834
  5,959,844
  5,959,868
  5,959,893
  5,959,976
  5,960,043
  5,960,677
  5,961,243
  5,961,891
  5,962,153
  5,962,430
  5,962,654
  5,962,903
  5,962,962
  5,963,248
  5,963,853
  5,963,860
  5,964,587
  5,964,664
  5,965,313
  5,965,378
  5,965,964
  5,966,072
  5,966,173
  5,966,178
  5,966,719
  5,966,770
  5,966,829
  5,966,892
  5,966,894
  5,966,925
  5,967,081
  5,967,168
  5,967,387
  5,967,488
  5,967,528
  5,967,665
  5,967,959
  5,967,960
  5,967,962
  5,968,133
  5,968,859
  5,968,862
  5,969,244
  5,969,722
  5,969,771
  5,970,400
  5,970,636
  5,970,773
  5,987,912
  5,989,271
  5,989,824
  5,990,646
  5,991,883
  5,992,751
  5,992,931
  5,992,979
  5,993,817
  5,995,026
  5,995,116
  5,995,469
  5,996,766
  5,997,144
  5,997,146
  5,997,149
  5,997,155
  5,997,160
  5,997,162
  5,997,174
  5,997,179
  5,997,186
  5,997,189
  5,997,201
  5,997,338
  5,997,357
  5,997,420
  5,997,421
  5,998,535
  5,998,796
  6,001,475
  6,001,483
  6,001,488
T
2
2
A
-
2
20
C/23
C
A/3
A
3/-
A/-
G
-
12/-
8/-
5
A/5
T
C
T
8/-
-
5
2
28
-
T
C
-
-
-
-
-
-
-
-
C
C
-
A
2
-
C
2
C
15/23
A
T
A
-
-
G
G
C
G
G
T/2
T/7
T
A
-
3
T
A/3
T
A/3
2/-
A
T
-
T
G
T
T
46
-
-
G
A
C
4
T
G
T
A
C
A
A
A
G
A
3/5
A
-
-
A
G
T
3/4
-
2
A
T
A
-
-
T
G
G
A
19
-
-
A
T
-
-
-
-
3/5
-
-
G
A
T
23
A
A
A
-
-
-
-
A
-
G
A
14/-
T
G
-
T
-
T
A
C
G
C
T
C
C
A
C
T/7
8/-
6/-
A
G/11
3/-
A
C/241
26
G
15
C
G
7
A
A
G
5
T
5
C
C
A
C
3/-
11
2
A
A
-
-
G
-
-
-
-
-
-
G
C
2/-
-
-
-
-