Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 107,882 (bp)   Positions: 382
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.002
.0
.0
.168
.011
.009
.011
.007
.017
.805
.12
--
--
--
.194
.005
.006
.001
.673
.214
--
--
--
.312
.023
.066
.713
.042
.094
.399
.347
.216
.011
.0
--
.011
.048
.025
.013
.077
.373
.683
.551
.46
.177
.42
.007
.343
.008
.615
--
.035
.042
.134
.32
--
--
--
.008
.0
.0
.081
.024
.115
.025
.118
.996
.997
--
--
--
--
--
--
.0
.005
.016
.016
.356
.166
.01
.025
.05
.008
.005
.016
.025
.121
.001
.001
.001
.002
.2
.052
.015
.005
.006
.013
.025
.021
.001
--
--
--
--
.007
.0
.001
.002
.001
.022
.022
.022
.021
.032
.133
.007
.003
.169
.086
.036
.011
.827
.05
.006
.034
.03
.038
.011
.993
.0
.027
.147
.062
.055
.005
--
.01
.001
.0
.0
.0
.001
.128
.228
.116
.047
.008
.332
.987
.01
.0
.003
.003
--
--
1.0
.99
.132
.014
.008
.104
.019
1.0
.866
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.093
.001
.321
.348
--
.5
--
.007
.039
--
--
.003
.001
.517
.554
.024
.003
.147
.001
.468
.014
.194
.695
.674
.021
.714
.899
.002
.171
.049
.331
.001
.006
.02
.034
.019
.001
.003
.001
.006
--
--
.18
--
.369
.016
.328
.004
.027
.052
.062
--
.044
.3
.247
.031
.017
.546
.126
.024
.003
.01
.018
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.325
.001
.01
--
--
.081
.178
.08
.457
.0
.016
.011
.008
.324
.16
.004
.012
.036
--
--
.103
.0
.001
.332
.075
.082
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.002
.001
.034
.103
.131
.011
.0
1.0
.945
.936
.02
.001
--
--
--
.03
.113
--
--
--
.078
--
--
.143
.731
.006
.0
.001
.023
.097
.276
.083
.109
.091
.682
.003
.003
.345
--
--
--
--
.027
--
.846
.072
.042
.124
--
--
--
.003
.016
.003
.012
--
--
--
.014
.067
.004
.009
.067
--
--
--
--
.052
.783
.039
.237
.02
.063
.331
.037
.001
.0
.0
.001
.151
.132
.068
.079
.831
.002
.003
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
G
A
G
G
C
C
T
T
C
C
C
A
A
C
T
A
A
C
G
A
A
A
T
C
G
C
T
C
T
4
3
C
T
A
T
C
A
G
T
A
T
G
A
G
C
T
C
T
T
A
T
A
C
T
A
A
C
G
G
T
C
A
G
G
A
A
C
4
2
2
G
T
G
A
2
C
T
T
C
A
G
C
G
G
6
C
G
6
G
T
G
T
T
A
C
A
4
C
7
A
T
T
G
G
A
A
T
A
C
A
A
C
A
A
T
A
G
C
T
G
T
G
C
3
T
G
C
G
A
G
A
G
A
2
A
C
A
T
T
T
G
A
C
C
T
C
A
T
C
C
A
C
C
A
A
T
T
C
A
T
C
C
T
A
G
A
2
T
2
T
2
G
2
T
2
2
A
2
A
2
T
A
2
A
T
A
A
C
C
C
3
G
T
A
G
C
T
T
C
4
T
10
8
G
A
T
A
18
A
A
G
T
A
T
C
T
G
C
G
G
8
T
T
3
5
T
C
T
T
T
4
A
A
G
A
T
G
G
G
C
C
G
C
T
G
T
A
C
T
G
G
T
C
T
3
2
G
T
T
T
T
2
3
T
A
C
T
A
G
C
A
T
C
4
G
T
G
G
A
A
C
C
T
C
A
2
2
C
G
C
C
C
C
A
A
A
9
C
2
A
T
C
G
C
C
C
G
C
G
A
G
G
2
T
G
C
C
G
G
T
G
T
T
T
T
T
8
6
A
C
4
3
T
A
C
A
2
T
A
4
T
G
A
12
8
2
C
C
G
C
T
C
C
C
G
A
A
A
C
C
C
A
C
T
A
T
C
T
T
T
3
A
2
T
5
G
G
A
4
T
T
C
  5,894,562
  5,895,383
  5,895,742
  5,895,784
  5,896,052
  5,896,129
  5,896,147
  5,896,158
  5,896,180
  5,896,219
  5,896,363
  5,896,397
  5,896,722
  5,897,042
  5,897,098
  5,897,309
  5,897,576
  5,897,709
  5,898,403
  5,898,619
  5,898,723
  5,898,927
  5,899,315
  5,899,445
  5,899,704
  5,899,899
  5,900,081
  5,900,429
  5,901,842
  5,901,918
  5,902,173
  5,902,188
  5,902,239
  5,902,315
  5,903,119
  5,903,648
  5,903,895
  5,904,078
  5,904,264
  5,904,270
  5,904,511
  5,904,575
  5,904,743
  5,904,834
  5,904,842
  5,904,870
  5,904,888
  5,904,939
  5,905,029
  5,905,254
  5,905,968
  5,906,680
  5,907,162
  5,907,414
  5,907,467
  5,907,533
  5,907,847
  5,907,856
  5,907,964
  5,908,185
  5,908,500
  5,908,781
  5,909,019
  5,909,125
  5,909,264
  5,909,533
  5,909,825
  5,910,322
  5,910,324
  5,910,509
  5,910,534
  5,910,537
  5,910,582
  5,910,728
  5,910,787
  5,911,082
  5,911,087
  5,911,247
  5,911,356
  5,912,084
  5,912,140
  5,912,178
  5,912,185
  5,912,259
  5,912,276
  5,912,281
  5,912,289
  5,912,326
  5,912,347
  5,912,831
  5,912,832
  5,912,833
  5,912,834
  5,912,909
  5,912,937
  5,912,984
  5,913,039
  5,913,054
  5,913,058
  5,913,543
  5,913,864
  5,914,707
  5,915,606
  5,915,614
  5,915,617
  5,915,618
  5,915,819
  5,915,827
  5,915,834
  5,915,838
  5,915,846
  5,915,853
  5,915,860
  5,915,867
  5,915,871
  5,915,874
  5,915,932
  5,916,017
  5,917,857
  5,918,300
  5,918,805
  5,918,980
  5,919,206
  5,919,476
  5,919,702
  5,920,147
  5,920,357
  5,920,363
  5,920,658
  5,921,322
  5,922,137
  5,922,713
  5,923,138
  5,923,375
  5,923,392
  5,923,452
  5,924,292
  5,924,446
  5,924,870
  5,925,343
  5,926,430
  5,926,461
  5,926,612
  5,926,629
  5,926,907
  5,927,185
  5,927,235
  5,927,315
  5,927,384
  5,927,731
  5,928,121
  5,928,592
  5,928,677
  5,928,801
  5,929,130
  5,929,402
  5,929,583
  5,930,354
  5,930,467
  5,930,850
  5,931,056
  5,931,134
  5,931,609
  5,931,762
  5,931,857
  5,931,906
  5,932,196
  5,932,201
  5,932,231
  5,932,271
  5,932,282
  5,932,284
  5,932,299
  5,932,321
  5,932,365
  5,932,720
  5,932,739
  5,932,756
  5,932,776
  5,932,822
  5,932,899
  5,932,907
  5,932,910
  5,932,911
  5,933,140
  5,933,286
  5,933,317
  5,933,536
  5,933,641
  5,933,781
  5,933,954
  5,933,956
  5,934,275
  5,934,488
  5,934,964
  5,935,206
  5,935,294
  5,935,424
  5,936,417
  5,937,117
  5,937,133
  5,937,184
  5,937,186
  5,937,302
  5,937,542
  5,938,634
  5,938,943
  5,940,023
  5,940,235
  5,940,302
  5,940,351
  5,940,353
  5,940,481
  5,940,491
  5,940,669
  5,941,049
  5,941,085
  5,941,656
  5,941,701
  5,941,763
  5,941,777
  5,941,780
  5,941,784
  5,941,806
  5,941,813
  5,941,816
  5,943,200
  5,943,667
  5,944,055
  5,944,067
  5,944,760
  5,945,787
  5,946,520
  5,946,781
  5,948,719
  5,948,999
  5,949,009
  5,949,011
  5,949,322
  5,949,398
  5,949,731
  5,949,848
  5,950,062
  5,950,099
  5,950,114
  5,950,233
  5,950,368
  5,950,682
  5,951,054
  5,951,061
  5,951,269
  5,952,239
  5,952,533
  5,952,720
  5,952,739
  5,952,740
  5,952,796
  5,953,106
  5,953,173
  5,953,215
  5,953,420
  5,953,556
  5,953,621
  5,954,083
  5,954,107
  5,954,472
  5,954,580
  5,954,731
  5,954,896
  5,955,619
  5,955,664
  5,956,087
  5,956,123
  5,956,443
  5,956,573
  5,956,654
  5,956,927
  5,956,932
  5,957,363
  5,957,372
  5,959,171
  5,959,419
  5,959,422
  5,959,623
  5,959,742
  5,959,803
  5,959,859
  5,959,873
  5,959,893
  5,959,901
  5,959,912
  5,960,034
  5,960,155
  5,960,174
  5,960,288
  5,960,291
  5,960,293
  5,960,307
  5,960,338
  5,960,342
  5,960,348
  5,960,980
  5,961,340
  5,962,143
  5,962,145
  5,962,157
  5,962,614
  5,962,800
  5,962,854
  5,962,855
  5,963,078
  5,963,229
  5,963,248
  5,963,367
  5,963,387
  5,963,492
  5,963,901
  5,963,922
  5,964,261
  5,964,535
  5,965,152
  5,965,478
  5,965,481
  5,965,628
  5,967,530
  5,967,665
  5,967,960
  5,967,962
  5,967,992
  5,968,574
  5,968,861
  5,968,862
  5,969,122
  5,969,737
  5,969,758
  5,969,760
  5,969,783
  5,970,011
  5,970,251
  5,970,637
  5,970,773
  5,971,076
  5,988,326
  5,989,262
  5,989,266
  5,989,268
  5,989,710
  5,989,767
  5,989,824
  5,989,864
  5,991,445
  5,991,565
  5,991,661
  5,991,699
  5,991,803
  5,991,883
  5,992,240
  5,992,751
  5,992,795
  5,992,823
  5,992,827
  5,992,835
  5,992,931
  5,993,393
  5,993,517
  5,993,817
  5,994,412
  5,995,026
  5,995,116
  5,995,469
  5,996,766
  5,996,768
  5,996,769
  5,996,770
  5,996,946
  5,998,490
  5,998,523
  5,998,534
  5,998,796
  6,001,475
  6,001,483
  6,001,488
-
G
A
A
T
T
2
2
-
2
A
G
G
T
G
-
C
20
C
C
G
-
2
A
T
T
C
T
C
-
-
T
C
T
C
C/A
T
A
C
G
C
C
T
3
T
2
T
C
A
C
C
G
A
A
G
G
T
A
A
C
T
G
A
A
G
G
T
4/-
2/-
2/-
G/A
T/C
G/3
5
-
T
3
C
A
G
T
G
A
G/A
6/-
C/A
G/A
-
G/A
C
A
C
A
G
C/2
T
-
-
7/-
-
C
C
2
4
5
4
-
-
-
-
-
-
-
-
C
C
A
T
-
A
2
A
T
-
C
T
G
C
G
A
G
C
G
-
G
C/T
G
C/5
C
C
2
G
T
T
C
T
G
C
T
T
G
G
T
C
G
G
G
T
T
A
T
T
A
G
A
G
2/-
5
2/-
T/A
2/-
G/A
2/-
T/A
-
2/-
A/3
2/-
A/G
-
T/3
T
-
A/3
C
T
A/2
G
T
T
3/-
5
C
3
A
A
2
2
T
-
T/-
10/-
8/-
A
G
C
3/AC
-
G
C
T
G
G
C
2
G
A
T
A
2
-
-
-
3/-
-
-
T
A
A
A
-
G
G
A
G
A
T
A
-
T
4/3
A
-
C
A
-
G
A
C
A
T
C
-
C
3/-
2/-
A
C
G
C
2
-
-
C
C
T
A
G
T
T
C
C
T
-
A
C
A
A
T
5
T
-
C
C/T
C
2/-
2/-
C/G
G/5
5/G
T
T
C/T
A/G
A/-
A/G
9/-
C/T
2/-
AC/-
T/C
A
A
C/G
G
G
T
C/G
G/2
A/-
A
C
2/-
G
A
T
C/G
G/A
A
A
C
-
-
C
3
C
8/-
6/-
A/T
T
-
-
G
A/T
C/-
A/T
-
C
G
-
C
A
T
-
-
2/-
T
3
A
T
C
T
T
5
A
G
T
5
C/T
C/T
C/T
A/T
T
2
G
C
T
C
A
C
-
-
2/-
T/-
5/-
3
G/2
A/-
-
-
-
-