chr start stop reference nuc variant nuc depth genic status zygosity variant ID 1 216297853 216297854 T TAC 9 GENIC heterozygous 61082414 1 216298751 216298752 C A 13 GENIC homozygous 61082416 1 216298876 216298877 C G 14 GENIC homozygous 61082417 1 216300493 216300494 A - 14 GENIC homozygous 61082418 1 216300545 216300546 C CAG 1 GENIC homozygous 61082419 1 216302693 216302694 A G 24 GENIC homozygous 61082420 1 216304025 216304026 A G 24 GENIC homozygous 61082421 1 216304081 216304082 G A 26 GENIC homozygous 61082422 1 216306588 216306593 AAAAT ----- 22 GENIC homozygous 61082426 1 216308858 216308859 T C 16 GENIC homozygous 61082427 1 216308893 216308894 C T 19 GENIC homozygous 61082428 1 216308955 216308956 C A 29 GENIC homozygous 61082429 1 216309105 216309108 TAA --- 14 GENIC homozygous 61082430 1 216310281 216310282 C T 23 GENIC homozygous 61082432 1 216310396 216310397 T - 27 GENIC homozygous 61082433 1 216310484 216310485 T G 42 GENIC homozygous 61082434 1 216311526 216311527 G A 20 GENIC homozygous 61082435 1 216311580 216311581 G A 27 GENIC homozygous 61082436 1 216311652 216311653 G A 24 GENIC homozygous 61082437 1 216311691 216311692 A G 27 GENIC homozygous 61082438 1 216311807 216311808 G A 24 GENIC homozygous 61082439 1 216311891 216311892 C A 17 GENIC homozygous 61082440 1 216312492 216312493 A G 29 GENIC homozygous 61082441 1 216313002 216313003 C T 23 GENIC homozygous 61082442 1 216314068 216314069 A G 18 GENIC homozygous 61082443 1 216314971 216314972 G GT 13 GENIC heterozygous 61082446 1 216314973 216314974 T TGTG 7 GENIC heterozygous 61082447 1 216314998 216314999 G A 16 GENIC homozygous 61082448 1 216315174 216315175 A G 36 GENIC homozygous 61082449 1 216315340 216315341 C T 21 GENIC homozygous 61082450 1 216315779 216315780 T C 21 GENIC homozygous 61082451 1 216316971 216316974 ATG --- 18 GENIC homozygous 61082452 1 216319880 216319881 A G 14 GENIC homozygous 61082453 1 216319901 216319907 TTTTAA ------ 18 GENIC homozygous 61082454 1 216320254 216320255 G A 15 GENIC homozygous 61082455 1 216322312 216322313 G A 23 GENIC homozygous 61082456 1 216322940 216322941 A G 20 GENIC homozygous 61082458 1 216323482 216323483 A G 22 GENIC homozygous 61082459 1 216323936 216323938 GG -- 10 GENIC homozygous 61082462 1 216324043 216324049 CCAATT ------ 14 GENIC homozygous 61082463 1 216301080 216301081 A AGTGTGTGTGTGTGTGT 9 GENIC homozygous 62198009 1 216304763 216304764 G T 17 GENIC homozygous 62198011 1 216305870 216305878 CACACACA -------- 12 GENIC heterozygous 62198013 1 216314973 216314974 T TG 7 GENIC heterozygous 62198015 1 216321831 216321832 A C 9 GENIC homozygous 62198017 1 216323895 216323896 T TTTTC 3 GENIC homozygous 62198019 1 216305868 216305878 CACACACACA ---------- 12 GENIC heterozygous 62236822 1 216314327 216314443 AAGAATGACACCTTTGGGGCTGGGGATTTAGCTCAGTGGTAGAGCGCTTACCTAGGAAGCGCAAGGCCCTGGGTTCGGTCCCCAGCTCCGAAAAAAAGAACCAAAAAAAAAAAAAA -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 30 GENIC homozygous 62100013 1 216325681 216325682 G A 27 GENIC homozygous 61082464 1 216326084 216326085 T TTG 31 GENIC homozygous 61082465 1 216326137 216326138 C T 30 GENIC homozygous 61082466 1 216328687 216328699 AGGAAACACACA ------------ 25 GENIC homozygous 61082470 1 216327358 216327359 C T 32 GENIC homozygous 61082467 1 216327856 216327857 T C 32 GENIC homozygous 61082468 1 216328115 216328116 A G 29 GENIC homozygous 61082469 1 216328809 216328810 T G 13 GENIC homozygous 61082471 1 216329655 216329656 A AAT 15 GENIC homozygous 61082472 1 216330623 216330624 A G 24 GENIC homozygous 61082473 1 216332142 216332143 A G 23 GENIC homozygous 61082474 1 216333773 216333774 G A 18 GENIC homozygous 61082475 1 216335101 216335102 G A 27 GENIC homozygous 61082476 1 216335339 216335340 G A 27 GENIC homozygous 61082477 1 216335708 216335709 A G 28 GENIC homozygous 61082478 1 216341215 216341216 A G 26 GENIC homozygous 61082479 1 216341521 216341522 T C 37 GENIC homozygous 61082480 1 216342376 216342377 A C 19 GENIC homozygous 61082481 1 216342377 216342378 A G 19 GENIC homozygous 61082482 1 216344201 216344202 G A 23 GENIC homozygous 61082483 1 216347751 216347752 G A 31 GENIC homozygous 61082484 1 216347791 216347792 G T 31 GENIC homozygous 61082485 1 216348585 216348595 ACACACACAC ---------- 8 GENIC heterozygous 62198021 1 216348587 216348595 ACACACAC -------- 8 GENIC heterozygous 62198023 1 216349744 216349745 T C 28 GENIC homozygous 61082486 1 216349871 216349872 A G 24 GENIC homozygous 61082487 1 216350122 216350123 T G 18 GENIC homozygous 61082488 1 216350211 216350212 A C 22 GENIC homozygous 61082489 1 216350487 216350488 C T 18 GENIC homozygous 61082490 1 216351284 216351285 G A 13 GENIC homozygous 61082491 1 216352015 216352016 A G 30 GENIC homozygous 61082492 1 216352119 216352120 G C 26 GENIC homozygous 61082493 1 216352721 216352722 A G 15 GENIC homozygous 61082494 1 216352854 216352855 G C 19 GENIC homozygous 61082495 1 216353333 216353334 T C 14 GENIC homozygous 61082496 1 216354474 216354475 C T 19 GENIC homozygous 61082497 1 216354789 216354790 G A 28 GENIC homozygous 61082498 1 216354848 216354849 A G 27 GENIC homozygous 61082499 1 216355712 216355713 T C 25 GENIC homozygous 61082500 1 216355844 216355845 C T 15 GENIC homozygous 61082501 1 216356456 216356457 C CCCTTG 15 GENIC homozygous 61082502 1 216356458 216356459 A T 16 GENIC homozygous 62198025 1 216356460 216356461 A - 17 GENIC homozygous 61082503 1 216356801 216356802 T C 21 GENIC homozygous 61082504 1 216356934 216356935 C T 28 GENIC homozygous 61082505 1 216358991 216358992 C T 14 GENIC homozygous 61082506 1 216359124 216359125 G A 10 GENIC homozygous 61082507 1 216359147 216359148 A G 11 GENIC homozygous 61082508 1 216359202 216359203 C CT 8 GENIC homozygous 61082509 1 216359695 216359696 A AC 5 GENIC homozygous 62198029 1 216360179 216360180 T C 16 GENIC homozygous 61082513 1 216360457 216360458 G C 32 GENIC homozygous 61082514 1 216360965 216360966 G A 35 GENIC homozygous 61082515 1 216361005 216361006 G A 39 GENIC homozygous 61082516 1 216361791 216361792 C G 32 GENIC homozygous 61082517 1 216361792 216361793 C G 33 GENIC homozygous 61082518 1 216361793 216361794 C G 33 GENIC homozygous 61082519 1 216362048 216362051 GAG --- 15 GENIC homozygous 61082520 1 216362128 216362129 A G 18 GENIC homozygous 61082521 1 216362263 216362268 GTTGA ----- 15 GENIC homozygous 61082522 1 216362305 216362306 C CAG 22 GENIC homozygous 61082523 1 216362742 216362743 G A 27 GENIC homozygous 61082526 1 216362877 216362878 G C 35 GENIC homozygous 61082527 1 216363962 216363963 A G 21 GENIC homozygous 61082528 1 216363970 216363971 C A 21 GENIC homozygous 61082529 1 216364153 216364154 T C 21 GENIC homozygous 61082530 1 216364341 216364342 C - 29 GENIC homozygous 61082531 1 216365477 216365478 G C 30 GENIC homozygous 61082532 1 216365786 216365787 A G 39 GENIC homozygous 61082533 1 216366379 216366385 CACACA ------ 3 GENIC homozygous 62198031 1 216367514 216367515 G C 22 GENIC homozygous 61082534 1 216368501 216368527 GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT -------------------------- 10 GENIC homozygous 62198033 1 216373800 216373801 T G 11 GENIC homozygous 61082536 1 216376517 216376518 A G 26 GENIC homozygous 61082537 1 216377557 216377558 C CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 18 GENIC homozygous 62198037 1 216381590 216381591 T C 13 GENIC homozygous 61082539 1 216382781 216382782 A C 20 GENIC homozygous 61082540 1 216383972 216383973 T TTTTC 9 GENIC possibly homozygous 61082541 1 216384000 216384001 C G 13 GENIC homozygous 61082542 1 216384030 216384031 A G 17 GENIC homozygous 61082543 1 216384292 216384293 C T 27 GENIC homozygous 61082544 1 216386108 216386109 G T 25 GENIC homozygous 61082545 1 216386558 216386559 A G 28 GENIC homozygous 61082546 1 216387780 216387781 C T 30 GENIC homozygous 61082547 1 216388761 216388762 C CAAA 15 INTERGENIC homozygous 61082548 1 216392343 216392344 G GTT 11 INTERGENIC homozygous 61082550 1 216395944 216395950 ACACAC ------ 8 INTERGENIC heterozygous 62248808 1 216395946 216395950 ACAC ---- 8 INTERGENIC heterozygous 62198041 1 216395948 216395950 AC -- 8 INTERGENIC heterozygous 62236823 1 216396021 216396022 T TA 18 INTERGENIC homozygous 61082551 1 216399205 216399206 C A 31 INTERGENIC homozygous 61082553 1 216399245 216399246 A AATGC 32 INTERGENIC homozygous 61082554 1 216400532 216400533 A T 36 INTERGENIC homozygous 61082555 1 216401381 216401401 GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT -------------------- 20 INTERGENIC heterozygous 62198044 1 216401383 216401401 GTGTGTGTGTGTGTGTGT ------------------ 20 INTERGENIC heterozygous 62198046 1 216401492 216401495 GCA --- 20 INTERGENIC homozygous 61082557 1 216401596 216401597 A AG 5 INTERGENIC homozygous 61082558 1 216402118 216402119 T TGATAGATAGATAGATA 11 INTERGENIC homozygous 62198048 1 216402890 216402891 G A 29 INTERGENIC homozygous 61082562 1 216403001 216403002 T C 27 INTERGENIC homozygous 61082563 1 216403371 216403372 T C 15 INTERGENIC homozygous 61082564 1 216405893 216405894 T TA 1 INTERGENIC homozygous 62198050 1 216405896 216405897 T TG 1 INTERGENIC homozygous 62198052 1 216450575 216450576 T C 38 GENIC homozygous 61082573 1 216458075 216458076 G CTCTCTCTCTCT 25 GENIC heterozygous 62198059 1 216462865 216462866 C G 21 GENIC homozygous 61082587 1 216464576 216464577 T C 28 GENIC homozygous 61082588 1 216465926 216465927 C CG 7 GENIC homozygous 62630060 1 216468638 216468639 T A 32 GENIC homozygous 61966206 1 216331482 216331483 T - 16 GENIC homozygous 61966201 1 216446843 216446844 T - 15 INTERGENIC homozygous 61966202 1 216451462 216451463 G C 18 GENIC homozygous 61966203 1 216464731 216464732 C T 28 GENIC homozygous 61966204 1 216466596 216466597 T C 32 GENIC homozygous 61966205 1 216468825 216468826 A G 19 GENIC homozygous 61082593 1 216470189 216470190 A ACG 21 GENIC homozygous 61966207 1 216470731 216470732 A AC 32 GENIC homozygous 61966208 1 216473792 216473793 A ACTCT 5 GENIC heterozygous 62236826 1 216475093 216475094 A AACACACACACACACACACACACAC 15 GENIC homozygous 62198065 1 216478556 216478557 A G 37 GENIC homozygous 61082597 1 216484063 216484064 G A 23 GENIC homozygous 61966209 1 216484809 216484811 AA -- 22 GENIC possibly homozygous 61804547 1 216485102 216485103 A - 21 GENIC homozygous 61082600 1 216486298 216486299 T C 15 GENIC homozygous 61082602 1 216487440 216487441 T C 26 GENIC homozygous 61966210 1 216488263 216488264 C CACGACGACGACG 26 GENIC homozygous 62630061 1 216490794 216490795 C CCAGAGTCTGGTACA 24 GENIC homozygous 61082604 1 216495025 216495026 A G 24 GENIC homozygous 61966211 1 216495287 216495288 T G 19 GENIC homozygous 61082607 1 216495743 216495744 T TA 14 GENIC homozygous 61082608 1 216495943 216495944 G T 22 GENIC homozygous 61966212 1 216496706 216496707 C T 27 GENIC homozygous 61966213 1 216497503 216497504 A T 34 GENIC homozygous 61966214 1 216497675 216497676 C A 20 GENIC homozygous 61082610 1 216499452 216499456 CACT ---- 8 GENIC heterozygous 62630062 1 216504227 216504228 T G 24 GENIC homozygous 61966215 1 216509920 216509923 CAC --- 21 GENIC homozygous 61082611 1 216510024 216510173 CACCACCACCACCATCACCATCATCACTATCACCACCACCACCACCATCACCATCATCACCATCACCACCACCACCATCACCACCACCACCACCACCTCCACTACCACCTCCATCACCACCACCACCATCACACCACCATCATCACCAT ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 29 GENIC possibly homozygous 62100090 1 216510488 216510489 G A 26 GENIC homozygous 61082615 1 216514688 216514689 C A 36 GENIC homozygous 61082619 1 216511219 216511220 T G 33 GENIC homozygous 61966216 1 216513303 216513304 C CGTGT 3 GENIC homozygous 61082617 1 216514057 216514058 T C 21 GENIC homozygous 61082618 1 216514808 216514810 AA -- 5 GENIC heterozygous 62198073 1 216514811 216514821 AAAGAAAGAA ---------- 4 GENIC heterozygous 62198075 1 216515289 216515290 A C 25 GENIC homozygous 61082623 1 216519453 216519454 G GACAGTGAA 27 GENIC homozygous 61082625 1 216519682 216519683 C CACACACACACAGAGAG 3 GENIC homozygous 62198079 1 216519727 216519753 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG -------------------------- 13 GENIC homozygous 62630063 1 216520171 216520172 A C 30 GENIC homozygous 61082628 1 216520176 216520177 A G 31 GENIC homozygous 61082629 1 216520932 216520933 A G 16 GENIC homozygous 61082630 1 216521177 216521178 T C 22 GENIC homozygous 61082631 1 216523263 216523264 C G 28 GENIC homozygous 61966217 1 216523416 216523417 G A 6 GENIC homozygous 61966218 1 216523991 216523992 A G 14 GENIC homozygous 61966219 1 216524055 216524056 G A 20 GENIC homozygous 61966220 1 216525971 216525972 G A 25 GENIC homozygous 61966221 1 216527033 216527034 C T 24 GENIC homozygous 61966222 1 216527586 216527587 C T 18 GENIC homozygous 61966223 1 216528265 216528266 G GA 21 GENIC homozygous 61966224 1 216530663 216530665 CG -- 27 GENIC homozygous 61966225 1 216531215 216531256 CCATGCCAAAACCCTGTGCCATTCTGTCAACAATGCTCCCT ----------------------------------------- 33 GENIC homozygous 62302514 1 216531355 216531356 A G 33 GENIC homozygous 61082641 1 216531744 216531745 T TGTGGGGACCAAC 24 GENIC homozygous 61082642 1 216534183 216534184 C T 18 GENIC homozygous 61082646 1 216534582 216534583 A AGTGTGTGT 2 GENIC homozygous 62355137 1 216536360 216536361 A G 25 GENIC homozygous 61082650 1 216537323 216537324 A ATAATAATAATAAT 12 GENIC homozygous 62630064 1 216537326 216537327 A T 17 GENIC homozygous 62630066 1 216538320 216538321 C - 7 GENIC possibly homozygous 62640371 1 216538322 216538329 CACAAAC ------- 12 GENIC heterozygous 62640372 1 216538674 216538675 C G 34 GENIC homozygous 61966227 1 216539073 216539074 T TAA 16 GENIC homozygous 61966228 1 216540096 216540097 A T 23 GENIC possibly homozygous 61966229 1 216540950 216540951 G C 39 GENIC homozygous 61082662 1 216540969 216540970 G A 32 GENIC homozygous 61082663 1 216541974 216541975 C T 17 GENIC homozygous 61966230 1 216541996 216541997 A G 15 GENIC homozygous 61082665 1 216542304 216542305 T C 22 GENIC homozygous 61082667 1 216542786 216542787 A G 23 GENIC homozygous 61082669 1 216543740 216543741 T TTTCAGAGCTTCTCGGG 24 GENIC homozygous 61082670 1 216544534 216544535 G A 23 GENIC homozygous 61966231 1 216545955 216545956 C T 25 GENIC homozygous 61966232 1 216549550 216549551 G A 27 GENIC homozygous 61966233 1 216550055 216550056 C G 21 GENIC homozygous 61082679 1 216550376 216550377 G C 24 GENIC homozygous 61082680 1 216551400 216551401 A G 32 GENIC homozygous 61082684 1 216551557 216551558 G A 26 GENIC homozygous 61966234 1 216554312 216554328 AAAAAGAGAGAGAGAG ---------------- 5 GENIC homozygous 62630067 1 216554669 216554670 A G 23 GENIC homozygous 61082690 1 216555741 216555742 C T 21 GENIC homozygous 61966235 1 216555775 216555776 C - 19 GENIC homozygous 61590599 1 216558216 216558217 T TAA 19 GENIC heterozygous 61082694 1 216558216 216558217 T TA 19 GENIC heterozygous 61082695 1 216558216 216558217 T TAAA 19 GENIC heterozygous 61804579 1 216562557 216562558 T C 25 GENIC homozygous 61966237 1 216562941 216562942 A G 16 GENIC homozygous 61966238 1 216564377 216564385 ACACATCA -------- 23 GENIC homozygous 62198101 1 216564386 216564387 G GTC 19 GENIC homozygous 62198103 1 216564388 216564389 C CGGAG 21 GENIC homozygous 62198105 1 216564393 216564394 C CCCGCCGCCG 20 GENIC homozygous 62198107 1 216564394 216564395 T A 20 GENIC homozygous 62198109 1 216564396 216564397 G GGGGGC 20 GENIC homozygous 61319104 1 216566362 216566363 C T 29 INTERGENIC homozygous 61966239 1 216566779 216566780 A AC 31 INTERGENIC homozygous 61804585 1 216568772 216568773 T TC 5 INTERGENIC homozygous 61082703 1 216568862 216568863 G - 18 INTERGENIC homozygous 61082704 1 216569397 216569398 A G 30 INTERGENIC homozygous 61082706 1 216569400 216569401 A AG 32 INTERGENIC homozygous 61082707 1 216569733 216569734 A G 20 INTERGENIC homozygous 61082708 1 216570305 216570306 A C 27 INTERGENIC homozygous 61082709 1 216570516 216570517 G A 16 INTERGENIC homozygous 61082710 1 216571432 216571433 T A 22 INTERGENIC homozygous 61082712 1 216573449 216573450 G A 32 INTERGENIC homozygous 61082714 1 216573741 216573749 CACCTCCC -------- 16 INTERGENIC homozygous 61082715 1 216573938 216573939 A G 30 INTERGENIC homozygous 61082716 1 216575506 216575507 G GCC 8 INTERGENIC homozygous 61082717 1 216575740 216575741 T TAC 7 INTERGENIC heterozygous 62413647 1 216575786 216575787 A G 26 INTERGENIC homozygous 61082721 1 216578271 216578272 T C 28 INTERGENIC homozygous 61082722 1 216578792 216578793 T G 18 INTERGENIC homozygous 61082723 1 216578930 216578931 A G 22 INTERGENIC homozygous 61082724 1 216579228 216579229 G A 33 INTERGENIC homozygous 61966240 1 216579518 216579519 G A 32 INTERGENIC homozygous 61966241 1 216579895 216579896 G A 25 INTERGENIC homozygous 61966242 1 216580076 216580077 C CT 16 INTERGENIC homozygous 61966243 1 216580709 216580710 G C 27 INTERGENIC homozygous 61966244 1 216580870 216580871 T - 19 INTERGENIC homozygous 61966245 1 216581019 216581020 A C 25 INTERGENIC homozygous 61966246 1 216581525 216581526 G A 18 INTERGENIC possibly homozygous 61966247 1 216582062 216582063 G A 18 INTERGENIC homozygous 61966248 1 216582527 216582528 A - 4 INTERGENIC homozygous 61082725 1 216584077 216584078 A G 18 INTERGENIC homozygous 62302515 1 216585180 216585184 TTTT ---- 20 INTERGENIC homozygous 61804593 1 216588914 216588915 C A 23 INTERGENIC homozygous 61082740 1 216591195 216591196 G A 20 INTERGENIC homozygous 61966249 1 216592642 216592650 GAATGAAT -------- 14 INTERGENIC homozygous 61082751 1 216592918 216592919 C CT 12 INTERGENIC heterozygous 61082753 1 216594349 216594353 GGAA ---- 13 INTERGENIC homozygous 61966250 1 216594516 216594517 A AGTGTGTGT 2 INTERGENIC homozygous 62519201 1 216595072 216595073 C A 27 INTERGENIC homozygous 61082761 1 216595949 216595950 T G 18 INTERGENIC homozygous 61966252 1 216599059 216599060 A - 13 INTERGENIC possibly homozygous 61804633 1 216600354 216600355 A T 34 INTERGENIC homozygous 61966253 1 216600942 216600943 A T 22 INTERGENIC homozygous 61966254 1 216603888 216603889 T C 8 INTERGENIC homozygous 61082774 1 216608285 216608286 G - 15 INTERGENIC homozygous 61082778 1 216609572 216609576 CCTA ---- 16 INTERGENIC heterozygous 62630068 1 216610106 216610107 G A 22 INTERGENIC homozygous 61966255 1 216612914 216612955 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCACACAC ----------------------------------------- 7 INTERGENIC possibly homozygous 62198123 1 216614162 216614163 A G 17 INTERGENIC homozygous 61966256 1 216615521 216615522 T C 23 INTERGENIC homozygous 61966257 1 216617824 216617825 T C 32 INTERGENIC homozygous 61082807 1 216620175 216620179 ACAC ---- 13 INTERGENIC homozygous 62413657 1 216620407 216620408 A AAC 21 INTERGENIC possibly homozygous 61082833 1 216620651 216620657 TTTTTG ------ 17 INTERGENIC homozygous 61966258 1 216622082 216622083 C T 21 INTERGENIC homozygous 61966259 1 216623263 216623265 AC -- 11 INTERGENIC homozygous 61966260 1 216624356 216624357 G A 28 INTERGENIC homozygous 61082840 1 216624374 216624375 G A 27 INTERGENIC homozygous 61082841 1 216626836 216626837 A G 11 INTERGENIC homozygous 61082844 1 216627379 216627380 A ACACACACACAC 12 INTERGENIC heterozygous 62198137 1 216629236 216629237 G GACACACAC 9 GENIC heterozygous 62198139 1 216629237 216629241 ACAC ---- 9 GENIC possibly homozygous 62470467 1 216626693 216626694 T TGAGAGAGA 8 INTERGENIC homozygous 62344448 1 216620719 216620720 A AAG 25 INTERGENIC heterozygous 62344447